Nouvelle méthode IA améliore la compréhension des risques pour la santé
Une nouvelle approche de l'IA explicable améliore les prédictions de risque d'Alzheimer grâce aux données cliniques.
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Table des matières
- Une Nouvelle Approche : Le Hybrid Value-Aware Transformer (HVAT)
- Développement de Méthodes XAI pour le HVAT
- Comment fonctionne l'Architecture HVAT
- Identification des Schémas Temporels
- Mesurer l'Impact et les Scores d'Impact
- Scores d'Impact au Niveau Populational
- Application Réelle : Une Étude sur les Anciens Combattants
- Résultats et Conclusions
- Implications pour la Pratique Clinique
- Limitations et Domaines pour la Recherche Future
- Conclusion
- Source originale
Ces dernières années, le deep learning a vraiment changé la donne en intelligence artificielle. Les réseaux de neurones profonds (DNN) sont des outils super puissants qui ont aidé à améliorer plein d'applications, surtout dans des domaines comme le traitement du langage naturel. Mais ces modèles sont souvent hyper complexes et peuvent ressembler à une "boîte noire" pour beaucoup de gens. Ça veut dire que c'est pas évident pour les gens de comprendre comment ils prennent des décisions. Pour y remédier, un domaine appelé IA explicable (XAI) a vu le jour, qui se concentre sur la compréhension du fonctionnement de ces modèles.
Les techniques de XAI aident à éclairer les processus de décision des DNN. En fournissant des explications claires, la XAI peut aider les utilisateurs à faire confiance et à valider les résultats produits par ces systèmes puissants. Certaines méthodes de XAI montrent comment différents input ou caractéristiques influencent les prédictions d'un modèle. Des exemples incluent Local Interpretable Model-agnostic Explanations (LIME), SHapley Additive exPlanations (SHAP), et Layer-wise Relevance Propagation (LRP).
Les modèles statistiques traditionnels, comme la régression logistique, sont plus simples à comprendre parce que leur structure est claire. Chaque variable contribue à la prédiction de manière évidente. Par exemple, l'influence d'une variable dans la régression logistique peut être exprimée par des coefficients. Cette clarté fait souvent défaut dans les DNN, rendant difficile pour les utilisateurs d'interpréter les résultats. En réponse à ce défi, certains chercheurs ont créé des méthodes de XAI adaptées aux DNN qui gèrent des données tabulaires. Ces méthodes fournissent des scores représentant l'importance de chaque variable d'entrée, comme fonctionnent les coefficients dans la régression logistique.
Une Nouvelle Approche : Le Hybrid Value-Aware Transformer (HVAT)
Récemment, une nouvelle architecture appelée Transformer a émergé, révolutionnant le domaine du traitement du langage naturel. De grands modèles de langage, comme BERT et GPT, ont été développés sur cette technologie. Inspiré par son succès et en reconnaissant les parallèles entre les données cliniques et le langage naturel, un nouveau modèle appelé Hybrid Value-Aware Transformer (HVAT) a été conçu. Ce modèle peut apprendre à partir de données cliniques longitudinales (liées au temps) et de données non longitudinales en même temps.
Le modèle HVAT peut analyser les valeurs numériques changeantes liées aux codes cliniques au fil du temps. Par exemple, il peut évaluer les résultats des tests de laboratoire ou les signes vitaux à mesure qu'ils varient. Des recherches ont montré que les modèles HVAT peuvent atteindre d'excellentes performances prédictives en matière de prévisions de résultats par rapport aux modèles qui n'utilisent que des données non longitudinales.
Les données longitudinales reflètent l'historique médical d'un patient dans le temps. Ce type de données est précieux car il capture les évolutions de l'état d'un patient. Le modèle HVAT vise à exploiter ces schémas temporels pour améliorer les prédictions. Cela soulève des questions importantes : Peut-on quantifier comment ces schémas temporels impactent les prédictions faites par le HVAT ? Et peut-on expliquer ces calculs de manière compréhensible pour les professionnels de santé ?
Développement de Méthodes XAI pour le HVAT
Pour répondre à ces questions, des chercheurs ont mis au point une nouvelle méthode XAI. Cette méthode vise à clarifier comment les schémas temporels dans les données des patients sont liés au risque d'événements indésirables pour la santé. Au départ, elle se concentre sur des concepts cliniques ayant des valeurs numériques dans le temps. Par exemple, les chercheurs ont appliqué cette méthode pour étudier la condition physique cardiorespiratoire (CRF) comme facteur de risque pour la maladie d'Alzheimer.
La condition physique cardiorespiratoire (CRF) est souvent mesurée lors de tests d'exercice. Les résultats sont généralement exprimés en unités appelées équivalents métaboliques (MET), où des chiffres plus élevés indiquent une meilleure forme physique. La méthode XAI évalue comment les changements dans la CRF au fil du temps se rapportent au risque de développer la maladie d'Alzheimer et des conditions associées.
La méthode XAI est conçue comme un cadre flexible qui peut analyser diverses variables cliniques, pas seulement la CRF.
Comment fonctionne l'Architecture HVAT
Le modèle HVAT traite les données longitudinales de manière unique. Pour chaque patient, une fenêtre de temps spécifique est choisie, et cette fenêtre est divisée en intervalles plus petits. Chaque intervalle est indexé avec des nombres naturels, comptés à rebours. Cela signifie que le point de données le plus récent reçoit le plus grand nombre, tandis que les points de données plus anciens obtiennent des nombres plus bas.
Ensuite, les informations cliniques dans cette fenêtre temporelle pour chaque patient sont organisées en une série de "tokens cliniques". Chaque token contient trois informations : un index temporel, un concept clinique et une valeur numérique. Cette structure permet au modèle de suivre comment le concept clinique change au fil du temps.
Le modèle HVAT utilise cette série de tokens cliniques avec certaines données non longitudinales pour prédire la probabilité d'un événement indésirable pour la santé.
Identification des Schémas Temporels
Pour évaluer comment la CRF et ses changements au fil du temps affectent la santé, deux schémas temporels clés sont examinés : la moyenne temporelle et la pente temporelle.
La moyenne temporelle représente le niveau global de la CRF pour un patient pendant la fenêtre de temps choisie. Elle est calculée comme la moyenne des valeurs de CRF au cours de cette période.
La pente temporelle, par contre, montre la tendance de la CRF au fil du temps. Elle indique si la CRF d'un patient s'améliore, diminue, ou reste stable. Par exemple, une pente positive indique une tendance à la hausse de la forme physique dans le temps, tandis qu'une pente négative indique un déclin.
Mesurer l'Impact et les Scores d'Impact
La méthode XAI fournit un moyen d'évaluer comment ces schémas temporels (moyenne et pente) affectent les risques prévus liés aux problèmes de santé.
Tout d'abord, les chercheurs calculent les valeurs de moyenne temporelle pour tous les patients d'un groupe. Une valeur de référence est établie, permettant des comparaisons. Pour les patients dont la moyenne temporelle diffère de cette référence, la sortie du modèle est évaluée à la fois avec les données originales et les données modifiées, ce qui mène au calcul des scores d'impact au niveau individuel.
Ces scores d'impact donnent un aperçu de la façon dont les changements dans la moyenne temporelle affectent les prédictions sur les risques pour la santé. Le même processus s'applique pour calculer les scores d'impact pour la pente temporelle, permettant aux chercheurs de comprendre à la fois les niveaux de forme physique globaux et les tendances au fil du temps.
Scores d'Impact au Niveau Populational
Pour obtenir une compréhension plus large, des scores d'impact au niveau populationnel sont calculés en faisant la moyenne des scores d'impact de tous les patients. Cette analyse peut révéler comment différents niveaux de CRF et taux de changement se rapportent à la probabilité de développer la maladie d'Alzheimer.
En calculant ces scores, les chercheurs peuvent déterminer comment les variations dans les niveaux de forme physique et les tendances peuvent mener à des risques plus élevés. Par exemple, une augmentation des niveaux globaux de CRF peut être liée à une diminution du risque d'Alzheimer, tandis qu'un déclin de la forme physique pourrait être corrélé avec un risque accru.
Application Réelle : Une Étude sur les Anciens Combattants
Pour valider la méthode XAI, les chercheurs ont mené une étude utilisant des données de patients de l'administration des vétérans des États-Unis. Cette étude rétrospective impliquait plus d'un demi-million de patients, se concentrant sur ceux ayant des valeurs de CRF documentées. La recherche visait à analyser la relation entre la CRF et le risque d'Alzheimer.
En formant le modèle HVAT avec les données collectées, les chercheurs pouvaient classifier les patients en fonction de leur risque de développer Alzheimer. Les résultats ont révélé comment les scores de moyenne et de pente temporelle influençaient ces prédictions.
Résultats et Conclusions
L'étude a produit des informations significatives sur la relation entre la CRF et le risque d'Alzheimer. Le score d'impact pour la moyenne temporelle a indiqué que des niveaux de forme physique plus élevés sont corrélés avec un risque plus bas de développer Alzheimer. Plus précisément, chaque augmentation du niveau moyen de CRF était associée à une réduction du risque.
Concernant la pente temporelle, les résultats ont démontré qu'une détérioration plus rapide de la CRF était liée à un risque plus élevé d'Alzheimer. L'analyse a montré des schémas différents pour les patients dont la CRF était stable par rapport à ceux qui connaissaient des baisses.
Implications pour la Pratique Clinique
Les résultats de cette étude ont des implications précieuses pour la pratique clinique. Comprendre comment les changements dans la CRF se rapportent au risque de maladie d'Alzheimer peut aider les professionnels de santé à prendre des décisions éclairées concernant les soins aux patients.
Les patients avec des niveaux de forme physique en déclin pourraient bénéficier d'interventions visant à améliorer leur CRF, réduisant potentiellement leur risque de déclin cognitif. De plus, la méthode XAI contribue au domaine croissant de l'IA explicable, fournissant aux prestataires de soins de santé des informations exploitables qui sont faciles à interpréter.
Limitations et Domaines pour la Recherche Future
Bien que la méthode XAI montre des promesses, il y a des limites. L'approche actuelle se concentre principalement sur des concepts cliniques avec des valeurs numériques, ce qui signifie que d'autres types de données, comme les codes diagnostiques sans valeurs, nécessitent d'autres stratégies pour l'interprétation.
En outre, la méthode considère actuellement des schémas temporels linéaires. Les données réelles peuvent présenter des tendances non linéaires qui ne sont pas prises en compte dans cette analyse. La recherche future devrait viser à relever ces limitations en développant de nouvelles variables dérivées et en explorant des schémas temporels plus complexes.
Le développement continu de méthodes XAI peut également améliorer la compréhension dans d'autres domaines, les rendant applicables à divers scénarios cliniques.
Conclusion
Le développement de la méthode XAI pour le modèle HVAT représente un pas en avant significatif pour rendre les DNN complexes plus compréhensibles. En clarifiant l'impact des schémas temporels sur les prédictions liées aux résultats de santé, cette méthode peut informer la prise de décision clinique.
Alors que les soins de santé s'appuient de plus en plus sur des modèles basés sur les données, il est crucial de s'assurer que ces modèles sont interprétables. Les résultats concernant la condition physique cardiorespiratoire et le risque d'Alzheimer illustrent le potentiel de la XAI pour combler le fossé entre les systèmes d'IA avancés et les applications pratiques en santé.
À l'avenir, les chercheurs doivent continuer à affiner ces méthodes pour relever les limitations et améliorer leur applicabilité dans différents domaines. Ce faisant, ils peuvent débloquer de nouvelles idées qui mèneront finalement à de meilleurs soins et résultats pour les patients.
Titre: A Novel Explainable AI Method to Assess Associations between Temporal Patterns in Patient Trajectories and Adverse Outcome Risks: Analyzing Fitness as a Risk Factor of ADRD
Résumé: We present a novel explainable artificial intelligence (XAI) method to assess the associations between the temporal patterns in the patient trajectories recorded in longitudinal clinical data and the adverse outcome risks, through explanations for a type of deep neural network model called Hybrid Value-Aware Transformer (HVAT) model. The HVAT models can learn jointly from longitudinal and non-longitudinal clinical data, and in particular can leverage the time-varying numerical values associated with the clinical codes or concepts within the longitudinal data for outcome prediction. The key component of the XAI method is the definitions of two derived variables, the temporal mean and the temporal slope, which are defined for the clinical concepts with associated time-varying numerical values. The two variables represent the overall level and the rate of change over time, respectively, in the trajectory formed by the values associated with the clinical concept. Two operations on the original values are designed for changing the values of the two derived variables separately. The effects of the two variables on the outcome risks learned by the HVAT model are calculated in terms of impact scores and impacts. Interpretations of the impact scores and impacts as being similar to those of odds ratios are also provided. We applied the XAI method to the study of cardiorespiratory fitness (CRF) as a risk factor of Alzheimers disease and related dementias (ADRD). Using a retrospective case-control study design, we found that each one-unit increase in the overall CRF level is associated with a 5% reduction in ADRD risk, while each one-unit increase in the changing rate of CRF over time is associated with a 1% reduction. A closer investigation revealed that the association between the changing rate of CRF level and the ADRD risk is nonlinear, or more specifically, approximately piecewise linear along the axis of the changing rate on two pieces: the piece of negative changing rates and the piece of positive changing rates.
Auteurs: Yijun Shao, E. Y. Zamrini, A. Ahmed, Y. Cheng, S. J. Nelson, P. Kokkinos, Q. Zeng-Treitler
Dernière mise à jour: 2024-05-17 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.17.24307541
Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.17.24307541.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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