FairEHR-CLP : Une nouvelle approche pour les prédictions en santé
Présentation de FairEHR-CLP, un cadre pour des prédictions de santé justes et précises utilisant des données EHR.
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Table des matières
- L'Importance des Prédictions Équitables en Santé
- Aperçu du Cadre FairEHR-CLP
- Le Problème des Biais dans les DSE
- Méthodes Existantes et Leurs Limites
- Cadre FairEHR-CLP
- Génération de Contreparties Synthétiques
- Prédictions Sensibles à l'Équité avec l'Apprentissage Contrastif
- Configuration Expérimentale
- Métriques d'Évaluation
- Résultats Principaux
- Étude d'Ablation
- Modalités de Données
- Composants du Modèle
- L'Importance de
- Analyse des Attributs Sensibles
- Conclusion
- Limitations et Travaux Futurs
- Impacts Plus Larges
- Exemples de Données DSE
- Démographiques
- Données Longitudinales
- Notes Cliniques
- Détails de Mise en Œuvre
- Source originale
Dans le secteur de la santé, l'équité dans les prédictions est super importante. Les Dossiers de santé électroniques (DSE) sont essentiels pour prendre des décisions médicales, mais les méthodes actuelles de prédiction ignorent souvent les biais sociaux importants liés aux données Démographiques. Ça peut mener à un traitement injuste pour certains groupes. Cet article présente FairEHR-CLP, un nouveau cadre qui vise à créer des prédictions justes et précises en utilisant l'Apprentissage contrastif avec les données DSE.
L'Importance des Prédictions Équitables en Santé
Les décisions en santé peuvent changer des vies. Cependant, si les modèles prédictifs sont biaisés, ils peuvent aggraver les inégalités existantes. Par exemple, des études montrent que certains groupes raciaux sont moins susceptibles de recevoir des médicaments contre la douleur par rapport à d'autres, même s'ils ont les mêmes conditions médicales. Ces biais dans les données d'entraînement peuvent amener les modèles à répéter ces disparités, affectant les soins en fonction de la race ou du genre. Il est crucial de développer des modèles prédictifs qui soient à la fois efficaces et équitables pour s'assurer qu'aucun groupe ne soit traité de manière injuste.
Aperçu du Cadre FairEHR-CLP
Il existe plein de méthodes pour améliorer l'équité dans les modèles prédictifs, mais elles ont souvent des limites. Les techniques de prétraitement modifient les données d'entraînement mais peuvent mener au surapprentissage. Les méthodes de post-traitement modifient les résultats après l'entraînement, ce qui peut prendre du temps. Celles qui se concentrent sur l'entraînement ignorent souvent la nature complexe des biais sociaux. FairEHR-CLP vise à résoudre ces problèmes avec une approche en deux étapes.
Dans la première étape, des contreparties synthétiques pour chaque patient sont générées. Ça signifie créer diverses identités démographiques tout en gardant les données de santé essentielles intactes. Dans la deuxième étape, le cadre utilise l'apprentissage contrastif pour aider à aligner les données des patients à travers des attributs démographiques sensibles tout en optimisant les prédictions avec un classificateur. Cette méthode prend en compte les défis uniques posés par les DSE, comme les tailles de groupes différentes et les déséquilibres de classes.
Le Problème des Biais dans les DSE
Les DSE contiennent une tonne d'informations sur les patients, mais ils reflètent souvent des biais systémiques qui proviennent des différences démographiques, socio-économiques et d'accès aux soins de santé. Ces biais peuvent amener les algorithmes entraînés sur ces données à renforcer ou même aggraver les inégalités. Par exemple, des études indiquent que les patients noirs sont moins susceptibles de recevoir un soulagement adéquat de la douleur par rapport à leurs homologues blancs, une tendance qui peut avoir de graves conséquences sur les soins aux patients.
Comme les décisions de santé peuvent changer la vie, il est crucial de s'assurer que les outils prédictifs ne nuisent pas involontairement aux groupes marginalisés. Par conséquent, il est essentiel de développer des modèles prédictifs qui accordent la priorité à l'équité et à l'efficacité.
Méthodes Existantes et Leurs Limites
Les méthodes actuelles pour améliorer l'équité dans les modèles prédictifs DSE tombent généralement dans trois catégories, toutes ayant leurs propres défauts. Les techniques de prétraitement modifient la distribution des données d'entraînement par échantillonnage ou d'autres méthodes, mais cela peut mener à un surapprentissage ou à des distorsions. Les techniques de post-traitement apportent des modifications après la fin de l'entraînement, ce qui peut être lent et coûteux en ressources. Les stratégies in-process comme la régularisation de la fonction de perte ou l'entraînement adversarial ignorent souvent l'interaction des biais sociaux complexes.
Ces défis soulèvent une question importante : Comment créer un modèle de prédiction équitable qui aborde efficacement les biais sociaux tout en utilisant les données démographiques comme prédicteurs ?
Pour répondre à cela, FairEHR-CLP utilise les données démographiques de manière responsable tout en minimisant les biais sociaux associés. Par exemple, si deux patients ont les mêmes problèmes de santé mais diffèrent par leur genre et leur ethnie, le modèle apprend des deux cas pour identifier des schémas de santé qui traversent les lignes démographiques. Cette méthode se concentre sur les similitudes en matière de santé plutôt que sur les différences démographiques.
Cadre FairEHR-CLP
FairEHR-CLP se compose de deux phases principales. La première phase est la génération de contreparties synthétiques, où des identités démographiques diverses sont créées pour chaque patient tout en conservant des informations de santé clés. La deuxième phase concerne la réalisation de prédictions en utilisant l'apprentissage contrastif, visant à réduire les différences de représentation entre les patients réels et leurs contreparties synthétiques.
Génération de Contreparties Synthétiques
La première étape de FairEHR-CLP consiste à générer des contreparties synthétiques pour les attributs sensibles, y compris la race, le genre, l'âge et le statut socio-économique. Pour chaque patient, une contrepartie synthétique est créée qui représente une identité démographique différente tout en maintenant l'intégrité des données de santé. Par exemple, si un patient est un homme blanc de 60 ans, la contrepartie synthétique pourrait être une femme noire de 65 ans ayant des conditions de santé similaires.
Cette étape améliore la représentation pour différentes démographies tout en veillant à ce que les informations de santé importantes restent inchangées. Les échantillons synthétiques sont ensuite utilisés avec les données réelles pour l'entraînement prédictif sans influencer les prédictions finales faites dans FairEHR-CLP.
Prédictions Sensibles à l'Équité avec l'Apprentissage Contrastif
Une fois que les données des patients réels et les contreparties synthétiques sont prêtes, l'étape suivante est de faire des prédictions sensibles à l'équité utilisant l'apprentissage contrastif. Pendant l'entraînement, chaque patient a des échantillons positifs définis comme leurs contreparties synthétiques, qui partagent des conditions de santé similaires mais diffèrent en démographie. Les échantillons négatifs sont tous les autres patients dans le lot d'entraînement.
Pour encoder les données provenant des échantillons réels et synthétiques, différents types de données patient sont traités de manières spécifiques. Les données démographiques sont traitées avec un modèle standard, tandis que les données de santé longitudinales sont traitées à l'aide de techniques avancées pour capturer leurs caractéristiques uniques. Les notes cliniques sont transformées à travers un modèle de représentation textuelle spécialisé. Les représentations combinées sont ensuite ajustées pour tenir compte des biais potentiels.
L'objectif total est de minimiser les biais et d'améliorer la performance à travers un objectif d'apprentissage combiné.
Configuration Expérimentale
Pour tester FairEHR-CLP, des expériences ont été menées en utilisant trois ensembles de données DSE. Ces ensembles de données se concentraient sur les patients chirurgicaux âgés de 50 ans ou plus, un groupe souvent impacté par des biais sociaux. Les trois tâches ciblées comprenaient l'identification de conditions comme le délire et le trouble lié à l'utilisation d'opioïdes (TLOU), ainsi que le suivi des réadmissions dans les 30 jours.
Métriques d'Évaluation
Pour évaluer comment FairEHR-CLP a performé, deux types de métriques ont été utilisées : la performance de classification et les métriques d'équité. Les scores F1 et les métriques AUROC ont fourni des informations sur la précision prédictive, tandis que des métriques d'équité comme les Chances Équilibrées (EO) et l'Indice de Disparité de Distribution d'Erreur (EDDI) ont mesuré l'équité à travers les groupes démographiques. Ces métriques aident à déterminer à quel point le modèle évite les biais tout en maintenant des prédictions efficaces.
Résultats Principaux
Les résultats ont montré que FairEHR-CLP a constamment surpassé d'autres méthodes tant en performance de classification qu'en équité. Par exemple, il a obtenu de meilleurs scores F1 et AUROC par rapport à des méthodes de classification sans caractéristiques démographiques, soulignant l'efficacité d'utiliser les caractéristiques démographiques de manière responsable. Comparé à des méthodes de dé-biaisage spécialisées, FairEHR-CLP a mieux performé dans la plupart des contextes, montrant qu'il peut gérer les biais sans sacrifier la puissance prédictive.
Étude d'Ablation
Les études d'ablation évaluent l'impact de différentes composantes de FairEHR-CLP sur sa performance globale. Divers aspects, tels que les modalités de données et l'efficacité des composants clés au sein du cadre, ont été évalués pour comprendre leur influence sur l'équité et l'utilité.
Modalités de Données
Les études ont révélé que l'utilisation d'une combinaison de données démographiques de patients et de données de santé longitudinales améliorait la performance plus que d'autres combinaisons. Dans l'ensemble, l'utilisation de l'ensemble de données complet a entraîné les meilleurs résultats, tant en précision de prédiction qu'en équité.
Composants du Modèle
L'importance des composants clés du modèle comme l'apprentissage contrastif et la couche de pertinence dynamique a également été évaluée. Les résultats ont indiqué que le retrait de ces composants entraînait des baisses significatives de performance et d'équité, soulignant leurs rôles complémentaires dans l'obtention de prédictions équilibrées.
L'Importance de
Les variations dans l'hyperparamètre d'équilibrage ont montré que des valeurs plus basses avaient tendance à privilégier la précision par rapport à l'équité, tandis que des valeurs plus élevées aboutissaient à une meilleure équité mais réduisaient la performance prédictive. Trouver le bon équilibre est crucial pour garantir à la fois des prédictions précises et un traitement équitable.
Analyse des Attributs Sensibles
L'analyse des attributs sensibles individuels a révélé des variations dans les biais selon différents facteurs. En général, le modèle a montré le moins de biais concernant le genre, suivi du statut socio-économique. Le biais racial s'est avéré plus prononcé, mettant en lumière les complexités liées à la modélisation de l'équité à travers des démographies diverses.
Conclusion
Le cadre FairEHR-CLP représente un pas important dans la résolution de l'équité dans les prédictions cliniques utilisant les DSE. En combinant efficacement les données démographiques des patients, les données longitudinales et les notes cliniques à travers un processus en deux étapes, il réduit les disparités dans les taux d'erreur parmi les sous-groupes démographiques. C'est important en santé, où un traitement équitable est essentiel.
Limitations et Travaux Futurs
Bien que FairEHR-CLP montre des promesses, il y a des limites à considérer. Une préoccupation est la qualité des données synthétiques. Si les données synthétiques ne reflètent pas avec précision les vraies données des patients, cela peut entraver l'efficacité du modèle à atténuer les inégalités. Les recherches futures devraient se concentrer sur l'amélioration des techniques de génération de données synthétiques, en particulier pour les données longitudinales et les notes cliniques.
De plus, le cadre pourrait faire face à des défis avec des catégories ambiguës dans les attributs sensibles, ce qui pourrait entraver un traitement équitable. Affiner ces catégories est essentiel pour une approche plus précise de la réduction des biais.
Impacts Plus Larges
FairEHR-CLP vise à améliorer l'équité dans les prédictions cliniques utilisant des DSE multimodaux. En abordant les biais sociaux liés aux facteurs démographiques, ce cadre offre un potentiel pour des résultats de santé plus équitables. Il représente une voie prometteuse pour combler les lacunes dans les disparités de santé, s'assurant que les modèles prédictifs soient précis et non biaisés.
Exemples de Données DSE
Pour illustrer les capacités de FairEHR-CLP, plusieurs exemples de données DSE de vrais patients, y compris des versions réelles et synthétiques, sont fournis. Cela inclut des informations démographiques, des données de santé longitudinales et des notes cliniques qui mettent en évidence les différences et les similarités à travers divers profils de patients.
Démographiques
Un exemple de données démographiques révèle les attributs réels et synthétiques d'un patient, montrant des variations dans les attributs sensibles tout en gardant les informations de santé intactes.
Données Longitudinales
Des exemples de données longitudinales démontrent en outre comment le cadre génère des données synthétiques parallèlement à de vraies mesures, permettant des analyses plus complètes de la santé des patients au fil du temps.
Notes Cliniques
Des notes cliniques synthétiques sont également fournies, montrant comment elles maintiennent des détails médicaux essentiels tout en transformant le wording pour une meilleure diversité de représentation. Cela garantit que le contexte clinique reste cohérent, améliorant la capacité du modèle à faire des prédictions éclairées.
Détails de Mise en Œuvre
Les expériences ont été réalisées sur des GPU puissants, assurant un traitement efficace des données. Un partage aléatoire train/test a été utilisé pour la préparation des ensembles de données. L'efficacité des techniques de génération de données synthétiques a été évaluée en continu pour garantir le contrôle de qualité.
Une exploration plus approfondie des prédicteurs cliniques est nécessaire pour comprendre comment ils influencent la capacité du modèle à prédire efficacement les résultats de santé. Avec des ajustements approfondis et des améliorations futures, FairEHR-CLP représente un pas en avant crucial dans la prédiction équitable des soins de santé.
Titre: FairEHR-CLP: Towards Fairness-Aware Clinical Predictions with Contrastive Learning in Multimodal Electronic Health Records
Résumé: In the high-stakes realm of healthcare, ensuring fairness in predictive models is crucial. Electronic Health Records (EHRs) have become integral to medical decision-making, yet existing methods for enhancing model fairness restrict themselves to unimodal data and fail to address the multifaceted social biases intertwined with demographic factors in EHRs. To mitigate these biases, we present FairEHR-CLP: a general framework for Fairness-aware Clinical Predictions with Contrastive Learning in EHRs. FairEHR-CLP operates through a two-stage process, utilizing patient demographics, longitudinal data, and clinical notes. First, synthetic counterparts are generated for each patient, allowing for diverse demographic identities while preserving essential health information. Second, fairness-aware predictions employ contrastive learning to align patient representations across sensitive attributes, jointly optimized with an MLP classifier with a softmax layer for clinical classification tasks. Acknowledging the unique challenges in EHRs, such as varying group sizes and class imbalance, we introduce a novel fairness metric to effectively measure error rate disparities across subgroups. Extensive experiments on three diverse EHR datasets on three tasks demonstrate the effectiveness of FairEHR-CLP in terms of fairness and utility compared with competitive baselines. FairEHR-CLP represents an advancement towards ensuring both accuracy and equity in predictive healthcare models.
Auteurs: Yuqing Wang, Malvika Pillai, Yun Zhao, Catherine Curtin, Tina Hernandez-Boussard
Dernière mise à jour: 2024-08-03 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2402.00955
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2402.00955
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
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