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ナリンゲニンの微生物生産:持続可能なアプローチ

科学者たちは微生物を使って、植物の廃棄物から持続可能にナリンゲニンを生産してるよ。

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微生物が持続的にナリンゲニ微生物が持続的にナリンゲニンを生成する微生物アプローチを強調している。研究は、効率的なナリンゲニン生産のための
目次

フラボノイドは植物から来る自然化合物の一種なんだ。たくさんの果物や野菜、その他の植物ベースの食品に見られる。フラボノイドには9,000種類以上の異なるタイプがあって、フラボン、フラバノール、イソフラボン、アントシアニン、そしてチャルコンが含まれてる。これらの化合物は健康に良い可能性があることで知られてる。がんや炎症、ウイルスから体を守る手助けをするかもしれないし、脳や心臓にも良い影響を与えるかもしれない。

重要なフラボノイドの一つにナリゲニンがある。ナリゲニンは植物がフラボノイドを作るプロセスで重要な役割を果たしてるんだ。ナリゲニンは他のフラボノイドが作られるためのビルディングブロックとして機能する。最近の研究ではナリゲニンはCOVID-19の治療に役立つかもしれないって言われてて、研究者たちの注目を集めてる。

フラボノイドの伝統的生産

伝統的には、フラボノイドや関連化合物は植物から抽出することで得られてきた。この方法は複雑で、化合物を分離して純化するのにたくさんの手間がかかる。残念ながら、このアプローチはフラボノイドを得るのに最もコスト効率が良い方法ではなく、持続可能性にも欠ける。自然に頼ると、得られる製品の量も少ない。

これらの問題を解決するために、科学者たちは微生物を利用してナリゲニンを生産する方法を探し始めた。微生物っていうのはバクテリアみたいな小さな生き物のことだ。この方法は効率的で、フラボノイドを大量に生産できる。

微生物を使ったナリゲニン生産

大腸菌、グルタミン酸コリネバクテリウム、そして酵母のサッカロミセス・セレビジエを使ってフラボノイドが作られてる。これらの微生物はシンプルな化合物をナリゲニンに変えることができる。例えば、研究者たちは大腸菌を遺伝子操作して、グルコースとグリセロールからナリゲニンを作るようにしたんだ。他の研究では、C.グルタミクムを使って似たような結果を得てる。

これらの方法は期待されてるけど、フラボノイドの生産に必要なマロン酸コアという重要な化合物の入手可能性にはまだ課題がある。

マロン酸コアの課題

マロン酸コアはナリゲニンを合成するのに必要不可欠。いくつかの研究では、より多くの脂質(脂肪)を生産できる微生物を使うことに焦点が当てられた。なぜなら、そういう微生物はより多くのマロン酸コアも生産できるから。特定の真菌、ムコール・サーキネロイデスはナリゲニンを生産するように改良されたけど、作られた量はまだ少なかった。

もう一つ重要なのは、ナリゲニンを作るのに必要な主成分であるクマリン酸がアルカリ前処理リグニンという物質に含まれていること。リグニンは植物の細胞壁の主要成分で、紙を作る過程でしばしば廃棄される。この廃棄物はナリゲニン生産の資源として再利用できるかもしれない。

微生物ホストとしてのアシネトバクター・バイリ

アシネトバクター・バイリ ADP1はリグニン化合物をナリゲニンに変える可能性のあるバクテリアとして研究されている。クマリン酸のような芳香族化合物を取り込んで利用する能力がある。また、このバクテリアはリグニン関連化合物の高濃度に耐えられる。

研究者たちはA.バイリ ADP1が特定の脂質を大量に生産できることを示していて、ナリゲニン生産を必要とするマロン酸コアを提供してくれる。さらに、このバクテリアは遺伝子操作しやすいから、こうした生産プロセスにおいて好ましいホストなんだ。

A.バイリ ADP1におけるナリゲニン生産の研究

この研究では、研究者たちはA.バイリ ADP1でナリゲニンを生産しようとした。バクテリアのクマリン酸を利用する能力を活かして、ナリゲニンを合成する新しい経路を作り出した。ナリゲニンの生産を高めるためにフィードバッチプロセスが導入され、大幅な生産量の増加が見られた。

材料と方法

研究者たちは様々なバクテリア株を実験に使った。それらの株を特別な培地で維持し、所望のバクテリアを選択するためにさまざまな抗生物質を使用した。ナリゲニン生産にはA.バイリ ADP1が用いられた。

バクテリアのナリゲニン生産能力を高めるために遺伝子改良が行われた。研究者たちはA.バイリ ADP1での変化を導くための特定のDNAテンプレートを作成した。

ナリゲニン生産を小規模でテストするために、チームはまず小さいチューブで改良されたバクテリアを育て、その後大きなフラスコに移した。時間と共にバクテリアの成長とナリゲニンの生産を監視した。

大規模生産のためには、生育条件をより良く管理できる制御された環境であるバイオリアクターを使用した。研究者たちはナリゲニンの出力を最適化するためにpHと基質濃度を調整した。

結果と議論

結果は、A.バイリ ADP1がクマリン酸からナリゲニンを効果的に生産できることを示した。研究者たちは小規模なセットアップでどれだけナリゲニンが生産できるかを最初にテストした。生産経路で使用した遺伝子の組み合わせによってナリゲニンの生産量が変わることが分かった。

ナリゲニンの最高生産量は、特定の遺伝子の組み合わせで達成され、以前の株よりも良い収量に繋がった。バイオリアクター条件にスケールアップしたとき、ナリゲニンの生産量は著しく増加した。

さらに、研究者たちは使用するクマリン酸の濃度がナリゲニンの生産に影響を与える可能性があることに気づいた。クマリン酸が多すぎると全体の生産を妨げることがある。それで、収量を最適化するためにクマリン酸濃度のバランスを見つけた。

また、ナリゲニン生産においてもう一つの重要な要素であるマロン酸の影響もテストした。マロン酸を分解する経路を抑制することで、バクテリア内のマロン酸コアの量を増やそうとした。しかし、結果は期待通りではなく、マロン酸コアの供給を増やす最良の方法を理解するためにさらなる調査が必要だ。

この研究は、成長環境のpHがナリゲニン生産に関与する酵素の活動に大きな役割を果たすことも強調してる。研究者たちは、pHを一定の範囲内に保つことで、生産率が向上することを見つけた。

最終的に、具体的な植物由来の遺伝子の組み合わせを使用し、バイオリアクター内の成長条件をコントロールすることで最高の結果が得られた。研究者たちは合計で66 mg/Lのナリゲニンを成功裏に生産し、この貴重な化合物を生産するための効果的なホストとしてのA.バイリ ADP1の可能性を示した。

結論

この研究は、A.バイリ ADP1がクマリン酸からナリゲニンを生産できる能力を示してる。バクテリアを改良し、成長条件を制御するアプローチは、今後のフラボノイド生産の可能性を示してる。見つかった結果は、リグニンのような廃棄物材料を活用する可能性と、生産方法を微調整するためのさらなる研究の必要性を浮き彫りにしてる。

この研究の成果は、A.バイリ ADP1がナリゲニンだけでなく、リグニンから派生する他の貴重な化合物を生産する強力な候補であることを示している。研究者たちは酵素の効率や代謝経路に関する課題に取り組み続けることで、リグニンを基盤としたバイオリファイナリーの可能性は、より持続可能な自然製品の供給につながるかもしれない。

オリジナルソース

タイトル: Metabolic engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for naringenin production

概要: Naringenin, a flavanone and a precursor for a variety of flavonoids, has potential applications in the health and pharmaceutical sectors. The biological production of naringenin using genetically engineered microbes is considered as a promising strategy. The naringenin synthesis pathway involving chalcone synthase (CHS) and chalcone isomerase (CHI) relies on the efficient supply of key substrates, malonyl-CoA and coumaroyl-CoA. In this research, we utilized a soil bacterium, Acinetobacter baylyi ADP1, which exhibits several characteristics that make it a suitable candidate for naringenin biosynthesis; the strain naturally tolerates and can uptake and metabolize coumarate, a primary compound in alkaline-pretreated lignin and a precursor for naringenin production. A. baylyi ADP1 also produces intracellular lipids, such as wax esters, thereby being able to provide an excess of malonyl-CoA for naringenin biosynthesis. Moreover, the genomic engineering of this strain is notably straightforward. In the course of the construction of a naringenin-producing strain, the coumarate catabolism was eliminated by a single gene knockout ({Delta}hcaA) and various combinations of plant-derived CHS and CHI were evaluated. The best performance was obtained by a novel combination of genes encoding for a CHS from Hypericum androsaemum and a CHI from Medicago sativa, that enabled the production of 18 mg/L naringenin in batch cultivations from coumarate. Furthermore, the implementation of a fed-batch system led to a significant 3.7-fold increase (66 mg/L) in naringenin production. These findings underscore the potential of A. baylyi ADP1 as a host for naringenin biosynthesis as well as advancement of lignin-based bioproduction.

著者: Suvi Santala, K. Kurnia, E. Efimova

最終更新: 2024-06-06 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.06.597799

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.06.597799.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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