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# 生物学 # 神経科学

脳の活動の複雑さをモデル化する

体性感覚皮質の詳細なモデルが脳の反応に対する理解を深める。

Michael W. Reimann, J. B. Isbister, A. Ecker, C. Pokorny, S. Bolanos-Puchet, D. Egas Santander, A. Arnaudon, O. Awile, N. Barros-Zulaica, J. Blanco Alonso, E. Boci, G. Chindemi, J.-D. Courcol, T. Damart, T. Delemontex, A. Dietz, G. Ficarelli, M. Gevaert, J. Herttuainen, G. Ivaska, W. Ji, D. Keller, J. King, P. Kumbhar, S. Lapere, P. Litvak, D. Mandge, E. B. Muller, F. Pereira, J. Planas, R. Ranjan, M. Reva, A. Romani, C. Rössert, F. Schürmann, V. Sood, A. Teska, A. Tuncel, W. Van Geit, M. Wolf, H. Markram, S. Ramaswamy

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高度な脳モデルのアプローチ 高度な脳モデルのアプローチ 作用についての洞察を明らかにしている。 革新的なシミュレーションが脳の機能や相互
目次

神経科学は脳と神経系の研究だよ。脳がどう働くか、どう構築されているか、そしていろんな状況にどう反応するかを理解しようとしてる。脳はすごく複雑で、いろんな部分が協力して動いてるから、直接研究するのは難しいんだ。だから、科学者たちは脳の中で何が起こるかをシミュレートするモデルを使うんだ。

脳研究の課題

脳は多くのレベルで組織されているから、研究するのが大変なんだ。これらのレベルがどう一緒に働いてるかを理解するのはチャレンジだよ。従来のラボでの調査はよく脳の小さな部分を見るけど、全体像が見えにくくなっちゃう。これを助けるために、大きなコンピュータモデルはいろんなレベルからの詳細な情報を集めて、全部をまとめることができるんだ。

脳モデルの構築

科学者たちは多くの小さなモデルを組み合わせて、一つの大きな3Dモデルを作るんだ。この大きなモデルは脳の特定の領域を表そうとしていて、研究者が異なる部分がどう相互作用するかを見ることを可能にするんだ。モデルの各部分は調整できるから、科学者は連携の仕方について予測できるんだ。

データの重要性

生物学的データが増えてくるにつれて、モデルは常にアップデートされて改善される必要があるんだ。これが重要な理由は二つあるよ:

  1. オープンソースのモデルは科学者が自分の成果を共有して、他の研究を改善するのを可能にする。
  2. モデルが脳の活動を予測するときに正確であることを確保する厳密な方法が必要だ。

私たちがやったこと

この研究では、触覚や他の感覚情報を処理する一次体性感覚野の詳細なモデルを作ることに焦点を当てたよ。私たちのモデルは協力して働く多くの小さな部分を含んでいて、異なる種類の脳細胞がどう相互作用するかを見ることができるんだ。

モデルの主な特徴

モデルの解剖学

私たちのモデルには脳細胞の特定の形や接続が含まれていて、実際の脳の構造を模倣することができるんだ。さまざまなニューロンタイプをモデル内で正しく配置することで、彼らがどうコミュニケーションをとっているかを見ることができるよ。

電気的特性

モデルを正確に動作させるために、異なるニューロンタイプの電気的な行動を研究したんだ。これは彼らがどう信号を送るか、そしてその信号がどれくらい強いかを見ることを意味するよ。さらに、モデルが実際の脳細胞からの実験測定を正確に再現できることも確認する必要があったんだ。

予測の検証

私たちのモデルが正しいことを確かめるために、それの予測を脳研究から集められた実際のデータと比較したよ。モデルが知られた脳の行動を再現できるか確認することで、正確性への信頼を築いていった。

脳活動のシミュレーション

自発的活動

脳機能の重要な側面の一つは自発的活動で、これはニューロンが外部の刺激なしに信号を送るときのことだよ。私たちのモデルはこの種の活動を再現できて、実際の脳で観察されたのと似たパターンを示したんだ。

刺激誘発活動

脳が皮膚への触覚のような刺激を受け取ると、それに反応して信号を送るよ。私たちのモデルもこれらの反応を正確にシミュレートできる。これによって、脳が異なる刺激にどのように反応するかを予測できて、感覚情報がどう処理されるかの洞察を得られるんだ。

レイヤー特異的な反応

私たちのモデルには異なる特徴を持つニューロンの異なる層が含まれていて、刺激に対する反応が異なることがわかったよ。モデルはこの振る舞いを捉えることができた。これらの反応を分析することで、感覚情報処理におけるさまざまな層の役割をより理解できるんだ。

モデルの予測能力

私たちのモデルは脳活動をシミュレートするための道具だけじゃなくて、脳の異なる部分がどう相互作用するかについて予測を立てるのにも役立つんだ。たとえば、特定の種類のニューロンが刺激への反応にどう影響するか、また異なる接続パターンが脳機能にどう影響するかを探求したよ。

抑制性ニューロンの探求

抑制性ニューロンは興奮性ニューロンの活動を制御するのに重要な役割を果たしてるんだ。私たちのモデル内でこれらの抑制性ニューロンがどう働くかを調べることで、脳内の興奮と抑制のバランスが全体的な脳機能にどう影響するかをさらに学べるよ。

特定のニューロンタイプの役割

私たちはPV+やSst+ニューロンなどの特定の抑制性ニューロンについて研究して、彼らが興奮性ニューロンの活動にどう影響するかを調べたんだ。これらの関係を理解することで、異なる細胞タイプが情報処理の効率を最大化するためにどう協力しているかが見えてくるよ。

構造と機能の接続

私たちのモデルを使うことで、脳の構造とその機能の関係を探求できるんだ。異なる接続パターンが異なる反応を引き起こすかもしれなくて、私たちのモデルはこれらの違いを視覚化する手助けをするよ。

電子顕微鏡からの洞察

最近のイメージング技術の進歩、特に電子顕微鏡によって、脳の構造を詳細に見ることができるようになったんだ。この情報を取り入れることで、モデルをさらに洗練させて、もっと正確にできるんだ。

欠損接続の補正

脳モデル化での一つの課題は、測定が難しい欠損接続に対処することなんだ。これを解決するために、モデルにランダムな入力を加えて、欠損接続の影響をシミュレートするよ。これで、モデルが不完全な情報でもどう振る舞うかを見ることができるんだ。

研究の将来の方向性

私たちの研究は、将来の研究の多くの可能性を開いているよ。新しいデータが得られれば、モデルをさらに洗練させて、脳の機能についての追加の疑問を探求できるんだ。このモデルは新しい仮説をテストするためのプラットフォームも提供できるよ。

結論

脳の研究は複雑だけど、私たちのようなモデルがその複雑さを簡単にし、明確にする手助けをしてくれるんだ。体性感覚野の包括的なモデルを構築することで、脳の異なる部分がどう相互作用して、さまざまな刺激にどう反応するかをシミュレートしたり予測したりできるんだ。

継続的な改善と検証を通じて、私たちは脳の機能とその構造とプロセスの複雑な関係についての理解を深めることを目指しているよ。新しいデータでモデルを洗練させ続けることで、脳のダイナミクスや機能についてさらに洞察を得られると期待してるんだ。

私たちのツールを他の人とオープンに共有することで、協力と神経科学研究のさらなる進展を促すよ。私たちのモデルからの発見は、脳の謎を解くための次の波の研究を推進し、最終的には神経学的な状態を理解し、治療を改善するのに貢献するんだ。

要するに、脳をモデル化するのは神経科学での最も複雑な質問に取り組む強力なアプローチだよ。私たちの研究は、詳細な解剖学的データと堅牢なシミュレーションを組み合わせて、脳がどう機能し適応するかを探る可能性を示しているんだ。

オリジナルソース

タイトル: Modeling and Simulation of Neocortical Micro- and Mesocircuitry. Part II: Physiology and Experimentation

概要: Cortical dynamics underlie many cognitive processes and emerge from complex multi-scale interactions, which are challenging to study in vivo. Large-scale, biophysically detailed models offer a tool which can complement laboratory approaches. We present a model comprising eight somatosensory cortex subregions, 4.2 million morphological and electrically-detailed neurons, and 13.2 billion local and mid-range synapses. In silico tools enabled reproduction and extension of complex laboratory experiments under a single parameterization, providing strong validation. The model reproduced millisecond-precise stimulus-responses, stimulus-encoding under targeted optogenetic activation, and selective propagation of stimulus-evoked activity to downstream areas. The models direct correspondence with biology generated predictions about how multiscale organization shapes activity; for example, how cortical activity is shaped by high-dimensional connectivity motifs in local and mid-range connectivity, and spatial targeting rules by inhibitory subpopulations. The latter was facilitated using a rewired connectome which included specific targeting rules observed for different inhibitory neuron types in electron microscopy. The model also predicted the role of inhibitory interneuron types and different layers in stimulus encoding. Simulation tools and a large subvolume of the model are made available to enable further community-driven improvement, validation and investigation.

著者: Michael W. Reimann, J. B. Isbister, A. Ecker, C. Pokorny, S. Bolanos-Puchet, D. Egas Santander, A. Arnaudon, O. Awile, N. Barros-Zulaica, J. Blanco Alonso, E. Boci, G. Chindemi, J.-D. Courcol, T. Damart, T. Delemontex, A. Dietz, G. Ficarelli, M. Gevaert, J. Herttuainen, G. Ivaska, W. Ji, D. Keller, J. King, P. Kumbhar, S. Lapere, P. Litvak, D. Mandge, E. B. Muller, F. Pereira, J. Planas, R. Ranjan, M. Reva, A. Romani, C. Rössert, F. Schürmann, V. Sood, A. Teska, A. Tuncel, W. Van Geit, M. Wolf, H. Markram, S. Ramaswamy

最終更新: 2024-12-13 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.05.17.541168

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.05.17.541168.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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