Die Evolution von CAM bei Tillandsia entschlüsseln
Eine Studie zeigt die genetische Komplexität hinter den CAM-Anpassungen bei Tillandsia-Pflanzen.
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Inhaltsverzeichnis
Die Studie darüber, wie komplexe Merkmale bei Lebewesen entstehen, ist für Wissenschaftler, die sich mit Evolution beschäftigen, eine grosse Herausforderung. Während man erwartet, dass einfache Merkmale, die durch eine einzige Veränderung in einem Gen verursacht werden, häufig sind, ist es gar nicht so leicht herauszufinden, wie kompliziertere Merkmale entstehen, die Veränderungen in mehreren Bereichen eines Organismus benötigen. Einige Merkmale scheinen in verschiedenen Pflanzen- und Tierarten immer wieder aufzutauchen, obwohl die genetischen Wege, die zu diesen Merkmalen führen, unterschiedlich sein können.
Eine Möglichkeit für dieses Auftreten ist, dass ähnliche physikalische Merkmale durch verschiedene Genveränderungen entstehen können. Das passiert, weil einige Merkmale von vielen verschiedenen Genen beeinflusst werden, und diese Gene möglicherweise überlappende Funktionen haben. Es gibt viele Beispiele dafür in der Natur, einschliesslich bestimmter Mäusearten und verschiedener Pflanzen, bei denen ähnliche Merkmale entstanden sind, ohne den gleichen genetischen Hintergrund zu teilen.
CAM)
Crassulaceae-Säurestoffwechsel (Eines dieser komplexen Merkmale nennt sich Crassulacean Acid Metabolism (CAM). Das ist eine Art, wie einige Pflanzen Kohlendioxid (CO2) einfangen, um ihnen bei der Fotosynthese zu helfen. In mindestens 38 Pflanzenfamilien haben Wissenschaftler herausgefunden, dass CAM mindestens 66 Mal unabhängig entwickelt wurde. CAM-Pflanzen haben eine spezielle Art, CO2 nachts zu speichern und es tagsüber zu nutzen, was sich von der Funktionsweise der meisten Pflanzen, den sogenannten C3-Pflanzen, unterscheidet.
Der Hauptunterschied zwischen CAM- und C3-Pflanzen ist die anfängliche Verarbeitung von CO2. CAM-Pflanzen verwenden ein Enzym, um CO2 in eine andere Chemikalie namens Malat umzuwandeln, die über Nacht gespeichert und dann tagsüber wieder in CO2 umgewandelt wird, um für die Fotosynthese genutzt zu werden. Dieser Prozess ermöglicht es CAM-Pflanzen, ihre Spalten oder Stomata nachts zu öffnen, wenn es kühler ist, und sie tagsüber geschlossen zu halten, wodurch Wasser gespart wird. Das ist besonders hilfreich für Pflanzen in heissen oder trockenen Regionen.
CAM wird als komplexes Merkmal angesehen. Es beinhaltet nicht nur Veränderungen im Timing, wann bestimmte Gene ein- oder ausgeschaltet werden, sondern es ist auch mit spezifischen anatomischen Merkmalen verbunden, die der Pflanze helfen, effektiv zu funktionieren. Zu diesen Merkmalen gehören grössere Speicherbereiche in den Zellen und unterschiedliche Anordnungen der Zellen. Früher dachte man, Pflanzen könnten nur als C3 oder CAM klassifiziert werden, aber neue Methoden haben gezeigt, dass viele Pflanzen eine Mischung dieser Merkmale zeigen können.
Die Rolle von Tillandsia
Die Untergattung Tillandsia, die zur Familie der Bromeliaceae gehört, ist eine interessante Gruppe, um zu untersuchen, wie sich verschiedene ökologische Merkmale bei Pflanzen entwickelt haben. Tillandsia umfasst über 250 Arten, die sich über einen Zeitraum von 7 Millionen Jahren entwickelt haben. Viele dieser Arten haben sich auf einzigartige Weise an ihre Umwelt angepasst, einschliesslich der Entwicklung von CAM.
Diese Studie zielt darauf ab zu erforschen, ob fakultative (die zwischen C3 und CAM wechseln können) und konstitutive CAM-Pflanzen (die konstant CAM verwenden) einen gemeinsamen genetischen Hintergrund haben oder ob sie ihre CAM-Eigenschaften durch unterschiedliche genetische Veränderungen erreichen. Dazu haben Wissenschaftler zwei Tillandsia-Arten untersucht: T. leiboldiana und T. vanhyningii, die sehr unterschiedliche Kohlenstoffisotopenmessungen gezeigt haben. Die eine wird als starke CAM-Pflanze angesehen, während die andere hauptsächlich als C3-Pflanze betrachtet wird.
Experimentelles Setup
Um die Forschungsfragen zu beantworten, wurden Experimente konzipiert, um Veränderungen in der Physiologie und Genexpression in Bezug auf CAM und Trockenstress festzuhalten. Beide Tillandsia-Arten wurden unter kontrollierten Bedingungen für 6 Wochen kultiviert, bevor sie einem 12-Stunden-Licht- und Dunkelzyklus für 14 Tage ausgesetzt wurden. Einige Pflanzen erlebten Trockenbedingungen, indem sie nicht gegossen wurden, während andere unter normalen Bewässerungsbedingungen blieben.
Nach 14 Tagen wurden Blattproben zu verschiedenen Zeiten während des Tages und der Nacht entnommen, um Schäden zu vermeiden. Die Analyse konzentrierte sich darauf, wie jede Art auf Trockenheit reagierte, insbesondere auf Veränderungen des Säuregehalts in den Blättern, die mit der CAM-Aktivität in Zusammenhang stehen, sowie auf die Genexpression durch RNA-Sequenzierung.
Messung von Änderungen der Säure
Die Säuregehalte in den Blattproben wurden gemessen, um Veränderungen zu beobachten, die tagsüber sowohl unter normalen als auch unter Trockenbedingungen auftraten. Diese Werte spiegeln die Fähigkeit der Pflanzen wider, CAM durchzuführen, da CAM-Pflanzen typischerweise nachts mehr Säuren ansammeln und sie tagsüber verwenden.
Die Ergebnisse zeigten, dass T. vanhyningii ein starkes CAM-ähnliches Muster aufwies, mit signifikanten Änderungen der Säurewerte zwischen Tag und Nacht. Im Gegensatz dazu zeigte T. leiboldiana unter normalen Bedingungen wenig Schwankungen im Säuregehalt, was darauf hindeutet, dass sie mehr wie eine typische C3-Pflanze funktionierte. Unter Trockenbedingungen begannen jedoch die Säurewerte von T. leiboldiana sich zu verändern, was auf einen möglichen schwachen CAM-Zyklus hindeutet.
Genexpressionsanalyse
Anschliessend wurde RNA-Sequenzierung verwendet, um die Gene zu verstehen, die für die beobachteten Veränderungen in den Pflanzen verantwortlich sind. Das Verfahren umfasste die Extraktion und Sequenzierung von RNA aus den Blattproben. Die Daten zeigten, dass die Verteilung der Genexpression zwischen den beiden Arten, insbesondere unter unterschiedlichen Bewässerungsbedingungen, erheblich variierte.
Die meisten Gene in T. vanhyningii blieben konstant, während T. leiboldiana eine viel breitere Reaktion auf Trockenstress zeigte. Das deutet darauf hin, dass T. vanhyningii, eine konstitutive CAM-Pflanze, ihre Stoffwechselprozesse auch während Trockenheit aufrechterhält, während T. leiboldiana sensibler auf Veränderungen der Wasserverfügbarkeit reagiert.
Überlappende Antworten
Weitere Analysen zeigten, dass es eine bemerkenswerte Überlappung in den Reaktionen der Genexpression zwischen den beiden Arten gab. Bei der Beobachtung der Reaktionen auf Trockenheit wurden viele Gene entweder in T. vanhyningii oder T. leiboldiana einzigartig exprimiert, was darauf hindeutet, dass jede Art ihre eigenen genetischen Strategien zur Bewältigung von Umweltstress entwickelt hat.
Trotz ihrer engen Verwandtschaft deuten die erheblichen Unterschiede in der Genexpression auf unterschiedliche evolutionäre Wege hin, wie sich jede Pflanze an ihre Umwelt anpasst. T. vanhyningii hält einen stabilen Stoffwechsel unter Stress aufrecht, während T. leiboldiana unter Trockenheit starke Anzeichen einer Aktivierung von CAM-Merkmalen zeigt.
Vergleich der Reaktionen auf Trockenheit
Der Vergleich hob auch hervor, dass T. leiboldiana's Reaktion mehr im Einklang mit typischen C3-Pflanzen zu stehen scheint, die unter Stress zu CAM wechseln können. Im Gegensatz dazu behält T. vanhyningii grösstenteils seine CAM-Funktionen ohne signifikante Veränderungen unter Trockenstress.
Das unterstreicht die Idee, dass verschiedene CAM-Strategien in eng verwandten Arten koexistieren können, und zeigt, wie komplexe genetische Wege zu ähnlichen Merkmalen auf unterschiedliche Weise führen können. Die Entdeckung, dass T. leiboldiana als schwache CAM-Pflanze und nicht als echte C3-Pflanze funktionieren könnte, zeigt die Wichtigkeit, diese Merkmale in verschiedenen Umwelt- und Entwicklungszusammenhängen zu untersuchen.
Diskussion
Die Studie veranschaulicht, wie CAM in verschiedenen Formen auftreten kann, was zu einer Reihe von Anpassungen in verschiedenen Pflanzenarten führt. Sie betont die Komplexität der pflanzlichen Reaktionen auf Umweltbedingungen und die genetischen Grundlagen solcher Anpassungen.
Darüber hinaus wird angedeutet, dass CAM nicht nur ein einzelnes Merkmal ist, sondern vielmehr ein Spektrum von Anpassungen, die verschiedene Pflanzen im Laufe der Zeit entwickelt haben. Durch die Untersuchung der Tillandsia-Gruppe können Forscher wichtige Erkenntnisse darüber gewinnen, wie sich diese Pflanzen in vielfältigen und oft herausfordernden Umgebungen entwickelt haben.
Fazit
Zusammenfassend hilft die Forschung zu den beiden Tillandsia-Arten, die evolutionären Wege im Zusammenhang mit CAM zu beleuchten. Die Ergebnisse zeigen, dass, während zwei Arten auf den ersten Blick ähnlich erscheinen und zur selben Gruppe gehören, ihre zugrunde liegenden genetischen Mechanismen bemerkenswert unterschiedlich sein können. Die unterschiedlichen Reaktionen von T. leiboldiana und T. vanhyningii auf Trockenstress verdeutlichen die komplexe Natur der Anpassung bei Pflanzen. Diese Unterschiede zu verstehen, ist entscheidend, um die Evolution pflanzlicher Merkmale und die komplexen Beziehungen zwischen Genetik und Umweltbedingungen zu schätzen.
Zukünftige Studien können auf dieser Forschung aufbauen, indem sie eine breitere Palette von Arten und Umweltbedingungen erkunden, um die Komplexität von CAM und dessen Rolle in der Pflanzenentwicklung weiter zu entschlüsseln.
Titel: Closely related facultative and constitutive CAM phenotypes show little transcriptomic overlap in the subgenus Tillandsia
Zusammenfassung: 1.O_LIThe evolutionary trajectory of Crassulacean acid metabolism (CAM) remains elusive, as it has evolved repeatedly, yet represents a complex trait requiring changes on several organismal levels. It is debated whether distinct forms of CAM embody a single quantitative trait, or entirely separate, categorical phenotypes. The subgenus Tillandsia provides an excellent opportunity to compare the genetic basis of different forms of CAM, as species are closely related, yet display a broad range of CAM phenotypes. C_LIO_LIBy combining physiological and transcriptomic analyses of well-watered and drought-stressed accessions of a Tillandsia species pair, we achieved a comprehensive characterization of their photosynthetic phenotypes and the transcriptomic underpinnings and overlap of distinct CAM phenotypes in Tillandsia. C_LIO_LIWe found that a species previously identified as C3 displays an active CAM cycle under drought stress, yet the effect of drought was markedly increased compared to the constitutive CAM species. The CAM-specific transcriptomic response to day-night changes and to drought showed little overlap between the two species, with most DE genes showing distinct regulation patterns or being unique to one species. C_LIO_LIOur study reveals that the two species do not exhibit a shared transcriptomic basis of CAM expressed at distinct levels, but that different transcriptomic routes can lead to similar phenotypes, supporting the view that CAM is a highly polygenic trait. C_LI
Autoren: Clara Groot Crego, S. Saadain, M. de La Harpe, J. Hess, M. H. J. Barfuss, W. Till, C. Lexer, O. Paun
Letzte Aktualisierung: 2024-05-10 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.09.593278
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.09.593278.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.
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