Améliorer l'analyse des données de santé avec des approches par blocs
De nouvelles méthodes améliorent l'analyse des données de santé pour les maladies chroniques.
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Table des matières
Ces dernières années, les chercheurs se sont de plus en plus intéressés aux modèles joints qui combinent des infos de deux types de données : une qui suit les changements dans le temps, comme les mesures de santé, et une autre qui enregistre des événements, comme les maladies ou les décès. Ces modèles aident à comprendre comment différents indicateurs de santé sont liés et peuvent être utiles pour faire des prédictions individuelles sur les résultats de santé.
Un domaine où c'est particulièrement utile, c'est l'étude des maladies chroniques multiples que les gens peuvent rencontrer. Quand quelqu'un a plus d'une maladie chronique en même temps, ça complique ses soins et son traitement. Comprendre comment ces conditions évoluent ensemble peut mener à de meilleures stratégies de gestion et de traitement.
Cependant, mettre en œuvre ces modèles peut être compliqué, surtout quand les processus impliqués deviennent complexes ou qu'il y a beaucoup de données. Avec la croissance des dossiers de santé, il devient plus difficile d'analyser les relations de manière efficace. Pour relever ces défis, de nouvelles méthodes ont été introduites pour simplifier le processus sans perdre en précision.
Modèles joints pour les données de santé
Les modèles joints qui connectent les Données longitudinales et les Données de survie ont gagné du terrain dans le domaine de la recherche en santé. Les données longitudinales examinent les changements dans le temps, par exemple, en mesurant plusieurs fois la pression artérielle d'un patient, tandis que les données de survie enregistrent quand des événements de santé importants se produisent, comme une crise cardiaque ou un décès.
Le but d'utiliser des modèles joints est d'analyser comment les changements dans les indicateurs de santé (les données longitudinales) sont liés au risque de vivre un événement (les données de survie). Ça aide à fournir des soins plus précis adaptés aux patients. Les chercheurs peuvent analyser des modèles et faire des prédictions basées sur les deux types de données, ce qui mène à des aperçus significatifs sur les résultats de santé.
Dans de nombreux cas, les patients peuvent passer d'un état de santé à un autre, par exemple, ne pas avoir de maladies chroniques puis en développer une ou plusieurs. Ce mouvement peut être représenté à l'aide d'un concept appelé modèles multistatés, qui étendent les modèles traditionnels pour tenir compte de ces conditions de santé changeantes.
Le besoin de méthodes améliorées
Malgré les avantages des modèles joints, ils présentent des exigences computationnelles importantes, surtout avec de gros ensembles de données. La complexité de ces modèles peut entraîner des limitations pratiques qui freinent leur utilisation dans des applications réelles. Cela signifie que même si les méthodes sont puissantes, elles peuvent ne pas être faisables pour que les chercheurs les appliquent à de plus grands ensembles de données de santé.
Les principaux problèmes viennent du besoin de calculer des estimations qui intègrent des informations de l'ensemble des données, ce qui rend le processus lent et inefficace. Quand les chercheurs essaient d'analyser des processus multistatés complexes avec de nombreuses transitions ou états, les calculs deviennent encore plus difficiles.
Pour résoudre ces problèmes, de nouvelles méthodologies ont été proposées qui décomposent le modèle en parties plus petites et plus gérables. Au lieu d'utiliser tout l'ensemble de données en même temps, ces méthodes se concentrent sur des sections plus petites des données, permettant une analyse plus rapide et plus efficace.
Nouvelles méthodologies : approches par blocs
Les approches par blocs proposées offrent une nouvelle perspective sur la gestion des données longitudinales et multistatées. En divisant la tâche globale en blocs plus petits, les chercheurs peuvent analyser chaque bloc indépendamment. Cette approche rend plus facile la spécification de différents modèles pour différents types de transitions, améliorant ainsi la flexibilité de l'analyse.
Ces méthodes utilisent le calcul parallèle, permettant de traiter différents blocs en même temps. Cela accélère non seulement l'analyse, mais aide aussi à améliorer la précision des estimations en n'utilisant que les données pertinentes à chaque bloc.
Deux principales stratégies sont proposées dans ces approches par blocs :
Décomposition des risques concurrents : Cette méthode sépare les processus multistatés en blocs basés sur des risques concurrents. Chaque bloc se concentre sur des transitions spécifiques, permettant aux chercheurs d'ajuster des modèles individuels qui n'utilisent que les données longitudinales et de temps à événement pertinentes.
Approche de transition unique : Cela pousse l'analyse encore plus loin en examinant chaque transition autorisée dans un bloc, en estimant le modèle de chaque transition séparément tout en utilisant encore les données longitudinales pertinentes.
Application des méthodologies
L'efficacité de ces nouvelles méthodologies a été testée via des études de simulation. Les chercheurs ont généré divers ensembles de données pour comparer les approches par blocs avec les méthodes traditionnelles. Les résultats ont montré que les approches par blocs fournissaient des estimations similaires, voire meilleures, tout en étant plus efficaces en termes de temps de calcul.
Dans la pratique, ces méthodologies ont été appliquées pour analyser des données de santé réelles provenant de dossiers électroniques de patients, en se concentrant sur la manière dont la pression artérielle est liée à la progression de plusieurs maladies chroniques. L'étude visait à déceler des modèles qui pourraient mener à de meilleures stratégies de gestion de la santé pour les personnes ayant plusieurs problèmes de santé.
Résultats et conclusions
Les études de simulation montrent que les méthodes par blocs proposées peuvent gérer avec succès de grands ensembles de données sans compromettre la précision. Il a été constaté que ces méthodes réduisent la charge computationnelle tout en maintenant une compréhension des relations entre les données longitudinales et les données d'événements.
Lorsqu'elles sont appliquées à de réelles données de santé, les approches par blocs ont révélé des modèles distincts dans la façon dont la pression artérielle change avec les maladies chroniques. Les résultats ont mis en évidence différentes structures d'association selon la transition de santé spécifique analysée. Cet aperçu est crucial, car il indique que les marqueurs de santé peuvent influencer les résultats de différentes manières selon les conditions de santé existantes d'un individu.
Implications pour les soins de santé
Les méthodologies par blocs améliorent non seulement l'efficacité computationnelle, mais renforcent aussi la capacité d'analyser des données de santé complexes. Cela signifie que les professionnels de santé peuvent s'appuyer sur des modèles plus précis quand ils prennent des décisions de traitement pour des patients avec plusieurs maladies chroniques.
En comprenant comment différents marqueurs de santé interagissent au fil du temps, les professionnels de santé peuvent élaborer des plans de traitement plus ciblés qui prennent en compte les parcours uniques que vivent les patients. Cela conduit à une meilleure gestion des maladies chroniques et en fin de compte, à de meilleurs résultats de santé pour les individus.
Directions futures
Bien que les méthodologies proposées soient prometteuses, il y a encore beaucoup de domaines à explorer. Les recherches futures peuvent se concentrer sur l'application de ces approches par blocs à une plus grande variété d'ensembles de données et de conditions de santé. Il y a aussi un potentiel pour intégrer des stratégies de modélisation plus sophistiquées, y compris des données longitudinales multivariées et des processus non-Markoviens, ce qui pourrait encore accroître l'utilité de ces méthodes en recherche santé.
Alors que les données continuent de croître en taille et en complexité, le besoin de techniques analytiques efficaces et robustes devient de plus en plus critique. Investir dans le développement de ces méthodes garantit que les chercheurs en santé peuvent suivre l'évolution des ensembles de données et continuer à fournir des aperçus précieux pour les soins aux patients.
Conclusion
En conclusion, le développement de méthodologies par blocs pour des modèles joints représente une avancée significative dans l'analyse des données de santé. En décomposant des modèles complexes en parties plus petites et plus gérables, les chercheurs peuvent faire des inférences efficaces et précises sans les limitations des méthodes traditionnelles.
Ces nouvelles approches ouvrent la voie à une meilleure compréhension des relations entre les marqueurs de santé et les événements, ce qui est particulièrement pertinent dans le contexte de l'augmentation de la multimorbidité chez les individus. Alors que les soins de santé continuent d'évoluer, de telles méthodologies joueront un rôle essentiel dans l'amélioration des soins aux patients et la gestion efficace des maladies chroniques.
Titre: Bayesian blockwise inference for joint models of longitudinal and multistate processes
Résumé: Joint models (JM) for longitudinal and survival data have gained increasing interest and found applications in a wide range of clinical and biomedical settings. These models facilitate the understanding of the relationship between outcomes and enable individualized predictions. In many applications, more complex event processes arise, necessitating joint longitudinal and multistate models. However, their practical application can be hindered by computational challenges due to increased model complexity and large sample sizes. Motivated by a longitudinal multimorbidity analysis of large UK health records, we have developed a scalable Bayesian methodology for such joint multistate models that is capable of handling complex event processes and large datasets, with straightforward implementation. We propose two blockwise inference approaches for different inferential purposes based on different levels of decomposition of the multistate processes. These approaches leverage parallel computing, ease the specification of different models for different transitions, and model/variable selection can be performed within a Bayesian framework using Bayesian leave-one-out cross-validation. Using a simulation study, we show that the proposed approaches achieve satisfactory performance regarding posterior point and interval estimation, with notable gains in sampling efficiency compared to the standard estimation strategy. We illustrate our approaches using a large UK electronic health record dataset where we analysed the coevolution of routinely measured systolic blood pressure (SBP) and the progression of multimorbidity, defined as the combinations of three chronic conditions. Our analysis identified distinct association structures between SBP and different disease transitions.
Auteurs: Sida Chen, Danilo Alvares, Christopher Jackson, Jessica Barrett
Dernière mise à jour: 2023-08-23 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2308.12460
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2308.12460
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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