CvFormer: Un Nuevo Enfoque para el Análisis Cerebral
CvFormer mejora el análisis de fMRI al combinar regiones del cerebro y sus conexiones.
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Tabla de contenidos
La resonancia magnética funcional, o FMRI, es una técnica médica moderna que se usa para ver la actividad del cerebro. Ayuda a los doctores a identificar problemas cerebrales al examinar cómo se conectan y funcionan juntos diferentes partes del cerebro. Pero muchos métodos actuales solo se enfocan en áreas específicas del cerebro o en cómo se conectan, perdiendo la oportunidad de combinar info de ambas.
El Problema
Los métodos actuales de análisis de fMRI a menudo separan las Regiones de Interés en el cerebro de su Conectividad. Esta separación puede llevar a perder oportunidades para recopilar información importante que puede ayudar a diagnosticar problemas neurológicos. Para entender el cerebro, hay que mirar tanto las regiones como las conexiones al mismo tiempo.
Presentando CvFormer
Para mejorar la forma en que estudiamos el cerebro usando fMRI, se creó un nuevo método llamado CvFormer. CvFormer está diseñado para analizar datos de fMRI mirando tanto las regiones de interés como las conexiones entre ellas. Este enfoque ayuda a reunir información más rica sobre el funcionamiento del cerebro.
CvFormer funciona creando dos conjuntos de información a partir de los datos de fMRI. Un conjunto se enfoca en las regiones de interés mientras que el otro observa cómo estas regiones se conectan. Al analizar estos dos conjuntos juntos, CvFormer puede resaltar la información complementaria que puede mejorar el análisis.
Cómo Funciona CvFormer
El Modelo CvFormer tiene tres partes principales:
Bloque de Tokens: Esta parte genera dos tipos de información de los datos de fMRI: uno para las regiones de interés y otro para su conectividad.
Bloque de Transformador Cross-view: Este componente clave analiza ambos conjuntos de información (las regiones y la conectividad). Combina los insights de ambas vistas, asegurándose de que no se pierdan detalles importantes de ninguno de los lados.
Bloque de Agrupamiento: Esta parte final reúne la información de las etapas anteriores para crear una vista completa de la Actividad cerebral.
Este modelo brilla porque puede combinar información de ambas vistas de manera eficiente sin requerir una potencia de cómputo excesiva, haciéndolo más rápido y efectivo en comparación con los métodos tradicionales.
Entrenando CvFormer
Para asegurarse de que CvFormer sea robusto y confiable, pasa por un proceso de entrenamiento en dos etapas:
Pre-entrenamiento Auto-supervisado: En esta primera etapa, el modelo aprende de la información en las regiones de interés y las vistas de conectividad sin necesitar etiquetas externas. Esto le ayuda a entender mejor los datos antes de pasar a un entrenamiento más detallado.
Ajuste Fino: En la segunda etapa, CvFormer utiliza datos etiquetados para perfeccionar su comprensión, combinando la información de ambas vistas para mejorar su rendimiento.
Este proceso de entrenamiento en dos etapas permite que CvFormer aprenda de manera efectiva, incluso cuando los datos son limitados.
Resultados y Beneficios
Las pruebas han mostrado que CvFormer funciona mejor que muchos métodos existentes en la clasificación de redes cerebrales. Usar tanto las regiones como las conexiones juntas permite tener una imagen más completa del funcionamiento del cerebro.
Al enfocarse en información complementaria, CvFormer proporciona insights que los métodos de vista única no captan. Esto lleva a una mejor precisión en el diagnóstico de trastornos cerebrales, lo cual es crucial para un tratamiento efectivo.
Comparación con Métodos Existentes
CvFormer se destaca en comparación con otras técnicas que solo consideran un aspecto de los datos cerebrales a la vez. Muchos métodos tradicionales luchan porque no utilizan efectivamente toda la información disponible. En contraste, CvFormer combina de manera efectiva los insights de ambas regiones y conectividad, resultando en un mejor rendimiento en diversas situaciones.
Conclusión
El estudio del cerebro a través de fMRI es crucial para diagnosticar trastornos neurológicos. Sin embargo, los métodos actuales a menudo pierden la oportunidad de analizar el cerebro de manera integral. CvFormer es un nuevo enfoque que combina tanto las regiones de interés como la conectividad para ofrecer una visión más holística de la función cerebral.
Al emplear un proceso de entrenamiento único en dos etapas, CvFormer mejora su capacidad de aprender de datos complejos, convirtiéndolo en una herramienta valiosa en el campo del análisis cerebral. Este modelo muestra gran promesa para mejorar cómo se diagnostican los trastornos cerebrales, llevando a mejores resultados para las personas afectadas por estas condiciones.
A medida que la investigación avanza, CvFormer podría allanar el camino para métodos más avanzados que mejoren aún más nuestra comprensión del cerebro humano y sus complejidades.
Título: CvFormer: Cross-view transFormers with Pre-training for fMRI Analysis of Human Brain
Resumen: In recent years, functional magnetic resonance imaging (fMRI) has been widely utilized to diagnose neurological disease, by exploiting the region of interest (RoI) nodes as well as their connectivities in human brain. However, most of existing works only rely on either RoIs or connectivities, neglecting the potential for complementary information between them. To address this issue, we study how to discover the rich cross-view information in fMRI data of human brain. This paper presents a novel method for cross-view analysis of fMRI data of the human brain, called Cross-view transFormers (CvFormer). CvFormer employs RoI and connectivity encoder modules to generate two separate views of the human brain, represented as RoI and sub-connectivity tokens. Then, basic transformer modules can be used to process the RoI and sub-connectivity tokens, and cross-view modules integrate the complement information across two views. Furthermore, CvFormer uses a global token for each branch as a query to exchange information with other branches in cross-view modules, which only requires linear time for both computational and memory complexity instead of quadratic time. To enhance the robustness of the proposed CvFormer, we propose a two-stage strategy to train its parameters. To be specific, RoI and connectivity views can be firstly utilized as self-supervised information to pre-train the CvFormer by combining it with contrastive learning and then fused to finetune the CvFormer using label information. Experiment results on two public ABIDE and ADNI datasets can show clear improvements by the proposed CvFormer, which can validate its effectiveness and superiority.
Autores: Xiangzhu Meng, Qiang Liu, Shu Wu, Liang Wang
Última actualización: 2023-09-14 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://arxiv.org/abs/2309.07940
Fuente PDF: https://arxiv.org/pdf/2309.07940
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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