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ウイルスが新しい宿主に感染するために進化する仕組み

研究によると、ウイルスは異なる細胞に感染するためにレセプター結合タンパク質を適応させるんだって。

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最近、世界はウイルスによる世界的なパンデミックという大きな挑戦に直面してきた。いろんな分野の研究者たちが、ウイルスがどう変わって適応するかを理解するために頑張っている。この研究の重要な側面の一つは、ウイルスが新しい種類の細胞に感染する方法だ。ウイルスが新しい宿主に感染するためには、宿主細胞の特定の分子を認識して付着できる必要がある。これには、特に受容体結合蛋白(RBP)というたんぱく質の変化が関わっていることが多い。

ウイルスが宿主細胞に感染する方法

ウイルスは複雑なライフサイクルを持っていて、宿主細胞に結合する能力が重要だ。ウイルスが新しい宿主に入ると、細胞の表面にある特定の受容体分子を認識する必要がある。これらの受容体は鍵のような役割を果たし、ウイルスのRBPは鍵穴に合う鍵のようなもの。鍵が合えば、ウイルスは入り込み、宿主の機械を奪って自分を複製する。

時には、ウイルスは適応して新しい受容体を認識し始めることがある。これは通常、RBPの小さな変化、つまり突然変異を通じて起こる。この突然変異があることで、ウイルスは新しい種類の細胞に付着できるようになり、感染可能な宿主の範囲が広がる。

突然変異の役割

突然変異はウイルスの遺伝子コードの変化だ。ウイルスの複製プロセスの過程で自然に起こることがある。一部の突然変異は、ウイルスが既存の受容体に結合する能力を向上させ、他のものは全く新しい受容体を使うことを可能にする。

例えば、バクテリオファージλというウイルスは、大腸菌の一種に感染することが知られている。研究によると、λがラボの環境でストレスを受けると、RBPに突然変異を獲得して新しい受容体を素早く使う進化を遂げることができる。この突然変異のプロセスは、ウイルスが新しい環境や宿主に適応できる方法を示しているので重要だ。

バクテリオファージΦ21に関する新しい研究

ウイルスがどのようにRBPを適応させるかをさらに理解するために、研究者たちはΦ21という別のバクテリオファージに注目した。このウイルスはλに似ているが、遺伝的な構成が少し異なっている。Φ21は複数の新しい受容体を使える進化を遂げていることが観察されている。

最近の研究で、科学者たちはΦ21が新しい受容体を使う過程でRBPがどのように変わるかを詳しく調べた。彼らは、λで観察されたのと同じプロセスがΦ21にも当てはまるのかを知りたかった。

受容体使用のテスト

研究者たちはまず、Φ21の特定の株であるΦD9を研究し始めた。この株は、大腸菌の三つの異なる受容体を使用できるように進化していた。チームは、ΦD9が異なる種類のウイルス粒子を示す兆候を示しているのか、つまりRBPに変化があったのかを理解したいと考えた。

まず最初に、Φ21が時間の経過とともにどのように崩壊していくのかを調べる実験を行った。これを行うために、時間とともにどれだけのウイルス粒子が活性を維持できているかを観察した。ΦD9の崩壊率をΦ21の祖先株と比較し、どのように感染能力を失う速度にパターンがあるのかを確認した。

崩壊パターンの観察

研究者たちは、ΦD9が二相性の崩壊パターンを示していることを発見した。つまり、感染能力を失う明確な二つの段階があるということだ。これは、単一の崩壊率を示した祖先株とは異なっていた。ΦD9における複数の崩壊率の存在は、異なるウイルス粒子が混在していて、一部は他よりも安定していることを示唆していた。

チームは、これらの粒子がどの受容体を使用できるかを調査することで調査を続けた。彼らは、異なる受容体を使用する異なる粒子が異なる速度で崩壊することを発見した。これは、粒子の安定性と、どの受容体に結合できるかとの関係があることを示していた。

たんぱく質の折りたたみの役割

次に、研究者たちは、感染中にRBPがどのように折りたたまれるか(3D形状をとるか)が、ウイルスがどの受容体を認識できるかに役割を果たすかを探求した。彼らは宿主細菌を操作して、シャペロニンと呼ばれる補助たんぱく質の産生を誘導した。これらのシャペロニンは、他のたんぱく質を適切に折りたたむのを助ける。

彼らの仮説は、これらのシャペロニンが利用できるとき、RBPはより安定した形に折りたたまれ、ウイルスが元の受容体により効果的に結合できるようになるというものだった。予想通り、シャペロニンが存在する際には、元の受容体に結合できる粒子がより多く存在し、新しい受容体をターゲットにするものは少なかった。

時間とともに起こること

研究者たちは、Φ21の進化の過程で崩壊速度がどのように変わるかも調べた。彼らは、進化過程のさまざまな時点からのこのウイルスの異なる分離株を研究した。彼らは、ファージが使用できる受容体が多ければ多いほど、全体的に安定性が低下するというパターンを記録した。興味深いことに、研究者たちはΦ21が進化するにつれて、RBPの全体的な安定性が変動することを発見し、受容体の使用とたんぱく質の安定性との複雑な関係を強調した。

ウイルス進化を理解する重要性

ウイルスが新しい宿主に適応する方法を理解することは、公衆衛生にとって重要な意味がある。特にパンデミックの時期には、Φ21やλのようなウイルスがRBPをどのように修正するかを学ぶことで、科学者たちはより良いワクチンや治療法を開発できる。

要するに、最近の研究は、ファージがどのように突然変異を通じて新しい受容体を使用するよう進化するかを明らかにした。この研究はウイルス進化の動的な性質と、ウイルスが宿主とどのように相互作用するかの背後にある複雑さを強調している。さらに、ウイルスのたんぱく質の不安定性が、その進化を妨げるのではなく助ける役割を果たしている可能性があることも示唆しており、ウイルスの適応能力に対する考え方を変えるかもしれない。

結論

Φ21やλのようなバクテリオファージの研究は、ウイルスの進化や適応について貴重な洞察を提供する。これらのウイルスがどのように変化し、宿主細胞の範囲を広げるかを調べることで、研究者たちはウイルス感染のメカニズムをより良く理解できる。この知識は、ウイルスの流行に対抗する効果的な戦略を開発し、公衆衛生を守るために重要だ。

ウイルス学の世界は複雑で常に変化している。持続的な研究は、ウイルスがどのように機能し、進化し、私たちがそれに効果的に対処できるかの秘密を解き明かし続けるために不可欠だ。これらのプロセスを理解することは、ウイルス性疾患がもたらす将来の課題に備えるための鍵となる。

オリジナルソース

タイトル: Bacteriophage {Phi}21s receptor-binding protein evolves new functions through destabilizing mutations that generate non-genetic phenotypic heterogeneity

概要: How viruses evolve to expand their host range is a major question with implications for predicting the next pandemic. Gain-of-function experiments have revealed that host-range expansions can occur through relatively few mutations in viral receptor-binding proteins, and the search for molecular mechanisms that explain such expansions are underway. Previous research on expansions of receptor use in bacteriophage {lambda} has shown that mutations that destabilize {lambda}s receptor-binding protein cause the receptor-binding protein to fold into new conformations that can utilize novel receptors but have weakened thermostability. These observations led us to hypothesize that other viruses may take similar paths to expand their host range. Here, we find support for our hypothesis by studying another virus, bacteriophage 21 ({Phi}21), which evolves to use two new host receptors within two weeks of laboratory evolution. By measuring the thermodynamic stability of {Phi}21 and its descendants, we show that, as {Phi}21 evolves to use new receptors and expands its host range, it becomes less stable and produces viral particles that are genetically identical but vary in their thermostabilities. Next, we show that this non-genetic heterogeneity between particles is directly associated with receptor use innovation, as phage particles with more derived receptor use capabilities are more unstable and decay faster. Lastly, by manipulating the expression of protein chaperones during {Phi}21 infection, we demonstrate that heterogeneity in thermostability and receptor use breadth of phage particles is directly related to the folding of phage proteins into different conformers. Altogether, our results provide support for the hypothesis that viruses can evolve new receptor-use tropisms through mutations that destabilize the receptor-binding protein and produce multiple protein conformers.

著者: Justin R Meyer, K. R. Gerbino, J. M. Borin, S. M. Ardell, J. J. Lee, K. D. Corbett

最終更新: 2024-04-15 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.15.589635

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.15.589635.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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