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Guide de rédaction pour les revues d'Oxford

Un guide complet pour les écrivains qui préparent des articles pour Oxford University Press.

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Guide de l'article deGuide de l'article del'Oxford Journalqui soumettent des manuscrits.Règles essentielles pour les auteurs
Table des matières

Ce guide aide les écrivains à rédiger des articles qui suivent les styles des revues de l'Oxford University Press. C'est un outil utile pour les auteurs qui préparent leurs manuscrits. Il fournit des règles et des infos importantes pour la préparation des articles.

Prendre le départ

Les auteurs doivent télécharger et installer le logiciel requis pour utiliser ce modèle. Si tu n’utilises pas un service en ligne pour écrire ton article, assure-toi d’avoir la bonne version du logiciel sur ton ordi. Le fichier modèle s'appelle "oup-authoring-template.cls" et doit être sauvegardé avec tes fichiers de manuscrit.

Pour en savoir plus sur les outils nécessaires, rends-toi sur les ressources en ligne pertinentes pour l’installation et les exigences.

Préparer ton article

Avant de commencer, on suppose que tu as déjà quelques bases sur l'utilisation du logiciel nécessaire. Après la configuration, utilise le fichier exemple "oup-authoring-template.tex" comme guide pour ton manuscrit.

Assure-toi de sauvegarder une copie du fichier modèle avant de commencer à éditer. L'exemple inclut des explications pour les différentes sections et éléments dont tu pourrais avoir besoin pour ton article. Tu peux remplacer le contenu d'exemple par le tien.

Structure de l'article

Ton article consistera en trois parties principales : le front matter, le main matter, et le back matter. Voilà comment le décomposer :

Front Matter

Cette section apparaît avant le contenu principal et inclut généralement le titre, les auteurs, et toutes les infos de contact pertinentes. Vérifie les exigences spécifiques de la revue à laquelle tu soumets.

  • Titre : Le titre de ton article.
  • Auteurs : Liste tous les auteurs avec les infos de contact pour l'auteur correspondant.
  • Affiliations : Inclure des détails sur le lieu de travail des auteurs.

Main Matter

C'est ici que va le contenu principal de ton article. Il aura plusieurs niveaux de titres pour organiser tes sections :

  • Sections : Chaque idée principale ou sujet doit commencer par un titre de section.
  • Sous-sections : Utilise des sous-sections pour diviser encore plus les sections en parties plus petites.
  • Sous-sous-sections : Ça peut être pour encore plus de détails sous les sous-sections.
  • Paragraphes : Pour des divisions plus courtes au sein d'une section.

Utilise des titres clairs pour faciliter le suivi de ton article par les lecteurs.

Back Matter

Cette partie vient après le contenu principal et peut inclure des annexes, des références, ou des biographies des auteurs.

  • Annexes : Tout matériel supplémentaire qui supporte ton article, mais qui n'est pas dans le texte principal, doit être placé ici.
  • Références : Cite toutes les sources utilisées dans ta recherche. Ça doit suivre un style spécifique.
  • Biographie de l'auteur : Si demandé, inclure une brève description des auteurs à la fin de l'article.

Figures et Tables

Quand tu inclus des images ou des graphiques, utilise les commandes appropriées pour t'assurer qu'ils sont bien placés dans ton document.

  • Figures : Les images doivent être étiquetées comme figures et avoir des légendes appropriées.
  • Tables : Des règles similaires s'appliquent aux tables ; elles doivent être numérotées et titrées correctement.

Assure-toi que les graphiques s'intègrent bien dans la zone de texte et soient correctement orientés s'ils sont grands.

Listes

Tu peux vouloir créer des listes dans ton texte. Il existe plusieurs types :

  • Liste numérotée : À utiliser pour des étapes ou des éléments ordonnés.
  • Liste non numérotée : Pour des éléments qui n'ont pas besoin d'un ordre spécifique.
  • Liste personnalisée : Pour des besoins de formatage spéciaux.

Des listes imbriquées sont également autorisées, ce qui signifie que tu peux placer des listes dans des listes si nécessaire.

Contenu Mathématique

Quand tu écris sur des sujets mathématiques, assure-toi d'utiliser les commandes appropriées pour les équations et les formules. Utilise des paquets conçus pour afficher le contenu mathématique, qui permettent un formatage clair.

Hyperliens et Références

Si tu utilises des citations ou que tu relis des sections dans ton texte, utilise les commandes spécifiques pour créer des liens cliquables. Ça aide les lecteurs à trouver facilement les matériaux référencés.

Derniers conseils

Garde à l'esprit que ce modèle est conçu pour t'aider à simplifier ton processus d'écriture. Suis la structure fournie et assure-toi de relire ton article avant de le soumettre. N’oublie pas de respecter les directives spécifiques fournies par la revue à laquelle tu soumets ton travail.

Utilise les outils disponibles judicieusement pour créer un article propre et professionnel. De bonnes pratiques d'écriture amélioreront la lisibilité et l'impact de ton travail.

Conclusion

En suivant les lignes directrices de ce manuel, tu peux créer un article bien structuré et soigné pour une soumission aux revues de l'Oxford University Press. Reste organisé, et vérifie toujours ton travail par rapport aux exigences de la revue.

Bonne écriture !

Source originale

Titre: PyamilySeq: A Python Tool for Interpretable Gene (Re)Clustering and Pangenomic Inference Across Species and Genera

Résumé: PyamilySeq is a Python-based tool designed for interpretable gene clustering and pangenomic inference, supporting analyses at both species and genus levels. It facilitates the clustering of gene sequences into families based on sequence similarity using CD-HIT, and can take the output of tried-and-tested sequence clustering tools such as CD-HIT, BLAST, DIAMOND, and MMseqs2. PyamilySeq is distinctive in its ability to integrate new sequences into existing clusters, providing a robust framework for iterative analysis while preserving the original clusters, useful when reannotating genomes. In addition to the standard Species mode which as with other tools performs core-gene analysis across a species range, PyamilySeq can be run in Genus mode where it detects the presence of gene families shared across multiple genera. These features enhance the tools applicability for ongoing and past genomic studies and comparative analyses. PyamilySeq generates comprehensive outputs, including gene presence-absence matrices and aligned sequence data, enabling downstream analysis and interpretation of the identified gene groups and pangenomic data.

Auteurs: Nicholas J. Dimonaco

Dernière mise à jour: 2024-07-27 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2407.19328

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2407.19328

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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