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Découvrez ExPeRT : Un nouveau modèle pour prédire l'âge du cerveau

ExPeRT donne des explications claires pour les prédictions d'âge cérébral en utilisant des prototypes.

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L'apprentissage profond, c'est une techno qui aide les ordis à apprendre à partir des données. Dans le secteur de la santé, ça peut aider à prédire des trucs importants, comme l'âge du cerveau. Mais beaucoup de modèles d'apprentissage profond sont souvent perçus comme des "boîtes noires". Ça veut dire que quand ils font des Prédictions, c'est dur de comprendre comment ils en sont arrivés là. Cette manque de clarté pousse les docs à être hésitants à utiliser ces modèles dans la vie réelle.

Pour améliorer ça, les chercheurs cherchent des moyens de créer des modèles qui expliquent leurs prédictions de manière claire. Une de ces méthodes est d'utiliser des Prototypes, qui sont des exemples que le modèle apprend pendant l'entraînement. L'idée, c'est que si on peut montrer quels exemples ont conduit à une prédiction spécifique, ce sera plus facile pour les docs de faire confiance aux résultats.

La plupart des modèles prototypes existants se sont concentrés sur des tâches où tu classes des trucs en catégories. Mais beaucoup de tâches d'imagerie médicale impliquent de prédire des valeurs continues, comme l'âge du cerveau à partir des scans. Cet article présente un nouveau modèle appelé Expert (modèle explicable basé sur les prototypes pour la régression utilisant le Transport Optimal). Ce modèle est conçu spécifiquement pour les cas où on prédit des valeurs continues, comme l'âge du cerveau.

C'est quoi ExPeRT ?

ExPeRT est un modèle qui prédit l'âge d'un cerveau à partir d'images. Il fait ça en comparant de nouvelles images à un ensemble d'exemples appris (prototypes) qu'il a déjà vus. Chaque prototype représente des infos sur la structure et l'âge du cerveau. Quand une nouvelle image arrive, le modèle regarde à quel point elle est similaire à ces prototypes et fait une prédiction basée sur cette similarité.

Le modèle donne aussi des infos sur ses prédictions. Par exemple, il montre quelles parties de la nouvelle image sont similaires à quels prototypes. Ce détail aide les docs à comprendre pourquoi un certain âge a été prédit.

Le souci avec les modèles d'apprentissage profond actuels

Les modèles d'apprentissage profond peuvent avoir une grande précision, mais ils manquent souvent de Transparence. Si un doc reçoit une prédiction, il pourrait se demander comment cette prédiction a été faite. Par exemple, si un modèle dit qu'un cerveau est plus vieux que la moyenne, le doc voudrait savoir quelles preuves ont conduit à cette conclusion. Sans explications, les docs peuvent ne pas se sentir à l'aise d'agir sur les prédictions.

Beaucoup de modèles utilisent des méthodes de saillance pour expliquer leurs prédictions. Ces méthodes créent des cartes de chaleur qui soulignent quelles parties d'une image ont le plus contribué à la prédiction. Cependant, ces cartes peuvent être trompeuses. Elles pourraient mettre en avant des zones non pertinentes ou ne pas montrer les vraies raisons derrière une prédiction.

Il y a aussi un défi pour créer des modèles qui équilibrent performance et explicabilité. Les modèles faciles à comprendre pourraient ne pas être aussi performants en termes de précision. Ce compromis doit être abordé dans l'imagerie médicale.

Comparaison des approches pour prédire l'âge du cerveau

Il y a eu diverses tentatives pour rendre les prédictions de l'âge du cerveau plus explicables. Certains chercheurs ont utilisé des méthodes de saillance, mais celles-ci ne donnent pas toujours des explications fiables et cohérentes. D'autres méthodes ont consisté à examiner des sections plus petites des images cérébrales, connues sous le nom de patches, mais elles nécessitaient plusieurs modèles, rendant tout ça plus compliqué et gourmand en ressources.

Une méthode récente a utilisé un seul modèle pour prédire des âges à travers toutes les sections d'une image cérébrale, offrant des prédictions détaillées. Cependant, la précision de ces prédictions n'était pas aussi élevée que celle des modèles précédents. De plus, créer des modèles génératifs pour illustrer les changements liés à l'âge reste une tâche complexe qui nécessite souvent beaucoup de données.

Comment ExPeRT fonctionne

ExPeRT apprend à partir d'un ensemble d'exemples pendant son entraînement. Chaque exemple (ou prototype) est un point de référence clé représentant une certaine structure du cerveau et un âge. Quand une nouvelle image de cerveau est présentée, ExPeRT calcule la distance entre la nouvelle image et chaque prototype dans son espace de représentation interne. Le modèle utilise ensuite ces distances pour faire des prédictions.

Le processus commence par prendre une image et la transformer en un format que le modèle peut comprendre-c'est ce qu'on appelle une représentation latente. Chaque prototype dans le modèle a une représentation similaire. Le modèle mesure à quelle distance chaque prototype est de la nouvelle image. Les prototypes plus proches ont plus d'influence sur la prédiction finale.

Pour rendre les calculs de distances encore plus détaillés, ExPeRT décompose les images en petites parties ou patches. Il fait correspondre ces patches entre la nouvelle image et les prototypes pour mieux comprendre les similarités. Par exemple, si un patch de tissu cérébral dans la nouvelle image ressemble de près à un patch d'un prototype, ça renforce la prédiction.

Le modèle utilise aussi une technique appelée Transport Optimal (OT) qui aide à trouver la meilleure façon de faire correspondre les patches de la nouvelle image à ceux des prototypes. Cette technique aide à obtenir une compréhension plus précise et détaillée des similarités.

Entraînement du modèle

Pour entraîner ExPeRT, le modèle doit comprendre à quel point les images sont similaires en termes de contenu. Pendant l'entraînement, il compare les distances entre les nouvelles images, les prototypes, et leurs étiquettes (comme l'âge). Il apprend à minimiser les différences entre les distances et les différences d'étiquettes attendues.

Avec l'aide d'une fonction de perte, le modèle ajuste sa façon d'apprendre pour s'assurer que les prédictions correspondent aux différences d'âge réelles. Un bon modèle réduit l'écart entre les âges prédits et réels, connu sous le nom d'erreur absolue moyenne (MAE).

Le processus d'entraînement inclut l'utilisation de paires d'images et de prototypes. Le modèle s'améliore à chaque cycle d'entraînement jusqu'à atteindre une performance optimale.

Résultats des ensembles de données

ExPeRT a été testé sur deux types d'images médicales : des IRM pour adultes et des échographies fœtales. Pour les IRM d'adultes, il était important de comprendre comment le cerveau vieillit avec le temps. Pour les échographies fœtales, le modèle a prédit l'âge du cerveau pendant différentes étapes de la grossesse.

Dans ces tests, ExPeRT a mieux performé que les modèles traditionnels qui manquaient d'explicabilité. Les prédictions faites étaient non seulement précises mais fournissaient aussi une justification claire, ce qui est super précieux dans les contextes cliniques.

Les docs pouvaient voir quels prototypes influençaient les prédictions, leur permettant de valider les résultats avec leurs connaissances médicales. Cette couche supplémentaire de transparence aide à instaurer la confiance dans les résultats du modèle.

Avantages d'ExPeRT

Un des principaux avantages d'ExPeRT est sa capacité à expliquer ses prédictions. Les modèles traditionnels pourraient te donner la prédiction d'âge mais te laisser dans le flou sur comment ce chiffre a été atteint. En revanche, ExPeRT fournit des insights détaillés sur le processus décisionnel en montrant quelles parties de l'image correspondaient aux prototypes.

En plus, ExPeRT est flexible et peut s'appliquer au-delà de la simple prédiction de l'âge du cerveau. Il pourrait potentiellement fonctionner dans d'autres domaines de l'imagerie médicale ou d'autres tâches de prédiction continue.

De plus, ExPeRT peut gérer des ensembles de données grands et complexes efficacement, ce qui en fait un choix adapté pour diverses applications dans le domaine médical.

Conclusion

Pour résumer, ExPeRT offre une solution prometteuse pour rendre les prédictions de l'âge du cerveau plus fiables et compréhensibles. En utilisant l'apprentissage par prototypes et le Transport Optimal, il crée une explication détaillée de comment les prédictions sont faites.

Alors que le secteur de la santé se tourne de plus en plus vers des technologies avancées, avoir des modèles capables de fournir de la clarté dans leurs processus de décision sera crucial. ExPeRT comble le fossé entre performance et explicabilité, conduisant à une meilleure acceptation et confiance dans les applications d'apprentissage machine en médecine.

Les travaux futurs exploreront plus de façons d'améliorer les caractéristiques du modèle, potentiellement en intégrant des ensembles de données supplémentaires et en affinant les méthodes d'entraînement. Au fur et à mesure qu'on continue de développer ces technologies, le but reste de fournir des outils qui soutiennent les professionnels de la santé dans leur prise de décision critique.

Source originale

Titre: Prototype Learning for Explainable Brain Age Prediction

Résumé: The lack of explainability of deep learning models limits the adoption of such models in clinical practice. Prototype-based models can provide inherent explainable predictions, but these have predominantly been designed for classification tasks, despite many important tasks in medical imaging being continuous regression problems. Therefore, in this work, we present ExPeRT: an explainable prototype-based model specifically designed for regression tasks. Our proposed model makes a sample prediction from the distances to a set of learned prototypes in latent space, using a weighted mean of prototype labels. The distances in latent space are regularized to be relative to label differences, and each of the prototypes can be visualized as a sample from the training set. The image-level distances are further constructed from patch-level distances, in which the patches of both images are structurally matched using optimal transport. This thus provides an example-based explanation with patch-level detail at inference time. We demonstrate our proposed model for brain age prediction on two imaging datasets: adult MR and fetal ultrasound. Our approach achieved state-of-the-art prediction performance while providing insight into the model's reasoning process.

Auteurs: Linde S. Hesse, Nicola K. Dinsdale, Ana I. L. Namburete

Dernière mise à jour: 2023-11-06 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2306.09858

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2306.09858

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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