ブラジルにおける結核のリファンピシン耐性の評価
研究は、2017年から2023年にかけてブラジルの結核における薬剤耐性のトレンドを分析している。
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結核(TB)は主に肺に影響を与える深刻な感染症だけど、体の他の部分にも影響を及ぼすことがあるんだ。世界保健機関(WHO)は、特定の薬、特にリファンピシンに対して耐性を持つために、標準治療に反応しない形のTBを発症する人もいるって指摘してる。2022年には、約41万人がこの耐性のあるTBを発症したと推定されてる。
TBの標準治療にはリファンピシンが重要な要素として含まれているんだけど、薬剤耐性のTBにかかると治療がすごく難しくなる。これが原因で、治療失敗や死のリスクが高まることがある。加えて、薬剤耐性を確認するためのルーチンテストが広く使われてない場所では、問題がさらに悪化するんだ。多くの国では、薬剤耐性を調べるために大規模な調査に依存していて、これらの調査は高額であまり頻繁には行われていない。
薬剤耐性の監視の重要性
リファンピシンに対する耐性を見つけるのは、TBの薬剤耐性を確認する際に特に重要なんだ。TBがリファンピシンとイソニアジドの両方に耐性がある場合は、多剤耐性結核(MDR-TB)と呼ばれる。Xpert MTB/RIFのような迅速診断テスト(RDT)は、TBとその薬剤耐性を迅速に検出するための便利なツールとして登場したんだ。これらのテストが導入されてから、RDTはルーチンのTBケアに組み込まれてきて、2023年には新たに診断されたTB患者のほぼ半数がこれらのキットでテストされたんだ。
RDTの使用が増えることで、薬剤耐性のTBケースを観察する新たな機会が生まれている。これらのテストは、患者の間の薬剤耐性に関する重要なデータを集めるのに役立つ。ただし、すべての患者がテストを受けられない場合や、テストを受ける人に明らかな違いがある場合、情報が歪む可能性があるんだ。たとえば、耐性が高いと知られている地域でテストが多く行われると、実際の耐性率よりも高い結果が出るかもしれない。
薬剤耐性を予測する際にバイアスの可能性を最小限に抑えるためには、収集したデータが完全であることが重要なんだ。WHOには、TBケースの高い割合がテストされていない限り、ルーチンで収集したデータを監視に使用しないことを推奨するガイドラインがある。これは、多くの国で薬剤耐性の推定が古い調査データに依存していることを意味していて、現在の状況を反映していないかもしれない。
ブラジルにおけるデータ収集
ブラジルはTBの影響を大きく受けている国として特定されているけど、リファンピシン耐性TBの影響はそれほどでもない。ブラジルでの最後の重要な薬剤耐性調査は2006年から2008年にかけて行われ、多くの人がそのデータが古いと見なしている。迅速診断テストは2014年にブラジルに導入され、2023年にはかなりの割合の症例がXpertを使ってテストされたんだ。
ブラジルのTB症例を分析するために、国家指定疾患情報システムからデータが収集された。このデータベースには、報告されたすべてのTB症例に関する重要な人口統計情報や健康情報が含まれている。この分析は、2014年から2023年に診断された症例に焦点を当て、死後診断されたものや他の施設に移されたものは除外した。患者は、新たに診断された症例(TB治療を受けたことがない人)と以前治療を受けた症例(以前に治療を受けたことがある人)に分類された。
バイアスが耐性推定に与える影響
各TB患者に対して、リファンピシン耐性があるかどうかを決定する特定の情報があるんだ。患者に耐性検査の記録があっても、すべての患者がテストを受けていなければ、全体の状況を正しく表していないかもしれない。テストがすべての患者グループで一貫して行われていない場合、バイアスのリスクが高まるんだ。
とはいえ、バイアスを引き起こす要因が知られ、それを考慮に入れれば、信頼できる推定を行うことができるんだ。この分析では、ブラジルのデータを使ってリファンピシン耐性のより正確な状況を作り出す方法が開発された。この方法は主に二つのステップから成り立っていて、まず観察された症例に基づいて患者がリファンピシン耐性を持つ可能性を推定し、次にそのデータを使ってテスト結果がない人のギャップを埋めることだよ。
TB症例における薬剤耐性のモデル化
さまざまな州からのデータを基に、患者のテスト結果が耐性だったかどうかを推定するための統計モデルが作られた。このモデルは、時間の流れ、地理的な違い、年齢や健康状態といった個々の特徴など、さまざまな要因を考慮するんだ。
このモデルは、特に有効な耐性検査結果を持つ患者に焦点を当ててる。新たに診断された患者と以前に治療を受けた患者のために別々のモデルが作られて、正確な予測ができるようになってる。主な分析は、2017年から2023年のデータに焦点を当てていて、この期間はテストカバレッジが大幅に改善されているからね。
欠損しているテスト結果の補填
いろいろな理由でテスト結果がなかった患者、たとえば検出できなかったり、全くテストを受けていなかったりする患者に対しては、モデルを使ってリファンピシン耐性を持っている確率を推定したんだ。観察されたデータと推定されたデータを組み合わせることで、TB症例における薬剤耐性のより明確な状況が生成されたんだ。
結果の分析
リファンピシン耐性の全体的な推定と総通知数が計算された。これには、実際のテスト結果とテストを受けていない人の推定値が含まれているんだ。これらの推定は、結果が無作為に欠損していると仮定したより簡単な計算方法と比較された。
時間が経つにつれて、テストカバレッジが増加するにつれ、リファンピシン耐性の有病率の推定値は、簡単な方法で計算されたものよりも高くなることがわかったんだ。これは、簡単なアプローチが、特に新たに診断された症例の中で耐性の発生を過小評価していたことを示している。
ブラジルにおけるTB耐性の傾向
2017年から2023年の間に、リファンピシン耐性のTB症例の数がブラジルで増加していると推定された。この期間中、新しい患者と以前に治療を受けた患者の両方で耐性の有病率、つまり耐性のある症例の割合は減少した。
ただし、ブラジルのさまざまな州ではリファンピシン耐性の有病率に大きな違いがあった。いくつかの州では、耐性の割合が比較的高かった一方で、他の州ではずっと低かった。この不均一な分布は、地域ごとの公衆衛生対策の必要性を浮き彫りにしているんだ。
WHOの推定との比較
モデルの結果をWHOの推定と比較すると、重要な違いが見られた。この研究のために開発されたモデルは、特に新しいTB症例を見たときに、ブラジルに関するより正確な推定を提供した。2022年のデータでは、モデルは新たに診断された症例の耐性の割合がWHOが報告したものよりも高いことを示しているんだ。
これらの不一致は、薬剤耐性を推定するために使用される方法の違いから生じる。WHOは、歴史的データや隣国からの推定に依存しているけど、この研究のモデルは、より最近のテストデータを使用しているから、より正確な結果が得られる可能性があるんだ。
研究の限界
この研究で開発されたアプローチは貴重な情報を提供するけど、いくつかの限界も認めなきゃいけない。一つの大きな懸念は、この方法の精度が、テストや耐性に影響を与える要因に関する完全な情報を持っていることに依存していることだ。欠落している要因や考慮されていない要因があれば、推定にバイアスが残り続ける可能性がある。
さらに、この分析は主に公的なテストデータに焦点を当てているから、私設で処理される多くの症例がカバーされていないと全体像が見えないかもしれない。このアプローチは、耐性レベルが時間とともに変動する理由を調査することには重点を置いていないけど、代わりに異なる変数間の関連性を強調しているんだ。
最後に、このモデルはTB診断時のリファンピシン耐性の有病率を反映することを目指しているけど、患者が治療中に薬剤耐性を発現する可能性を考慮していないんだ。
結論
ブラジルのTBケースにおけるリファンピシン耐性を分析するために開発された方法は、完璧なテストカバレッジがない状況でも、既存のデータを使って洞察を得る可能性を示している。得られた結果は、薬剤耐性に関する重要な傾向を明らかにしており、公衆衛生戦略においてより注目すべき地域を浮き彫りにしているんだ。
薬剤耐性のレベルやその影響要因を理解することで、公衆衛生当局はTBがもたらす課題にもっと対処できるし、多くの人が必要なケアを受けられるようにアプローチを調整できるんだ。この研究は、今後の研究や健康アウトカムを改善するためのより強力な監視システムへの道を開いているよ。
タイトル: Surveillance for TB drug resistance using routine rapid diagnostic testing data: Methodological development and application in Brazil
概要: Effectively responding to drug-resistant tuberculosis (TB) requires accurate and timely information on resistance levels and trends. In contexts where use of drug susceptibility testing has not been universal, surveillance for rifampicin-resistance--one of the core drugs in the TB treatment regimen--has relied on resource-intensive and infrequent nationally-representative prevalence surveys. The expanded availability of rapid diagnostic tests (RDTs) over the past decade has increased testing coverage in many settings, however, RDT data collected in the course of routine (but not universal) use may provide biased estimates of resistance. Here, we developed a method that attempts to correct for non-random use of RDT testing in the context of routine TB diagnosis to recover unbiased estimates of resistance among new and previously treated TB cases. Specifically, we employed statistical corrections to model rifampicin resistance among TB notifications with observed Xpert MTB/RIF (a WHO-recommended RDT) results using a hierarchical generalized additive regression model, and then used model output to impute results for untested individuals. We applied this model to case-level data from Brazil. Modeled estimates of the prevalence of rifampicin resistance were substantially higher than naive estimates, with estimated prevalence ranging between 28-44% higher for new cases and 2-17% higher for previously treated cases. Our estimates of RR-TB incidence were considerably more precise than WHO estimates for the same time period, and were robust to alternative model specifications. Our approach provides a generalizable method to leverage routine RDT data to derive timely estimates of RR-TB prevalence among notified TB cases in settings where testing for TB drug resistance is not universal. Author SummaryWhile data on drug-resistant tuberculosis (DR-TB) may be routinely collected by National TB Control Programs using rapid diagnostic tests (RDTs), these data streams may not be fully utilized for DR-TB surveillance where low testing coverage may bias inferences due to systematic differences in RDT access. Here, we develop a method to correct for potential biases in routine RDT data to estimate trends in the prevalence of TB drug resistance among notified TB cases. Applying this approach to Brazil, we find that modeled estimates were higher than naive estimates, and were more precise compared to estimates produced by the World Health Organization. We highlight the value of this approach to settings where testing coverage is low or variable, as well as settings where coverage may surpass existing coverage thresholds, but that could nonetheless benefit from additional statistical correction.
著者: Sarah Baum, D. M. Pelissari, F. Dockhorn Costa, L. O. Harada, M. Sanchez, P. Bartholomay, T. Cohen, M. C. Castro, N. A. Menzies
最終更新: 2024-07-23 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.22.24310845
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.22.24310845.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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