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# Biologie# Genetik

Die Auswirkung von stabilisierender Selektion auf genetische Eigenschaften

Untersuchen, wie stabilisierende Selektion genetische Merkmale und Vielfalt über die Zeit beeinflusst.

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Inhaltsverzeichnis

Das Verstehen, wie Eigenschaften durch Genetik geprägt werden, ist ein wichtiger Teil der Biologie. Einige Eigenschaften, die von vielen Genen beeinflusst werden, nennt man polygenetische Eigenschaften. Um ein besseres Verständnis für diese Eigenschaften zu bekommen, nutzen Forscher genetische Modelle und Daten aus Studien, die viele Gene gleichzeitig betrachten. Ein gängiges Modell, das erklärt, wie sich einige Eigenschaften im Laufe der Zeit ändern könnten, nennt man Stabilisierende Selektion. Diese Art der Selektion bevorzugt Eigenschaften, die nahe einem optimalen Wert liegen, und fördert keine extremen Variationen.

Die Rolle der stabilisierenden Selektion

Stabilisierende Selektion funktioniert, indem sie Individuen mit Eigenschaften bevorzugt, die nahe dem Durchschnitt liegen, während die mit Eigenschaften, die weit vom Durchschnitt entfernt sind, weniger Erfolg haben. Diese Idee wird sowohl durch theoretische Argumente als auch durch reale Daten unterstützt. Studien zeigen, dass viele Eigenschaften bei Menschen, wie der Fortpflanzungserfolg, Muster stabilisierender Selektion aufweisen. Wenn Forscher sich menschliche Eigenschaften angesehen haben, fanden sie, dass die Verteilung von Genvarianten (Allelen) und deren Wirkungen gut mit dem übereinstimmt, was stabilisierende Selektion vorschlägt.

Konsequenzen der stabilisierenden Selektion

Das Hauptresultat der stabilisierenden Selektion auf eine Eigenschaft ist eine Verringerung ihrer genetischen Vielfalt im Laufe der Zeit. Das geschieht auf zwei Hauptarten. Erstens führt die stabilisierende Selektion zu Kombinationen von Allelen, die sich gegenseitig ausgleichen und es extremen Eigenschaften erschweren, sich durchzusetzen. Das wird oft als der „Bulmer-Effekt“ bezeichnet. Er schafft negative Assoziationen zwischen Allelen, die ähnliche Effekte auf eine Eigenschaft haben. Zweitens schwächt die stabilisierende Selektion die Wahrscheinlichkeit, dass seltene Allele in der Population bestehen bleiben, was zu einem allmählichen Verlust genetischer Variation an diesen Stellen führt.

Um zu verdeutlichen, wie das funktioniert, betrachten wir eine genetische Stelle, die eine Eigenschaft beeinflusst. Wenn das häufige Allel die Eigenschaft verstärkt, muss der Rest des Genoms einen ausgleichenden Effekt haben, der den durchschnittlichen Eigenschaftswert zurück zum optimalen Niveau zieht. Diese Dynamik führt oft dazu, dass das seltenere Allel, das möglicherweise auch den Eigenschaftswert verringert, benachteiligt wird. Weil das seltenere Allel weniger gut zur umgebenden genetischen Landschaft passt, wird es in der Regel negativ ausgewählt.

Geschwindigkeit der Veränderungen in der Allelfrequenz

Die Geschwindigkeit, mit der sich Allelfrequenzen ändern, wenn stabilisierende Selektion im Spiel ist, wird durch die durchschnittlichen Effekte der Allele und den genetischen Hintergrund, zu dem sie gehören, bestimmt. Eigenschaften nehmen zu oder ab, basierend auf den Assoziationen zwischen Allelen und ihren verbundenen Partnern im Genom. Dieses Phänomen schafft eine Situation, in der der durchschnittliche Einfluss der Allele an einem bestimmten Ort näher am optimalen Eigenschaftsniveau liegt, was zu einem schwächeren Selektionsdruck und langsameren Veränderungen in der Allelfrequenz führt.

Veränderungen der Allelfrequenzen messen

Um das zu verstehen, schauen Forscher sich an, wie sich die Frequenz von Allelen von einer Generation zur nächsten ändert. Sie können die erwarteten Veränderungen basierend auf den Effekten eines Allels, der Stärke der Selektion und dem gesamten genetischen Hintergrund berechnen. Frühere Forschungen haben diese Dynamik umfassend untersucht und Einblicke gegeben, wie stabilisierende Selektion Eigenschaften formt.

In diesen Studien wurde festgestellt, dass, obwohl stabilisierende Selektion zu einer Verringerung der Variabilität unter den Allelen führt, dies die gesamte genetische Variabilität nicht auf einfache Weise beeinflusst. Es gibt ein Gleichgewicht zwischen den negativen Assoziationen, die aus stabilisierender Selektion entstehen, und dem natürlichen Mix von Allelen durch Rekombination.

Fokussierung auf individuelle Loci

Frühere Arbeiten konzentrierten sich typischerweise auf die Gesamteigenschaften von Eigenschaften, die von stabilisierender Selektion betroffen sind. Allerdings kann es entscheidend sein, zu verstehen, wie sich jeder Locus (oder Genort) verhält, um praktische Anwendungen zu ermöglichen. Zum Beispiel hilft es, wenn man sich die kombinierte Verteilung von Allelfrequenzen und deren Effekten aus grossen Studien ansieht, ein klareres Bild der genetischen Architektur von Eigenschaften zu formen. Das ist besonders wichtig, wenn mehr genetische Daten verfügbar werden.

Die genetische Basis polygenetischer Eigenschaften

Bei einer polygenetischen Eigenschaft, die von stabilisierender Selektion beeinflusst wird, stammt die Genetische Variation aus mehreren Loci. Jeder Locus hat ein steigendes oder fallendes Allel, und deren kombinierte Effekte bestimmen den Eigenschaftswert. Beim Studium dieser Eigenschaften ignorieren Forscher oft Mutationen an anderen Loci, um sich darauf zu konzentrieren, wie jeder Locus zum Gesamtbild beiträgt.

Der Eigenschaftswert für ein Individuum kann als Summe der Effekte all dieser Loci betrachtet werden, wobei jedes Allel positiv oder negativ zum Gesamtwert beiträgt. Der gesamte Eigenschaftswert ergibt sich aus diesen genetischen Informationen sowie den Umweltfaktoren.

Der Einfluss der Umwelt

Umweltstörungen können ebenfalls die Eigenschaftswerte beeinflussen, aber Forscher gehen oft davon aus, dass sich diese Störungen im Laufe der Zeit ausgleichen. Daher bleibt der Fokus auf den genetischen Einflüssen, wenn untersucht wird, wie sich Eigenschaften unter stabilisierender Selektion entwickeln.

Die Fitness von Individuen hängt in diesem Kontext eng mit ihrem Eigenschaftswert zusammen. Diejenigen mit Werten, die näher am Optimum liegen, haben eine höhere Wahrscheinlichkeit, erfolgreich zu reproduzieren. Daher nähert sich der durchschnittliche Eigenschaftswert in der Population schnell dem optimalen Wert, während Selektionsdrücke wirken.

Analyse der marginalen Fitness

Um zu analysieren, wie sich Allelfrequenzen ändern, berechnen Forscher die Fitness, die mit jedem Allel an einem Locus verbunden ist. Das hilft zu bestimmen, wie effektiv ein bestimmtes Allel ist, um den gewünschten Eigenschaftswert zu fördern. Die erwartete Änderung in der Allelfrequenz kann dann basierend auf diesen Fitness-Schätzungen vorhergesagt werden.

Forscher berücksichtigen auch einfache Berechnungen, die verschiedene Quellen natürlicher Variation ignorieren. Nachdem sie Faktoren wie die Auswirkungen der Umwelt und anderer Loci berücksichtigt haben, verbessern sich die Vorhersagen erheblich.

Hintergrundphänotypische Variabilität

Bei der Bewertung der phänotypischen Variabilität schauen Wissenschaftler, wie die gesamte Variation in Eigenschaften von genetischen Faktoren beeinflusst wird. Das Vorhandensein von Hintergrundvariabilität verdünnt den Einfluss stabilisierender Selektion auf bestimmte Loci. Dieses Verständnis führt zu einer genaueren Vorhersage, wie sich Allelfrequenzen über Generationen ändern.

Der Bulmer-Effekt neu betrachtet

Der Bulmer-Effekt, der sich auf die negative Verbindung zwischen Allelen unter stabilisierender Selektion bezieht, verringert die genetische Varianz einer Eigenschaft. Die Beziehung zwischen ausgewählten Allelen und ihren assoziierten Loci beeinflusst den durchschnittlichen Wert, den jedes Allel während der Selektion erfährt.

Wenn Selektionsdrücke auf die Population wirken, bestimmen der durchschnittliche Effekt der Allele und ihre Interaktionen, wie schnell sich Allelfrequenzen ändern können. Engere Beziehungen zwischen Allelen führen zu stärkeren Maskierungseffekten, was zu langsameren Änderungen in der Frequenz führt.

Variable Linkage-Effekte

In komplexeren Modellen kann die genetische Architektur mehrere verbundene Allele umfassen. Linkage bezieht sich darauf, wie eng Allele auf demselben Chromosom liegen, was beeinflusst, wie sie gemeinsam weitergegeben werden. Das beeinflusst die Menge an Varianz in einer Eigenschaft aufgrund stabilisierender Selektion.

Der Grad der Verknüpfung beeinflusst die erwartete genetische Varianz und die dynamische Natur der Allelfrequenzen. Eng verbundene Loci können ausgeprägtere Effekte zeigen, während lose verbundene Loci mehr Unabhängigkeit aufweisen können.

Einbeziehung von Daten aus der realen Welt

Die Verwendung von genomischen Daten aus grossen Studien gibt Forschern die Informationen, die sie benötigen, um ihre Modelle zu testen. Diese Daten spiegeln die realen Komplexitäten der Genetik wider, einschliesslich wie mehrere Gene interagieren und wie sie sowohl von stabilisierender Selektion als auch von Umweltfaktoren beeinflusst werden.

Durch den Einsatz dieser Modelle ist es möglich, Einblicke in die genetische Architektur verschiedener Eigenschaften wie Grösse oder Intelligenz zu gewinnen. Diese Einsichten können in verschiedenen Anwendungen hilfreich sein, einschliesslich Medizin, Landwirtschaft und dem Verständnis menschlichen Verhaltens.

Die Rolle von genomweiten Assoziationsstudien

Genomweite Assoziationsstudien (GWAS) haben zum Ziel, Verbindungen zwischen genetischen Varianten und Eigenschaften zu identifizieren. Diese Studien sind entscheidend, um die genetischen Grundlagen komplexer Eigenschaften zu entschlüsseln. Durch die Untersuchung einer Vielzahl von Genvarianten auf einmal können Forscher ableiten, wie diese Varianten zu beobachtbaren Eigenschaften beitragen.

Die Ergebnisse von GWAS helfen, unser Verständnis davon zu formen, wie stabilisierende Selektion innerhalb von Populationen wirken könnte. Sie zeigen Muster in der Allelfrequenz und den Effektgrössen, die mit theoretischen Vorhersagen übereinstimmen und die Bedeutung stabilisierender Selektion bei der Gestaltung genetischer Vielfalt verstärken.

Potenzielle Herausforderungen bei der Dateninterpretation

Obwohl diese Modelle Klarheit bieten, stellen sie auch Herausforderungen bei der Dateninterpretation dar. Die Variabilität von Allelfrequenzen in verschiedenen Populationen kann beeinflussen, wie gut polygenetische Scores Eigenschaften in unterschiedlichen Gruppen vorhersagen. Unterschiede in genetischen Hintergründen und Umweltbedingungen bedeuten, dass das, was in einer Population funktioniert, möglicherweise nicht direkt auf eine andere übertragbar ist.

Verschiedene Faktoren tragen zu diesen Diskrepanzen bei. Populationsunterschiede können zu Variabilität in Allelfrequenzen, den Effekten von Allelen und sogar den Umwelteinflüssen auf bestimmte Eigenschaften führen.

Verbesserung der Vorhersagegenauigkeit

Um die Übertragbarkeit polygenetischer Scores zu verbessern, ist es wichtig, zu berücksichtigen, wie stabilisierende Selektion und der Bulmer-Effekt die Dynamik der Allele verändern. Indem Forscher „effektive“ Effektgrössen für Allele definieren, können sie die Vorhersagen von Eigenschaftswerten in verschiedenen Populationen verbessern.

Der Einsatz besserer Modelle kann unser Verständnis davon erweitern, wie Eigenschaften weitergegeben werden und wie sie sich im Laufe der Zeit ändern könnten. Das kann zu einer effektiveren Nutzung genetischer Informationen führen und bessere Einblicke in Gesundheit, Krankheitsanfälligkeit und andere wichtige Merkmale bieten.

Beziehung zwischen Allelewechsel und Populationsunterschieden

Der Allelewechsel, oder die Veränderung von Allelen in Populationen, wird von stabilisierender Selektion beeinflusst. Dieser Prozess neigt dazu, schneller zu sein als neutraler Drift, was bedeutet, dass Eigenschaften unter stabilisierendem Druck schneller schwanken können.

Forschungen zeigen, dass die Dynamik der Veränderungen in der Allelfrequenz zwischen Populationen unterschiedlich ist. Wenn beispielsweise eine genetische Variante in einer Population häufig, in einer anderen jedoch selten ist, könnte das zu erheblichen Unterschieden in der Ausprägung von Eigenschaften führen.

Implikationen für zukünftige Forschungen

Das Verstehen, wie stabilisierende Selektion und der Bulmer-Effekt die Dynamik der Allelfrequenzen beeinflussen, ist entscheidend für zukünftige Forschungen. Mit neuen Daten, die weiterhin verfügbar werden, wird das Verfeinern dieser Modelle unsere Fähigkeit verbessern, vorherzusagen, wie sich Eigenschaften entwickeln.

Das Zusammenspiel von genetischen Faktoren und Umweltfaktoren wird weiterhin ein wichtiger Studienbereich bleiben. Die Integration verschiedener Datensätze und die Berücksichtigung mehrerer Dimensionen genetischer Variation werden unser Verständnis komplexer Eigenschaften weiter bereichern.

Fazit

Die Untersuchung der genetischen Architektur komplexer Eigenschaften zeigt ein reiches Geflecht von Interaktionen zwischen Genen und deren Umgebungen. Stabilisierende Selektion dient als kraftvolles Rahmenwerk, um zu verstehen, wie Eigenschaften in Populationen erhalten bleiben. Durch die Verwendung genomischer Daten und populationengenetischer Modelle können Forscher tiefere Einblicke in die Dynamik der Evolution von Eigenschaften und deren Auswirkungen auf Gesundheit, Landwirtschaft und mehr gewinnen.

Während sich das Feld weiterentwickelt, wird das Potenzial, dieses Wissen anzuwenden, wachsen – was ein umfassenderes Verständnis der genetischen Grundlagen der Eigenschaften, die uns definieren, ermöglichen wird.

Originalquelle

Titel: The effect of long-range linkage disequilibrium on allele-frequency dynamics under stabilizing selection

Zusammenfassung: Stabilizing selection on a polygenic trait reduces the traits genetic variance by (i) generating correlations (linkage disequilibria) between opposite-effect alleles throughout the genome and (ii) selecting against rare alleles at polymorphic loci that affect the trait, eroding heterozygosity at these loci. Here, we characterize the impact of the linkage disequilibria, which stabilizing selection generates on a rapid timescale, on the subsequent allele-frequency dynamics at individual loci, which proceed on a slower timescale. We obtain expressions for the expected per-generation change in minor-allele frequency at individual loci, as functions of the effect sizes at these loci, the strength of selection on the trait, its variance and heritability, and the linkage relations among loci. Using whole-genome simulations, we show that our expressions predict allele-frequency dynamics under stabilizing selection more accurately than the expressions that have previously been used for this purpose. Our results have implications for understanding the genetic architecture of complex traits.

Autoren: Carl Veller, S. Negm

Letzte Aktualisierung: 2024-06-28 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.27.601075

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.27.601075.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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