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Transformer les conversations de santé en ligne en données précieuses

Un nouveau système transforme les discussions de santé en ligne en données de recherche exploitables.

Ramez Kouzy, Roxanna Attar-Olyaee, Michael K. Rooney, Comron J. Hassanzadeh, Junyi Jessy Li, Osama Mohamad

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Table des matières

Les réseaux sociaux sont devenus une véritable mine d'infos, surtout sur la santé. Des plateformes comme Reddit regorgent de discussions où les gens partagent leurs expériences avec des médicaments et des problèmes de santé. Cependant, fouiller dans tout ce blabla pour trouver des infos utiles, c'est un peu comme chercher une aiguille dans une botte de foin, ou peut-être plus comme chercher une épingle à cheveux dans un bol de spaghetti. Cet article détaille un nouveau système conçu pour faciliter cette tâche en tirant des données utiles de ces discussions sur un type spécifique de médicament.

Pourquoi c'est important de parler de santé en ligne ?

Quand les gens parlent de leur santé sur internet, ça peut être une vraie mine d'or d'infos. Par exemple, les discussions autour des agonistes des récepteurs du peptide-1 semblable au glucagon (GLP-1), un type de médicament pour la perte de poids et le diabète, offrent un aperçu des expériences réelles. Les gens partagent leurs réussites, leurs échecs et tout le reste. Mais comment transformer tous ces pensées et ressentis en données quantifiables que les chercheurs en santé peuvent utiliser ? C'est là qu'intervient cette nouvelle approche.

Le défi de la Collecte de données

Le principal obstacle, c'est que ces bavardages sont souvent désorganisés, c'est-à-dire un mélange de mots sans aucune structure claire. Extraire des infos spécifiques, comme combien de personnes ont perdu du poids ou quelles préoccupations elles avaient sur le cancer, c'est pas facile du tout. C'est un peu comme essayer de trouver un goût de jellybean précis dans un bol rempli de saveurs mélangées, bonne chance !

Comment on a résolu le problème

Le nouveau système, appelé QuaLLM-Health, est basé sur un cadre qui se concentre sur la compréhension de ces données chaotiques. Voici comment ça marche :

Collecte de données

On a commencé par rassembler un max de discussions : plus de 410 000 posts et commentaires de cinq groupes Reddit populaires axés sur le GLP-1. Imagine trier une bibliothèque, mais au lieu de livres, t’as des conversations sans fin sur la perte de poids et la santé. On a utilisé une API (un outil fancy qui nous permet de récupérer des données) pour recueillir toutes ces infos.

Filtrage des données

Ensuite, il a fallu éliminer le bruit. Avec un peu de magie des mots-clés (en utilisant des termes comme "cancer" ou "chimiothérapie"), on a réduit notre recherche à environ 2 390 entrées pertinentes. Pense à ça comme à utiliser un chinois pour enlever les morceaux épais quand tu fais de la soupe.

Nettoyage du bazar

Une fois qu'on avait nos conversations pertinentes, on a encore nettoyé les données. On a viré les doublons et les posts en langues étrangères, ce qui nous a laissé environ 2 059 entrées uniques. C'est comme polir un diamant ; on devait s'assurer que les bons morceaux brillent sans distractions.

Préparer le terrain pour le succès

Développement de directives

Pour s'assurer que tout le monde soit sur la même longueur d'onde, on a créé des directives pour annoter les données, qui disent aux Annotateurs humains quoi rechercher dans chaque post. On voulait garder tout cohérent pour que quand on tire des infos sur, disons, les survivants du cancer, tout le monde sache exactement ce qu'il faut chercher.

Une touche humaine

Ensuite, deux personnes très calées ont pris un échantillon aléatoire des données nettoyées et l'ont annoté selon nos directives. Cet élément humain est crucial ; après tout, les machines pourraient passer à côté des nuances de sens ! S'ils n'étaient pas d'accord sur quelque chose, ils en discutaient pour parvenir à un consensus. Ça a donné un dataset fiable qui pourrait servir de référence pour évaluer comment le modèle informatique se débrouille.

Travailler avec le modèle linguistique

Essai initial

Pour la suite, on s'est tournés vers un grand modèle linguistique (LLM) - en gros, un super programme informatique capable de lire et comprendre le langage humain. Notre but était de lui apprendre à extraire des infos utiles de nos données Reddit. Au début, c'était un peu comme un enfant qui apprend à marcher ; il pouvait faire des connexions simples mais trébuchait sur des idées plus complexes, comme comprendre les différents types de cancer.

Affinage du modèle

Après cette première tentative, on a affinés notre approche. On a créé des prompts - comme de petits exercices pour le LLM - en lui fournissant des directives spécifiques basées sur ce que nos annotateurs humains avaient suivi. On a aussi inclus des exemples de scénarios délicats pour aider le modèle à mieux identifier les infos nuancées.

Test de la cohérence

Pour s'assurer que l'ordinateur s'améliorait, on a effectué plusieurs tests sur le même dataset. À chaque fois, les résultats étaient similaires, montrant que le modèle devenait plus stable dans ses performances. Imagine une équipe de sport qui a enfin compris comment travailler ensemble ; ils commencent à gagner plus de matchs, de manière constante.

Application du cadre

Avec tout qui fonctionnait bien, on a lâché notre LLM bien entraîné sur l'ensemble du dataset de 2 059 entrées. Il a réussi à extraire toutes les variables nécessaires efficacement. Tout le processus a pris environ une heure et coûté moins cher qu'un repas !

Et après ?

En regardant vers l'avenir, cette nouvelle approche a ouvert la voie à une méthode plus organisée pour analyser d'énormes quantités de textes désordonnés sur les réseaux sociaux. Ça montre qu'avec les bons outils et un peu de guidance humaine, on peut transformer des discussions chaotiques en données significatives qui aident les chercheurs en santé à mieux comprendre les expériences des patients.

Conclusion

En gros, utiliser des LLM pour extraire des données de santé des réseaux sociaux n'est pas juste malin ; c'est révolutionnaire. Avec notre nouveau système, on peut déterrer des infos précieuses des bavardages de gens ordinaires et les transformer en insights qui pourraient aider à façonner les décisions futures en matière de santé. Alors, la prochaine fois que tu scrolles sur les réseaux sociaux, souviens-toi ; il y a plus que des mèmes et des vidéos de chats - il y a un monde de données qui attend d'être exploité, tout comme ce goût de jellybean caché qui n'attend qu'à être découvert !

En résumé, notre travail montre que les discussions sur la santé en ligne peuvent être transformées en données qui informent la recherche en santé, grâce à une combinaison de LLM, d'expertise et d'une approche structurée de la collecte de données. C'est gagnant-gagnant pour les chercheurs et ceux qui s'investissent dans de meilleurs résultats en santé.

Source originale

Titre: QuaLLM-Health: An Adaptation of an LLM-Based Framework for Quantitative Data Extraction from Online Health Discussions

Résumé: Health-related discussions on social media like Reddit offer valuable insights, but extracting quantitative data from unstructured text is challenging. In this work, we present an adapted framework from QuaLLM into QuaLLM-Health for extracting clinically relevant quantitative data from Reddit discussions about glucagon-like peptide-1 (GLP-1) receptor agonists using large language models (LLMs). We collected 410k posts and comments from five GLP-1-related communities using the Reddit API in July 2024. After filtering for cancer-related discussions, 2,059 unique entries remained. We developed annotation guidelines to manually extract variables such as cancer survivorship, family cancer history, cancer types mentioned, risk perceptions, and discussions with physicians. Two domain-experts independently annotated a random sample of 100 entries to create a gold-standard dataset. We then employed iterative prompt engineering with OpenAI's "GPT-4o-mini" on the gold-standard dataset to build an optimized pipeline that allowed us to extract variables from the large dataset. The optimized LLM achieved accuracies above 0.85 for all variables, with precision, recall and F1 score macro averaged > 0.90, indicating balanced performance. Stability testing showed a 95% match rate across runs, confirming consistency. Applying the framework to the full dataset enabled efficient extraction of variables necessary for downstream analysis, costing under $3 and completing in approximately one hour. QuaLLM-Health demonstrates that LLMs can effectively and efficiently extract clinically relevant quantitative data from unstructured social media content. Incorporating human expertise and iterative prompt refinement ensures accuracy and reliability. This methodology can be adapted for large-scale analysis of patient-generated data across various health domains, facilitating valuable insights for healthcare research.

Auteurs: Ramez Kouzy, Roxanna Attar-Olyaee, Michael K. Rooney, Comron J. Hassanzadeh, Junyi Jessy Li, Osama Mohamad

Dernière mise à jour: 2024-11-26 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2411.17967

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2411.17967

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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