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# 健康科学# 呼吸器内科

新しい肺炎の検査方法が期待できそうだよ。

研究が、肺炎カリニの診断のための鼻咽頭スワブを調査してるよ。

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目次

肺炎を引き起こす小さな真菌、Pneumocystis jiroveciiは、特にHIV/AIDSを持つような免疫が弱い人々に影響を与えるんだよね。また、HIVがない5歳以下の子供においても、肺炎の最も一般的な真菌原因だよ。HIVの予防と治療が進んでいるにも関わらず、今でも多くの人がこの真菌によって肺炎になってしまうんだ。これは、臓器移植やがん治療のために免疫を抑える薬を使う人が増えているからでもあるし、また、発展途上国ではHIVの管理がまだ課題なんだ。

診断の課題

Pneumocystis肺炎(PJP)の診断での主要な問題は、この真菌がラボで培養できないことなんだ。だから、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)という特定のテストが診断においてすごく重要なんだ。PCRテストは、喀痰や肺からの液体など、肺の下部から取ったサンプルで行われることが多い。でも、中にはこれらのサンプルを提供できない患者もいるんだ。例えば、弱っている、非常に若い、または呼吸に苦労している場合など。サンプルを集めるのは不快で、特に特別な道具を使った手順ではリスクが伴うことがあるんだ。

肺からサンプルを集めるには専門のプロと高価な機材が必要で、これが田舎や貧しい国の患者に適切な検査を受けるのを難しくしているんだ。

より良い検査方法の必要性

P. jiroveciiの検査のためのサンプル収集の方法を、患者を危険にさらさないようにもっと簡単で安価にする必要があるんだ。一つの代替案は、侵襲性が低い鼻咽頭スワブを使うことなんだけど、最近の研究でこのスワブと従来の肺のサンプルを比較したものが十分にないんだ。最後の大きな研究は10年以上前のもので、HIVの高い国の子供たちにだけ焦点を当てていた。

研究の概要

この研究は、肺炎を診断する際にP. jiroveciiの検査に鼻咽頭スワブが良い方法かどうかを確認し、サンプルの質がテスト結果にどのように影響するかを見てみることを目的としていたんだ。

研究デザイン

研究は、患者の記録を振り返る形で行われた。研究の詳細はチェックリストに載ってるよ。

設定と参加者

研究はオーストラリアのクイーンズランドで行われていて、人口の約0.14%がHIVを持っている。研究に含まれた患者はPJPの疑いがある人たちで、肺からのサンプルでPCR検査を受けていて、同時に肺サンプルの検査の1週間以内に鼻咽頭スワブも取られていたんだ。

検査方法

PCRテストは、肺サンプルと鼻咽頭スワブの両方で行われた。主な目的は、テストが真菌の兆候を示しているかどうかを確認することだった。研究では、この真菌のDNAをサンプルの中から探す特定のタイプのPCRが使われた。

サンプルの質を評価

サンプルの質を確認するために、研究者たちは特定の人間のDNAをマーカーとして見た。これによって、サンプルにどれだけの人間の細胞が含まれているか理解できたんだ。人間の細胞が多いほど、サンプルの質は良いってことになる。

統計分析

研究者たちは鼻咽頭の結果が利用できる患者に焦点を当てて、高品質なサンプルがどれだけあったかを確認した。鼻咽頭スワブが肺サンプルと比較してPJPをどれだけ検出できたかを評価するために、さまざまな値を計算したんだ。

結果

合計111人の患者が研究の基準を満たしていた。中にはデータが欠けている患者もいて、それも記録されていた。PJPと診断された人たちは、肺サンプルのPCRで真菌が陽性だったよ。

結果から、鼻咽頭スワブはPJPの例を非常に正確に特定できることがわかったんだ。テスト結果が陽性なら、患者はPJPの可能性が高いってこと。ただし、いくつかのケースを見逃してしまったから、肺サンプルと比べると完全ではなかったんだ。

サンプルの質は重要で、PJPが陽性の鼻咽頭スワブは、偽陰性を示したものよりも多くの人間DNAを含んでいて、質が良いことを示していたよ。

サンプル収集の重要性

結果は、より高品質のサンプルが正しい診断の可能性を高めることを示した。これを実現するための方法の一つが、患者から複数のスワブを取ることだよ。これにより、結果の精度が大幅に向上する可能性があるんだ。例えば、2つのスワブを使うことで、テストの感度が約88%に上昇することがあるよ。

複数の標本を収集する重要性は、COVID-19の検査など他のテストとの比較でも強調されていて、複数のサンプルで検査することで検出率が改善されることがあったんだ。

研究結果の文脈

この研究は、HIVの感染率が低い場所で大人のPJP診断に鼻咽頭スワブを使用することを検討した最初の研究の一つとして注目に値するよ。これらのスワブを使う利点は、医者が同時に他の感染症の可能性を検査できることなんだ。この研究では、PJPを持つ患者の中にPCRテストでウイルス感染が確認された人もいたんだ。

制限事項

この結果は子供には当てはまらないかもしれない、だって子供は研究に含まれていなかったからね。サンプルサイズは比較的小さかったし、観察研究だったから潜在的なバイアスがあるかもしれない。でも、研究者たちは2年間にわたってクイーンズランドのさまざまな公立病院から患者を集めて、このリスクを減らすようにしたんだ。

また、結果が良い兆しを見せているものの、さらなる研究が必要だってことも重要だよ。将来の研究では、異なる設定や人口で結果が維持されるかどうかを見極めるために、もっと大きなグループの患者を調べるべきだよ。

結論

この研究は、Pneumocystis肺炎の診断に鼻咽頭スワブを使う利点があるかもしれないことを示唆してる。結果は、これらの結果を確認するための大規模な研究が必要だってことを支持してる。代替の検査方法があれば、患者がタイムリーで正確な診断を受けやすくなるし、治療の結果も良くなると思うよ。

オリジナルソース

タイトル: Comparison of nasopharyngeal swab vs. lower respiratory tract specimen PCR for the diagnosis of Pneumocystis jirovecii pneumonia

概要: Background and objectiveDiagnosis of P. jirovecii pneumonia (PJP) is by PCR on lower respiratory tract specimens, the collection of which is not always well-tolerated and requires trained staff and costly equipment not usually available in low-resource settings. We aimed to evaluate P. jirovecii PCR performed on nasopharyngeal swabs (NPS) as a diagnostic test for PJP, as well as the impact of specimen quality on test performance. MethodsPatients with clinically-suspected PJP in public hospitals in Queensland, Australia, who had quantitative P. jirovecii PCR performed on lower respiratory tract specimens from 1 January 2015 to 31 December 2016, and also had NPS collected by healthcare staff within seven days of lower respiratory tract specimen collection were included in this retrospective cohort study. Quantitative P. jirovecii PCR was performed, and sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values were calculated. Specimen quality was assessed by quantifying endogenous retrovirus 3 (ERV3) loads, with higher values indicating better specimen quality. ResultsOne hundred and eleven patients were included. The sensitivity of NPS P. jirovecii PCR was 0.66 and specificity was 1.0. The positive predictive value was 1.0 and the negative predictive value was 0.63. Median ERV3 loads in lower respiratory tract specimens and NPS were not significantly different in true positive vs. true negative patients, but was significantly higher in true positives vs. false negatives (7.55x102 vs. 3.67x102; P=0.05). ConclusionP. jirovecii PCR on NPS was highly specific but poorly sensitive. Proper specimen collection is essential to ensure adequate quality and prevent misclassification. Summary at a GlanceUsing nasopharyngeal swabs instead of lower respiratory tract specimens for PCR to diagnose P. jirovecii pneumonia (PJP) may be better tolerated and improve diagnostic accessibility. In this two-year retrospective cohort study of patients with clinically-suspected PJP from Queensland, Australia, P. jirovecii PCR on NPS had high specificity but low sensitivity.

著者: Rusheng Chew, S. Tozer, K. Ulett, D. Paterson, D. Whiley, T. Sloots, D. Fielding, C. Zappala, F. Bashirzadeh, J. Hundloe, C. Bletchley, M. Woods

最終更新: 2023-10-30 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.28.23297710

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.28.23297710.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。

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