Avancement de la détection des maladies cardiaques grâce à de nouveaux algorithmes
Un nouvel algorithme semble prometteur pour détecter efficacement les souffles cardiaques.
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Table des matières
- Le Problème des Méthodes de Détection Actuelles
- Notre Approche
- Défis de Données
- Le PhysioNet Challenge 2022
- Méthodes Utilisées dans Notre Algorithme
- Traitement des données
- Extraction de Caractéristiques
- Prédictions par Réseau Neuronal
- Modèles Semi-Markoviens Cachés
- Résultats
- Comparaison avec d'Autres Approches
- Discussion
- Importance de l'Étiquetage Précis
- Directions Futures
- Conclusion
- Source originale
Les maladies cardiaques sont une des principales causes de décès dans le monde, avec des millions de personnes qui en meurent chaque année. Malgré leur gravité, plein de types de maladies cardiaques ne sont pas très connus, ce qui fait que beaucoup de cas ne sont pas détectés, surtout chez les jeunes. Un problème courant est la maladie cardiaque valvulaire rhumatismale, qui touche beaucoup de gens, surtout dans les pays en développement. C'est super important de repérer ces maladies cardiaques tôt pour offrir un meilleur traitement et éviter des problèmes à long terme.
Pour détecter les maladies cardiaques, les docteurs écoutent souvent le cœur avec un stéthoscope. Ce truc leur permet d'entendre des sons anormaux, comme des souffles cardiaques, qui peuvent signaler des soucis avec les valves du cœur. Mais tous les docteurs n'ont pas le même niveau avec le stéthoscope, et beaucoup ne détectent pas les problèmes cardiaques correctement. Donc, il faut une méthode simple et pas chère pour tester ces maladies, surtout dans les endroits avec moins de ressources.
Le Problème des Méthodes de Détection Actuelles
Pour l'instant, le seul outil largement utilisé pour entendre les sons cardiaques en soins primaires, c'est le stéthoscope. Bien que ce soit un test rapide et simple, son efficacité peut varier beaucoup d'un docteur à l'autre. Un docteur expérimenté pourrait détecter les soucis de valve cardiaque avec précision à peine la moitié du temps. Ce taux de réussite plutôt bas montre qu'il faut trouver des méthodes plus fiables pour identifier les problèmes cardiaques, surtout dans des zones qui manquent de soins spécialisés.
L'analyse automatisée des sons cardiaques, qui utilise des enregistrements d'appareils électroniques, est une solution prometteuse pour améliorer la détection des souffles. Ces dernières années, des chercheurs ont proposé de nouvelles méthodes qui se basent sur l'apprentissage automatique et l'intelligence artificielle. Cependant, beaucoup de ces méthodes ont encore des soucis comme le sur-apprentissage, où le modèle apprend trop de ses données d'entraînement et ne fonctionne pas bien sur de nouvelles données.
Pour relever ce défi, le George B. Moody PhysioNet Challenge 2022 a demandé aux équipes de créer des Algorithmes capables de détecter les souffles cardiaques dans un nouvel ensemble de données pédiatriques. Ce défi avait pour but de comparer différentes méthodes et de trouver des solutions efficaces pour une utilisation clinique réelle.
Notre Approche
Dans notre travail, on présente un nouvel algorithme qui a bien marché au défi PhysioNet. Contrairement à beaucoup d'autres équipes qui se sont basées sur des modèles complexes d'apprentissage profond, notre méthode a utilisé un truc différent basé sur des leçons apprises lors des défis précédents. On se concentre sur une analyse comparative, en examinant comment notre algorithme a performé sur deux tâches distinctes.
Défis de Données
Un gros souci dans la recherche sur l'analyse automatisée des sons cardiaques, c'est la disponibilité de données de qualité. La plupart des stéthoscopes utilisés dans les hôpitaux sont encore des modèles analogiques traditionnels, ce qui signifie que les enregistrements des sons cardiaques ne sont pas souvent gardés. Ça complique la création de jeux de données complets pour la recherche. Par conséquent, les chercheurs se basent souvent sur des données disponibles publiquement, mais ces ensembles présentent leurs propres défis.
Un exemple de jeu de données utile est celui du défi PhysioNet 2016. Cependant, cet ensemble a des limites, car il ne comprend pas assez de détails sur la façon dont les enregistrements ont été faits ou sur les résultats des patients. Le défi 2022 visait à surmonter certaines de ces barrières en fournissant un nouvel ensemble de données spécialement conçu pour cet objectif.
Le PhysioNet Challenge 2022
Les participants au PhysioNet Challenge 2022 devaient développer des algorithmes pour détecter les souffles cardiaques et prédire les résultats de santé des patients en utilisant un nouvel ensemble de données collectées au Brésil. Cet ensemble contient des enregistrements réalisés avec un stéthoscope électronique spécifique chez plusieurs patients au cours de divers programmes de dépistage.
Le défi a fourni des données en deux parties principales : une pour entraîner les algorithmes et une autre pour tester leurs performances. Au fur et à mesure que les équipes développaient leurs algorithmes, elles pouvaient affiner leurs modèles en fonction de leurs performances sur l'ensemble de validation.
Méthodes Utilisées dans Notre Algorithme
Notre algorithme a utilisé une combinaison de techniques pour analyser efficacement les sons cardiaques. Voici un aperçu des étapes de notre approche.
Traitement des données
Pour commencer, on a transformé les enregistrements bruts des sons cardiaques en un format plus facile à analyser. Cela a impliqué de normaliser l'amplitude des sons, permettant une comparaison cohérente quel que soit l'utilisation du stéthoscope ou la condition du patient. On s'est concentré sur l'extraction de caractéristiques clés des enregistrements, qui peuvent servir d'indicateurs de la santé cardiaque.
Extraction de Caractéristiques
En traitant les enregistrements, on a créé une représentation visuelle appelée log-spectrogramme. Ce format nous permet d'observer les changements de fréquence au fil du temps, ce qui aide à identifier différents sons cardiaques. On a utilisé une méthode qui lisse le bruit indésirable et améliore la clarté des signaux observés.
Prédictions par Réseau Neuronal
Ensuite, on a appliqué un Réseau de neurones récurrent (RNN) pour faire des prédictions sur ce qu'on a entendu dans les enregistrements. Ce type de réseau est conçu pour gérer des séquences de données, parfait pour analyser le son dans le temps. Le RNN se concentre sur la distinction entre différents sons cardiaques comme S1, S2 et les souffles.
Modèles Semi-Markoviens Cachés
Pour peaufiner nos prédictions, on a utilisé des modèles semi-Markoviens cachés. Ces modèles aident à interpréter la sortie de notre RNN pour segmenter les sons cardiaques avec précision, en tenant compte du temps et de la séquence des événements. Cette méthode améliore notre capacité à identifier les souffles et à évaluer la qualité des enregistrements.
Résultats
Notre algorithme a obtenu des résultats impressionnants dans les deux tâches du défi. Dans la tâche de détection des souffles, il avait un taux de sensibilité de près de 93%, ce qui signifie qu'il pouvait identifier correctement un pourcentage élevé de cas où des souffles étaient présents. Dans la tâche de résultat clinique, notre algorithme s'est classé premier, montrant son efficacité à prédire la santé des patients en fonction de leurs sons cardiaques.
Comparaison avec d'Autres Approches
Beaucoup d'autres équipes se sont largement appuyées sur des modèles d'apprentissage profond, qui sont puissants mais peuvent facilement surajuster des petits ensembles de données. En revanche, notre approche, utilisant des modèles plus simples combinés à des techniques de traitement des données efficaces, a bien fonctionné sur différents ensembles de test. On a constaté que les équipes avec des algorithmes plus complexes avaient parfois du mal à généraliser, tandis que notre méthode structurée a donné de bons résultats sans surajustement.
Discussion
Bien que notre algorithme ait montré du succès dans la détection des souffles cardiaques et la prédiction des Résultats cliniques, il reste des défis à relever. Un point crucial est la dépendance à des étiquettes précises pour les sons cardiaques, qui peuvent varier selon l'expérience du clinicien et l'équipement.
Importance de l'Étiquetage Précis
La qualité des annotations des sons cardiaques est essentielle pour entraîner et évaluer les algorithmes. Notre ensemble de données avait des annotations faites par un seul clinicien, ce qui pourrait mener à des incohérences. À l'avenir, avoir plusieurs évaluateurs pour étiqueter pourrait améliorer la fiabilité des données.
Directions Futures
Pour la suite, on vise à explorer comment notre algorithme peut intégrer plus d'infos sur les patients, comme l'âge et l'historique médical, pour améliorer encore plus les prédictions. En se concentrant sur des types spécifiques de maladies cardiaques qui produisent des sons distincts, on peut développer des outils qui soient non seulement sensibles mais aussi spécifiques à certaines conditions.
Conclusion
En résumé, notre algorithme représente un pas important vers l'amélioration de la détection des souffles cardiaques et la prédiction des résultats des patients. La combinaison de techniques de modélisation avancées, de traitement efficace des données et d'évaluation soignée a conduit à un succès notable lors du PhysioNet Challenge 2022. En continuant à peaufiner ces méthodes et à adresser les limitations actuelles, on peut contribuer à de meilleurs outils de surveillance de la santé cardiaque qui pourraient aider beaucoup de patients à l'avenir.
Globalement, nos résultats soulignent le potentiel de l'analyse automatisée des sons cardiaques pour améliorer la pratique clinique, surtout dans des environnements où l'accès aux spécialistes est limité. D'autres efforts devraient se concentrer sur des mises en œuvre faciles d'utilisation de ces outils pour promouvoir leur utilisation généralisée dans les milieux de soins primaires.
Titre: A recurrent neural network and parallel hidden Markov model algorithm to segment and detect heart murmurs in phonocardiograms
Résumé: Detection of heart disease using a stethoscope requires significant skill and time, making it expensive and impractical for widespread screening in low-resource environments. Machine learning analysis of heart sound recordings can improve upon the accessibility and accuracy of diagnoses, but existing approaches require further validation on larger and more representative clinical datasets. For many previous algorithms, segmenting the signal into its individual sound components is a key first step. However, segmentation algorithms often struggle to find S1 or S2 sounds in the presence of strong murmurs or noise that significantly alter or mask the expected sound. Segmentation errors then propagate to the subsequent disease classifier steps. We propose a novel recurrent neural network and hidden semi-Markov model (HSMM) algorithm that can both segment the signal and detect a heart murmur, removing the need for a two-stage algorithm. This algorithm formed the CUED Acoustics entry to the 2022 George B. Moody PhysioNet challenge, where it won the first prize in both the challenge tasks. The algorithms performance exceeded that of many end-to-end deep learning approaches that struggled to generalise to new test data. As our approach both segments the heart sound and detects a murmur, it can provide interpretable predictions for a clinician. The model also estimates the signal quality of the recording, which may be useful for a screening environment where non-experts are using a stethoscope. These properties make the algorithm a promising tool for screening of abnormal heart murmurs. Author summaryThe use of machine learning algorithms to detect heart disease from sound recordings has great potential to enable widespread and low-skill screening, improving early detection and treatment. The area has seen increasing interest in recent years, with many novel algorithms inspired by deep learning advancements in other fields. However, the size of heart sound datasets remains small, making deep learning models particularly susceptible to overfitting. In addition, the performance of these algorithms has rarely been directly compared on unseen data. We describe a novel lightweight algorithm to detect and classify murmurs in heart sound recordings. This algorithm was the winning entry into the George B. Moody PhysioNet 2022 challenge, beating many complex deep-learning approaches. Our approach both detects and localises the murmur, providing an interpretable result for a clinician.
Auteurs: Andrew McDonald, M. J. F. Gales, A. Agarwal
Dernière mise à jour: 2023-12-29 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.26.23300540
Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.26.23300540.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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