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# Scienze della salute # Patologia

Migliorare le previsioni sul cancro al seno con macchie combinate

Combinare le macchie H&E e IHC porta a previsioni migliori per gli esiti del cancro al seno.

Abhinav Sharma, Fredrik K. Gustafsson, Johan Hartman, Mattias Rantalainen

― 6 leggere min


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Il cancro al seno è un problema di salute importante che colpisce tante persone in tutto il mondo. Per diagnosticarlo, i medici usano campioni di tessuto mammario chiamati campioni di istopatologia. Questi campioni vengono esaminati attraverso varie tecniche di colorazione. La colorazione più comune è l'ematossilina e eosina (H&E), che mostra la struttura generale delle cellule. Ci sono anche marcatori speciali, noti come colorazioni immunoistochimiche (IHC), che aiutano a identificare proteine specifiche nelle cellule.

I medici guardano a questi campioni colorati per classificare il cancro, il che può aiutare a prevedere come un paziente potrebbe rispondere al trattamento. Valutano caratteristiche come lo stato del Recettore degli estrogeni (ER) e del Recettore del progesterone (PR), insieme ai livelli di HER2 e Ki-67, per avere un'idea più chiara del comportamento del cancro.

Il Ruolo della Tecnologia nella Diagnosi del Cancro al Seno

Recentemente, il mondo della medicina ha visto cambiamenti entusiasmanti con l'introduzione della tecnologia digitale. La digitalizzazione della patologia consente immagini di alta qualità chiamate immagini a tutto campo (WSI). Con queste immagini, i modelli di apprendimento profondo possono analizzare i campioni e aiutare i medici a prendere decisioni sul trattamento. Potrebbe sembrare fantascienza, ma sta succedendo proprio ora!

Questi modelli sono stati usati per prevedere vari fattori legati alle risposte ai trattamenti e ai rischi per i pazienti, aprendo la strada a cure più personalizzate. Tuttavia, la maggior parte degli studi si è concentrata solo sulle immagini H&E.

Combinare Diverse Colorazioni per Previsioni Migliori

Mentre le colorazioni H&E sono state il punto di riferimento per oltre cento anni, è importante notare che le colorazioni IHC possono fornire informazioni preziose. Ogni colorazione ha intuizioni uniche sul cancro, e insieme possono offrire una visione complessiva. Immagina un puzzle in cui ogni pezzo rivela una parte dell'immagine; è così che funziona la combinazione di queste colorazioni.

I ricercatori sono stati curiosi di sapere se usare più colorazioni potesse portare a previsioni migliori sugli esiti dei pazienti rispetto a fare affidamento solo sulle colorazioni H&E. Così, hanno deciso di dare un'occhiata più da vicino.

Il Progetto di Studio

In un nuovo studio, i ricercatori volevano testare quanto bene un modello che usa sia immagini H&E che IHC potesse prevedere gli esiti dei pazienti. Si sono concentrati su pazienti trattati per cancro al seno invasivo in un ospedale di Stoccolma, Svezia. Hanno raccolto un dataset di 945 pazienti con informazioni complete sui loro campioni di istopatologia e varie caratteristiche cliniche.

Per garantire un test equo, i dati sono stati organizzati accuratamente. Questo ha coinvolto la suddivisione dei pazienti in diversi gruppi per ottimizzare i modelli di previsione e controllare come si comportassero.

Preparare le Immagini

Prima di immergersi nell'analisi, i ricercatori dovevano preparare le immagini. Questo includeva la rimozione di eventuali sfondi indesiderati e la suddivisione delle WSI in piastrelle più piccole. Pensala come se stessi tagliando una gigantesca pizza in fette gestibili. Se qualche fetta sembrava sfocata, veniva scartata, assicurando che venissero analizzate solo immagini chiare.

Poi, ogni immagine IHC è stata allineata con l'immagine H&E corrispondente. Questo processo è come far combaciare i pezzi di un puzzle, assicurando che tutti i dettagli si allineassero perfettamente.

Come Funziona il Modello

Una volta che tutto era pronto, i ricercatori hanno utilizzato due modelli per estrarre caratteristiche dalle piastrelle: UNI e CONCH. Questi modelli sono stati addestrati usando un gran numero di immagini patologiche. Funzionano come dei detective molto esperti, raccogliendo schemi e dettagli nelle immagini.

Le piastrelle di ogni colorazione sono state poi combinate per creare un set di caratteristiche completo. Questo set è stato usato per sviluppare un modello di Apprendimento a Molteplici Istanze (MIL) che poteva prevedere il punteggio di rischio per ciascun paziente. Questo significa che i ricercatori potevano stimare la probabilità che un paziente sperimentasse una recidiva di cancro o avesse bisogno di un trattamento aggiuntivo.

Valutare le Prestazioni del Modello

Per valutare quanto bene il loro modello funzionasse, i ricercatori hanno calcolato una metrica chiamata indice di concordanza (C-index). Questo numero ci dice quanto accuratamente il modello può prevedere gli esiti dei pazienti rispetto ai risultati reali.

I risultati hanno mostrato che il modello che usava solo le immagini H&E aveva un C-index di 0.65. Non male, giusto? Ma quando si combinano le immagini H&E con quelle IHC, il C-index è migliorato ulteriormente, arrivando fino a 0.72.

Cosa implica questo? Suggerisce che utilizzare entrambi i tipi di immagini insieme offre una previsione più accurata rispetto all'utilizzo di essi separatamente.

Variabili Cliniche e Loro Impatto

Per vedere se l'aggiunta di variabili cliniche potesse migliorare le previsioni, i ricercatori hanno anche esaminato fattori come l'età e la dimensione del tumore. Quando combinati con il modello a più colorazioni, hanno trovato che includere variabili cliniche ha fatto una leggera differenza nelle previsioni per alcuni modelli, ma non per tutti.

Immagina di cercare di cuocere una torta: aggiungere la giusta quantità di ingredienti può farla lievitare magnificamente. Tuttavia, a volte hai solo bisogno della giusta combinazione di glassa per farla davvero brillare!

Pesi di Attenzione e la Loro Significanza

I ricercatori volevano esplorare quanto il modello si concentrasse su diverse aree delle immagini tessutali. Per farlo, hanno esaminato i pesi di attenzione assegnati alle piastrelle. È come osservare dove un detective illumina il suo torcia mentre indaga su una scena del crimine.

Hanno scoperto che le aree di attenzione variavano significativamente. Ad esempio, nei modelli che utilizzavano solo colorazioni H&E, le aree di alta attenzione mostravano sovrapposizioni con i modelli che includevano sia immagini H&E che IHC. Questo suggerisce che certe caratteristiche di entrambe le colorazioni forniscono intuizioni preziose che possono migliorare le previsioni.

Cosa Hanno Scoperto?

Lo studio ha concluso che utilizzare una combinazione di colorazioni H&E regolari e marcatori IHC di routine ha migliorato la capacità di prevedere gli esiti dei pazienti per il cancro al seno. I risultati indicano che un mix di queste colorazioni cattura informazioni più rilevanti, portando a valutazioni di rischio migliori.

Anche se i risultati sono promettenti, è importante notare che i ricercatori hanno sottolineato la necessità di ulteriori ricerche. Testare questi modelli su popolazioni più ampie e con tempi di follow-up più lunghi aiuterebbe a confermare i loro risultati.

Il Futuro della Diagnosi del Cancro al Seno

Quindi, qual è il prossimo passo? I ricercatori puntano a convalidare i loro risultati con dati aggiuntivi per garantire che i loro modelli a più colorazioni siano affidabili. Vogliono anche esplorare tecniche di modellazione più complesse per analizzare come diverse colorazioni interagiscono tra loro.

Con il continuo avanzamento della tecnologia, si spera di fornire ai pazienti affetti da cancro al seno strumenti ancora migliori per diagnosi e valutazione del rischio, portando a opzioni di trattamento personalizzate.

In sintesi, la combinazione di diverse colorazioni può aiutare i medici a fare previsioni migliori sul cancro al seno. È un passo verso piani di trattamento più completi e informati che possono, in ultima analisi, aiutare a migliorare i risultati per i pazienti.

Brindiamo al futuro della diagnosi del cancro al seno, dove tecnologia e pensiero innovativo si incontrano, e magari un pizzico di umorismo! Perché se possiamo mescolare scienza con un po' di risate, potremmo semplicemente trovare un modo per rendere il percorso avanti un po' più facile.

Fonte originale

Titolo: Multi-stain modelling of histopathology slides for breast cancer prognosis prediction

Estratto: BackgroundPathologic assessment of the established biomarkers using standard hematoxylin & eosin (H&E) and immunohistochemical (IHC) stained whole slide images (WSIs) is central in routine breast cancer diagnostics and contributes prognostic and predictive information that guides clinical decision-making. However, other than only aggregated protein-expression values from IHC WSIs, a spatial combination of histo-morphological information from IHC and H&E WSIs can potentially improve prognosis prediction in breast cancer patients. In this study, we aim to develop a deep learning-based risk-stratification method for breast cancer using routine H&E and IHC-stained histopathology WSIs from resected tumours. MethodsThis is a retrospective study including WSIs from surgical resected specimens from 945 patients from the South General Hospital in Stockholm. One H&E and four IHC (ER, PR, HER2, and Ki-67) stained sections were included from each patient, retrieved from the same tumour block. The IHC WSIs with the H&E WSI were registered, and corresponding images patches (tiles) were extracted for each image modality. Features from the registered tiles were extracted using two existing and publicly available histopathology foundation models (UNI and CONCH). Using the extracted features together with time-to-event data, we optimised an attention-based multiple instance learning (MIL) model using the Cox loss (negative partial log-likelihood loss) and recurrence-free survival (RFS) as the survival endpoint. ResultsUsing cross-validation we observed a prognostic performance with a C-index of 0.65 (95%CI: 0.56 - 0.72) for the risk score prediction using only H&E WSIs and UNI as the tile-level feature extractor. Combinations of H&E with one or more IHC modalities were subsequently evaluated, with the highest performance observed in the model combining the H&E and PR WSI data and the model combining all the stains, obtaining a C-index of 0.72 (95% CI: 0.65 - 0.79) and 0.72 (95% CI: 0.64 - 0.79) respectively. ConclusionMultiple stain modalities are used in routine breast cancer pathology, but has not been considered together for prognostic modelling. The results in this study suggests that models combining morphological features extracted by histopathology foundation models across multiple stain modalities can improve prognostic risk-stratification performance compared to single-modality models.

Autori: Abhinav Sharma, Fredrik K. Gustafsson, Johan Hartman, Mattias Rantalainen

Ultimo aggiornamento: 2024-11-18 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.11.10.24317066

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.11.10.24317066.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia medrxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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