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研究が明らかにしたSARS-CoV-2の重要な宿主因子

研究がCOVID-19治療のための重要な細胞成分を明らかにした。

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SARS-CoVSARS-CoV2の重要な要因が明らかになった-19の治療法につながるかもね。新しい発見があれば、もっと良いCOVID
目次

COVID-19パンデミックが始まって以来、SARS-CoV-2というウイルスが世界中で7億7500万人以上に感染し、700万人以上の死者を出してる。過去にも、SARS-CoV-1(2003年)やMERS(2012年)など、他のコロナウイルスが人に深刻な病気を引き起こしてきた。ワクチンや治療法が登場しても、ワクチンを受けたくない人、不平等なワクチン配布、免疫反応を回避して広がる新しい変異株などの問題で、SARS-CoV-2はまだ大きな健康リスクを持ってる。

SARS-CoV-2と戦うためには、このウイルスが宿主の体とどう相互作用するかを詳しく調べる必要がある。この相互作用を研究することで、SARS-CoV-2についてもっと知り、より良い治療法を開発できる。

SARS-CoV-2って何?

SARS-CoV-2はコロナウイルス科に属するウイルスの一種。外層があって、RNAを遺伝子材料として使ってるウイルスがこの科には含まれる。ウイルス粒子は丸くて、ヒト細胞にくっついて入るためのスパイクタンパク質で覆われている。細胞の中に入ると、ウイルスはRNAを放出して、それを元に自分を複製するためのタンパク質が作られる。

ウイルスは、ACE2という特定の受容体を含むさまざまな細胞の成分を利用して、細胞に入ることができる。CRISPRと呼ばれる手法を使った以前の研究によって、ウイルスが複製するために宿主細胞で必要な重要な因子や経路が特定されてる。しかし、これらの研究の多くはウイルスのライフサイクルの初期段階に焦点を当てていて、増殖後にウイルスが細胞から出る方法についての詳細が抜け落ちてた。

研究のアプローチ

この研究では、SARS-CoV-2のライフサイクルのすべての段階に関与する宿主因子を探すために、異なるスクリーニング手法を使用した。研究者たちは、RNA干渉法(siRNA)を使って、ウイルスが細胞に感染し、RNAを複製し、細胞から出るために重要な宿主因子を見つけた。この研究から得た洞察は、新しい抗ウイルス治療法の設計に役立つかもしれない。

研究者たちは最初にCaco-2という特定の細胞株を使って実験を行った。この細胞は自然にACE2受容体を発現していて、SARS-CoV-2の感染を研究するのに適している。さまざまな細胞遺伝子をsiRNAでターゲットにすることで、特定の遺伝子をノックアウトしたときにウイルスの複製能力がどう変わるかを見ることができた。

スクリーニングからの発見

スクリーニングでは、ウイルスの複製を助ける253の宿主因子が特定された。また、ウイルスの複製を制限しているように見える81の因子も観察された。研究者たちは、これらの細胞因子125についてさらに詳細に研究し、SARS-CoV-2の複製における役割を確認した。

多くの特定された因子が細胞内のタンパク質輸送、免疫応答の調整、細胞構造の維持など、さまざまな生物学的プロセスに関与していることがわかった。スクリーニングの結果は、SARS-CoV-2のライフサイクルにおける重要な因子、特にウイルスの複製や細胞からの放出に関与する因子を明らかにした。

宿主因子とウイルスの相互作用

次のステップでは、特定された宿主因子をSARS-CoV-2のライフサイクルの特定の段階にマッピングすることにした。研究者たちは、HSPG2(Perlecanとして知られる)という重要な宿主因子が、ウイルスが細胞に入るのを助ける重要な役割を果たすことを発見した。この因子は細胞を囲む支持構造である細胞外マトリックスに存在し、SARS-CoV-2のスパイクタンパク質と直接相互作用する。

この相互作用を確認するために、研究者たちはヒト細胞からPerlecanを単離し、スパイクタンパク質がそれに結合する実験を行った。これにより、Perlecanがウイルスがヒト細胞に付着し、入るのを助ける可能性があることが示唆された。

ウイルス複製の分析

研究者たちは次に、宿主因子がSARS-CoV-2のライフサイクルのさまざまな段階、特にウイルスの侵入、RNAの複製、粒子の放出にどのように影響するかを調べた。いくつかの因子がウイルスの侵入に大きな影響を与える一方で、ウイルスRNAの複製には影響しないことがわかった。特定の宿主因子をノックアウトすると、細胞から放出される感染性ウイルス粒子の量が減ることもあった。

合計で、ウイルスのライフサイクルの後半、特に粒子の放出に重要な27の宿主因子が特定され、感染の初期段階には影響しないことが示された。これらは新しく形成されたウイルス粒子を細胞の表面に移動させるために必要な小胞輸送に関与するタンパク質だった。

幅広い抗ウイルスターゲットの可能性

同様の宿主因子が他のコロナウイルスにも必要かもしれないことを認識して、研究者たちは特定された因子をSARS-CoV-1やMERSなどの関連ウイルスに対してもテストした。その結果、SARS-CoV-1、SARS-CoV-2、MERSに重要な17の因子が見つかった。これらの共通因子を特定することで、特定のウイルスに特化せず、複数のコロナウイルスに対して効果的な治療法を開発する可能性が広がる。

宿主因子の薬理学的阻害

この研究では、特定の宿主因子をターゲットにした治療戦略の可能性も探った。ウイルスの複製を助ける経路を調節する宿主因子BIRC2が発見され、Smac模倣薬と呼ばれる小分子阻害剤を使用することで、BIRC2を阻害するとSARS-CoV-2の複製が細胞培養やマウスモデルで効果的に減少することが示された。

感染したマウスにBIRC2の阻害剤を投与した結果、肺に存在するウイルスの量が大幅に減少した。長期使用は体重減少や生存に影響を与えたけど、この結果はBIRC2がCOVID-19のための新しい抗ウイルス薬の開発に有望なターゲットであることを示している。

将来の治療への影響

この研究は、SARS-CoV-2が宿主細胞とどのように相互作用するかを理解することの重要性を強調してる。ウイルスの侵入、複製、放出のための重要な宿主因子をスムーズに特定することで、新しい治療法の道を開く貴重な洞察を提供してる。

これらの宿主因子をターゲットにすることは特に魅力的で、複数のコロナウイルスに対抗できる幅広い抗ウイルス療法を生み出す可能性がある。未来のアウトブレイクに備える手助けになるかもしれない。

結論

SARS-CoV-2と関連する宿主因子を見つけようとする努力は、そのライフサイクルに関する知識を広げ、新しい治療戦略の可能性を示してる。ウイルスと宿主の相互作用に焦点を当てることで、抗ウイルス治療の重要なターゲットになりうる主要なタンパク質が特定された。科学者たちがこれらの相互作用を研究し続けることで、COVID-19や他の似たようなウイルスの脅威に立ち向かう効果的な薬が開発されることが期待される。

この研究は、ウイルス感染を理解し、それに対処する効果的な解決策を見つけるための協力的で包括的なアプローチの必要性を示している。

オリジナルソース

タイトル: Global siRNA Screen Reveals Critical Human Host Factors of SARS-CoV-2 Multicycle Replication

概要: Defining the subset of cellular factors governing SARS-CoV-2 replication can provide critical insights into viral pathogenesis and identify targets for host-directed antiviral therapies. While a number of genetic screens have previously reported SARS-CoV-2 host dependency factors, these approaches relied on utilizing pooled genome-scale CRISPR libraries, which are biased towards the discovery of host proteins impacting early stages of viral replication. To identify host factors involved throughout the SARS-CoV-2 infectious cycle, we conducted an arrayed genome-scale siRNA screen. Resulting data were integrated with published datasets to reveal pathways supported by orthogonal datasets, including transcriptional regulation, epigenetic modifications, and MAPK signalling. The identified proviral host factors were mapped into the SARS-CoV-2 infectious cycle, including 27 proteins that were determined to impact assembly and release. Additionally, a subset of proteins were tested across other coronaviruses revealing 17 potential pan-coronavirus targets. Further studies illuminated a role for the heparan sulfate proteoglycan perlecan in SARS-CoV-2 viral entry, and found that inhibition of the non-canonical NF-kB pathway through targeting of BIRC2 restricts SARS-CoV-2 replication both in vitro and in vivo. These studies provide critical insight into the landscape of virus-host interactions driving SARS-CoV-2 replication as well as valuable targets for host-directed antivirals.

著者: Laura Martin-Sancho, X. Yin, Y. Pu, S. Yuan, L. Pache, C. Churas, S. Weston, L. Riva, L. M. Simons, W. Cisneros, T. Clausen, P. de Jesus, H. N. Kim, D. Fuentes, J. Whitelock, J. Esko, M. Lord, I. Mena, A. Garcia-Sastre, J. Hultquist, M. Frieman, T. Ideker, D. Pratt, S. Chanda

最終更新: 2024-07-10 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.10.602835

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.10.602835.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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