Nuevas perspectivas sobre el desarrollo cerebral fetal con fMRI
Los investigadores presentan un conjunto de datos para estudiar la conectividad cerebral fetal.
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Tabla de contenidos
- Métodos y Muestra de Datos
- Etapas de Procesamiento de Datos
- Visión General de la Estructura de Datos
- Reconstrucción de Imágenes
- Correcciones Espaciales
- Mapeos de Nativo a Plantilla
- Filtrado Temporal
- Grupo 1: Artefactos de Inconsistencia Espacial
- Grupo 2: Cambios de Señal Inducidos por Movimiento
- Grupo 3: Artefactos del Esquema de Muestreo
- Control de Calidad y Selección de Datos
- Resultados y Hallazgos
- Análisis a Nivel de Grupo
- Perspectivas sobre Redes Cerebrales
- Conclusión
- Fuente original
Desde el principio de la vida, incluso antes de nacer, el cerebro ya muestra señales de estar activo y conectado. Esta red de conexiones en el cerebro es clave para los comportamientos complejos y las habilidades de pensamiento que se desarrollan después. Las investigaciones han resaltado cuán crítico es el tiempo en el útero para un cerebro sano. Con más evidencia que muestra esta importancia, los científicos ahora buscan entender cómo se forman estas conexiones cerebrales mientras el feto se desarrolla.
Los avances en la tecnología de imagen, especialmente la fMRI fetal (Resonancia Magnética Funcional), han abierto nuevas puertas para estudiar cómo funciona el cerebro humano en sus primeras etapas. Esta tecnología permite a los investigadores observar el cerebro mientras todavía está en el útero, pero trae sus propios desafíos. Por ejemplo, el movimiento del feto y los cambios en el cuerpo de la madre pueden dificultar la obtención de imágenes claras. Estos problemas pueden afectar la Calidad de los datos recolectados.
Para entender mejor estos temas, los investigadores han lanzado esfuerzos para recopilar datos sobre la Función cerebral fetal. Desafortunadamente, hay una falta de conjuntos de datos disponibles públicamente que otros puedan usar para sus estudios. Para abordar esta brecha, se ha creado un nuevo conjunto de datos de acceso abierto, que contiene un gran número de escaneos de fMRI fetal. Este conjunto de datos se ha desarrollado con métodos especiales para garantizar la calidad de las imágenes y permitir que los investigadores realicen análisis significativos.
Métodos y Muestra de Datos
Los participantes fueron cuidadosamente seleccionados para este estudio como parte de un proyecto transversal dedicado a la ciencia abierta. La investigación recibió las aprobaciones necesarias y se obtuvo el consentimiento informado de las familias antes de que se realizaran las imágenes. La imagen se realizó utilizando un sistema de alta calidad, que permite obtener escaneos detallados del cerebro en desarrollo.
Los datos de fMRI fetal consistieron en numerosos escaneos. El estudio incluyó escaneos cuya calidad era lo suficientemente buena para el análisis. Después de una revisión inicial de las imágenes, algunos escaneos fueron eliminados del procesamiento posterior debido a problemas de calidad. Los escaneos a menudo fueron complementados por imágenes anatómicas tomadas al mismo tiempo, lo que permite un mejor análisis de la estructura y función cerebral.
En total, se recopiló un número significativo de escaneos fetales, y estos escaneos pasaron por un riguroso proceso de procesamiento para asegurar la mejor calidad de datos posible. El proceso involucró múltiples pasos para corregir cualquier distorsión o movimiento que pudiera haber afectado la calidad de la señal durante la imagen.
Etapas de Procesamiento de Datos
Visión General de la Estructura de Datos
El conjunto de datos fue cuidadosamente organizado para facilitar su uso. Incluye imágenes en dos formatos diferentes: el espacio de adquisición original y un espacio anatómicamente consistente. Este último es crucial para asegurarse de que los datos puedan ser analizados correctamente, con ajustes realizados por cualquier distorsión o movimiento que ocurriera durante la imagen.
Reconstrucción de Imágenes
Uno de los primeros pasos en el procesamiento de las imágenes involucró reconstruirlas a partir de datos en bruto. Este proceso permitió a los investigadores obtener imágenes claras que luego podían ser corregidas por movimiento u otras distorsiones. Se aplicaron métodos especiales para obtener la mejor imagen posible de la actividad cerebral sin interferencias externas.
Correcciones Espaciales
El siguiente paso involucró hacer correcciones a las imágenes para tener en cuenta cualquier distorsión causada por el movimiento. El cerebro fetal está rodeado de varios tejidos que pueden afectar la calidad de la imagen, por lo que los investigadores trabajaron cuidadosamente para corregir cualquier cambio dinámico que ocurriera durante el escaneo.
La corrección de movimiento fue especialmente importante porque el feto puede moverse, lo que afectaría los escaneos. Los investigadores utilizaron técnicas avanzadas para estimar y corregir cualquier movimiento para asegurarse de que las imágenes finales fueran lo más precisas posible.
Mapeos de Nativo a Plantilla
Las imágenes fueron alineadas y mapeadas a plantillas anatómicas. Este paso permitió comparaciones entre diferentes escaneos y facilitó a los investigadores el análisis de los datos y compartir hallazgos con otros en el campo. Los mapeos ayudaron a crear un conjunto de datos cohesivo donde las imágenes podrían ser analizadas exactamente juntas.
Filtrado Temporal
El filtrado temporal es otro paso crítico en el proceso de procesamiento. Esto implica evaluar la calidad de los datos a lo largo del tiempo y filtrar cualquier ruido o disturbios de señal que puedan afectar los resultados. Los investigadores dividieron los posibles disturbios de señal en diferentes grupos basados en sus características.
Grupo 1: Artefactos de Inconsistencia Espacial
Este grupo incluye factores que podrían afectar cuán similares son los diferentes volúmenes de imágenes a lo largo del tiempo. Estos problemas podrían surgir de movimientos durante el escaneo u otras fluctuaciones inesperadas en la señal. Los investigadores implementaron varias técnicas para identificar y minimizar estas perturbaciones.
Grupo 2: Cambios de Señal Inducidos por Movimiento
El movimiento puede causar cambios inesperados en las señales recolectadas. Los investigadores evaluaron este tipo de perturbación al observar tejidos no de materia gris, como la materia blanca y el líquido cefalorraquídeo. Al analizar estas áreas, pudieron identificar patrones adicionales de movimiento que podrían impactar la calidad de los datos de imagen.
Grupo 3: Artefactos del Esquema de Muestreo
Finalmente, algunas perturbaciones están relacionadas con la forma en que se muestrean los datos durante la imagen. Estos artefactos pueden llevar a variaciones en la señal que no reflejan la actividad cerebral real. Los investigadores emplearon métodos estadísticos para identificar y tener en cuenta estos artefactos para mejorar la precisión de sus análisis.
Control de Calidad y Selección de Datos
Una vez que los datos habían sido procesados, era esencial evaluar su calidad. Los investigadores realizaron evaluaciones visuales junto con análisis estadísticos para asegurarse de que las imágenes escaneadas cumplieran con criterios de calidad preestablecidos. Este paso garantizó que solo los mejores datos se utilizaran para un análisis más detallado.
Se definió un conjunto de reglas específicas para determinar qué escaneos eran adecuados para el análisis. Los investigadores calificaron cada escaneo en función de la calidad visual y medidas complementarias de calidad, como la relación señal-ruido. Los escaneos que cumplían con los estándares de calidad fueron retenidos, mientras que otros fueron excluidos de análisis posteriores.
Resultados y Hallazgos
El conjunto de datos final es robusto, incluyendo un gran número de escaneos que han sido rigurosamente procesados y son adecuados para análisis de conectividad. Los resultados muestran una oportunidad significativa para futuras investigaciones sobre el desarrollo funcional del cerebro prenatal.
Análisis a Nivel de Grupo
Al emplear análisis a nivel de grupo, los investigadores pueden entender mejor cómo diferentes áreas del cerebro fetal se conectan y funcionan juntas. Estos conocimientos pueden arrojar luz sobre cómo progresa el desarrollo del cerebro a lo largo del tiempo y ayudar a identificar posibles desviaciones del desarrollo típico.
Los investigadores ya han comenzado a investigar estas conexiones utilizando el nuevo conjunto de datos. Los hallazgos iniciales han demostrado la capacidad de detectar cambios en los patrones de conectividad que varían con la edad del feto. Esta información es crítica para entender el desarrollo cerebral normal y podría tener implicaciones para identificar trastornos del desarrollo.
Perspectivas sobre Redes Cerebrales
Los análisis a nivel de grupo han revelado una serie de redes funcionales dentro del cerebro fetal. Los resultados tempranos sugieren que ciertas áreas del cerebro muestran simetría interhemisférica, lo que significa que están organizadas de manera similar en ambos lados. Este descubrimiento puede llevar a una mejor comprensión de cómo se desarrolla la arquitectura funcional del cerebro a lo largo del tiempo.
Es crucial seguir explorando estas redes en estudios futuros. Al examinar las conexiones y las interacciones entre diferentes regiones cerebrales, los investigadores pueden obtener información sobre el desarrollo cognitivo y conductual que podría surgir a medida que los niños crecen.
Conclusión
La creación de un conjunto de datos de acceso abierto de escaneos de fMRI fetal representa un paso significativo en el campo de la neurociencia. Este recurso permite a los investigadores explorar el desarrollo funcional temprano del cerebro y sienta las bases para importantes avances en nuestra comprensión del desarrollo cerebral prenatal.
Los desafíos de estudiar el desarrollo cerebral fetal usando fMRI son enormes, pero este nuevo conjunto de datos proporciona a los investigadores una herramienta valiosa para abordar estos problemas. Empleando técnicas avanzadas de imagen y rigurosos controles de calidad, los científicos ahora pueden trabajar con datos de alta calidad que pueden llevar a importantes descubrimientos sobre la conectividad cerebral y el desarrollo temprano.
A medida que la investigación continúa en esta área, se espera que los hallazgos contribuyan a una mayor comprensión de cómo evoluciona la función cerebral en el útero y cómo las experiencias tempranas podrían moldear el desarrollo cerebral en la vida posterior. Los esfuerzos continuos para mejorar las metodologías y ampliar los conjuntos de datos serán clave para desentrañar los misterios del cerebro humano en desarrollo.
Título: The developing Human Connectome Project fetal functional MRI release: Methods and data structures
Resumen: Recent advances in fetal fMRI present a new opportunity for neuroscience to study functional human brain connectivity at the time of its emergence. Progress in the field however has been hampered by the lack of openly available datasets that can be exploited by researchers across disciplines to develop methods that would address the unique challenges associated with imaging and analysing functional brain in utero, such as unconstrained head motion, dynamically evolving geometric distortions, or inherently low signal-to-noise ratio. Here we describe the developing Human Connectome Projects release of the largest open access fetal fMRI dataset to date, containing 275 scans from 255 fetuses and spanning the period of 20.86 to 38.29 post-menstrual weeks. We present a systematic approach to its pre-processing, implementing multi-band soft SENSE reconstruction, dynamic distortion corrections via phase unwrapping method, slice-to-volume reconstruction and a tailored temporal filtering model, with attention to the prominent sources of structured noise in the in utero fMRI. The dataset is accompanied with an advanced registration infrastructure, enabling group-level data fusion, and contains outputs from the main intermediate processing steps. This allows for various levels of data exploration by the imaging and neuroscientific community, starting from the development of robust pipelines for anatomical and temporal corrections to methods for elucidating the development of functional connectivity in utero. By providing a high-quality template for further method development and benchmarking, the release of the dataset will help to advance fetal fMRI to its deserved and timely place at the forefront of the efforts to build a life-long connectome of the human brain.
Autores: Vyacheslav R Karolis, L. Cordero-Grande, A. Price, E. Hughes, S. P. Fitzgibbon, V. Kyriakopoulou, A. Uus, N. Harper, D. Prokopenko, D. Bridglal, J. Willers Moore, S. Wilson, M. Pietsch, D. Christiaens, M. Deprez, L. Z. J. Williams, E. C. Robinson, A. Makropoulos, S.-R. Farahibozorg, J. O'Muircheartaigh, M. Rutherford, D. Rueckert, D. Edwards, T. Arichi, S. M. Smith, E. Duff, J. V. Hajnal
Última actualización: 2024-06-19 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598863
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598863.full.pdf
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