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# 生物学# 生化学

TDO2をターゲットにする:がん治療におけるRac-1の可能性

Rac-1はTDO2の新しい阻害剤として期待されていて、癌治療を助けるんだ。

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Rac-1:Rac-1:がんに対する新しい希望阻害剤として浮上してる。Rac-1は癌におけるTDO2の潜在的な
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トリプトファンは、体がいろいろな機能に使う大事なアミノ酸で、たとえばタンパク質を作ったり、気分を調整する脳内化学物質セロトニンを生成したりするのに必要なんだ。トリプトファンを処理する重要な酵素には、トリプトファン-2,3-ジオキシゲナーゼ(TDO2)とインドールアミン-2,3-ジオキシゲナーゼ1(IDO1)がある。これらの酵素は構造は違うけど、同じ化学反応をしてトリプトファンを体が使える分子に変換する。

TDO2とIDO1は、代謝や免疫反応のような多くの体のプロセスで重要な役割を果たしていて、特に炎症やがんのような状況では特に重要なんだ。これらの酵素の活性レベルは、体内の一酸化窒素の存在など、いろんな生物学的要因によって変わることがある。この変動は、特に腫瘍の文脈で、免疫反応を抑制する状態に寄与することがある。

酵素阻害剤の役割

研究者たちは、腫瘍に対する免疫反応を強化するための治療法として、これらの酵素の活性を阻害(またはブロック)できる小分子を探してるんだ。TDO2やIDO1を阻害することで、腫瘍微小環境での影響を打ち消せるかもしれないと期待してる。

いろんな阻害剤がTDO2とIDO1の両方をターゲットにしてるけど、その中には酵素の特定の形態、つまり活性なホロ型(重要な分子ヘムを含む)や不活性なアポ型(ヘムがないもの)に結合するように設計されたものがある。効果的な治療法を見つけて、より良い抗腫瘍免疫につなげることに集中してる。

でも、多くのIDO1阻害剤は臨床試験ではあまり良い結果を示していないんだ。唯一注目すべき成功例が、エパカドスタットという特定の阻害剤で、これは既存のがん治療と組み合わせても生存率を改善しなかった。

Rac-1の発見

最近の研究で、TDO2を阻害する化合物を探す際にRac-1という新しい阻害剤が発見された。この阻害剤は、TDO2を高レベルで発現するSW48細胞の実験を通じて特定された。重要な発見は、Rac-1がTDO2の活性を効果的に阻害できることだった。

実験室のテストでは、Rac-1は10μMの濃度で60%の阻害を示した。さらに高用量では効果が増すことが分かり、将来の研究に向けて有望な候補となった。

生細胞での結合の理解

Rac-1がTDO2の不活性型に結合することを確認するために、研究者たちはバイオルミネセンス共鳴エネルギー移動(BRET)という技術を使った実験を行った。MCF7細胞は通常TDO2を発現しないが、酵素のバージョンをルミネセントタンパク質にリンクさせるように遺伝子改変された。トレーサー染料を追加すると、結合に応じた信号変化を測定できた。

Rac-1をトレーサーと一緒に追加すると、結合信号が減少して、Rac-1が不活性TDO2への結合をトレーサーと競っていることが確認された。これにより、Rac-1が生細胞内でTDO2に効果的にターゲットして結合できることが証明された。

Rac-1とTDO2の相互作用

Rac-1とTDO2の相互作用は、詳細な構造解析を通じてさらに探求された。研究では、Rac-1がTDO2のヘム結合部位にフィットしていることが示され、酵素の構造が変わることが分かった。この形状の変化によって、Rac-1はTDO2が正常に機能するのをブロックできるようになる。

Rac-1がTDO2に結合する際には、酵素の特定の部分との具体的な相互作用がある。特に、重要なアミノ酸との水素結合を形成して、結合ポケットでのフィット感が強くなる。科学者たちはX線結晶学を使って、Rac-1がTDO2とどのように相互作用するかを正確に視覚化し、その結合メカニズムに関する貴重な洞察を得た。

熱的安定性とさらなるテスト

Rac-1の存在下でのTDO2の安定性もテストされた。研究者たちは、Rac-1とその分離バージョンであるエナンチオマーがTDO2の熱的安定性を高めることを見つけた。これは、タンパク質が温度上昇にどのように反応するかを測定する差動走査フルオリメトリー(DSF)を使って評価された。

Rac-1はTDO2をより安定にして、熱下で分解されにくくすることが分かった。この安定化効果は、Rac-1がどのように機能するかを理解するだけでなく、TDO2阻害に基づくより効果的な治療法の開発にも重要だ。

結晶化と構造決定

Rac-1がTDO2にどのように結合するかをよりよく理解するために、研究者たちはRac-1の存在下でアポ-TDO2を結晶化した。このプロセスでは、ヘムを作らない特別な細菌株を使用して、実験中にTDO2が不活性型のままであることを確保した。

結晶によって、Rac-1とTDO2の相互作用の詳細な分析が可能になった。結果として、Rac-1がTDO2酵素のすべての部分に効果的に結合し、全体的な形状や機能に影響を与えることが示された。

将来の治療への影響

Rac-1がTDO2の不活性型をターゲットにする阻害剤としての発見は大きな意味を持つ。これはTDO2をターゲットにした治療法の新しい可能性を開くかもしれないし、がんに対する免疫反応を改善する可能性がある。Rac-1や似たような化合物が従来の阻害剤とは異なる作用をするため、研究者たちは免疫機能を回復させるためのより効果的な方法を提供できると考えている。

TDO2とIDO1の働きや、それに対する阻害剤の影響を理解することは重要だ。科学者たちがこれらの酵素と免疫系との関係を探求し続ける中で、将来の治療がさまざまながんに苦しむ患者の結果を改善できることを期待している。

結論

TDO2とIDO1を理解し、阻害しようとする旅は、がん研究の重要な側面であり続ける。Rac-1のような有望な化合物が現れる中で、腫瘍細胞を認識して排除する免疫系の能力を高める新しい戦略を開発できるという楽観がある。

研究が続くことで、トリプトファン代謝の背後にあるプロセスや、それを利用してがん患者の治療選択肢を強化する方法についての理解が深まることを目指している。この分野での発見は、より効果的ながん治療への重要なステップを示している。

オリジナルソース

タイトル: Discovery and binding mode of small molecule inhibitors of the apo form of human TDO2

概要: Tryptophan-2,3-dioxygenase (TDO2) and indoleamine-2,3-dioxygenase (IDO1) catalyze the conversion of L-tryptophan to N-formyl-kynurenine and play important roles in metabolism, inflammation, and tumor immune surveillance. Their enzymatic activities depend on their heme contents, which vary dynamically according to biological conditions. Inhibitors binding to heme-containing holo-TDO2 are known, but to date no inhibitor that binds to the heme-free state (apo-TDO2) has been reported. We describe the discovery of the first apo-TDO2 targeting inhibitors, to our knowledge, together with their co-crystal structures and inhibition of cellular TDO2 activity at low nanomolar concentrations.

著者: Aengus Mac Sweeney, C. Lotz-Jenne, R. Lange, S. Cren, G. Bourquin, L. Goglia, T. Kimmerlin, M. Wicki, M. Mueller, N. Artico, S. Ackerknecht, P. Pfaff, C. Joesch

最終更新: 2024-06-04 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.09.574827

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.09.574827.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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