Wie asexuelle Rädertierchen sich durch DNA-Reparatur anpassen
Forschung zeigt, dassbdelloide Rädertierchen DNA-Reparaturmechanismen haben, um in extremen Bedingungen zu überleben.
Karine Van Doninck, A. Houtain, A. Derzelle, M. Lliros, B. Hespeels, E. Nicolas, P. Simion, J. Virgo, T. Lenormand, B. Hallet
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Inhaltsverzeichnis
- Studienübersicht
- Erkenntnisse über A. vaga
- Durchgeführte Experimente
- Genetische Veränderungen über Generationen
- Arten von beobachteten genetischen Veränderungen
- Deletionen und Duplikationen
- Auswirkungen von Strahlung auf genetisches Material
- Vererbung von beschädigter DNA
- Einzigartige Chromosomenstruktur
- DNA-Reparaturmechanismus
- Auswirkungen der Forschungsergebnisse
- Fazit
- Originalquelle
Homologe Rekombination (HR) ist ein Weg, wie Zellen ihr DNA reparieren können, wenn sie beschädigt wird. Diese Methode ist wichtig, weil sie sicherstellt, dass die DNA genau wieder aufgebaut wird. Ausserdem hilft HR während der Fortpflanzung vieler Arten, genetische Variation zu erzeugen, indem verschiedene genetische Merkmale kombiniert werden. Diese Mischung kann einer Art dabei helfen, sich besser an ihre Umgebung anzupassen.
Studienübersicht
In dieser Studie haben Forscher untersucht, wie HR bei einem einzigartigen, asexuellen Organismus namens bdelloide Rädertier funktioniert, speziell bei einer Art namens Adineta vaga. Dieses Rädertier ist interessant, weil es extreme Bedingungen überstehen kann. Die Forscher wollten herausfinden, ob meiotische Rekombination, ein Prozess, der normalerweise zur DNA-Reparatur und zum Mischen genetischer Merkmale bei der Fortpflanzung genutzt wird, auch bei diesen asexuellen Rädertieren vorkommt.
Erkenntnisse über A. vaga
Die Forscher haben zuvor entdeckt, dass A. vaga eine spezielle Methode hat, um Eier zu produzieren. Im Gegensatz zu vielen anderen Organismen paaren sich ihre Chromosomen während einer Art Zellteilung, die die Anzahl der Chromosomen nicht verringert, was zur Erzeugung von Eiern mit der gleichen Anzahl an Chromosomen wie das Elternteil führt. Dieser Prozess könnte eine effektive DNA-Reparatur durch meiotische HR ermöglichen. Das Team bemerkte Anzeichen in natürlichen Populationen von A. vaga, die darauf hindeuteten, dass sie eine Art Rekombination durchlaufen.
Durchgeführte Experimente
Die Forscher führten verschiedene Experimente durch. Sie suchten nach Veränderungen in den Genen des Rädertieres über Generationen in zwei Umgebungen: eine, in der die Rädertierchen hydriert blieben, und eine andere, wo sie trockenen Bedingungen ausgesetzt waren. Diese Veränderungen wurden über 75 Generationen verfolgt. Sie untersuchten auch, wie das DNA des Rädertieres Schäden, die durch Strahlung verursacht wurden, mit einem anderen experimentellen Setup reparierte.
Genetische Veränderungen über Generationen
Im ersten Experiment sequenzierten die Forscher die DNA von mehreren Linien von A. vaga und fanden heraus, dass im Laufe der Zeit die genetische Vielfalt in beiden Gruppen, den hydrierten und den dehydrierten, abnahm. Sie bemerkten, dass die Rate des Verlusts an genetischer Vielfalt in den dehydrierten Proben höher war. Das deutete darauf hin, dass die extremen trockenen Bedingungen zu schnelleren genetischen Veränderungen führen könnten.
Die Forscher entdeckten Cluster von verlorenen Genen, die sie Verlust von Heterozygosität (LOH) nannten. Die meisten dieser Cluster waren klein, aber einige waren deutlich grösser, was darauf hinweist, dass in einigen Fällen grössere DNA-Abschnitte verloren gingen.
Arten von beobachteten genetischen Veränderungen
Das Team fand zwei Arten von genetischen Veränderungen: Deletionen, bei denen Teile der DNA verloren gehen, und Duplikationen, bei denen Teile der DNA in mehreren Kopien vorhanden sind. Sie stellten fest, dass diese Ereignisse nicht zufällig waren. Stattdessen traten sie tendenziell an den Enden der Chromosomen auf, und Linien mit mehr Rekombinationsevents hatten eine höhere Anzahl genetischer Veränderungen.
Deletionen und Duplikationen
Die Deletionen traten hauptsächlich an den Chromosomenenden auf, während Duplikationen zusätzliche Kopien bestimmter DNA-Teile hinzufügten. Diese Veränderungen könnten aus der Art resultiert sein, wie Chromosomen Abschnitte ihrer DNA während der Rekombination austauschten. Die Ergebnisse zeigten, dass bestimmte genetische Muster entweder auf eine Deletion oder eine Wiederherstellung der DNA hinweisen könnten.
Einige der Deletionen waren gross, während andere kleiner waren. Die Forscher überlegten, wie diese Deletionen als Ergebnis ungleicher Austausche zwischen homologen Chromosomen während der Fortpflanzung auftreten könnten. Sie schauten sich auch spezifische Fälle an, in denen DNA dupliziert oder gelöscht wurde und wie diese Veränderungen das gesamte Genom beeinflussten.
Auswirkungen von Strahlung auf genetisches Material
In einem anderen Teil der Studie wollten die Forscher sehen, wie extreme DNA-Schäden durch Strahlung A. vaga beeinflussten. Sie fanden heraus, dass die Exposition gegenüber Strahlung zu grösseren Deletionen führte im Vergleich zu den Verlusten in den vorherigen Experimenten. Die verstreute Natur dieser Deletionen deutete darauf hin, dass die DNA zufällig zerbrochen war.
Interessanterweise erkannten die Forscher, dass die Fragmentierung der DNA zu einer Verringerung der Wachstumsrate der Rädertierchen führte, insbesondere bei der höchsten Strahlendosis. Diese Abnahme der Wachstumsrate zeigt, dass die Rädertierchen Schwierigkeiten hatten, ihre normalen Funktionen aufgrund der durch Strahlung verursachten Schäden aufrechtzuerhalten.
Vererbung von beschädigter DNA
Als die Forscher die Nachkommen von A. vaga nach der Strahlenexposition untersuchten, stellten sie fest, dass einige der gebrochenen Chromosomen an die nächste Generation weitergegeben wurden. Das scheint dem widersprechen, was normalerweise über die Vererbung von Chromosomen verstanden wird, wo Fragmente, die bestimmte Strukturen fehlen, normalerweise verloren gehen. Die Beobachtung deutete darauf hin, dass A. vaga eine spezielle Anordnung in seinen Chromosomen haben könnte, die das Überleben und die Segregation von Fragmenten während der Zellteilung ermöglicht.
Einzigartige Chromosomenstruktur
Die Studie deutete darauf hin, dass A. vaga eine andere Struktur in seinen Chromosomen haben könnte im Vergleich zu typischen Eukaryoten. Chromosomen in anderen Organismen haben normalerweise eine zentralisierte Struktur, die als Zentromer bezeichnet wird und bei der ordnungsgemässen Trennung während der Zellteilung hilft. Die Forscher denken jedoch, dass A. vaga möglicherweise eine ausgedehntere Struktur hat, die als holokentrische Anordnung bezeichnet wird. Dies ermöglicht es den Chromosomenfragmenten, sich richtig zu trennen, selbst wenn ihnen bestimmte Abschnitte fehlen.
DNA-Reparaturmechanismus
Die Forscher schlugen einen neuen Prozess zur DNA-Reparatur vor, der als bruchinduzierte homologe Verlängerungsreparatur (BIHER) bezeichnet wird. Dieser Prozess scheint zu funktionieren, indem er die gebrochenen Enden von Chromosomen mithilfe der verbleibenden homologen Chromosomen als Vorlagen verlängert. Über Generationen könnte diese Reparaturmethode allmählich die Grösse der Deletionen verringern und helfen, die verlorenen DNA-Abschnitte wiederherzustellen.
Auswirkungen der Forschungsergebnisse
Die Erkenntnisse aus dieser Forschung geben Aufschluss darüber, wie A. vaga sein genetisches Material selbst unter widrigen Bedingungen erhält. Die Fähigkeit, gebrochene Chromosomen zu reparieren und genetische Veränderungen zu tolerieren, trägt wahrscheinlich zur Widerstandsfähigkeit dieses Organismus bei.
Die Kombination aus seiner einzigartigen Fortpflanzungsmethode, der flexiblen genetischen Struktur und den effizienten DNA-Reparatursystemen hilft A. vaga, in extremen Umgebungen zu gedeihen. Insgesamt könnten diese Forschungsergebnisse breitere Auswirkungen auf das Verständnis haben, wie andere Organismen mit ähnlichen Eigenschaften genetische Variationen managen und sich an herausfordernde Bedingungen anpassen.
Fazit
Zusammenfassend ist A. vaga ein einzigartiger Organismus, der seine genetischen Prozesse angepasst hat, um in rauen Umgebungen zu überleben. Durch verschiedene Experimente haben Forscher gezeigt, wie dieses Rädertier homologe Rekombination nicht nur zur DNA-Reparatur, sondern auch zur Schaffung genetischer Vielfalt nutzt. Die Ergebnisse betonen die Bedeutung, diese Prozesse zu verstehen, die Auswirkungen auf eine Vielzahl von Arten haben könnten, insbesondere auf solche, die asexuell reproduzieren. Zukünftige Studien könnten weiter untersuchen, wie diese Mechanismen die Anpassungsfähigkeit und Widerstandsfähigkeit des Organismus erhöhen.
Titel: Transgenerational chromosome repair in the asexual bdelloid rotifer Adineta vaga
Zusammenfassung: Homologous recombination is an essential DNA repair mechanism that promotes chromosome pairing and ensures allele segregation during meiosis in sexual organisms. Here, we explore the dual function of homologous recombination in the bdelloid rotifer Adineta vaga, an ancient asexual species known for its remarkable resilience to extreme genotoxic stresses. Genomic analyses reveal that A. vaga uses meiotic recombination, both to promote spontaneous crossovers and gene conversion during oogenesis and to repair the genome in response to DNA damage. Our study identifies a novel transgenerational DNA repair mechanism, termed break-induced homologous extension repair (BIHER), which operates on single DNA ends to repair fragmented chromosomes over successive generations. Our findings suggest that meiotic BIHER, coupled with the holocentric structure of chromosomes, represents a key adaptation of life in extreme environments.
Autoren: Karine Van Doninck, A. Houtain, A. Derzelle, M. Lliros, B. Hespeels, E. Nicolas, P. Simion, J. Virgo, T. Lenormand, B. Hallet
Letzte Aktualisierung: 2024-10-21 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.25.577190
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.25.577190.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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