Come i latticini aiutano a rintracciare il virus H5N1
Il campionamento del latte al dettaglio rivela informazioni cruciali sul monitoraggio delle malattie zoonotiche.
Andrew J. Lail, William C. Vuyk, Heather Machkovech, Nicholas R. Minor, Nura R. Hassan, Rhea Dalvie, Isla E. Emmen, Sydney Wolf, Annabelle Kalweit, Nancy Wilson, Christina M. Newman, Patrick Barros Tiburcio, Andrea Weiler, Thomas C. Friedrich, David H. O’Connor
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Indice
- L'importanza del One Health
- H5N1 e il suo impatto
- Perché il latte è diventato un focus di Sorveglianza
- Test per HPAI nei prodotti caseari
- L'approccio tiled-amplicon
- Risultati dello studio
- Le implicazioni più ampie della ricerca
- I vantaggi del campionamento accessibile
- Limitazioni del campionamento del latte al dettaglio
- La necessità di una ricerca più completa
- Conclusione: le lezioni apprese e il futuro
- Fonte originale
- Link di riferimento
Nel nostro mondo interconnesso, la salute delle persone, degli animali e dell'ambiente è tutta collegata. Questa è l'idea alla base dell'approccio One Health. Dice che tutto è connesso, dai piccoli germi nei nostri corpi ai grandi ecosistemi all'esterno. Quando una parte è colpita, può avere un effetto a catena sugli altri.
L'importanza del One Health
Recentemente, abbiamo visto quanto sia importante questo approccio, specialmente con le malattie che passano dagli animali agli esseri umani, conosciute come malattie zoonotiche. Queste malattie possono causare gravi focolai e pandemie. Ecco perché gli esperti si concentrano su modi per studiare e prevenire queste malattie.
Una caratteristica chiave della strategia One Health è la necessità di una comunicazione chiara e collaborazione tra diverse aree della salute. Questo include condividere informazioni e lavorare insieme per migliorare la nostra risposta a malattie infettive emergenti. È come uno sport di squadra in cui ognuno deve fare la sua parte per vincere.
H5N1 e il suo impatto
Una delle malattie che ha destato allarmi è l'H5N1, un ceppo di influenza aviaria che colpisce sia gli uccelli che i mammiferi. Nel 2021, una versione pericolosa dell'H5N1 è stata avvistata in Nord America, colpendo fauna selvatica e pollame. Sfortunatamente, questo ha causato molte morti tra gli uccelli e il bestiame. Entro marzo 2024, un nuovo focolaio di H5N1 è stato confermato nel bestiame da latte in diversi stati. Questo ha sollevato preoccupazioni a causa del potenziale di trasmissione agli esseri umani, in particolare ai lavoratori del latte.
Sorveglianza
Perché il latte è diventato un focus diPerché il latte, ti starai chiedendo? Beh, è un prodotto alimentare che molte persone consumano. Gli scienziati hanno deciso di controllare se l'H5N1 era presente nel latte proveniente da fonti al dettaglio. Raccogliere campioni di latte dai negozi di alimentari potrebbe fornire un quadro più chiaro di dove il virus si stesse diffondendo, specialmente in aree dove controllare singole fattorie era difficile.
Nelle operazioni commerciali casearie, il latte proveniente da più mucche viene raccolto, rendendo più facile per gli scienziati testare grandi campioni senza dover andare fattoria per fattoria. Anche se la pastorizzazione (un processo che uccide i germi nel latte) di solito distrugge il virus, gli scienziati hanno scoperto che il materiale genetico del virus H5N1 poteva comunque essere rilevato.
Test per HPAI nei prodotti caseari
Nel corso di un periodo di due mesi, i ricercatori hanno raccolto 66 campioni di diversi prodotti caseari provenienti da vari stati. Hanno trovato che, tra tutti questi campioni, alcuni hanno dato esito positivo per il materiale genetico dell'H5N1. Per capire quanti campioni erano contaminati, hanno utilizzato un metodo chiamato RT-qPCR. Questa tecnica li ha aiutati a rilevare le impronte genetiche del virus.
Si scopre che i prodotti caseari al dettaglio, come latte e yogurt, possono essere utili per monitorare il virus H5N1. Anche se la pastorizzazione rende il virus innocuo, i ricercatori possono comunque imparare molto esaminando il latte per i marcatori genetici dell'H5N1.
L'approccio tiled-amplicon
Per approfondire ulteriormente sul virus, i ricercatori hanno usato un metodo chiamato sequenziamento tiled-amplicon. Questo termine tecnico significa che hanno suddiviso il codice genetico del virus in pezzi per analizzarlo meglio. Facendo ciò, sono riusciti a ottenere una buona porzione del codice del virus dai campioni positivi.
Hanno scoperto che alcune delle sequenze genetiche corrispondevano a quelle del virus H5N1 che causava i focolai, permettendo loro di capire come il virus si stesse evolvendo e diffondendo.
Risultati dello studio
Dai campioni raccolti, i ricercatori sono stati in grado di confermare quali stati avevano Contaminazione da H5N1 nei loro prodotti caseari. I risultati sono stati condivisi pubblicamente, aiutando i dipartimenti sanitari statali e altri ricercatori a rispondere rapidamente all'epidemia.
È interessante notare che lo studio ha rivelato che, mentre la maggior parte dei campioni aveva qualche tipo di materiale genetico virale, non tutti erano contaminati allo stesso modo. Alcuni campioni mostrano concentrazioni più elevate del materiale genetico del virus rispetto ad altri. I ricercatori hanno analizzato queste differenze per saperne di più sulla diffusione e la gravità dei focolai.
Le implicazioni più ampie della ricerca
I risultati del campionamento dei prodotti caseari al dettaglio si sono rivelati significativi per diversi motivi. In primo luogo, hanno rivelato lacune nei sistemi di test e sorveglianza. Molti stati non stavano controllando regolarmente l'H5N1 nei prodotti caseari, il che potrebbe portare a ritardi nell'identificazione dei focolai.
In secondo luogo, lo studio ha messo in evidenza il potenziale di utilizzare prodotti alimentari comuni come strumento di sorveglianza. Controllando articoli che le persone comprano comunemente, i ricercatori possono tenere d'occhio i virus senza fare affidamento solo sulle ispezioni delle fattorie.
I vantaggi del campionamento accessibile
Raccogliere campioni dai negozi di alimentari non è solo più conveniente; è anche economico. Dato che i prodotti caseari sono ampiamente distribuiti, testarli aumenta le possibilità di catturare potenziali focolai prima che si diffondano ulteriormente.
Inoltre, poiché il campionamento può essere fatto in laboratori di base, anche piccole strutture di test che non hanno caratteristiche di alta sicurezza possono partecipare al monitoraggio dell'H5N1. Questo democratizza il processo, rendendolo più inclusivo per i ricercatori di tutti i tipi.
Limitazioni del campionamento del latte al dettaglio
Tuttavia, non tutti i prodotti caseari sono uguali. Una grande percentuale di latte prodotto viene utilizzata per fare formaggio e altri prodotti piuttosto che essere venduta come latte fluido. Ciò significa che campionare il latte al dettaglio potrebbe saltare potenziali focolai che si verificano nelle fattorie focalizzate sulla produzione.
Inoltre, quando più fonti sono combinate in un prodotto, può essere difficile risalire alla fattoria originale. La complessità aumenta se vari ingredienti provengono da luoghi diversi, rendendo difficile individuare da dove potrebbe provenire il virus.
La necessità di una ricerca più completa
I ricercatori hanno riconosciuto che c'è bisogno di fare di più per migliorare la comprensione di come si diffonde l'HPAI. Gli stati hanno regole diverse riguardo ai test, il che può lasciare lacune nel monitoraggio. L'obiettivo è migliorare queste pratiche sulla base dei risultati di studi come questo.
In futuro, i ricercatori possono implementare politiche più ampie per il Testing e il monitoraggio che possono aiutare a garantire la sicurezza alimentare e la salute pubblica.
Conclusione: le lezioni apprese e il futuro
Qual è il messaggio finale di tutto questo lavoro? Innanzitutto, l'approccio One Health non è solo una teoria; è un quadro pratico che può essere applicato a problemi reali. Esaminare il legame tra la salute animale, la salute pubblica e la sicurezza alimentare può portare a risultati migliori per tutti.
Mentre affrontiamo focolai come l'H5N1, è fondamentale pensare in modo creativo a come possiamo monitorare e rispondere. I prodotti caseari al dettaglio offrono un'opportunità unica per gli scienziati di rilevare e analizzare malattie, ampliando gli strumenti disponibili per la protezione della salute pubblica.
E chissà? Forse la prossima grande scoperta nel monitoraggio delle malattie zoonotiche arriverà dal banco dei Latticini del tuo negozio di fiducia. Pensa un po': mentre prendi il tuo latte mattutino, gli scienziati potrebbero essere al lavoro per tenere tutti al sicuro. Così, la prossima volta che versi il latte nella tua ciotola di cereali, ricorda che potrebbe contenere più di solo colazione; potrebbe essere un pezzo chiave per tenere lontane le malattie.
In questo mondo sempre connesso, ogni piccolo passo conta, e ogni bicchiere di latte potrebbe far parte di una soluzione più grande. Quindi, alza il tuo bicchiere alla scienza, alla collaborazione e ai modi innovativi per proteggere la nostra salute e quella dei nostri amici pelosi!
Fonte originale
Titolo: Pasteurized retail dairy enables genomic surveillance of H5N1 avian influenza virus in United States cattle
Estratto: Highly pathogenic avian influenza (HPAI) viruses with H5 hemagglutinin (HA) genes (clade 2.3.4.4b) are causing an ongoing panzootic in wild birds. Circulation of these viruses is associated with spillover infections in multiple species of mammals, including a large, unprecedented outbreak in American dairy cattle. With limited testing of dairy herds, there is an unmet need for genomic surveillance. Infected cattle can shed high amounts of HPAI H5N1 viruses in milk, allowing detection in pasteurized retail dairy samples. Over a 2-month sampling period in one Midwestern city, we obtained dairy products processed in 20 different states. Here we demonstrate that a tiled-amplicon sequencing approach produced over 90% genome coverage at greater than 20x depth from 5 of 13 viral RNA positive samples. A combination of RT-qPCR testing and sequencing from retail dairy products can be a useful component of a One Health framework for responding to the avian influenza outbreak in cattle.
Autori: Andrew J. Lail, William C. Vuyk, Heather Machkovech, Nicholas R. Minor, Nura R. Hassan, Rhea Dalvie, Isla E. Emmen, Sydney Wolf, Annabelle Kalweit, Nancy Wilson, Christina M. Newman, Patrick Barros Tiburcio, Andrea Weiler, Thomas C. Friedrich, David H. O’Connor
Ultimo aggiornamento: 2024-12-13 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.12.12.24318872
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.12.12.24318872.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
Si ringrazia medrxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.
Link di riferimento
- https://www.idtdna.com/pages/tools/primerquest
- https://github.com/andersen-lab/avian-influenza
- https://dx.doi.org/10.17504/protocols.io.kqdg322kpv25/v1
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/
- https://github.com/dholab/Lail-et-al-2024-analysis-pipeline
- https://github.com/dholab/Lail-et-al-2024-analysis-pipeline/blob/main/pyproject.toml
- https://clades.nextstrain.org
- https://nextstrain.org/avian-flu/h5n1-cattle-outbreak/genome