Progretti nel Federated Learning per l'imaging medico
FedFBN migliora l'addestramento dei modelli usando dati medici diversi, proteggendo la privacy dei pazienti.
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Indice
Negli ultimi anni, il deep learning ha mostrato grandi potenzialità nell'analizzare le immagini mediche, in particolare le radiografie toraciche. Grandi dataset hanno aiutato a creare modelli in grado di rilevare diversi problemi di salute con alta precisione. Tuttavia, molti di questi dataset contengono solo alcune Etichette di malattia e possono essere divisi tra diverse istituzioni. Questa divisione crea sfide, specialmente quando alcune etichette potrebbero mancare o essere incomplete, complicando il modo in cui possiamo addestrare modelli efficaci.
Panoramica del Federated Learning
Il Federated Learning (FL) è un metodo che permette a più sedi di addestrare modelli di machine learning senza condividere dati sensibili. Invece di inviare tutti i dati a una sede centrale, ogni sito allena il proprio modello con i propri dati e condivide solo gli aggiornamenti con un server centrale. Questo server combina i risultati di ogni modello locale per creare un modello finale che riflette la conoscenza di tutte le sedi.
Questo approccio è particolarmente utile nell'imaging medico perché consente di utilizzare dati provenienti da vari ospedali rispettando la privacy dei pazienti. Tuttavia, dato che i dati possono differire molto in qualità e quantità da un sito all'altro, questo può portare a sfide nella creazione di un forte modello globale.
Sfide nel Federated Learning
Molte immagini mediche e le loro etichette associate provengono da diverse fonti. Questo significa che i dati possono essere molto diversi tra loro, il che pone delle sfide per il federated learning. Quando i modelli locali addestrati su vari dataset cercano di condividere informazioni, le differenze possono portare a risultati scarsi. In particolare, sorge un problema quando si utilizzano strati di normalizzazione del batch nei modelli. Questi strati aiutano ad accelerare l'addestramento regolando gli input, ma quando i dati sono molto diversi, questo aggiustamento può influire negativamente sul modello finale.
Problemi di Batch Normalization
Gli strati di normalizzazione del batch (BN) giocano un ruolo importante nel modo in cui i modelli di deep learning apprendono. Assicurano che il processo di addestramento sia stabile e possono accelerare l'apprendimento. Tuttavia, quando i dati provengono da fonti diverse (Non-IID), le statistiche apprese da ogni modello locale possono essere incoerenti. Questo può rendere difficile combinare i modelli in modo efficace, risultando in una minore accuratezza.
Introduzione di FedFBN
Per migliorare questo, introduciamo un nuovo metodo chiamato FedFBN. Questo approccio è ispirato a metodi già di successo e utilizza reti pre-addestrate mantenendo le statistiche di normalizzazione del batch invariate durante l'addestramento. Così facendo, speriamo di ridurre i problemi causati da differenze nei dati migliorando la performance del modello globale.
Setup degli Esperimenti
Abbiamo condotto diversi esperimenti per testare l'efficacia di FedFBN. Abbiamo esaminato:
- Dati distribuiti ma contenenti tutte le etichette necessarie.
- Dati distribuiti con alcune etichette mancanti.
- Dati non-iid e completi.
- Dati non-iid e con etichette mancanti.
In tutti gli esperimenti, FedFBN è stato confrontato con altri metodi comuni, come il tradizionale FedAvg e un metodo recente chiamato FedBN.
Esperimenti Chiave
Esperimento 1: Dati IID Distribuiti con Etichette Complete
Nel nostro primo esperimento, abbiamo utilizzato due dataset sintetici con tutte le etichette di malattia. Qui abbiamo trovato che FedFBN ha performato altrettanto bene del modello di riferimento, dimostrando di potersi adattare bene a questa situazione ideale.
Esperimento 2: Dati IID Distribuiti con Etichette Parziali
Successivamente, abbiamo testato scenari in cui alcune etichette erano mancanti. Anche in questa situazione più complessa, FedFBN ha performato paragonabile al modello di riferimento, indicando che poteva comunque funzionare bene nonostante le informazioni mancanti.
Esperimento 3: Dati Non-IID Distribuiti con Etichette Complete
Nel terzo round, siamo passati a dati non-iid più complessi. Qui, FedFBN ha mantenuto livelli di performance simili ai modelli di riferimento, dimostrando di poter generare risultati affidabili in circostanze meno che ideali.
Esperimento 4: Dati Non-IID Distribuiti con Etichette Parziali
Infine, abbiamo affrontato il caso più difficile con dati non-iid e etichette mancanti. In questo scenario, FedFBN ha superato altri metodi, mostrando la sua capacità di adattarsi e apprendere efficacemente nonostante le sfide della varietà e scarsità dei dati.
Panoramica dei Risultati
In tutti gli esperimenti, FedFBN ha generalmente performato meglio di altri metodi. Nei casi con etichette parziali, ha mostrato una forte comprensione delle etichette di malattia condivise, performando bene anche quando le informazioni erano mancanti. Ha anche dimostrato robustezza nel trattare dati provenienti da diverse distribuzioni.
Conclusione
Affrontare i dati di imaging medico che sono distribuiti e non uniformemente etichettati è un passo cruciale per avanzare nelle pratiche cliniche. I nostri risultati supportano la capacità di FedFBN di creare Modelli Globali efficaci affrontando le sfide legate alla normalizzazione del batch e alla diversità dei dati. Questo dimostra che ci sono migliori alternative ai metodi comuni come il FedAvg, specialmente per quanto riguarda le realtà dei dati medici. Anche se c'è bisogno di ulteriori ricerche in contesti più ampi e diversi, i risultati iniziali suggeriscono che FedFBN ha un grande potenziale nell'aiutare a sviluppare strumenti di imaging medico utili.
In sintesi, mentre lavoriamo per migliorare l'uso del federated learning nella sanità, FedFBN offre nuove possibilità per un migliore addestramento dei modelli che rispetta la privacy dei pazienti mentre sfrutta la forza collettiva dei dati provenienti da varie istituzioni.
Titolo: Optimizing Federated Learning for Medical Image Classification on Distributed Non-iid Datasets with Partial Labels
Estratto: Numerous large-scale chest x-ray datasets have spearheaded expert-level detection of abnormalities using deep learning. However, these datasets focus on detecting a subset of disease labels that could be present, thus making them distributed and non-iid with partial labels. Recent literature has indicated the impact of batch normalization layers on the convergence of federated learning due to domain shift associated with non-iid data with partial labels. To that end, we propose FedFBN, a federated learning framework that draws inspiration from transfer learning by using pretrained networks as the model backend and freezing the batch normalization layers throughout the training process. We evaluate FedFBN with current FL strategies using synthetic iid toy datasets and large-scale non-iid datasets across scenarios with partial and complete labels. Our results demonstrate that FedFBN outperforms current aggregation strategies for training global models using distributed and non-iid data with partial labels.
Autori: Pranav Kulkarni, Adway Kanhere, Paul H. Yi, Vishwa S. Parekh
Ultimo aggiornamento: 2023-03-10 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://arxiv.org/abs/2303.06180
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2303.06180
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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