L'impatto dei predatori sul successo della bio-augmentazione
Uno studio rivela come i predatori del suolo influenzano la sopravvivenza dei batteri introdotti in ambienti inquinati.
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Indice
- Il Ruolo dei Predatori nel Suolo
- Scopo dello Studio
- Tipi di Suolo
- Introduzione dei Batteri
- Impostazione Sperimentale
- Quantificazione dei PAH
- Esaminare le Comunità di Predatori
- Risultati: Impatto della Bioaumento
- Cambiamenti nelle Popolazioni Batteriche
- Comunità Microbiche Arricchite
- Punti Chiave
- Conclusione
- Fonte originale
L'inquinamento causato dalle attività umane è un problema serio che colpisce l'ambiente, danneggiando sia gli ecosistemi che la vasta varietà di vita al loro interno. Un modo per affrontare questa questione è la bioaumento, che prevede l'aggiunta di microorganismi capaci di degradare sostanze nocive nel Terreno. Questo metodo è particolarmente utile per trattare inquinanti persistenti, come certi chimici noti come idrocarburi aromatici policiclici (PAH).
Il successo della bioaumento dipende da quanto bene i microorganismi introdotti sopravvivono e funzionano nel nuovo ambiente. La loro capacità di adattarsi è influenzata da varie sfide, come la disponibilità di risorse e la competizione con i microorganismi nativi. Anche se i ricercatori hanno spesso studiato la competizione per le risorse, l'impatto di organismi del suolo più grandi che consumano Batteri-chiamati predatori-è stato trascurato. Comprendere come questi predatori interagiscono con i microorganismi introdotti può darci preziose informazioni sull'efficacia della bioaumento.
Il Ruolo dei Predatori nel Suolo
Negli ecosistemi del suolo, i piccoli predatori, come certi protisti (organismi unicellulari) e alcuni batteri, giocano un ruolo importante. Aiutano a controllare le popolazioni di batteri tramite Predazione, il che può influenzare la sopravvivenza dei microbi introdotti. Gli organismi del suolo più grandi consumano spesso batteri, ma i loro effetti sui microorganismi appena aggiunti non sono stati studiati in modo approfondito.
La presenza di questi predatori può influenzare i tipi di batteri che si stabiliscono nel suolo. Quando la popolazione di batteri cambia, può alterare l'intera comunità di organismi del suolo. Questo significa che quando introduci nuovi batteri, anche la comunità di predatori potrebbe rispondere, influenzando il successo del processo di bioaumento.
Diversi tipi di suolo hanno diverse comunità di predatori, e la loro presenza può portare a risultati variabili durante gli sforzi di biorisanamento. Ad esempio, il suolo inquinato da molto tempo potrebbe sostenere predatori diversi rispetto al suolo che è stato contaminato solo di recente. Comprendere queste differenze è fondamentale per migliorare le strategie di bioaumento.
Scopo dello Studio
L’obiettivo di questo studio era esaminare gli effetti della predazione sulla sopravvivenza dei batteri introdotti e identificare quali organismi predatori potrebbero consumare questi microbi. Per farlo, i ricercatori hanno inoculato campioni di suolo con una specifica miscela di batteri in grado di degradare i PAH. Hanno osservato come questi batteri interagissero con i due tipi di suolo-uno con una lunga storia di contaminazione e l'altro con una storia di contaminazione breve.
Tipi di Suolo
Due tipi di suolo sono stati utilizzati nell'esperimento. Un tipo è stato prelevato da un'area inquinata, mentre l'altro proviene da un parco urbano senza contaminazione. Il suolo contaminato era stato precedentemente trattato con fanghi petrolchimici, portando a un mix di vari PAH. Il team di ricerca ha contaminato artificialmente il suolo non inquinato con una miscela di PAH specifici per creare un ambiente controllato per studiare il processo di degradazione.
Introduzione dei Batteri
I ricercatori hanno utilizzato una combinazione di due batteri, Sphingobium sp. e Burkholderia sp., noti per la loro capacità di degradare i PAH. Questi batteri sono stati marcati con un isotopo di carbonio speciale, permettendo al team di tracciare la loro presenza e attività nel suolo.
Impostazione Sperimentale
L'esperimento prevedeva la creazione di piccoli ambienti di suolo, noti come microcosmi, per osservare quanto bene i batteri inoculati sarebbero sopravvissuti e funzionati nel tempo. I microcosmi contenevano campioni di suolo monitorati per 30 giorni dopo l'introduzione dei batteri. I ricercatori controllavano regolarmente il suolo per livelli di umidità, temperatura e eventuali cambiamenti nelle popolazioni batteriche.
Quantificazione dei PAH
Durante l'esperimento, la concentrazione di PAH nel suolo è stata misurata a diversi punti nel tempo per vedere quanto efficacemente i batteri introdotti stessero degradando queste sostanze nocive. Confrontando i livelli di PAH prima e dopo l'introduzione dei batteri, i ricercatori potevano valutare quanto fosse successo il processo di bioaumento.
Esaminare le Comunità di Predatori
Per comprendere meglio le interazioni nel suolo, i ricercatori hanno anche analizzato le comunità di predatori presenti nei due tipi di suolo. Hanno utilizzato tecniche per estrarre e analizzare il DNA microbico, che ha aiutato a identificare quali organismi erano presenti e come erano coinvolti nella degradazione degli inquinanti.
Risultati: Impatto della Bioaumento
Nel suolo contaminato di recente, i batteri introdotti hanno rimosso con successo i PAH entro 30 giorni. Al contrario, i batteri non hanno mostrato la stessa efficacia nel suolo che era stato inquinato a lungo. Questa differenza ha messo in evidenza l'impatto della lunga storia di contaminazione, che ha probabilmente influenzato i tipi di predatori presenti e le loro interazioni con i batteri introdotti.
Cambiamenti nelle Popolazioni Batteriche
Dopo l'introduzione dei batteri, i ricercatori hanno osservato un cambiamento nelle popolazioni sia dei batteri introdotti che di quelli nativi. Nel suolo contaminato a breve termine, i batteri introdotti inizialmente prosperarono, ma i loro numeri diminuì nel tempo. Al contrario, nel suolo contaminato a lungo termine, i batteri introdotti hanno avuto difficoltà a sopravvivere, evidenziando la sfida rappresentata dalla comunità di predatori già stabilita.
Comunità Microbiche Arricchite
L'esperimento ha identificato molti tipi diversi di batteri che sono aumentati in numero dopo l'introduzione delle ceppi inoculati. Questo includeva sia organismi eucarioti che batterici che interagivano con i microbi introdotti. Lo studio ha rivelato come queste comunità cambiavano nel tempo, indicando le complesse relazioni nel suolo.
Nel suolo contaminato a breve termine, i batteri introdotti sono stati rapidamente incorporati nella rete trofica. Vari organismi eucarioti, principalmente protisti, hanno risposto rapidamente alla presenza dei nuovi batteri, indicando il loro ruolo nel ciclo dei nutrienti. Nel suolo contaminato a lungo termine, la risposta è stata diversa, con vari organismi ameboidi e altri predatori che hanno impiegato più tempo per incorporare i batteri introdotti.
Punti Chiave
Questo studio sottolinea l'importanza delle comunità di predatori nel successo della bioaumento. Mostra che i fattori ambientali possono influenzare come i batteri introdotti sopravvivono e funzionano nei suoli contaminati. Nei suoli inquinati a breve termine, i batteri introdotti erano più efficaci, ma nei suoli inquinati a lungo termine, i predatori già stabiliti ostacolavano notevolmente la loro capacità di prosperare.
Inoltre, comprendere le dinamiche delle relazioni predatore-preda negli ecosistemi di suolo può aiutare i ricercatori a sviluppare strategie di biorisanamento migliori. Identificando i principali gruppi predatori e comprendendo i loro comportamenti, gli sforzi futuri di bioaumento possono essere mirati a aumentare le possibilità di rimozione efficace degli inquinanti.
Conclusione
I risultati di questa ricerca evidenziano che, mentre l'introduzione di microorganismi può essere una strategia promettente per ripulire gli ambienti inquinati, il successo di questi sforzi dipende in gran parte dalle interazioni con la comunità di suolo esistente. Studiando queste relazioni, gli scienziati possono migliorare gli approcci per gestire l'inquinamento e ripristinare efficacemente gli ecosistemi.
Titolo: Analysis of predation-driven inoculum loss and carbon flow in bioaugmented soils through DNA-SIP
Estratto: Bioaugmentation is considered as a sustainable and cost-effective methodology to recover contaminated environments, but its outcome is highly variable. Predation is a key top-down control mechanism affecting inoculum establishment, however its effects on this process have received little attention. This study focused on the impact of trophic interactions on bioaugmentation success in two soils with different pollution exposure histories We inoculated a 13C-labelled pollutant-degrading consortium in these soils and tracked the fate of the labelled biomass through stable isotope probing (SIP) of DNA. We identified active bacterial and eukaryotic inoculum-biomass consumers through amplicon sequencing of 16S rRNA and 18S rRNA genes coupled to modified enrichment factor calculation. Inoculation effectively increased PAH removal in short-term polluted soils but not in long-term polluted soils. A decrease in the relative abundance of the inoculated genera was observed already on day 15 in the long-term polluted soil, while growth of these genera was observed in the short-term polluted soil, indicating establishment of the inoculum. In both soils, eukaryotic genera dominated as early incorporators of 13C-labelled biomass, while bacteria incorporated the labelled biomass at the end of the incubation period, probably through cross-feeding. We also found different successional patterns between the two soils. In the short-term polluted soil, Cercozoa and Fungi genera predominated as early incorporators, whereas Ciliophora, Ochrophyta and Amoebozoa were the predominant genera in the long-term polluted soil. Our results showed differences in the inoculum establishment and predator community behaviours, affecting bioaugmentation efficiency. This highlights the need to further study predation effects on inoculum survival to increase the applicability of inoculation-based technologies.
Autori: Esteban Emanuel Nieto, S. D. Jurburg, N. Steinbach, S. Festa, I. S. Morelli, B. Coppotelli, A. Chatzinotas
Ultimo aggiornamento: 2024-04-02 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.02.587735
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.02.587735.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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