希少疾患の課題に挑む
研究が、稀な病状を持つ患者の発作に対する遺伝的な関連性を明らかにした。
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全世界で約4億4600万人が希少疾患に苦しんでいて、これは世界人口の約6%にあたるんだ。これらの病気は診断が難しいことが多いし、患者が非常に少ないから、正しい診断が出るまでに何年もかかる場合もあって、無数の検査を受けたり、時には誤った結論に至ったりすることもあるんだ。診断が出た後も、有効な治療法は通常限られてる。既存の薬剤を別の病気に使う薬の再利用は、これらの希少ケースには適用できないことが多いから、難しいんだ。患者の数が少ないから、資金提供機関に研究への投資を納得させるのが大変なんだよね。保険会社も十分な支援を提供しないことが多くて、患者にとってはさらに厳しい状況になる。
希少疾患の遺伝的性質
大半の希少疾患は遺伝的要因があって、約85%は遺伝子の問題が原因だと言われてるんだ。主に劣性の状態に分類されるよ。つまり、病気が現れるためには、両親から不完全な遺伝子が2つとも遺伝されなきゃいけないんだ。例えば、鎌状赤血球貧血は、HBB遺伝子の2つのコピーが同じ変異を持っているときに起こるんだ。逆に、劣性状態は、各親から異なる不完全なコピーを受け取ったときに起こることがあって、これを複合ヘテロ接合体変異って言う。嚢胞性線維症なんかがその例で、CFTR遺伝子の両方のコピーが異なる変異の影響を受けてるんだ。
これらの劣性疾患の患者は、親が健康そうに見える家族から来ることが多いけど、家系に似た病歴があることがある。知られている有害な変異の他に、同じ遺伝子の中の他の変異が、軽度から重度のさまざまな症状を引き起こすことがあるんだ。例えば、CFTR遺伝子では約1,700の異なる変異が、いろんな症状の嚢胞性線維症を引き起こすことがあるんだ。
面白いことに、CFTR遺伝子の健康なコピーと不完全なコピーを持つ健康そうな人も、嚢胞性線維症に関連する軽度の症状を示すことがある。これによって、病気のより軽い形態が、科学者に希少疾患に関わる生物学的プロセスを学ぶ手助けになるかもしれないんだ。
UDN)
未診断疾患ネットワーク (2014年に、診断が難しい非常に希少な状態に苦しむ患者を助けるために、未診断疾患ネットワーク (UDN) が作られたんだ。これらの患者はユニークなケースで、「N-of-1」って呼ばれることもある。彼らの症状が非常に珍しいから、同じ状態の人を見つけるのが難しいんだ。ほとんどのUDN患者は、散発的または疑わしい劣性状態を持っていて、複数の身体システムに影響を及ぼすことがあるんだ。
これらの希少な状態を、似た遺伝的変異を持つ健康な人と一緒に研究することで、特定の症状の原因についての洞察を得られることがある。これが、希少疾患患者の診断や治療の改善につながるんだ。
研究の概要
この研究では、非常に希少な障害に関連する特定の遺伝子を見ていて、特に発作のある患者に焦点を当てたんだ。発作はさまざまな原因で起こるし、多くの場合、複雑な生物学的経路の結果なんだ。これらの原因を理解することで、研究者がより良い治療法や治療法を見つける手助けになるんだ。
各UDN患者について、彼らの状態に関連付けられた可能性のある遺伝子を持つ健康な個体を探して、研究者は英国バイオバンクと呼ばれる大きなデータセットを利用して、多くの個人の情報から遺伝的変異と様々な症状との関連を見つけたんだ。
データ収集と分析
UDN患者のデータは収集されて、研究者に提供されるんだ。これには遺伝情報や症状の詳細が含まれてる。研究者は、発作に関連する遺伝子が少なくとも1つある患者に焦点を当てて、患者データを絞り込んだんだ。遺伝的変異を示唆する組み合わせを持つ患者に特に目を向けたんだよ。
合計で、UDN患者に関連する発作に結びついた130の遺伝子を特定したんだ。次のステップは、これらの患者とUK Biobankの健康な個体を比較して、特定した遺伝子に関連する共通の症状を見つけようとしたんだ。
研究からの結果
データを調べた結果、いくつかの興味深いパターンが見つかったんだ。UDN患者と健康な個体の両方に有害な変異が見られた特定の遺伝子がいくつかあったんだ。特に6つの遺伝子が、発作に関連する可能性のある症状との有望な関連を示したんだ:
1. MPO遺伝子
MPO遺伝子に変異がある患者は、異常な白血球数を示し、これは感染を示すことが多いんだ。1人のUDN患者は感染に関連する発作を経験していて、これが彼女の健康問題、特に痛みを伴う症状による睡眠問題に影響されている可能性があるんだ。
2. P2RX7遺伝子
この遺伝子は、血液中の炎症マーカーに関連していたんだ。1人の患者は両側の強直性・間欠的発作を経験していて、これは体の炎症に関連しているかもしれない。炎症はてんかんと関連付けられていて、炎症が発作を引き起こしたのか、あるいは発作の結果なのか疑問を呼ぶんだ。
3. PIGQ遺伝子
この遺伝子の変異は消化問題に関連していて、なぜか一部の患者が消化器症状と発作の両方を経験するかの理由を説明できるかもしれない。神経系と消化系を繋ぐ細胞機能に関与していて、異なる身体機能との間の複雑なつながりを浮き彫りにしているんだ。
4. SQSTM1遺伝子
この遺伝子を持つ患者は骨成長障害の兆候を示していて、1人のUDN患者は異常な動きと小さい頭蓋骨を持っていたんだ。これが発作のリスクを高める可能性があるんだ。異常な成長は脳への圧力に影響を与えることがあって、発作活動を引き起こすかもしれない。
5. COL27A1遺伝子
この遺伝子は骨の形態異常に関係していて、関連するUDN患者は手術を必要とするいろんな骨の問題を抱えていたんだ。患者の頭蓋骨の問題は、発作に寄与している可能性があって、身体的異常が脳機能に影響を与えることを強調しているんだ。
6. CACNA2D2遺伝子
この遺伝子の変異を持つ患者は、異常な赤血球生成に関連する兆候を示しているんだ。1人のUDN患者は健康な赤血球が不足していることを示す症状を呈していて、これが脳への酸素供給を減らして、発作を引き起こす可能性があるんだ。
結論と今後の方向性
希少疾患は、診断と治療の両面で重大な課題をもたらすんだ。進行中の努力にもかかわらず、現在、希少疾患のうち治療法が利用可能なのは約6%だけなんだ。希少疾患と一般人口の症状との関連を探ることで、より良い治療アプローチが導き出されるかもしれないんだ。
UDN患者を大きなデータセットと一緒に分析することで、研究者は希少疾患についての理解を広げられるんだ。この研究は、これらの状況の複雑さを強調していて、発作を引き起こすメカニズムが必ずしも神経的な問題から直接生じるわけではなく、他の身体システムが関与している可能性も示唆しているんだ。
今後の研究は、これらの発見を基に、異なる初期症状を持つ患者を調べたり、より進んだ遺伝子テストを使用してさらなる関連を明らかにすることができるかもしれない。目標は、複雑なニーズに対応する新しい方法を特定することで、希少疾患に苦しむ患者の生活を改善することなんだ。
タイトル: Phenotypic overlap between rare disease patients and variant carriers in a large population cohort informs biological mechanisms
概要: The biological mechanisms giving rise to the extreme symptoms exhibited by rare disease patients are complex, heterogenous, and difficult to discern. Understanding these mechanisms is critical for developing treatments that address the underlying causes of diseases rather than merely the presenting symptoms. Moreover, the same dysfunctional biological mechanisms implicated in rare recessive diseases may also lead to milder and potentially preventable symptoms in carriers in the general population. Seizures are a common, extreme phenotype that can result from diverse and often elusive biological pathways in patients with ultrarare or undiagnosed disorders. In this pilot study, we present an approach to understand the biological pathways leading to seizures in patients from the Undiagnosed Diseases Network (UDN) by analyzing aggregated genotype and phenotype data from the UK Biobank (UKB). Specifically, we look for enriched phenotypes across UKB participants who harbor rare variants in the same gene known or suspected to be causally implicated in a UDN patients recessively manifesting disorder. Analyzing these milder but related associated phenotypes in UKB participants can provide insight into the disease-causing molecular mechanisms at play in the rare disease UDN patient. We present six vignettes of undiagnosed patients experiencing seizures as part of their recessive genetic condition, and we discuss the potential mechanisms underlying the spectrum of symptoms associated with UKB participants to the severe presentations exhibited by UDN patients. We find that in our set of rare disease patients, seizures may result from diverse, multi-step pathways that involve multiple body systems. Analyses of large-scale population cohorts such as the UKB can be a critical tool to further our understanding of rare diseases in general.
著者: Shilpa Nadimpalli Kobren, L. Fitzsimmons, Undiagnosed Diseases Network, B. K. Beaulieu-Jones
最終更新: 2024-04-19 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.04.18.24305861
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.04.18.24305861.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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