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La vita microbica prospera in ambienti estremi

Uno studio svela come i microorganismi si adattano in ambienti estremi come Yellowstone.

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In alcuni ambienti estremi, si possono trovare piccole creature viventi chiamate Procarioti. Questi posti possono avere condizioni molto particolari come alta o bassa acidità, calore intenso, forte luce solare e alti livelli di sale. Queste condizioni somigliano a come era la Terra tanto tempo fa e potrebbero essere presenti anche su altri pianeti.

Tra i pochi tipi di eucarioti microbici che riescono a sopravvivere in questi ambienti difficili ci sono le alghe rosse, in particolare un gruppo conosciuto come Cyanidiophyceae. Questo include tipi noti come Galdieria e Cyanidioschyzon, che si trovano spesso in sorgenti termali e in siti minerari con luce, calore e acidità estremi. Queste alghe hanno sviluppato adattamenti speciali che permettono loro di prosperare dove la maggior parte della vita non può.

Uno dei modi in cui queste alghe si sono adattate a tali ambienti è attraverso un processo chiamato trasferimento genico orizzontale. Questo significa che hanno acquisito geni da altri organismi, aiutandole a resistere a metalli, tossine e condizioni dure.

Area di Studio

Per capire meglio come queste alghe e altri microrganismi interagiscono nei loro ambienti, i ricercatori hanno studiato aree lungo Lemonade Creek nel Parco Nazionale di Yellowstone (YNP). Si sono concentrati su tre habitat distinti: biofilm verdi e rigogliosi nel torrente, piccole forme di vita nascoste tra le rocce e terreni acidi vicino al torrente. L'obiettivo era vedere quali ruoli svolgono Cyanidiophyceae e procarioti in queste comunità e come rispondono ai cambiamenti di luce solare, che è importante per la loro crescita.

Campionamento e Metodi

I campioni da Lemonade Creek sono stati raccolti dai tre habitat in diversi momenti della giornata. Ogni ambiente è stato campionato più volte per avere un'idea precisa delle forme di vita presenti. I ricercatori hanno utilizzato tecniche avanzate per analizzare il materiale genetico presente nei campioni e per vedere quali tipi di interazioni avvenivano tra i diversi organismi.

Raccolta Dati

Per analizzare i materiali genetici, i ricercatori hanno elaborato i campioni per scoprire quali organismi erano presenti e quanti ce n'erano di ciascun tipo. Hanno creato assemblaggi di dati genetici per capire la diversità della vita in ciascun ambiente. Hanno anche esaminato come venivano espressi i geni, il che aiuta a determinare quali organismi erano attivi in diversi momenti della giornata.

Risultati da Lemonade Creek

Composizione Generale

Negli habitat studiati, le Cyanidiophyceae sono risultate essere gli organismi più dominanti. Un tipo, Cyanidioschyzon merolae, costituiva più della metà del materiale genetico trovato nel biofilm del torrente. Un altro tipo, Galdieria yellowstonensis, era presente ma in numero inferiore. Questi due tipi di alghe erano le principali forme di vita che producevano energia dalla luce solare in questi ambienti.

Interazione con i Procarioti

Oltre alle alghe, c'erano anche batteri e altri microrganismi presenti. Mentre le alghe erano i produttori principali, i batteri contribuivano anche alla comunità. I campioni hanno mostrato che diversi organismi coesistono in una rete complessa di interazioni, con alcuni che prosperano durante il giorno e altri di notte.

Cambiamenti Stagionali nell'Attività

Lo studio ha rivelato che le alghe seguivano un ritmo giornaliero influenzato dalla luce che cambiava. L'attività di Cyanidioschyzon merolae raggiungeva il massimo durante il giorno quando il sole era più forte, mentre Galdieria yellowstonensis mostrava più attività di notte. Questo suggerisce che diverse specie possono adattare i loro comportamenti e ruoli in base alle condizioni ambientali.

Disintossicazione di Sostanze Dannose

Sia le alghe che i batteri giocano ruoli importanti nella disintossicazione di sostanze dannose come l'arsenico e il mercurio nei loro habitat. Per esempio, alcuni geni legati alla disintossicazione dell'arsenico erano per lo più attivi nei batteri, mentre entrambi i tipi di alghe contribuivano alla disintossicazione del mercurio. Questa responsabilità condivisa sottolinea come diverse forme di vita collaborano per sopravvivere in ambienti difficili.

Cambiamenti Metabolici

I ricercatori hanno anche studiato le sostanze chimiche prodotte dagli organismi in questi habitat. Hanno scoperto che la concentrazione di vari metaboliti cambiava durante il giorno, riflettendo le attività metaboliche degli abitanti. Per esempio, alcune sostanze raggiungevano il picco a mezzogiorno quando la fotosintesi era più attiva.

Schemi di Espressione Genica

L'analisi dell'espressione genica ha mostrato che Cyanidioschyzon merolae aveva un alto numero di geni attivi durante il giorno rispetto alla notte. Questo suggerisce che stava fotosintetizzando attivamente quando la luce solare era disponibile. Al contrario, Galdieria yellowstonensis mostrava una maggiore attività genica di notte, indicando che potrebbe fare maggiore affidamento su materiali organici in assenza di luce solare.

Dinamiche della Comunità

Le dinamiche di queste comunità erano complesse. La presenza di più specie portava a risposte variabili ai cambiamenti ambientali, il che può influenzare la salute complessiva della comunità. Le interazioni osservate mostrano che gli organismi non esistono solo in isolamento, ma sono parte di un ecosistema più grande dove si influenzano e dipendono l'uno dall'altro.

Conclusione

La ricerca nel Lemonade Creek evidenzia le relazioni intricate tra i microrganismi che vivono in ambienti estremi. Cyanidiophyceae, in particolare Cyanidioschyzon merolae, svolgono un ruolo vitale come produttori primari, mentre i batteri contribuiscono anche ai processi di disintossicazione e stabilità della comunità. I risultati migliorano la nostra comprensione di come la vita possa prosperare in condizioni estreme e di come diversi organismi possano adattarsi a sopravvivere attraverso cooperazione e ruoli specializzati.

In generale, questo studio fornisce un'idea delle interazioni fondamentali che sostengono la vita in uno degli habitat più difficili della Terra, mostrando la resilienza e l'adattabilità di questi microrganismi.

Fonte originale

Titolo: Community-wide interactions sustain life in geothermal spring habitats

Estratto: We investigated an alga-dominated geothermal spring community in Yellowstone National Park, USA. Our goal was to determine how cells cope with abiotic stressors during diurnal sampling that spanned over two orders of magnitude in solar irradiance. We report a community level response to toxic metal resistance and energy cycling that spans the three domains of life. Arsenic detoxification is accomplished via complementary gene expression by different lineages. Photosynthesis is dominated by Cyanidioschyzon, with the mixotroph, Galdieria, relegated to nighttime heterotrophy. Many key functions, including the cell cycle, are strongly regulated by diurnal light fluctuations. These results demonstrate that biotic interactions are highly structured in extreme habitats. We suggest this was also the case on the early Earth when geothermal springs were cradles of microbial life, prior to the origin of eukaryotes.

Autori: Timothy G Stephens, J. Van Etten, T. McDermott, W. Christian, M. Chaverra, J. Gurney, Y. Lee, H. Kim, C. H. Cho, E. Chovancek, P. Westhoff, A. Otte, T. R. Northen, B. P. Bowen, K. B. Louie, K. Barry, I. V. Grigoriev, T. Mock, S.-L. Liu, S.-y. Miyagishima, M. Yoshinaga, A. Weber, H. S. Yoon, D. Bhattacharya

Ultimo aggiornamento: 2024-09-07 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.03.611078

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.03.611078.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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