Apprentissage profond dans le diagnostic de la drépanocytose
L'analyse automatisée des globules rouges améliore le diagnostic de la drépanocytose.
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Table des matières
- Importance d'analyser les globules rouges
- Utilisation de l'Apprentissage profond pour la Classification des GR
- Collecte et traitement des données
- Le modèle d'apprentissage profond
- Importance de la morphologie des érythrocytes
- Lien entre l'hémoglobine et la drépanocytose
- Options de traitement pour la drépanocytose
- Avantages de l'analyse automatisée des GR
- Défis dans la classification des GR
- Amélioration de la performance du modèle
- Utilisation de LIME et SHAP pour l'interprétabilité
- Directions futures de la recherche
- Conclusion
- Source originale
- Liens de référence
La drépanocytose (SCD) est une maladie qui affecte la forme des Globules rouges (GR). Normalement, les GR sont ronds et flexibles, ce qui leur permet de circuler facilement dans les vaisseaux sanguins. Mais avec la SCD, ces cellules deviennent rigides et prennent une forme de croissant ou de faucille. Ce changement de forme peut entraîner divers problèmes de santé, y compris de la douleur et des complications dans différents organes.
Importance d'analyser les globules rouges
Identifier et compter les différentes formes des GR peut aider les médecins à diagnostiquer des maladies comme la SCD. En comprenant les formes et les conditions de ces cellules dans les échantillons de sang, les professionnels de santé peuvent prendre de meilleures décisions concernant les options de traitement. L'apprentissage automatique (ML) peut être un outil puissant dans ce processus, car il peut analyser des images d'échantillons de sang pour détecter et quantifier les formes déformées des GR.
Utilisation de l'Apprentissage profond pour la Classification des GR
Les avancées récentes en technologie ont permis aux chercheurs de développer des modèles d'apprentissage profond, en particulier les réseaux de neurones convolutionnels (CNN), qui peuvent classifier et quantifier les formes de GR. Dans cette approche, un modèle CNN spécial a été conçu pour faire la différence entre les formes normales et déformées des GR dans les images prises chez des patients atteints de SCD. L'accent était mis sur trois formes principales de GR : les discocytes (forme normale), les ovalocytes et les cellules falciformes.
Collecte et traitement des données
Pour entraîner le modèle d'apprentissage profond, des échantillons de sang ont été collectés auprès de patients diagnostiqués avec la SCD. Ces échantillons ont ensuite été analysés au microscope, produisant un total de 428 images brutes. Chaque image a été traitée pour générer 10 377 images de cellules uniques. Ce grand ensemble de données était nécessaire pour s'assurer que le modèle puisse apprendre à identifier correctement différentes formes de GR.
Le modèle d'apprentissage profond
Le modèle développé pour cette étude comprenait 18 couches d'architecture CNN. Cette configuration complexe a permis au modèle d'atteindre une précision élevée de 81 %, dépassant d'autres modèles utilisés dans des études antérieures. De plus, deux techniques, SHAP et LIME, ont été utilisées pour interpréter les prédictions du modèle, aidant à expliquer comment les décisions ont été prises en fonction des images entrantes.
Importance de la morphologie des érythrocytes
Les érythrocytes, ou globules rouges, transportent l'oxygène dans tout le corps. Toute variation de leur forme ou de leur contenu peut affecter leur fonction. L'Hémoglobine, une protéine dans les GR, joue un rôle essentiel dans ce processus. Comprendre comment l'hémoglobine change dans différentes conditions aide à expliquer l'importance d'analyser les formes des GR.
Lien entre l'hémoglobine et la drépanocytose
La SCD est causée par une mutation dans les gènes qui produisent l'hémoglobine. Cette mutation entraîne la production d'une hémoglobine anormale, provoquant le durcissement des GR et leur forme en faucille. Les GR en forme de faucille ont du mal à passer à travers de petits vaisseaux sanguins, ce qui entraîne des obstructions pouvant causer de la douleur et des dommages aux organes.
Options de traitement pour la drépanocytose
Gérer la SCD implique plusieurs options de traitement, y compris des médicaments, des transfusions sanguines et des thérapies visant à réduire la douleur et les complications. Les avancées récentes ont introduit de nouveaux médicaments sur le marché, mais les traitements de base comme les transfusions sanguines restent cruciaux. Surveiller et gérer les niveaux d'hémoglobine est vital pour prévenir des complications graves.
Avantages de l'analyse automatisée des GR
Analyser manuellement les images des GR peut être lent et sujet à des erreurs, même pour le personnel médical expérimenté. En automatisant ce processus avec des techniques d'apprentissage profond, les prestataires de santé peuvent gagner du temps et améliorer la précision dans le diagnostic des conditions. Les systèmes automatisés permettent un traitement plus rapide des échantillons de sang, permettant aux médecins de se concentrer davantage sur le soin des patients.
Défis dans la classification des GR
Malgré les avancées, il existe encore des défis pour classifier correctement les GR. Des problèmes comme les cellules qui se chevauchent dans les images peuvent rendre difficile pour le modèle d'identifier correctement les cellules uniques. C’est pourquoi des techniques de segmentation d'image sont essentielles pour séparer et analyser les GR individuels à partir d'images groupées.
Amélioration de la performance du modèle
Pour améliorer la performance du modèle d'apprentissage profond, plusieurs architectures CNN pré-entraînées ont été testées. Chaque modèle apportait des forces différentes à l'analyse. Parmi eux, un modèle CNN profond personnalisé a surpassé les autres, montrant une meilleure précision dans l'identification et la classification des formes de GR.
Utilisation de LIME et SHAP pour l'interprétabilité
En utilisant les algorithmes LIME et SHAP, les chercheurs ont pu interpréter les décisions prises par le modèle d'apprentissage profond. Ces outils ont fourni des informations sur les parties des images de GR qui ont influencé les prédictions, renforçant la transparence du modèle. Comprendre ces décisions est particulièrement crucial dans les applications médicales où les conséquences des erreurs peuvent être sérieuses.
Directions futures de la recherche
En regardant vers l'avenir, les chercheurs cherchent à expérimenter avec des ensembles de données plus grands et à incorporer d'autres types de formes de GR pour l'analyse. Cela aidera à améliorer la capacité du modèle à identifier diverses conditions et à contribuer à la compréhension globale des troubles sanguins. De plus, adapter le modèle à d'autres maladies améliorera son applicabilité en milieu clinique.
Conclusion
En résumé, l'exploration de la morphologie des GR par le biais de l'apprentissage profond offre une approche prometteuse pour diagnostiquer et gérer des maladies comme la SCD. À mesure que la technologie progresse, la capacité d'automatiser et d'analyser avec précision les images des GR aura un impact significatif sur les soins de santé, offrant un meilleur soutien aux cliniciens et améliorant les résultats pour les patients. Explorer ce domaine davantage pourrait mener à des méthodes révolutionnaires pour identifier diverses conditions liées au sang, améliorant en fin de compte les processus de diagnostic.
Titre: A Novel Deep Learning based Model for Erythrocytes Classification and Quantification in Sickle Cell Disease
Résumé: The shape of erythrocytes or red blood cells is altered in several pathological conditions. Therefore, identifying and quantifying different erythrocyte shapes can help diagnose various diseases and assist in designing a treatment strategy. Machine Learning (ML) can be efficiently used to identify and quantify distorted erythrocyte morphologies. In this paper, we proposed a customized deep convolutional neural network (CNN) model to classify and quantify the distorted and normal morphology of erythrocytes from the images taken from the blood samples of patients suffering from Sickle cell disease ( SCD). We chose SCD as a model disease condition due to the presence of diverse erythrocyte morphologies in the blood samples of SCD patients. For the analysis, we used 428 raw microscopic images of SCD blood samples and generated the dataset consisting of 10, 377 single-cell images. We focused on three well-defined erythrocyte shapes, including discocytes, oval, and sickle. We used 18 layered deep CNN architecture to identify and quantify these shapes with 81% accuracy, outperforming other models. We also used SHAP and LIME for further interpretability. The proposed model can be helpful for the quick and accurate analysis of SCD blood samples by the clinicians and help them make the right decision for better management of SCD.
Auteurs: Manish Bhatia, Balram Meena, Vipin Kumar Rathi, Prayag Tiwari, Amit Kumar Jaiswal, Shagaf M Ansari, Ajay Kumar, Pekka Marttinen
Dernière mise à jour: 2023-05-02 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2305.01663
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2305.01663
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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