植物のレジリエンスにおける微生物の役割
研究で、葉っぱの微生物が気候変動によるストレスを受けた植物をサポートする方法が明らかになった。
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気候変動による極端な天候、例えば高温、干ばつ、塩分増加は、農業や作物生産に深刻な挑戦をもたらしてる。この変化は、植物の成長や発達に影響を与え、土壌や葉っぱの微生物との関係にも影響するんだ。この関係は重要で、健康的な微生物のバランスが植物病を防ぐのに役立つから、もしバランスが崩れたら、植物病や作物の収量が減ることに繋がる。だから、植物がストレスの多い環境条件下で微生物コミュニティのバランスをどう維持するかを理解することが大事なんだ。
葉っぱの微生物の重要性
葉っぱにいるバクテリアは植物の健康にとって重要な役割を果たしてる。彼らは植物を病気から守るけど、有害な感染を防ぐためにも調整が必要なんだ。植物は有益なバクテリアを引き寄せてバランスの取れた微生物コミュニティを維持するためにいろいろな方法を発展させてきた。微生物が住む葉っぱの部分、つまりフィロスフィアは、土壌や空気からバクテリアを集められる。このプロセスは、体系的またはランダムに起こることがある。
植物の防御は、植物が病気に立ち向かうのを助けるだけでなく、葉っぱにいるバクテリアのバランスを維持する上でも重要な役割を果たしてる。たとえば、友好的なバクテリアと潜在的に有害なバクテリアの相互作用は、病気に繋がる不均衡を避けるのに役立つ。さらに、特定の植物化合物は、資源を提供したり毒性を作り出すことで、どのバクテリアが植物に引き寄せられるかに影響を与えることができる。ただ、植物の免疫が健康な植物でバクテリアがどのように集められるかにどう繋がるかは、まだもっと探求が必要なんだ。
環境が植物の免疫に与える影響
植物の免疫系は、その周りの環境に影響される。温度などのストレッサーが植物の免疫にどう影響するかはまだ研究中だけど、温度は大きな影響を示してる。例えば、適度に高い温度では、植物の防御ホルモンであるサリチル酸の生成が減少する。この減少は、植物が病原体に対して脆弱になることで病気のリスクを高めることに繋がる。一部の微生物は植物が熱ストレスに耐えるのを助けることができるので、葉っぱのマイクロバイオームが温度上昇の悪影響を和らげるかもしれない。
植物マイクロバイオームとレジリエンスの研究
私たちは、植物の免疫系が葉っぱの微生物の自然な集まりによって達成されるバランスが、植物が温度ストレスに対処するのに重要だと考えた。このアイデアを試すために、まず植物の生物学的プロセスが葉っぱのマイクロバイオームのバランスにどう影響するかを調べた。健康的だけど、葉っぱの微生物のバランスが異なるランダムな変異体植物を作ったんだ。この変異体の免疫信号が病原体や熱ストレスにどう反応するかを調査した。最終的に、バランスの取れたマイクロバイオームが温度変化による免疫応答の変化をどう補うかを評価した。
変異体植物の特徴
私たちは、ドイツのイエナから集めた特定のタイプのアラビドプシス・タリアナ、NG2エコタイプから変異体植物のライブラリを作った。化学変異誘発を使って、さまざまな変異体を生成した。第二世代では、標準植物型に比べてバクテリアの負荷が高い変異体をスクリーニングした。約5%の変異体植物がバクテリアの負荷が増加していて、これが微生物の集まり方が変わったことを示してる。一つの特定の変異体、「CLLF」と名付けたものは、最も高いバクテリアの負荷を持っていて、葉っぱが巻き込まれるなどの独特な特徴を示した。
CLLF変異体のマイクロバイオームの研究
私たちは、標準のNG2植物と変異体CLLFの完全なマイクロバイオームを調べた。ほとんど遺伝的に一貫していて、制御された環境で育てた。微生物のコロナイゼーションの違いが土壌接触によるものではないように、植物と土を分けて育てた。3週間後、CLLFの葉っぱには標準植物の約100倍のバクテリアが存在しているのが分かった。この結果は、敏感なテスト方法を通じて確認された。
さらに、CLLF変異体の葉っぱは、標準植物と比べてより多様なバクテリアの種類を引き寄せていて、よりリッチな微生物コミュニティを示唆している。さらなる分析で、二つの植物の微生物コミュニティには明確な違いがあることが分かった。
CLLFにおける微生物バランスの評価
CLLF植物の高いバクテリア負荷が健康的か問題があるかを確認するために、集めたバクテリアの種類をじっくり見た。全体的に、CLLF植物は標準植物と同じバクテリアのファミリーを含んでいたけど、特定のタイプがかなり多かった。この増加は、有害なバクテリアによる過剰成長によるものではなく、通常は不健康な微生物状態を引き起こすディスバイオシスとは違っていた。
私たちは、CLLF植物がラボ条件下で病気の症状を示すかどうかもチェックしたけど、健康を保っていた。さらに、屋外の庭での生存をテストしたところ、標準植物と同じようにうまくいった。この証拠は、CLLF変異体が高いバクテリア負荷にもかかわらず、バランスの取れた微生物コミュニティを成功裏に作り出していることを示唆している。
CLLFの強化された免疫系
私たちは、CLLF変異体の免疫系がうまく機能しているかを調べた。CLLF植物の防御ホルモンのレベルを測定したところ、標準型よりも高いことが分かり、より活発な免疫応答を示していた。無菌状態で育てた際も、CLLF植物はこれらのホルモンのレベルが高まるのを示し、これは微生物の存在によるものだけではないことが確認された。
熱ストレス時のCLLFの防御応答
高温にさらされると、植物は防御関連遺伝子の発現が低下し、感染に対して脆弱になることが一般的だ。私たちの研究では、温度の上昇中でも、CLLF植物は耐性を示し、安定した免疫応答を見せた。彼らの遺伝子発現プロファイルは、通常予想されるような大きな変化はなく、安定していた。この安定性が、彼らが病原体に対してのレジリエンスに寄与しているかもしれない。
植物の健康におけるマイクロバイオームの構成の役割
CLLF植物の免疫系とマイクロバイオームの関係をさらに理解するために、セミノトビオナ実験を行った。これは、CLLFの完全なマイクロバイオームまたは特定のグループを除く簡略化されたバージョンを使って植物に接種することを含んでいた。すべての関連する微生物が存在する際に健康的な植物成長が観察された。しかし、減少したマイクロバイオームを使用した際、標準植物は微生物の多様性の喪失によって免疫応答が増加した。
興味深いことに、減少したマイクロバイオームを持つCLLF植物は、ストレス下でも健康的な成長を維持し、彼らの頑強な免疫系が多様性の欠如を補ったことを示唆している。一方、標準植物は苦痛の兆候を示し、ストレス時に安定性を保つためにマイクロバイオームに大きく依存していることが分かった。
結論
私たちの発見は、多様な微生物コミュニティが植物の環境ストレスに対するレジリエンスを大幅に高めることができることを強調している。CLLF変異体は、高いバクテリア負荷と共存する能動的な免疫応答が、ディスバイオシスを避けるバランスを作り出す例を示している。この研究は、気候変動が農業に及ぼす影響を和らげるために、植物マイクロバイオームを意図的に強化する方法に関するさらなる研究の道を開く。植物ホルモンが有益な微生物を引き寄せる役割と、頑強な免疫系を維持することの理解が、極端な条件に耐える作物を開発するためには不可欠なんだ。
要するに、気候変動が農業に深刻なリスクをもたらす一方で、植物とその微生物コミュニティの複雑な関係が作物のレジリエンスを高める機会を提供している。将来的な戦略は、変化する環境条件下で健康と生産性を確保するために、免疫応答と微生物の負荷をうまくバランスを取れる植物を育てることを含むかもしれない。
タイトル: Immunity and bacterial recruitment in plant leaves are parallel processes whose link shapes sensitivity to temperature stress
概要: Rising global temperatures necessitate developing climate-resilient crops with better adaptability to changing climates. Under elevated temperatures, plant immunity is downregulated, putting them at risk of foliar pathogen attack. Manipulating plant defense hormones is one way to mitigate this detrimental effect. However, it is unclear how plant immunity interacts with plant microbiome assembly and how temperature will thus affect overall plant health and stability. We used chemical mutagenesis to identify a phenotypically healthy genotype of A. thaliana, "CLLF", that compared to the wild type naturally recruits an altered leaf bacteriome, including unusually high bacteria loads. Simultaneously, CLLF hyperaccumulates salicylic acid (SA) and jasmonates, has constitutively upregulated systemic and innate defenses, and has increased resistance to necrotrophic fungal and hemi-biotrophic bacterial pathogens, indicating that pathogen immunity and non-pathogen recruitment function in parallel. Growth of specific non-pathogenic leaf bacteria on SA as a carbon source suggests the same hormones may even link the two processes. CLLF also showed high tolerance to heat stress in comparison to the wild type, but SA-associated defense processes are not downregulated under heat. Synthetic community (SynCom) experiments showed that when the taxonomic diversity of bacteria available to CLLF is artificially reduced, resilience to heat stress is compromised, leading to dysbiosis, but this does not occur with the full SynCom or in the wild type with any SynCom. Thus, the downregulation of defenses in response to heat may contribute to avoidance of dysbiosis caused by some leaf bacteria, but full bacteriome taxonomic diversity can restore balance. Significance StatementPlants are living ecosystems colonized by diverse microorganisms who strongly shape host health. Understanding how balance arises in host-associated microbiomes is a key step to understanding how to preserve, manage and possibly optimize these complex ecosystems, especially in a changing climate. Using a random mutagenesis approach in a natural A. thaliana ecotype, we find that constitutively upregulated defenses are associated with both tolerance to (a)biotic threats and healthy recruitment of leaf bacteria, very likely in a direct manner. Thus, immunity and bacterial recruitment in leaves operate in parallel. Synthetic community experiments show further that this link plays important roles in shaping plant resilience to heat stress, an important consideration in developing plants more stable to climate change.
著者: Matthew T. Agler, J. Jose, E. Teutloff, S. Naseem, E. T. Barth, R. Halitschke, M. Marz
最終更新: 2024-06-10 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.10.598336
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.10.598336.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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