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KI in der Histopathologie: Die Auswirkungen von HistoGPT

HistoGPT verändert, wie Pathologen Berichte aus Gewebeabbildungen erstellen.

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Histopathologie ist eine Methode zur Diagnose von Krankheiten, indem man Gewebeproben unter dem Mikroskop anschaut. Ärzte, die Pathologen genannt werden, überprüfen diese Proben, um zu sehen, ob es Anzeichen von Krebs oder anderen Krankheiten gibt. Sie folgen strengen Richtlinien, um sicherzustellen, dass ihre Bewertungen genau und konsistent sind. Nach der Untersuchung der Proben schreiben Pathologen detaillierte Berichte. Diese Berichte helfen anderen Ärzten, die Diagnose zu verstehen und Behandlungsoptionen zu entscheiden. Das Schreiben dieser Berichte kann jedoch viel Zeit und Mühe kosten. Da es immer mehr Krebsfälle und weniger Pathologen an vielen Orten gibt, könnte die Geschwindigkeit der Patientenversorgung leiden.

Die Rolle der Künstlichen Intelligenz

Künstliche Intelligenz (KI) kann Pathologen bei ihren täglichen Aufgaben helfen. KI-Tools können einfachere Fälle bearbeiten und den Pathologen ermöglichen, sich auf komplexe Situationen zu konzentrieren. Moderne KI-Systeme, wie tiefe neuronale Netze, sind grossartig darin, Muster in Bildern zu erkennen. Diese Systeme können trainiert werden, um Krebsarten zu klassifizieren, Gewebetypen zu identifizieren und Patientenprognosen zu erstellen, indem sie hochauflösende Bilder von Gewebeproben analysieren.

Pathologen analysieren diese Bilder normalerweise auf verschiedene Weisen. Einige Methoden betrachten kleine Teile des Bildes, während andere die gesamte Probe analysieren. Das Fokussieren auf kleine Abschnitte kann jedoch wichtige Details übersehen. Neuere Methoden versuchen, diese beiden Ansätze zu kombinieren. Es gibt auch Fortschritte bei der Verknüpfung von Bildern mit Textdaten, sodass KI mehr Kontext in ihre Analysen einbringen kann.

Was ist HistoGPT?

HistoGPT ist ein neues KI-Modell, das darauf ausgelegt ist, Histopathologie-Berichte aus sehr hochauflösenden Bildern von Gewebeproben zu erstellen. Es nimmt mehrere Abschnitte von Gewebe vom gleichen Patienten und verwendet eine Kombination aus visueller und sprachlicher Verarbeitung, um Berichte zu erstellen, die beschreiben, was im Gewebe beobachtet wird.

HistoGPT kann wichtige Gewebedetails, Zelltypen und mögliche Diagnosen basierend auf den analysierten Bildern hervorheben. Benutzer können ihm Anweisungen geben, um spezifische Informationen zu bekommen, wie Vorhersagen über Tumorarten oder -dicken. Das Modell produziert Berichte, die nicht nur zeigen, was es identifiziert, sondern auch, woher diese Beobachtungen in den Gewebe-Images stammen. Diese Transparenz hilft Pathologen, die KI-generierten Berichte besser zu verstehen.

Wie HistoGPT entwickelt wurde

Um HistoGPT zu erstellen, wurde ein grosser Datensatz von Hautgewebe-Bildern und entsprechenden Berichten gesammelt. Die Bilder stammen von Tausenden von Patienten, und die Berichte wurden von ausgebildeten Pathologen verfasst. Dieser Datensatz wurde genutzt, um HistoGPT zu trainieren, damit es sowohl aus den visuellen Daten als auch aus den Berichten lernen kann.

Um zu überprüfen, wie gut HistoGPT funktioniert, wurde es mit verschiedenen Gruppen von Proben aus unterschiedlichen Standorten getestet. Ein Team qualifizierter Pathologen überprüfte die Berichte von HistoGPT, um deren Genauigkeit zu überprüfen. Sie verglichen die KI-generierten Berichte mit denen, die von Menschen verfasst wurden, um Konsistenz und Zuverlässigkeit sicherzustellen.

Die Architektur von HistoGPT

HistoGPT besteht aus zwei Hauptteilen: einem Vision-Modul, das die Gewebe-Bilder verarbeitet, und einem Sprach-Modul, das Texte generiert. Der visuelle Teil analysiert die Bilder, um nützliche Details herauszuziehen. Das Sprach-Modul verwendet dann diese Details, um kohärente Berichte zu erstellen.

Es gibt verschiedene Versionen von HistoGPT, wie kleine, mittlere und grosse Modelle, die jeweils darauf zugeschnitten sind, unterschiedliche Datenmengen zu verarbeiten. Die grösseren Modelle können komplexere Bilder verarbeiten und detailliertere Berichte generieren. Bei der Erstellung dieser Modelle wurde ein Gleichgewicht gefunden, um das System nicht zu überlasten und gleichzeitig eine hohe Leistung zu gewährleisten.

Training von HistoGPT

HistoGPT wurde trainiert, um sowohl aus Bildern als auch aus Text zu lernen, damit es genaue pathologische Berichte erstellen kann. Das Training umfasste einen zweiphasigen Ansatz. Zuerst wurde das Vision-Modul trainiert, um Muster in den Gewebe-Bildern zu erkennen. Dann wurde das Sprach-Modul mit den kombinierten Daten trainiert, um Texte basierend auf den visuellen Informationen zu generieren, die es gelernt hat.

Während des Trainingsprozesses wurden Massnahmen ergriffen, um sicherzustellen, dass HistoGPT nicht einfach Phrasen auswendig lernt, sondern den Kontext und die Semantik der Informationen versteht. Zusätzliche Techniken, wie Daten-Augmentation, wurden eingesetzt, um die Trainingsdaten anzureichern und die Leistung des Modells zu verbessern.

HistoGPT in Aktion

Wenn HistoGPT im "Expertenführung"-Modus verwendet wird, können Pathologen eine vorläufige Diagnose eingeben, um der KI zu helfen, einen verfeinerten Bericht zu erstellen. Dieser Modus ermöglicht es Pathologen, interaktiv mit dem Modell zu arbeiten und die Gesamtqualität der Berichte zu verbessern.

Das Modell kann eine Vielzahl von Hautkrankheiten verarbeiten und wichtige diagnostische Details genau vorhersagen. Bewertungen haben gezeigt, dass HistoGPT Berichte generieren kann, die oft genauso gut sind, wenn nicht sogar besser als die von menschlichen Pathologen für häufige Hautzustände.

Bewertung der Leistung von HistoGPT

Die Leistung von HistoGPT wurde durch mehrere Methoden bewertet. Die von der KI generierten Berichte wurden anhand von Originalberichten unter Verwendung verschiedener Metriken verglichen, die die Genauigkeit von Schlüsselwörtern und die semantische Ähnlichkeit der Texte messen.

Pathologen überprüften eine Teilmenge von Berichten und stellten fest, wie gut die KI abschneidet. Viele fanden, dass die Berichte von HistoGPT entweder besser oder genauso gut waren wie die original menschlich verfassten Berichte in einer signifikanten Anzahl von Fällen. Die Ergebnisse zeigten, dass es zwar bei häufigen Krankheiten gut abschneidet, es jedoch Einschränkungen bei weniger häufigen Bedingungen gibt.

Anwendung in der realen Welt

HistoGPT wurde anhand realer klinischer Fälle bewertet, um zu sehen, wie gut es ausserhalb eines kontrollierten Settings funktioniert. Eine Auswahl von Fällen wurde aus einer dermatologischen Klinik entnommen, und HistoGPT generierte Berichte für diese Proben ohne vorherige Hilfe oder Anleitung.

Die generierten Berichte wurden dann von erfahrenen Pathologen bewertet, die feststellten, dass HistoGPT für viele der häufigen Erkrankungen, wie das Basalzellkarzinom, genaue Berichte erzeugte. Allerdings hatte es Schwierigkeiten mit bestimmten Bedingungen, die es in seinen Trainingsdaten nicht ausreichend kennengelernt hatte, wie beispielsweise Melanome.

Fazit: Die Zukunft von HistoGPT

HistoGPT stellt einen bedeutenden Fortschritt im Einsatz von KI im Bereich der Pathologie dar. Durch die Bereitstellung einer Möglichkeit, detaillierte Berichte aus hochauflösenden Gewebeimages zu erstellen, kann es Pathologen helfen, effizienter zu arbeiten. Das Potenzial dieser Technologie zur Verbesserung der Patientenversorgung ist enorm, besonders da die Anforderungen im Gesundheitswesen weiter steigen.

In der Zukunft können durch das Training von HistoGPT mit vielfältigeren Datensätzen weitere Verbesserungen erzielt werden. Dadurch könnte es ein breiteres Spektrum von Krankheiten und Zuständen effektiver bearbeiten. Zudem gibt es das Potenzial, dass HistoGPT sich zu einem konversationellen Tool entwickelt, das spezifische Anfragen zur Pathologie beantworten kann, was es zu einer interaktiveren Ressource für medizinisches Fachpersonal macht.

Die Forschung in diesem Bereich wird fortgesetzt, und die Entwicklung von Modellen wie HistoGPT könnte den Weg für noch grössere Innovationen in der medizinischen Diagnostik und den Behandlungsergebnissen ebnen. Während wir mehr darüber lernen, wie KI im Gesundheitswesen unterstützen kann, könnten Werkzeuge wie HistoGPT zu einem integralen Bestandteil der Arbeit von Pathologen und anderen medizinischen Fachkräften werden.

Originalquelle

Titel: Generating clinical-grade pathology reports from gigapixel whole slide images with HistoGPT

Zusammenfassung: Histopathology is considered the gold standard for determining the presence and nature of disease, particularly cancer. However, the process of analyzing tissue samples and producing a final pathology report is time-consuming, labor-intensive, and non-standardized. Therefore, new technological solutions are being sought to reduce the workload of pathologists. In this work, we present HistoGPT, a vision language model that takes digitized slides as input and generates reports that match the quality of human-written reports, as confirmed by natural language processing metrics and domain expert evaluations. We show that HistoGPT generalizes to five international cohorts and can predict tumor subtypes and tumor thickness in a zero-shot fashion. Our work represents an important step toward integrating AI into the medical workflow. We publish both model code and weights so that the scientific community can apply and improve HistoGPT to advance the field of computational pathology. HighlightsO_LIA large vision language model is trained to generate dermatopathology reports C_LIO_LIIt takes as input multiple whole slide images and outputs tissue descriptions C_LIO_LIGenerated reports match human-written reports as confirmed by pathologists C_LIO_LIIt predicts tumor subtypes and thickness zero-shot better than current methods C_LI

Autoren: Carsten Marr, M. Tran, P. Schmidle, S. J. Wagner, V. Koch, B. Novotny, V. Lupperger, A. Feuchtinger, A. Boehner, R. Kaczmarczyk, T. Biedermann, N. I. Comfere, R. Guo, C. Wang, K. Eyerich, S. A. Braun, T. Peng

Letzte Aktualisierung: 2024-06-19 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.03.15.24304211

Quell-PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.03.15.24304211.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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