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# 生物学 # 微生物学

サルモネラの広がりと抗生物質の影響についての新しい知見

研究がサルモネラがどのように広がり、マウスで抗生物質にどう反応するかを明らかにした。

Matthew K Waldor, J. A. Hotinger, I. W. Campbell, K. Hullahali, A. Osaki

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サルモネラのダイナミクスが サルモネラのダイナミクスが 明らかに! 生物質の効果が明らかになった。 研究でサルモネラの広がりと感染に対する抗
目次

サルモネラ・エンテリカは、世界中で多くの病気や死を引き起こす危険なバイ菌だよ。2,000種類以上の異なるタイプがあって、その中にはチフスみたいな重い病気を引き起こすものもある。多くのタイプは通常腸に影響を与えるけど、最近は腸以外で感染を引き起こすケースが増えてるんだ。

このバイ菌はいろんな動物の中で生き延びられるし、細胞の中でも外でも成長できるんだ。科学者たちは、マウスを使ってこのバイ菌がどんな風に病気を引き起こすかを研究してる。研究でよく使われるサルモネラの一種はS.タイフィムリウム。マウスの中で、このバイ菌は体全体に広がって、腸から他の臓器にどう移動するかについて多くのことがわかってきたよ。

サルモネラの追跡

研究者たちは、感染中のサルモネラの振る舞いに興味があって、特に体のいろんな部分でのバイ菌の数がどんな風に変化するかを見てるんだ。このためにユニークな遺伝子タグ、つまりバーコードを使う方法が便利なんだ。昔の研究では少数のバーコードを使ってたから、詳細な情報を得るのが難しかった。これを改善するために、研究者たちはいろんなバーコードを作って、バイ菌の振る舞いをもっと詳しく観察できるようにしたんだ。

55,000以上のバーコードを使うことで、科学者たちはマウスに導入した後にどれだけの細菌が生き残ったか、そして体全体にどう広がっていったかを追跡できるようになった。これによって、細菌がどこで成長に苦労しているか、他の部分にどう侵入するかがわかるんだ。

抗生物質の影響

重要な発見の一つは、抗生物質、特にストレプトマイシンがサルモネラの広がりに与える役割についてだ。ストレプトマイシンは、マウスの腸の有用な細菌の数を減らして、サルモネラ感染に対する感受性を高めるためによく使われるんだ。研究者たちがS.タイフィムリウムを導入する前にマウスにストレプトマイシンを与えたところ、細菌がより簡単に広がり、多くの数になっていることがわかったんだ。

ストレプトマイシン処理されたマウスの感染では、大きな変化が見られたんだ。例えば、これらのマウスはより早く体重を減らして、糞便に含まれる細菌の量が増えていた。観察によると、治療を受けていないマウスは時間とともに徐々に細菌を減らしていったが、ストレプトマイシンを受けたマウスはずっと多くの量を急速に排出したんだ。

細菌の広がりの測定

研究者たちは、ストレプトマイシン治療が細菌の広がりにどのように影響するかを見るために、さまざまな臓器におけるS.タイフィムリウムの量を測定した。治療されたマウスの腸には、未治療のマウスに比べて細菌が大幅に増えていて、コロニー形成のための障壁が緩んでいることを示していた。一方で、脾臓や肝臓のような他の臓器に見られる細菌の量は、治療されたマウスと未治療のマウスとの間であまり大きな違いはなかった。

個体群ダイナミクスの理解

S.タイフィムリウムがどれくらい広がるかをよりよく理解するために、研究者たちは腸内の創始個体群を調査したんだ。すると、未治療のマウスの中でこれらの創始細菌の数には高い変動が見られた。これは、各マウスが感染に対して異なる経験をしたことを示唆してる。バイ菌の数が異なるということは、あるマウスがこのバイ菌をうまく保有するのに直面した課題が多かったことを示している。

しかし、ストレプトマイシン処理後は、これらのバイ菌のための障壁が増して、腸内でより多くの細菌が繁殖できるようになった。この発見は重要で、抗生物質が体内のサルモネラの振る舞いやダイナミクスを変える可能性があることを示している。

細菌のコンパートメントの調査

さらなる分析では、未治療のマウスでは腸の異なる部分に異なる細菌群が存在していることがわかった。つまり、腸内で細菌同士がうまく混ざっていなかったんだ。このコンパートメント化は、サルモネラが限られた交流のある異なる地域で成長していることを示唆している。一方で、ストレプトマイシン処理されたマウスを見ると、腸内の細菌の個体群がはるかに似ていて、混ざり合うことが増えていたんだ。

研究者たちは次に、糞便サンプルを調べることでこれらの細菌個体群のパターンがどう変わったかを見た。未治療のマウスの糞便サンプルは、腸の中にあるものとはかなり異なることが多く、腸内に生息している多くのものが糞便に排出されていないことを示唆していた。ストレプトマイシン治療後には、腸と糞便サンプルの間で細菌の個体群の類似性が高まり、腸にもっと多くの細菌が流れ込んでいることを示していた。

サルモネラの早期広がり

研究のもう一つの大きな側面は、早期にサルモネラが他の臓器に広がる方法を理解することだった。S.タイフィムリウムは、感染が発生してすぐに広がり始め、腸内で大きな数を確立する前からも広がることがわかった。肝臓のサンプルと腸のサンプルを比較することで、これらの個体群の間の共有が少ないことに気づき、細菌が腸内で増殖する前に肝臓に広がるという考えを支持することになった。

異なる感染経路の調査

異なる感染経路の影響を試すために、研究者たちは経口摂取(ガバージや飲水による)と、腹腔内注射(IP)や血流内注射(IV)を比較した。興味深いことに、IPとIVの注射は、経口ルートで経験する厳しいボトルネックを経ずに、細菌がさまざまな臓器に到達するためのよりストレートな道を提供していた。

S.タイフィムリウムが経口ルートで導入されると、腸内でかなりの障害に直面することが多いが、直接注射では肝臓や脾臓といった臓器に迅速かつ容易に定着した。これらの発見は、経口ルートが腸をバイパスしたときよりも細菌にとって大きな挑戦であることを強調している。

腸への再播種

研究者たちはまた、サルモネラがどうやって広がった後に腸に戻ることができるのかを調べた。S.タイフィムリウムは、胆嚢などの腸外の部位から腸に戻れることが観察された。細菌が胆汁に見つかると、多くの場合、腸内でより均一な細菌個体群をもたらし、特に胆汁に目に見える病変があるときにそうなることがわかった。これは、胆嚢の健康と細菌が腸管に再入りする能力との関連を示唆している。

胆嚢の病理

さらに調査を進めると、濁りや硬化といった特定の病理を持つ胆汁は、S.タイフィムリウムの負荷が高いことと相関していることがわかった。この関係は、損なわれた胆汁が細菌の生存や増殖を助ける可能性があることを示している。硬化した胆汁を持つマウスのほとんどは雌で、感染の重症度と性別との関連性を示唆しているかもしれない。

結論

バーコード付きのS.タイフィムリウムの大規模なライブラリを使うことで、研究者たちはこのバイ菌が体内でどのように広がるかについて貴重な洞察を得たんだ。この発見は、腸内マイクロバイオータがサルモネラの振る舞いをコントロールする大きな役割を果たしていること、そしてストレプトマイシンのような抗生物質が感染のダイナミクスを大きく変える可能性があることを強調している。こうした相互作用を理解することで、研究者たちはサルモネラとその宿主との複雑な関係をよりよく把握できて、感染による治療戦略の改善に向けた道筋が開けていくんだ。

オリジナルソース

タイトル: Quantification of Salmonella enterica serovar Typhimurium Population Dynamics in Murine Infection Using a Highly Diverse Barcoded Library

概要: Murine models are often used to study the pathogenicity and dissemination of the enteric pathogen Salmonella enterica serovar Typhimurium. Here, we quantified S. Typhimurium population dynamics in mice using the STAMPR analytic pipeline and a highly diverse S. Typhimurium barcoded library containing [~]55,000 unique strains distinguishable by genomic barcodes by enumerating S. Typhimurium founding populations and deciphering routes of spread in mice. We found that a severe bottleneck allowed only one in a million cells from an oral inoculum to establish a niche in the intestine. Furthermore, we observed compartmentalization of pathogen populations throughout the intestine, with few barcodes shared between intestinal segments and feces. This severe bottleneck widened and compartmentalization was reduced after streptomycin treatment, suggesting the microbiota plays a key role in restricting the pathogens colonization and movement within the intestine. Additionally, there was minimal sharing between the intestine and extraintestinal organ populations, indicating dissemination to extraintestinal sites occurs rapidly, before substantial pathogen expansion in the intestine. Bypassing the intestinal bottleneck by inoculating mice via intravenous or intraperitoneal injection revealed that Salmonella re-enters the intestine after establishing niches in extraintestinal sites by at least two distinct pathways. One pathway results in a diverse intestinal population. The other re-seeding pathway is through the bile, where the pathogen is often clonal, leading to clonal intestinal populations and correlates with gallbladder pathology. Together, these findings deepen our understanding of Salmonella population dynamics. Significance StatementSalmonella is a prevalent food-borne pathogen that infects hundreds of millions of people worldwide. Here, we created a highly complex barcoded Salmonella enterica serovar Typhimurium library containing [~]55,000 barcodes to further understand and quantify Salmonella population dynamics in experimental murine infection. Through comparisons of barcode abundance and frequency in different samples and following different routes of inoculation, we quantify key facets of Salmonella infection, including bottleneck sizes and dissemination patterns, and uncover hidden routes of spread that drive heterogeneity in infection outcome. These observations provide a detailed map of Salmonella infection and demonstrate the power of high-diversity barcoded libraries in deciphering microbial population dynamics.

著者: Matthew K Waldor, J. A. Hotinger, I. W. Campbell, K. Hullahali, A. Osaki

最終更新: 2024-12-11 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.28.601246

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.28.601246.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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