テンソルiSSAを使った動物の動き分析の改善
新しい方法で動物の移動や生息地の選択がよくわかるようになった。
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動物の動き方を理解することは、保全や彼らが周りにどう反応するかを知るのに大事なんだ。研究者たちはよく追跡データを使って動物の動きのパターンを調べてる。一つの方法は生息地選択分析を通じてこのデータを分析すること。この方法は、動物が環境の特徴に基づいてスペースをどう使うかを見てるんだ。
生息地選択モデルの主な目的は、異なる特徴が動物の動きの選択にどのように影響するかを測定すること。これは、様々な要因に基づいて動物が特定の場所にいる確率を見ることを含むけど、動物が物理的な制限のために場所間を自由に移動できないことも認めてる。昔は、野生動物の追跡データはあまり詳しくなかったから、研究者たちは動物が研究エリア内を独立して移動してると思ってた。だから、科学者たちは通常、資源選択分析(RSA)という方法を使って動物の位置を分析してた。
でも、技術が進んで動物をより正確に追跡できるようになったことで、彼らの動きが独立していないことがわかった。この新しい理解は、特に短時間でどれだけ移動できるかについての以前の仮定を再評価する必要があることを意味してる。研究者たちは、動物がどれだけ動けるかを考える新たな方法を提案して、ステップの長さ(2つの場所の間の距離)や向きの変化(2つのステップ間の方向の変化)に基づいてる。
このアイデアをさらに進めて、いくつかの研究者はステップ選択分析(SSA)を作ったけど、全員がこの方法を使うわけじゃない。一部の研究は、ステップの長さや向きの変化をモデルに数学的に組み込んで、動物の動きをよりよく理解できるようにした。この新しいアプローチは、統合ステップ選択分析(iSSA)として知られてて、動物がどの場所を選ぶかの可能性をその動きに基づいて推定するんだ。
例えば、ドイツでコウモリを追跡した研究では、コウモリが他のコウモリの狩りの活動に基づいて動きを調整することが示された。また別の研究では、気温がムースの動き方に影響を与え、気温が上がるとあまり動かなくなることがわかった。
伝統的に、iSSAモデルは条件付きロジスティック回帰という方法を使ってて、これはステップの長さや向きの変化が特定のパターンに従うことを仮定してる。でもこのアプローチは、動物が実際に何をしてるかを捉えきれないかもしれない。一部の研究者は、ステップの長さと向きの変化が相関している方法を調査して、この相関を分析に組み込む提案をした。コピュラという方法は、2つ以上の要因が互いにどのように影響し合うかをモデル化するのに役立つ。
さらに、環境要因が動物の動きに与える影響は必ずしも単純じゃないこともある。例えば、気温が動物の動きに線形的に影響しないかもしれないし、極端な気温は全体的に動きを減少させることもある。こういう複雑さを処理するために、一部の研究者は一般化加法モデル(GAM)を使うことを提案してて、動物の動きに影響する異なる要因の非線形な関係を捉えることができる。
その中の一つのアプローチは、GAMを使って生息地選択モデルをフィッティングしつつ、ステップの長さと向きの変化の関係を考慮すること。この組み合わせた方法は、動物が生息地内でどう動くかのより明確なイメージを提供できる。
シミュレーション研究では、研究者たちは異なるシナリオでモデルの性能をテストするために様々な条件を作り、異なる動きのパターンに基づいて動物のトラックを生成し、標準的なiSSA手法と新しいテンソル積統合ステップ選択分析(Tensor-iSSA)の両方を使って結果を分析した。
Tensor-iSSAメソッドは、ステップの長さと向きの変化の関係をより柔軟に捉えることで、動物の動きの複雑さを実際に反映することを目指してる。初期の発見では、Tensor-iSSAが特定の条件下で従来の方法よりも良い結果を出すことが示された、特に変数が相互依存している場合に。
研究者たちはその後、実データに目を向け、北ドイツで数日間追跡されたノクチュールコウモリの研究に自分たちの方法を適用した。土地利用に関する情報を共変量として使い、これらのコウモリが採餌飛行中に生息地をどう選択したのかを探った。彼らの結果は、Tensor-iSSAモデルがコウモリの動きに関する重要な詳細を捉えたことを示し、ステップの長さと向きの変化の間に明確な関係があることがわかった。短いステップはより探索的な動きに、長いステップはより直線的な移動に関連してることを示唆してる。
さらに、Tensor-iSSAモデルは、選択係数の推定における不確実性のより正確な表現を提供し、最終的には研究者が動物の行動や生息地の使用を理解するのに影響を与える。この改善された理解は保全活動に役立ち、動物の個体群や生息地の管理をより良くすることができる。
Tensor-iSSAアプローチの大きな利点の一つは、研究者が動物の動きに影響を与える異なる要因の複雑な相互作用を厳格な仮定に頼らずに探ることができるところ。この柔軟性は、動物が気候変動や生息地の喪失にどう反応するかをより良く予測する扉を開く。
研究者たちは、自分たちの方法がデータの欠落した空間的変動を考慮できることも示した。この欠落情報を含める能力は、モデルの信頼性を高め、動物の行動の推定を改善する。
さらに、研究者たちはTensor-iSSAアプローチが、個体差や動物間の変動を考慮したランダム効果など、さまざまな要因を組み込むことができるように適応できることを強調した。このように調整・洗練されたモデルを必要に応じて作成できることは、野生動物研究において有望なツールだ。
結論として、Tensor-iSSAアプローチは、異なる要因の関係をより包括的に考慮することで、動物の動きの決定をより深く理解できることを示してる。研究者がテレメトリーデータをより柔軟なモデリング技術で分析することで、より正確な予測を生み出し、実際のシナリオをより反映した保全戦略を作成することができる。
技術が進化し、データが増えることで、動物の動きに関する理解が向上する可能性はますます高まる。この洞察は、野生動物の個体群や生態系の未来の健康と持続可能性を確保する上で重要な役割を果たす。Tensor-iSSAのような革新的な方法の進化は、常に変化する世界の中で複雑な生態学的質問に対処するために研究アプローチを適応させる重要性を強調してる。
タイトル: Flexible movement kernel estimation in habitat selection analyses with generalized additive models
概要: O_LIHabitat selection analysis includes resource selection analysis (RSA) and step selection analysis (SSA). These frameworks are used in order to understand space use of animals. Particularly, the SSA approach specifies the space availability of sequential locations through a movement kernel. This movement kernel is typically defined as the product of independent parametric distributions of step lengths (SLs) and turning angles (TAs). However, this assumption may not always be plausible for real data where short SLs are often correlated with large TAs and vice versa. C_LIO_LIThe objective of this paper is to relax the need for parametric distributions using generalized additive models (GAMs) and the R-package mgcv, based on the work of Klappstein et al. (2024). For this, we propose to specify the movement kernel as a bivariate tensor product, rather than independent distributions of SLs and TAs. In addition, we account for residual spatial autocorrelation in this GAM-approach. C_LIO_LIUsing simulations, we show that the tensor product approach accurately estimates the underlying movement kernel and that the fixed effects of the model are not biased. In particular, if the data are simulated with a copula distribution for SL and TA, i.e. if the independence assumption for SL and TA does not hold, the GAM approach produces better estimates than the classical approach. In addition, including a bivariate tensor product in the model leads to a better uncertainty estimation of the model parameters and a higher predictive quality of the model. C_LIO_LIIncorporating a bivariate tensor product solves the problem of assuming parametric distributions and independence between SLs and TAs. This offers greater flexibility and makes the analysis of real data more reliable. C_LI
著者: Rafael Arce Guillen, J. Pohle, F. Jeltsch, M. Roeleke, B. Reineking, N. Klappstein, U. Schlägel
最終更新: 2024-07-01 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.27.600970
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.27.600970.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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