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# 生物学# ゲノミクス

葉さび病に対する小麦の強化

研究によって、葉さび病に対抗するための寒冷地冬小麦の遺伝的抵抗性が特定された。

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小麦の抵抗性研究小麦の抵抗性研究的抵抗性があることがわかった。研究によると、有害な葉のさびに対する遺伝
目次

小麦は世界中で栽培されている主要な食料作物で、アメリカの農業セクターでも重要な役割を果たしていて、トウモロコシや大豆に次いで3番目の位置を占めてるんだ。最近、アメリカでの小麦生産量はかなりの水準に達していて、毎年何百万バスケットも収穫されてる。ほとんどの小麦は冬小麦、特に硬い冬小麦(HWW)が主にアメリカの大平原で育てられてるけど、小麦農家は病気、特にさび病からの大きな課題に直面してる。これは収量を大幅に減少させる可能性があるんだ。

さび病と小麦

いろんな病気の中でも、葉さび病が一番一般的で、これはプッチニア・トリティシナというカビが引き起こすんだ。このカビには多くの異なる系統があって、さまざまな種類の小麦に効果的に攻撃できるんだ。アメリカでは、農家が毎年このカビの多様なレースを報告していて、商業用の小麦品種の抵抗性をすぐに克服できるように素早く適応することがわかる。

小麦の植物は、葉さび病に対抗するための特定の遺伝子、つまり葉さび病抵抗性(Lr)遺伝子を持っていて、これらの遺伝子は2つのタイプに分けられるんだ:苗の抵抗性(ASR)と成株の抵抗性(APR)。苗の抵抗性遺伝子は通常非常に効果的だけど、カビの病原性株が急速に発展する原因になることもある。一方で、成株の抵抗性遺伝子はより耐久性のある抵抗性を提供するけど、若い植物の時にはあまり効果がないんだ。

小麦のLr遺伝子の現状

今のところ、多くのLr遺伝子が小麦で特定されてるけど、現在のカビの系統に対して有用なものはすべてではないんだ。これらの遺伝子のいくつかはすぐに効果を失う。特定の抵抗性遺伝子を持った小麦の育種で成功したことはあるけど、ゆっくりさび病に抵抗する遺伝子の特定はほんの数例しかないんだ。この状況は、葉さび病に効果的に抵抗できる小麦品種がもっと必要であることを示してる。

小麦の抵抗性に関する遺伝子研究

最近の技術の進歩により、研究者が小麦のゲノムを調べて、葉さび病抵抗性に関連する遺伝的マーカーを特定するのが楽になったんだ。これらのマーカーは、病気抵抗性に関連する特定の特性を植物の遺伝的構造と結びつけるのに役立つ。研究者が使う一般的な方法の一つは、全ゲノム関連解析(GWAS)と呼ばれるもので、このアプローチを使うことで、病気抵抗性に寄与する特定の遺伝子座を特定することができる。

さまざまなタイプの小麦を使ったGWASの研究がすでにいくつか行われて、葉さび病抵抗性に関連するリンクを探ってるけど、硬い冬小麦に特化した包括的なGWASは行われていない。今回の研究は、新しい葉さび病抵抗の源を見つけ、背後にある遺伝的基盤を理解することを目的としているんだ。

研究材料と方法

植物素材と遺伝子型解析

この研究を行うために、アメリカの大平原のさまざまな育種プログラムから硬い冬小麦の育種ラインと品種のコレクションを取得したんだ。これらの育種ラインは、病気に対する抵抗性の可能性があるものを選んで、葉さび病に対する抵抗性を高めるために選ばれてる。遺伝子型は、特定の遺伝的マーカーを同定するために高度な遺伝子解析技術を使って分析された。

苗段階での葉さび病評価

これらの小麦ラインが葉さび病にどれだけ抵抗できるかをテストするために、研究者たちはそれを苗段階でいくつかのカビのレースに対して評価したんだ。植物は制御された条件下で育てられ、葉さび病にだけさらされるようにした。病気の重症度は、植物を抵抗性または感受性と分類する助けとなる特定のスケールを使って評価された。

成株段階での葉さび病評価

苗評価に加えて、小麦ラインはフィールドで成株段階でもテストされた。これにより、植物が実際の条件で葉さび病にどれだけ抵抗できるかを見ることができた。評価では、葉の面積がどれだけ葉さび病の膿胞で覆われていたかと、植物が示した感染応答の種類が考慮された。

データ分析

研究者たちは、評価中に収集されたデータを分析するために統計技術を使用した。異なる遺伝的マーカーと葉さび病抵抗性との関係を調べて、この分析は小麦植物におけるさび病への改善された抵抗性に関連する遺伝的マーカーを特定するのを助けた。

結果

苗段階での葉さび病応答

研究は、葉さび病の異なるレースに対する小麦の遺伝子型の反応の範囲を特定したんだ。いくつかの遺伝子型は強い抵抗性を示した一方で、他のものは感受性を示した。かなりの数の遺伝子型が効果的な抵抗遺伝子を持っていることを示唆する反応を示した。

成株段階での葉さび病応答

成株段階では、結果が抵抗性と感受性の小麦遺伝子型の明確な区別を示したんだ。フィールドテストで高い抵抗性を示した遺伝子型がかなりの割合を占めていて、効果的な抵抗Traitsが存在することを確認した。異なる環境では、病気圧力の異なるレベルが観察され、さまざまな条件での病気抵抗性の研究の必要性がさらに強調された。

リンケージ不平衡と集団構造

リンケージ不平衡は、異なる遺伝的マーカーが偶然よりも一緒に相続される頻度を示していて、これを分析することで研究している小麦遺伝子型の集団の遺伝的構造についての洞察が得られるんだ。結果は、遺伝的マーカーが評価された小麦ラインのグループ内の多様性を理解するのに役立つことを示してた。

ゲノムワイド関連マッピング

収集されたデータを使用して、研究者は苗段階と成株段階の両方で葉さび病応答と有意に関連する多くの遺伝的マーカーを特定したんだ。特に興味深いマーカーがいくつか見つかって、これらは両方のタイプの抵抗性と関連してた。結果は、新しい抵抗遺伝子を潜在的に保持しているゲノム内のユニークな位置を指し示していて、将来の育種プログラムに対して有益な情報を提供するんだ。

結論

この研究は、硬い冬小麦の葉さび病抵抗性の遺伝的基盤についての洞察を提供するものなんだ。効果的な抵抗遺伝子とそれらが特定の遺伝的マーカーと関連することを特定することで、研究者たちは小麦の育種努力を強化することを望んでる。調査結果は、耐久性のある葉さび病抵抗性を持つ品種をもっと開発することが可能であることを示唆していて、進化する葉さび病カビのもたらす課題に対処するために必要なんだ。

この研究から得られた知識は、小麦生産の未来に大きな影響を与える可能性があって、農家に葉さび病と戦うためのより良い道具を提供し、より安定した食料供給を確保するのに役立つんだ。遺伝学と育種方法の進歩が続いている中で、強靭な小麦品種の開発の見通しは明るいと思う。

要するに、効果的な抵抗源を特定し、その背後にある遺伝的基盤を理解することが、小麦の最も破壊的な病気に対する戦いで重要になるんだ。これらの努力が、グレートプレーンズやその先の農家にとって健康的な作物と向上した収量につながることを望んでる。

オリジナルソース

タイトル: Identification of leaf rust resistance loci in hard winter wheat using genome-wide association mapping

概要: Leaf rust, caused by Puccinia triticina (Pt), is a serious constraint to wheat production. Developing resistant varieties is the best approach to managing this disease. Wheat leaf rust resistance (Lr) genes have been classified into either all-stage resistance (ASR) or adult-plant resistance (APR). The objectives of this study were to identify sources of leaf rust resistance in contemporary U.S. hard winter wheat (HWW) and to dissect the genetic basis underlying leaf rust resistance in HWW. A panel of 732 elite HWW genotypes was evaluated for response to U.S. Pt races at the seedling stage and at the adult plant stage in leaf rust nurseries in Oklahoma, Texas, and Kansas. Further, the panel was genotyped using Multiplex Restriction Amplicon Sequencing (MRA-Seq) and DNA markers linked to the known ASR genes Lr18, Lr19, Lr21, Lr24, Lr37, and Lr42 and APR genes Lr34, Lr46, Lr67, Lr68, Lr77, and Lr78. Single nucleotide polymorphism (SNP) markers derived from MRA-Seq, DNA markers linked to the known Lr genes, and the phenotypic data were used for genome-wide association study (GWAS) to identify markers associated with leaf rust response. Gene postulation based on leaf rust reactions, DNA markers, and GWAS suggested the presence of Lr1, Lr2a, Lr10, Lr14a, Lr16, Lr18, Lr19, Lr21, Lr24, Lr26, Lr34, Lr37, Lr39, Lr42, Lr46, Lr68, Lr77, and Lr78 in the HWW panel. The GWAS identified 59 SNPs significantly associated with leaf rust response, of which 20 were likely associated with novel resistance loci and can be used to enhance wheat leaf rust resistance.

著者: Meriem Aoun, I. P. Lakkakula, J. A. Kolmer, R. Sharma, P. St. Amand, A. Bernardo, G. Bai, A. Ibrahim, R. L. Bowden, B. F. Carver, J. D. Boehm

最終更新: 2024-10-13 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.09.617432

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.09.617432.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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