小児がんリスクに関する遺伝的知見
新しい研究で、若いがん患者の遺伝的変異が明らかになった。
Mark Pinese, N. A. Fuentes-Bolanos, E. Courtney, C. Mayoh, M. Warby, L. M. S. Lau, M. Wong-Erasmus, D.-A. Khuong-Quang, P. Barahona, B. Padhye, S. El-Kamand, S. Nunag, P. Ajuyah, A. Sherstyuk, A.-K. Altekoester, A. Sullivan, N. Poplawski, C. Kiraly-Borri, S. O'Sullivan, H. Marfan, R. Alli, L. Curnow, K. Bhatia, A. Anazodo, T. N. Trahair, M. Mateos, J. R. Hansford, H. Dholaria, S. Josephi-Taylor, A. S. Moore, W. Nicholls, N. G. Gottardo, P. Downie, S.-L. Khaw, H. Tapp, G. McCowage, L. Dalla-Pozza, F. Alvaro, P. J. Wood, V. Tyrrell, M. Haber, M. J. Cowley, P. G Ekert
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目次
子供や若者のがんは大きな健康問題で、特にこの病気に関わる遺伝的要因を理解することが重要なんだ。生殖細胞がん感受性って、がんになるリスクを高める可能性がある遺伝的変化のことを指すんだ。研究によると、多くの若いがん患者は、こういった遺伝的バリアントを持っていることが分かっているけど、どれくらい一般的なのか、どんな種類があるのか、腫瘍の発展とどう関わっているのか、まだまだ学ぶべきことが多いんだ。
遺伝子検査の必要性
今のところ、がんと診断された子供や若者向けの体系的な遺伝子検査が足りてないんだ。このギャップがあると、遺伝情報を使ってがんリスクを管理するのが難しくなっちゃう。推定によれば、8%から16%の小児がん患者が、がんにつながる遺伝的バリアントを持っている可能性があるんだ。この推定の幅は、患者群や検査方法、遺伝的変化の評価基準の違いによるものかもしれない。
こういった遺伝的バリアントがどれくらい一般的なのかを正確に把握するには、がん腫瘍と患者の遺伝的背景を詳しく調べる必要があるんだけど、若いがん患者における腫瘍の特徴と遺伝的バリアントの両方を調べた包括的な研究はまだ行われていないんだ。この研究不足が、これらのバリアントの普及度や、若者におけるがんリスク管理における重要性に関する不確実性を生んでいる。
現在の遺伝子検査方法
若いがん患者の遺伝的バリアントを特定するために、いくつかの方法が使われているんだ。多くの研究は生殖細胞DNAにのみ焦点を当てた遺伝子検査に集中しているが、他の研究では腫瘍と生殖細胞DNAの両方を分析している。しかし、これらのアプローチが臨床の場でどれほど効果的かや実用性は、まだ完全には評価されていない。
全ゲノムシーケンシング(WGS)という方法は、より確実に遺伝的バリアントを特定できる可能性があるんだけど、小児がん患者の通常の臨床ケアにおける役割はまだはっきりしていない。
PRISM研究:マルチモーダルアプローチ
こういった問題に対処し、がん遺伝学における精密医療の適用を評価するために、PRISM研究というのが行われたんだ。この研究は、成績が悪いがんを持つ若い患者における遺伝的バリアントを広範に調査することを目的としていた。腫瘍と生殖細胞のWGS、RNAシーケンシング、メチル化分析などの先進的な技術を使ったんだ。がん感受性遺伝子に関する現在のガイドラインを適用することで、研究者たちは遺伝的バリアントの普及度とその患者ケアへの影響を明確に把握することを目指した。
参加者の詳細と方法論
PRISM研究には、30%未満の推定生存率を持つ攻撃的ながんと診断された496人の患者が参加したんだ。全参加者に対して腫瘍と生殖細胞のシーケンシングが行われ、遺伝的バリアントが特定され、これらのバリアントが他の臨床情報や腫瘍の特徴とどう関連しているかを理解したんだ。
生殖細胞バリアントについての発見
参加者の分析から、77人の患者に85の生殖細胞バリアントが特定されて、率は15.5%だったんだ。一部の患者は複数のバリアントを持っていた。研究では、がんの家族歴が示唆される患者は報告可能な生殖細胞バリアントを持つ可能性が高いことが分かったんだけど、興味深いことに、生殖細胞バリアントを持つ患者の大半は、がんの関連する家族歴を持っていなかったんだ。
生殖細胞バリアントを持つことと、がんの種類、性別、診断時年齢などの要因との間には、有意な関連性は見つからなかった。でも、特定のがんの種類には、特定の遺伝的バリアントとの関連性が確立されていて、いくつかのがんのタイプは、他のものよりも遺伝的リスクに密接に関連している可能性があるんだ。
特定された生殖細胞バリアントの種類
この研究では、32の遺伝子にわたる生殖細胞バリアントが特定されたんだ。最も影響を受けた遺伝子はTP53、CHEK2、NF1で、がんの発展に関与していることが知られているんだ。バリアントの種類と患者のがんの種類には明確な関連があったよ。例えば、ミスマッチ修復に関連するバリアントは中枢神経系の腫瘍を持つ患者にしか見られず、特定の遺伝的リスクが特定のがんのタイプに密接に結びついていることを示している。
生殖細胞発見の臨床的価値
生殖細胞バリアントを特定することの臨床的な重要性は、変わることがあるんだ。PRISM研究では、14.1%の患者が高い臨床的価値を持つと考えられるバリアントを持っていて、これらのバリアントは顕著ながんリスクを示唆していたんだ。これらの高価値バリアントのほとんどは、高いまたは中程度の浸透率を持つがんの遺伝性条件に関連していた。
この研究は、通常の遺伝子検査の方法では特定されなかった多くの患者がいることを明らかにして、攻撃的ながんを持つ子供たちのために広範な遺伝子スクリーニングの重要性を強調したんだ。報告された生殖細胞バリアントの40%以上は、伝統的にそれらの遺伝的バリアントと関連していないがんの種類を持つ患者に見つかったことから、これらの患者のための遺伝子検査の行い方を再評価する必要があるね。
腫瘍分析が生殖細胞解釈に与える影響
腫瘍分析と遺伝子検査の統合は、生殖細胞バリアントが腫瘍の発展にどのように関わっているかを理解するのに役立ったんだ。多くの患者にとって、腫瘍の特徴は生殖細胞バリアントががんの進行に関与している可能性を示していた。こういった包括的な分析は、特定の遺伝的バリアントの存在と重要性を確認するのに必要不可欠だったんだ。
多くのケースで、腫瘍内の特定の分子特徴が生殖細胞バリアントの存在と対応していて、これらの遺伝的変化が腫瘍の発展に寄与していることを示していた。研究では、50%以上の生殖細胞バリアントが腫瘍の特徴と関連があり、それががんにおける因果関係を示唆していた。
臨床管理と遺伝カウンセリング
PRISM研究の結果は、臨床管理に大きな影響を与えたんだ。医療専門家は、生殖細胞バリアントに関する情報を使って、患者やその家族の治療決定やリスク管理に役立てることができた。この研究では、報告可能なバリアントを持つほぼすべての患者に、その結果が担当の腫瘍医に伝えられたことが示された。
このプロセスを通じて、多くの患者がさらなる評価と検査のためにがん遺伝学サービスに紹介されたんだ。腫瘍医からは、遺伝子検査の結果が患者のがんに対する理解を深め、治療の決定に影響を与えたというフィードバックがあったよ。
遺伝子検査の高い受け入れ
攻撃的ながんを持つ患者の家族は、遺伝子検査やその結果に基づくフォローアップ評価を受けることに非常に前向きだったんだ。ほとんどの家族は確認検査を完了し、関連があれば生殖オプションについて話し合うことにオープンだった。この意欲は、がんと診断された子供を持つ家族にとって遺伝子検査の潜在的な利点を強調しているね。
課題と今後の方向性
この研究は貴重な洞察を提供したけど、これらの発見を日常の臨床慣行に翻訳するにはまだ課題があるんだ。予後が悪いがんに焦点を当てているため、結果がすべての若いがん患者に当てはまるわけではないんだ。遺伝子検査の影響をより広範ながんについて探るために、さらなる研究が必要だし、これらの発見が患者ケアに与える長期的な利益を評価する必要があるね。
結論
PRISM研究は、特に予後が悪いがんを持つ若いがん患者における生殖細胞バリアントの役割を理解する上での重要な一歩なんだ。報告可能な生殖細胞バリアントの高い普及率は、この集団における包括的な遺伝子スクリーニングの必要性を強調しているんだ。腫瘍のプロファイルと遺伝子分析を統合することで、医療提供者は遺伝的要因ががんリスクに果たす役割をよりよく理解できて、最終的には患者の管理と結果を改善することができる。这个研究結果は、遺伝子検査の戦略を洗練し続け、若者におけるがんに対する遺伝的要因の理解を拡げることの価値を強調しているよ。
タイトル: Integrated germline and somatic molecular profiling to detect cancer predisposition has a high clinical impact in poor-prognosis paediatric cancer
概要: Germline predisposition has a significant role in paediatric cancer. However, the optimal approach to identifying cancer-causing germline pathogenic variants (GPV) in children, and even the prevalence of GPV among children with cancer, remain unclear. Here we report our findings from a comprehensive survey of GPV in 496 children with poor-prognosis cancer. By integrating tumour and germline molecular profiling we identified GPV in 15.5% of patients, 48.1% of whom had not met clinical genetic testing criteria. Although the cancer type was outside the recognised phenotypic spectrum for 43.7% of reported GPV, 63.2% of these were clinically actionable for cancer risk. Integrated germline-tumour analysis increased the GPV detection rate by 8.5%, and informed germline interpretation in 14.3% of patients with GPV, highlighting the value of integrated analyses. Our findings establish the benefit of broad integrated tumour-germline screening, over phenotype-guided testing, to detect GPV in children with poor prognosis cancers.
著者: Mark Pinese, N. A. Fuentes-Bolanos, E. Courtney, C. Mayoh, M. Warby, L. M. S. Lau, M. Wong-Erasmus, D.-A. Khuong-Quang, P. Barahona, B. Padhye, S. El-Kamand, S. Nunag, P. Ajuyah, A. Sherstyuk, A.-K. Altekoester, A. Sullivan, N. Poplawski, C. Kiraly-Borri, S. O'Sullivan, H. Marfan, R. Alli, L. Curnow, K. Bhatia, A. Anazodo, T. N. Trahair, M. Mateos, J. R. Hansford, H. Dholaria, S. Josephi-Taylor, A. S. Moore, W. Nicholls, N. G. Gottardo, P. Downie, S.-L. Khaw, H. Tapp, G. McCowage, L. Dalla-Pozza, F. Alvaro, P. J. Wood, V. Tyrrell, M. Haber, M. J. Cowley, P. G Ekert
最終更新: 2024-08-09 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.08.08.24311493
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.08.08.24311493.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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