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Présence du virus Zika au Sindh, Pakistan

Une étude révèle la circulation du virus Zika au Sindh, mettant en avant les défis de détection.

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Le virus Zika (ZIKV) a été identifié comme une cause de Fièvre chez les enfants et les adultes à travers le monde. Cependant, les pays d'Asie de l'Ouest et du Moyen-Orient n'ont pas encore vu beaucoup de cas. Au Pakistan, certains cas ont montré des signes d'Anticorps ZIKV, mais la fiabilité de cette info est incertaine à cause des problèmes pour détecter des virus similaires.

ZIKV est un virus qui mesure environ 40 à 60 nanomètres. Il a une couche extérieure protectrice et contient du matériel génétique fait d'ARN simple brin, qui fait environ 11 000 lettres de long. Cet ARN porte des instructions pour fabriquer des protéines qui aident le virus à fonctionner. ZIKV a plusieurs protéines qui l'aident à infecter les cellules hôtes et à se multiplier.

Ces dernières années, des épidémies d'autres virus comme la Dengue et le chikungunya ont touché beaucoup de gens au Pakistan. Le chikungunya a été confirmé récemment à Karachi, la plus grande ville du pays. Il peut y avoir des cas de ZIKV qui n'ont pas été signalés parce que ses symptômes peuvent être légers et ressemblent à ceux d'autres infections virales. Un bon système de test est nécessaire pour distinguer le ZIKV des autres virus apparentés.

Défis de Détection

Le ZIKV est souvent confondu avec d'autres virus parce qu'ils partagent des symptômes similaires. Le manque de cas confirmés au Pakistan ne signifie pas que le virus ne se propage pas. En fait, il est probable que le ZIKV soit présent mais ne soit pas signalé à cause de symptômes légers qui ne poussent pas les gens à chercher de l'aide médicale. Le ZIKV est transmis par les mêmes espèces de moustiques que la dengue et le chikungunya, et ils peuvent produire des symptômes similaires chez les personnes infectées.

Des recherches ont montré que le ZIKV circule souvent aux côtés d'autres virus apparentés comme la dengue, le virus du Nil occidental, le virus de l'encéphalite japonaise, et le virus de la fièvre jaune. Tester pour les anticorps peut être compliqué parce que la présence d'anticorps d'un virus peut affecter les résultats pour un autre. Ça rend difficile de savoir avec certitude si quelqu'un a le ZIKV. Malheureusement, il n'y a pas eu beaucoup d'études réalisées au Pakistan pour clarifier la situation.

Objectif de l'Étude

Le but principal de cette étude était de vérifier si le ZIKV était à l'origine des cas de fièvre chez des personnes de différentes zones de la province du Sindh, au Pakistan. Les chercheurs ont utilisé des méthodes de test spécifiques pour chercher le ZIKV chez les Patients ayant de la fièvre et d'autres symptômes similaires.

Éthique et Recrutement des Patients

Avant de commencer l'étude, les chercheurs ont obtenu l'approbation d'un comité d'éthique local. Les patients ayant une fièvre durant de 5 à 7 jours ont été approchés par des professionnels de santé formés. Les infos sur l'étude leur ont été partagées, et seuls ceux qui ont accepté de participer ont été inclus.

Lieux de l'Étude

Cinq hôpitaux dans la province du Sindh ont été choisis pour l'étude. Les membres du personnel ont été formés pour collecter des données et des échantillons auprès des patients. Les hôpitaux impliqués dans l'étude étaient situés dans des grandes villes, offrant un bon accès à une variété de patients.

Critères d'Inclusion et d'Exclusion

Les patients âgés de 10 à 65 ans présentant des symptômes de fièvre étaient éligibles pour participer. Ceux en dehors de cette tranche d'âge ou diagnostiqués avec d'autres maladies spécifiques comme la grippe ou la tuberculose n'ont pas été inclus dans l'étude.

Collecte de Données sur les Patients

Une étude transversale a été réalisée, et un total de 745 patients ont été inclus d'avril 2015 à juin 2017. Leurs échantillons de sang ont été prélevés pour tester le ZIKV, et divers facteurs y compris leur âge, sexe, et symptômes ont été enregistrés. Les symptômes évalués comprenaient la fièvre, des éruptions cutanées, des douleurs corporelles, des maux de tête, et d'autres signes de maladie. Des tests sanguins ont été effectués pour vérifier d'autres indicateurs de santé.

Les chercheurs ont considéré la présence d'anticorps ZIKV comme un signe d'infection possible au ZIKV, suivant les directives établies par les autorités de santé.

Résultats des Tests

Parmi les 745 patients, 4,9 % ont testé positifs pour des anticorps ZIKV sans montrer de signes d'infection d'autres virus similaires. Parmi ceux qui ont montré des signes d'infection, certains avaient des anticorps réagissant aussi à d'autres virus.

Les échantillons de sang ont d'abord été testés pour le virus de la dengue. Ceux testés négatifs pour la dengue ont ensuite été testés pour le ZIKV. Les niveaux d'anticorps ZIKV dans le sang des patients ont donné des informations sur une possible infection par le ZIKV.

Tests PCR en Temps Réel

L'ARN, le matériel génétique du ZIKV, a été extrait des échantillons des patients. Ce processus d'extraction a été réalisé avec soin pour préparer les échantillons pour les tests. En utilisant des outils et méthodes spécifiques, les chercheurs ont cherché à détecter la présence d'ARN du ZIKV.

Culture du Virus

Les équipes de recherche ont cultivé le ZIKV dans un laboratoire en utilisant des cellules spéciales. Elles ont surveillé la croissance du virus pour assurer des résultats de test précis. Le virus a été cultivé étape par étape pour analyser son comportement.

Tests de Neutralisation

Pour confirmer les infections par le ZIKV, les chercheurs ont effectué un test de neutralisation. Ce test consistait à mélanger le sérum des patients avec le virus dans une culture de laboratoire pour voir si le sérum pouvait empêcher le virus de provoquer une infection. Des résultats positifs indiquaient que les anticorps dans le sérum du patient pouvaient effectivement lutter contre le ZIKV.

Analyse Statistique

Les chercheurs ont utilisé des outils statistiques pour analyser les données. Ils ont comparé différentes catégories de patients en fonction des résultats des tests pour trouver des motifs chez ceux qui ont testé positif, négatif, ou montré une réactivité croisée avec d'autres virus.

Résultats sur le ZIKV dans le Sindh

Sur les 745 patients évalués, un petit pourcentage a testé positif pour des anticorps ZIKV. Les échantillons avec réactivité croisée ont montré que certains individus avaient des anticorps pouvant réagir avec plusieurs flavivirus comme la dengue et le virus du Nil occidental. La majorité des patients présentaient des symptômes légers.

Les symptômes cliniques communs parmi les patients positifs pour le ZIKV incluaient la fièvre, mais des symptômes spécifiques comme des éruptions cutanées et des maux de tête étaient monnaie courante dans tous les groupes de patients. Le sexe et l'âge n'ont pas notablement affecté les taux d'infection par le ZIKV.

Conclusion sur la Présence du ZIKV

D'après les résultats, il semble que le ZIKV circule au Pakistan, surtout dans la région du Sindh. L'étude souligne le besoin d'un meilleur système de test et de surveillance pour confirmer les infections par le ZIKV, car elles peuvent imiter d'autres maladies comme la dengue.

En confirmant le ZIKV par des tests spécifiques, les chercheurs visent à améliorer la compréhension de la propagation de ce virus au Pakistan. L'étude indique un besoin urgent de recherches continues pour surveiller le ZIKV et son impact sur la santé publique.

Les efforts futurs devraient se concentrer sur des méthodes de test simultanées, y compris des échantillons de sérum et d'urine, pour obtenir une image plus claire des infections par le ZIKV dans la région. Cela pourrait aider les professionnels de santé à mieux diagnostiquer et gérer les cas de maladies fébriles chez les patients.

Grâce à une surveillance et des tests appropriés, les responsables de la santé peuvent cartographier les risques et se préparer à de possibles augmentations des cas de ZIKV, surtout pendant la saison des moussons quand les populations de moustiques augmentent.

Source originale

Titre: Zika Virus looming epidemic in Pakistan: seroprevalence findings by plaque reduction neutralization test in the Sindh Region of Pakistan

Résumé: BackgroundZika virus (ZIKV) has emerged as a cause of febrile illness in children and adults globally. West Asian and Middle Eastern countries have not yet experienced the widespread emergence of ZIKV. In Pakistan, detection of ZIKV antibodies have been reported. However, the validity of this data is questionable given the current understanding of flaviviral antigenic cross-reactivity. In order to determine if ZIKV is circulating in the Sindh region of Pakistan, patients presenting to healthcare centers with an acute febrile dengue-like illness were evaluated for ZIKV infection. MethodsDengue virus (DENV) screening in patients was performed using a commercial ELISA Rapid Test NS1 antigen capture test. All DENV negative samples were tested for Zika virus, using a commercial IgM capture ELISA kit. Additionally, a plaque reduction neutralization test (PRNT) was performed to measure neutralizing antibodies. Singleplex, two-step Real-time PCR using general primers and probes was performed for the detection of Zika virus nucleic acid. ResultsPatients with acute dengue-like illness (DLI) presenting at healthcare centers in different sites throughout the Sindh region of Pakistan were recruited. A total of 745 patient samples were tested for ZIKV via IgM ELISA and RT-PCR. Thirty-seven samples (4.9%) tested positive for ZIKV IgM without any cross-reactivity to other flaviviruses tested simultaneously. These were considered as presumptive positive for ZIKV, selected presumptive positive samples (n=20) were confirmed using PRNT50 using Vero cells. All 20 samples showed ZIKV neutralization at PRNT50. ConclusionsOur study provides evidence that ZIKV is circulating in the Sindh region of Pakistan and is a probable cause of clinical dengue-like illness (DLI) cases that are seen seasonally in Pakistan.

Auteurs: Erum Khan, K. imtiaz, J. Farooqui, K. L. Barr, a. A. R. Kanji, D. Prakoso, Z. Azizullah, M. T. Long

Dernière mise à jour: 2023-05-01 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.04.27.23289241

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.04.27.23289241.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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