Morts excédentaires en Argentine pendant la pandémie de COVID-19

La pandémie de COVID-19 a eu un énorme impact sur la santé mondiale. À la fin de 2022, il y avait plus de 732 millions de cas confirmés et environ 6,7 millions de décès signalés par l'Organisation mondiale de la santé (OMS). Au-delà de ces chiffres, l'OMS estime qu'il y a eu environ 14,8 millions de décès supplémentaires dans le monde à cause de la pandémie, ce qui représente environ 2,7 fois le nombre de décès confirmés liés au COVID-19. En 2020 et 2021, parmi 131 millions de décès toutes causes confondues dans le monde, environ 15,9 millions étaient liés au COVID-19, directement ou indirectement.

En Argentine, la pandémie a entraîné environ 10 millions de cas confirmés et près de 160 000 décès entre mars 2020 et décembre 2022. Les taux de Mortalité ont changé de manière significative chaque année, avec plus de 53 000 décès en 2020, presque 85 000 en 2021 et environ 24 000 en 2022. L'impact le plus significatif s'est produit pendant 2020 et 2021. L'Amérique latine, y compris l'Argentine, a connu certains des taux de cas et de décès les plus élevés au monde. Des pays comme le Pérou et le Mexique avaient des taux de mortalité excessifs très élevés, montrant que les effets de la pandémie variaient énormément selon les régions.

Avant la pandémie, le taux de mortalité en Argentine était stable, oscillant entre 809,8 et 757,0 décès pour 100 000 de 2015 à 2019. Cependant, ce chiffre a grimpé à 829,0 puis à 953,5 en 2020 et 2021, respectivement. La plupart des études sur la mortalité excessive se sont concentrées sur 2020, avec moins d'analyses s'étendant jusqu'en 2021.

Le terme "Décès excédentaires" désigne le nombre de décès qui se produit au-delà de ce qui est généralement attendu en fonction des tendances historiques. La mortalité excédentaire est mesurée en pourcentage des décès attendus pendant des périodes normales et sert d'outil précieux pour comparer l'impact d'événements comme les pandémies sur les taux de mortalité. Contrairement aux mesures de mortalité traditionnelles, le suivi de la mortalité excédentaire nécessite des données complètes sur toutes les causes de décès dans le temps.

Évaluer l'impact d'une pandémie à travers la mortalité excédentaire est crucial parce que cela prend en compte de nombreux éléments qui peuvent affecter les taux de décès. Cela inclut les politiques de santé gouvernementales, les changements dans le comportement social et la préparation des systèmes de santé. Bien que les experts s'accordent à dire que les décès excédentaires sont le meilleur moyen de mesurer l'impact de la pandémie, il n'y a toujours pas d'accord sur ce qui constitue des décès "normaux". Deux méthodes courantes pour déterminer cela sont l'utilisation des percentiles de décès historiques et des modèles plus complexes incluant des facteurs supplémentaires comme le climat.

Cet article vise à étudier la mortalité excédentaire en Argentine pendant 2020 et 2021 et à évaluer les variations entre différentes zones. Il mettra aussi en place une plateforme open-source pour aider les chercheurs et le public à analyser les données de mortalité et à prendre des décisions éclairées sur la Santé publique.

#Aperçu de l'étude

L'étude a utilisé des données de mortalité mensuelles de 2015 à 2021 pour dessiner des courbes représentant les décès toutes causes confondues à travers l'Argentine. Les infos ont été publiées par le ministère de la Santé de l'Argentine et sont disponibles via leur portail Open Data. Les données sont divisées par mois, et l'étude a examiné des juridictions complètes à travers 11 provinces. Plusieurs petites régions ont été combinées en fonction de leur proximité géographique.

Des données de température ont été collectées à partir de stations météorologiques à travers le pays de 2015 à 2021. De plus, des rapports hebdomadaires sur les cas de maladies grippales ont été inclus. Des études précédentes utilisant des modèles similaires ont montré que cette approche renforce l'exactitude des résultats.

Une technique de modélisation spécifique appelée modèle additif généralisé (GAM) a été utilisée pour estimer les décès attendus. Divers modèles ont été testés, et le GAM a été le meilleur pour prédire la mortalité pour les années 2020 et 2021. Ce modèle a examiné les tendances au fil des années et inclus des facteurs comme la température et les rapports de maladies, permettant des prédictions sur le nombre de décès attendus.

Pour analyser les données, la recherche les a divisées en ensembles de formation, de validation et de test. Le modèle GAM a été choisi parce qu'il tenait efficacement compte des tendances des données au fil du temps. Il a examiné le nombre de décès par rapport aux changements liés au temps, y compris la température et les rapports de maladies.

Les pourcentages de mortalité excédentaire ont été calculés à l'aide du modèle GAM, ce qui a permis d'estimer les décès attendus chaque mois. Le nombre total de décès excédentaires a été déterminé en comparant les décès observés avec les décès attendus du modèle. Des intervalles de confiance pour ces estimations ont également été générés.

#Résultats des décès excédentaires

Au cours de la période d'étude, l'Argentine a connu environ 133 612 décès excédentaires. Ce chiffre est comparé aux 137 736 décès officiellement signalés à cause du COVID-19 durant la même période. Cela indique une légère sous-estimation des décès par COVID-19 d'environ 3 %. En 2021 spécifiquement, il y a eu 91 125 décès excédentaires signalés en plus de 84 190 décès dus au COVID-19, indiquant une plus grande différence.

En regardant les zones géographiques, les plus hauts pics de décès ont été observés dans la province de Buenos Aires et la ville de Buenos Aires, avec des pics significatifs en juillet, août et septembre 2020, ainsi qu'en janvier et mai 2021. Cependant, d'autres régions comme Córdoba et Santa Fe n'ont vu que deux pics pendant cette période.

Dans la première moitié de 2020, certaines régions, dont Santa Fe et Córdoba, ont signalé des niveaux de mortalité inférieurs à ceux attendus. La seconde moitié de 2020 a vu une hausse significative des décès excédentaires dans de nombreuses zones, certaines régions ayant connu plus de 73 % de mortalité excédentaire. En 2021, toutes les régions ont montré une mortalité excédentaire significative, avec les taux les plus élevés observés dans des régions spécifiques.

#Analyse interactive et visualisation

Un outil interactif a été développé pour permettre aux utilisateurs d'analyser les résultats plus facilement. Cette plateforme permet de faire des comparaisons entre différentes régions et de décomposer les données à divers niveaux. Elle offre un moyen convivial de comprendre des données complexes tout en utilisant des modèles sophistiqués en arrière-plan.

#Limitations de l'étude

Il est important de noter que les mesures utilisées pour évaluer la mortalité excédentaire ne tiennent pas compte des différences d'âge et de composition démographique des différentes populations. Les études futures pourraient explorer si elles doivent se concentrer sur les structures démographiques ou les considérer comme des biais potentiels dans les interprétations. De plus, le manque de données pour 2022 a présenté des défis, car les données de mortalité sont enregistrées en fonction de la date d'enregistrement.

De plus, les règles pour catégoriser les causes de décès pendant la pandémie ont changé. Cela aurait pu mener à une sur-représentation des décès par COVID-19 dans les statistiques officielles et à une sous-représentation des décès dus à d'autres causes. L'analyse a montré qu'en 2021, le nombre de décès excédentaires a dépassé le nombre de décès dus au COVID-19 enregistrés, suggérant une sous-estimation et d'autres causes de décès.

#Conclusion

Cette étude met en lumière à quel point la pandémie de COVID-19 a profondément affecté la mortalité en Argentine. Les résultats révèlent que les taux de décès durant cette période étaient alarmants, dépassant simplement les chiffres rapportés du COVID-19. Il est nécessaire d'avoir des stratégies de santé publique solides pour gérer de telles crises à l'avenir.

À mesure que nous rassemblons plus de données et améliorons les méthodologies pour mesurer la mortalité excédentaire, les idées tirées de cette analyse peuvent aider à orienter des interventions de santé ciblées. Les recherches futures devraient également examiner les raisons derrière les taux de mortalité excédentaire et les schémas de diverses causes de décès pour adapter efficacement les réponses de santé publique.