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# 生物学 # 進化生物学

遺伝子共有の複雑な世界

生物が驚くべき方法でDNAを交換する様子を見てみよう。

T. Brann, F. S. de Oliveira, A. V. Protasio

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目次

遺伝子共有は、隣人から砂糖のカップを借りるのに似てるけど、砂糖の代わりにDNAを借りるって感じ。生き物はDNAの一部を交換できるから、見た目や機能が変わったりするんだ。これは親と子の間だけじゃなくて、寄生虫とその宿主みたいな近い関係の異なる種の間でも起こるよ。

生き物はどうやって遺伝子を共有するの?

ほとんどの生き物は親から特徴を受け継ぐ。これを縦の遺伝と呼ぶんだけど、時にはDNAが家系図をまっすぐに下るんじゃなくて横に移動することもある。これが横断的遺伝子移動、略してHGTだよ。HGTでは、DNAが家族のつながりなしに生き物から別の生き物にスニークしていくことができるんだ。

これは特にバイ菌のような小さい生き物に多いけど、もっと大きな生き物にも起こることがある。ただしペースは遅いんだ。例えば、真核生物と言われるより複雑な生き物では、DNAの借り入れはバイ菌に比べてずっと少ない。これは真核生物がバイ菌にはない保護バリアみたいな多くの層を持ってるからだよ。

寄生虫の役割

寄生虫は、バーベキューにずっと居座る熱心な隣人みたいなもので、宿主と長い間一緒に過ごして、いろいろ吸収しちゃうんだ。この密接な接触が遺伝子共有の機会を生む。寄生虫が宿主を食べるとき、組織をむしゃむしゃ食べるだけじゃなくて、宿主のDNAも吸収してるかも。

海のような環境では、多くの生き物が同じプールで泳いでるからDNAを共有しやすい。例えば、小さな植物や魚、イソギンチャクは水を通じてDNAを共有できるんだ。

転移可能要素:スニーキーなDNA

DNAの中には転移可能要素(TEs)と呼ばれる部分があって、これは基本的にジャンプできるDNAのかけらなんだ。音楽椅子のゲームを想像してみて、みんなが席を争うんじゃなくて、この小さなDNAの部分がゲノムの中でジャンプしてる感じ。TEsはその特性から、横断的遺伝子移動にしばしば関与してる。これらは一つの生き物から別の生き物に移動しながら、余分なDNAのかけらを運ぶことが多い。

TEsはかなり多いんだ。人間の場合、DNAの半分以上を占めることもあるよ!間違った場所に落ちることで遺伝子を混乱させることもあるけど、生き物はこのジャンプする部分を管理する方法を学んできた。例えば、TEsを静かに保つ特別な場所を作ることができるんだ。

例:ヒル

ここにシュistosoma mansoniっていうヒルがいて、寄生のびっくりな世界に住んでるよ。この小さいやつはDNAの借り入れが得意で、まずカタツムリに住んでから人間に泳いでいく。適応力抜群だね。

このヒルはTEsがたくさん入ってて、遺伝物質を移動させる面白い方法を持ってるから、遺伝子共有パーティーの主役なんだ。

シュistosomaのライフサイクル

S. mansoniのライフサイクルはかなりの波乱万丈だ。まずカタツムリの中で無性生殖して増える。そして、人間の宿主を探して離れ、そこで形を変えて有性生殖をする。カタツムリの中でいくつかのライフステージを経ることで、宿主のDNAと出会うチャンスがいっぱいあるんだ。

DNAのつながりを探す

S. mansoniがどのように遺伝子を共有するかを理解することは、複雑なソーシャルネットワークでの友情をたどるようなもの。最近の研究では、そのゲノムを調べて、カタツムリや他の生き物からどんな遺伝子を借りているかを見ているよ。科学者たちは、S. mansoniのDNAを他の種と比較して、共通点を探し始めたんだ。

彼らはS. mansoniで見つかるTEsのコレクションをまとめて、他の生き物に親戚がいるかどうかを調べた。カタツムリやS. mansoniが一緒にいる他の生き物に注目しながら、いろんな種を調べたんだ。

遺伝子ハントの結果

驚くべきことに、研究者たちはS. mansoniがカタツムリの宿主に存在するTEsと多くの共通点を持つことを発見したよ。実際、いくつかのカタツムリの種にはこれらのTEsのほぼ完全なコピーが見つかった。

これは、フラットワームがその歴史のどこかで宿主からこれらのジャンプするDNAのかけらを拾った可能性を示唆しているね。だから次にカタツムリを見たら、フラットワームのDNA形成に貢献しているかもしれないって思い出してね!

消えた遺伝子の謎

研究者がもっと掘り下げると、多くの他の関連寄生虫がこれらのTEsを共有していないことがわかった。これは、TEsが世代を経て引き継がれたんじゃなくて、カタツムリから来たのかもしれないと彼らを疑問に思わせた。つまり、フラットワームとカタツムリの宿主との間で、歴史のある時点で直接遺伝子共有があった可能性があるってことだ。

さらに多くのつながりを発見

研究はそこで終わらなかった。科学者たちはさらに広い範囲の生き物を調べて、遺伝子共有がどれほど広がっているかを見た。S. mansoniのTEsがカタツムリ以外の動物にも見られるかどうかも気になって、なんと見つかったんだ!

研究者たちは、多くのメタゾーン-全く異なる生物群-がこれらのTEsの何らかの形を持っていることを発見した。まるで、厳格な猫好きだと思ってた隣人が、実はヘビを飼ってたことが判明したみたい!

遺伝子を通じた進化の理解

これらの発見は、進化をより理解するための扉を開くことになる。種を超えた遺伝子の移動は、科学者が生き物が時間をかけて環境にどのように適応してきたかを解明するのに役立つ。以前は少し不明瞭だった関係も明らかにするかもしれない。枝が葉を交換する家系図を組み立てるみたいな感じだね。

S. mansoniのDNAとそれがTEsを共有するいろんな生き物のDNAを比較すると、データは種の進化がどう行われてきたかについて知っていることと完全に一致しないことがある。この不一致は、これらの生き物の間で遺伝子がどのように移動し混ざるかについて新しい疑問を引き起こす。

新しい遺伝子共有のネットワーク

科学者たちは、Perere-3やSr3のようなTEsが、フラットワームとカタツムリだけでなく、より広範囲の他の生き物の間でも移動していることを示す複雑なつながりの網を組み立てているんだ。

これらのTEsの素晴らしい旅は、DNAの世界の旅行セールスマンみたいに見える-常に動き回って、つながりを作って、新しい関係を生み出して進化の景観を変えちゃう。

結論:遺伝子共有の進行中の物語

種間の遺伝子共有の物語は、ドラマや波乱、予期しない出会いに満ちてる。フラットワームからカタツムリ、その先へ、DNAはただ家系図に留まるだけじゃなく、自分の冒険に出かけちゃうんだ。

科学者たちがこの複雑な遺伝的つながりの網をさらに掘り下げるにつれて、すべての生き物がどれだけつながっているかについてもっと学ぶことができるだろう。だから次回、パーティーで誰かが遺伝子移転について話すときは、舞台裏でDNAの取引が進行中だってことを知って笑えるね!

オリジナルソース

タイトル: Horizontal transfer of a LINE-RTE retrotransposon among parasite, host, prey and environment.

概要: BackgroundHorizontal transfer of transposable elements is both impactful, owing to the subsequent transposition burst, and insightful, providing information on organisms evolutionary history. In eukaryotes, horizontal gene transfer (HGT) often involves transposable elements (TEs), host-parasite relationships, aquatic environments or any of them combined. The flatworm Schistosoma mansoni is a human parasite with two free-living aquatic stages (intercalated between a definitive human host and intermediate snail host) and has a sizable TE content. We aimed to identify and characterise potential instances of HGT leveraging new genomic resources available. ResultsUsing the latest chromosome-scale genome assembly and available TE sequences we identify two putatively horizontally transferred elements, named Perere-3 and Sr3, in the S. mansoni genome. We demonstrate the presence of these TEs in the genomes of Schistosoma spp. intermediate hosts, most likely explained by HGT. Perere-3 / Sr3 were also found across a wide range of additional organisms not susceptible to schistosome infection, including turtles, fish and other molluscs. ConclusionsWe propose that the patchy distribution of Perere-3/Sr3 across the phylogenetic tree is best explained by HGT. This phenomenon is likely linked to the parasitic nature of schistosomes, as several snail species sharing the elements are susceptible to infection. However, presence of Perere-3/Sr3 in species beyond this relationship may suggest wider ancestral Schistosomatidae host ranges and/or undescribed schistosomes.

著者: T. Brann, F. S. de Oliveira, A. V. Protasio

最終更新: 2024-12-07 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.24.625053

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.24.625053.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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