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# Ciências da saúde# Medicina genetica e genomica

Variantes de DNA Mitocondrial: Impactos na Saúde

Estudo revela ligações entre mudanças no DNA mitocondrial e vários problemas de saúde.

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Índice

As mitocôndrias são partes minúsculas das nossas células que têm um papel super importante em nos manter vivos. Elas ajudam a transformar a comida que comemos em energia. Mas, mudanças no material genético encontrado nas mitocôndrias, conhecido como DNA mitocondrial (mtDNA), podem causar problemas e levar a várias doenças. Essas mudanças podem afetar o funcionamento das mitocôndrias, resultando em uma série de problemas de saúde. Este artigo explora como certas mudanças no mtDNA podem estar relacionadas a doenças e o que podemos aprender estudando-as em populações maiores.

Variantes do DNA Mitocondrial e Saúde

Pesquisas descobriram mais de 90 alterações prejudiciais no DNA mitocondrial que podem causar doenças raras que afetam vários órgãos. Além disso, outros estudos ligaram mudanças no mtDNA a condições mais comuns como Diabetes, doença de Parkinson e até mesmo derrame. Entender essas mudanças pode ajudar os cientistas a ver como elas podem contribuir para o desenvolvimento dessas doenças.

Limitações de Estudos Anteriores

Pesquisas anteriores sobre o DNA mitocondrial tiveram algumas limitações. Muitos estudos focaram em grupos pequenos de pessoas com doenças específicas, o que pode levar a conclusões enganosas sobre a frequência dessas mudanças e como elas impactam a saúde. Estudos maiores, envolvendo populações geneticamente diversas, poderiam fornecer informações mais precisas sobre os efeitos dessas mudanças.

Novas Oportunidades de Pesquisa

Com os recentes avanços na tecnologia de sequenciamento do genoma completo, os cientistas agora conseguem analisar o material genético completo de muitas pessoas de uma vez. Essa abordagem permite que os pesquisadores estudem tanto o DNA mitocondrial quanto o nuclear em grandes grupos, como o UK Biobank, que inclui cerca de 200.000 pessoas. Esse tipo de dado é crucial, pois oferece uma visão mais completa de como as variantes mitocondriais afetam a saúde humana.

Design do Estudo

A pesquisa usou dados do UK Biobank, que inclui informações detalhadas sobre a saúde de meio milhão de indivíduos no Reino Unido. Esse conjunto de dados contém informações coletadas a partir de auto-relatos, registros médicos e exames de sangue, combinados com informações genéticas. A inclusão de uma população diversificada, sem foco em doenças específicas, torna o estudo ideal para entender como as mudanças mitocondriais impactam a saúde.

Grupo de Pacientes com Variante Específica

O estudo focou em uma variante mitocondrial específica conhecida como m.3243A>G, que está ligada ao diabetes. Os pesquisadores analisaram 95 pacientes com essa variante que foram encaminhados para avaliação diabética. O objetivo era entender como essa variante e outras estão associadas a diversas Características de Saúde.

Características de Saúde Analisadas

A pesquisa examinou 15 problemas de saúde comuns conhecidos por estarem ligados a doenças mitocondriais. Os dados foram coletados do UK Biobank, usando várias fontes como auto-relatos, codificação médica e medições de biomarcadores no sangue.

Coleta de Dados Genéticos

Os dados de sequenciamento do genoma completo foram preparados usando um processo específico que garantiu resultados de alta qualidade. A análise teve como objetivo identificar mudanças no DNA mitocondrial a partir dos dados genéticos dos 200.030 participantes. Foi tomado um cuidado especial para evitar identificar variantes incorretamente, assegurando que as descobertas fossem o mais precisas possível.

Processo de Filtragem

Para garantir a confiabilidade dos resultados, critérios de filtragem rigorosos foram aplicados. Esse processo ajudou a excluir amostras com dados de baixa qualidade e aquelas que poderiam levar a conclusões erradas. No total, mais de 179.000 amostras foram analisadas, resultando em um foco em mudanças mitocondriais significativas.

Analisando o Impacto das Variantes

O estudo realizou uma análise detalhada das variantes mitocondriais para ver como elas estavam associadas a características de saúde específicas. O objetivo era entender quais variantes tinham ligações fortes com doenças e como essas associações poderiam mudar com base na quantidade de DNA alterado presente.

Descobertas sobre Variantes Patogênicas Conhecidas

Os resultados mostraram que, embora existam muitas variantes patogênicas conhecidas, a maioria é muito rara. A pesquisa encontrou que a variante m.3243A>G estava associada ao diabetes e a problemas auditivos, com níveis mais altos dessa variante levando a um aumento do risco dessas condições. A variante teve um impacto único, especialmente quando presente em certos níveis no sangue.

Comparação de Populações

Ao comparar pacientes com a variante m.3243A>G encaminhados por causa do diabetes com aqueles encontrados na população geral, foram observadas diferenças significativas no risco de doenças. Os probandos mostraram uma taxa muito maior de diabetes aos 50 anos em comparação com indivíduos no UK Biobank com a mesma variante. Isso sugere que aqueles selecionados para avaliação clínica podem ter um risco maior do que os que não foram.

O Papel dos Pontuações de Risco para Diabetes Tipo 2

O estudo também examinou como o risco genético geral para diabetes tipo 2 alterou a probabilidade de ter diabetes para indivíduos que carregam a variante m.3243A>G. Diferentes pontuações genéticas indicaram riscos variados, apontando para a relação complexa entre genética nuclear e mitocondrial no desenvolvimento de doenças.

Variantes Raras e Seu Impacto

A pesquisa analisou variantes raras do DNA mitocondrial para avaliar suas possíveis conexões com os 15 traços de saúde examinados. Não foram encontradas associações significativas para muitas dessas variantes raras, indicando que elas podem não contribuir muito para os traços de saúde gerais avaliados.

Associações Significativas Encontradas

As únicas associações consistentes detectadas envolveram variantes mitocondriais relacionadas aos níveis de enzimas no fígado. Várias variantes afetaram a aspartato aminotransferase (AST), uma enzima chave, enquanto não mostraram ligações com a doença hepática gordurosa não alcoólica, sugerindo que os mecanismos envolvidos podem ser diferentes do que se entendia anteriormente.

Conclusões

Esta pesquisa ilustra a importância de estudar variantes mitocondriais usando populações grandes e diversificadas. Os achados sugerem que a presença de certas variantes, particularmente a m.3243A>G, aumenta significativamente o risco de diabetes e outros problemas de saúde à medida que o nível da variante aumenta. No entanto, embora o estudo tenha encontrado algumas associações, muitas variantes patogênicas conhecidas eram raras e não mostraram ligações fortes com os traços de saúde analisados.

Implicações para Futuras Pesquisas

Os resultados deste estudo destacam a necessidade de continuar a pesquisa em genética mitocondrial. Ao entender como essas pequenas mudanças podem afetar a saúde em uma população, os cientistas podem avaliar melhor os riscos e orientar futuras práticas médicas. Isso pode levar a métodos mais eficazes para identificar indivíduos em risco de doenças mitocondriais e melhorar as abordagens gerais de saúde.

Limitações e Considerações

O estudo reconhece algumas limitações, incluindo o viés de seleção no UK Biobank e a possível exclusão de variantes relevantes devido a critérios de filtragem rigorosos. Estudos futuros devem incluir populações mais diversas para obter uma imagem mais clara de como as variantes mitocondriais contribuem para os riscos à saúde.

Potencial para Descobertas Incidentais

À medida que o sequenciamento do genoma completo se torna mais comum em testes genéticos, há um potencial para descobertas incidentais relacionadas a variantes mitocondriais. As evidências deste estudo sugerem que identificar tais variantes pode trazer benefícios significativos à saúde, especialmente para mulheres em idade reprodutiva, permitindo estratégias de intervenção precoce.

Em resumo, a exploração de variantes do DNA mitocondrial apresenta uma avenue empolgante para entender questões de saúde complexas e pode remodelar como vemos e gerenciamos doenças ligadas à função mitocondrial. Com os avanços na tecnologia, pesquisas contínuas provavelmente fornecerão mais insights que podem levar a melhores resultados de saúde para muitos.

Fonte original

Título: Large-scale blood mitochondrial genome-wide study provides novel insights into mitochondrial disease-related traits

Resumo: Background/ObjectivesWhole genome sequencing (WGS) from large cohorts enables the study of mitochondrial DNA (mtDNA) variation on human health. We aimed to investigate the influence of common, rare, and pathogenic mtDNA variants on 15 mitochondrial disease-related phenotypes. MethodsUsing WGS from 179,862 individuals from in the UK Biobank, we identified mtDNA variants using MitoHPC. We performed extensive association analyses with 15 mitochondrial disease-relevant phenotypes. We compared the results for the m.3243A>G variant with those from a clinically referred patient cohort. ResultsOf 15,881 mtDNA variants, 12 homoplasmic and one heteroplasmic variant had genome-wide significant associations. All homoplasmic variants increased aspartate aminotransferase level and three were novel, low frequency, variants (MAF[~]0.002 and beta[~]0.3 SD). Only m.3243A>G (MAF=0.0002) associated with diabetes (OR=5.6, 95%CI [3.2-9.9]), deafness (OR=12.3, 95%CI [6.2-24.4]) and heart failure (OR=39.5, 95%CI [9.76-160.1]). Multi-system disease risk and penetrance of all three traits increased with m.3243A>G level. Diabetes risk was further influenced by common nuclear genome variation. The penetrance of diabetes with m.3243A>G in the UK Biobank was lower than clinically referred patients, partly attributed to lower heteroplasmy. Of 73 pathogenic mitochondrial disease variants, most were rare in the population with low penetrance. ConclusionOur study highlights the utility of WGS for investigating mitochondrial genetics within a large, unselected population. We identified novel associations and demonstrated that pathogenic mitochondrial variants have lower penetrance in clinically unselected than clinically referred settings. m.3243A>G associated with mitochondrial-related phenotypes at higher heteroplasmy. Our findings suggest potential benefits of reporting incidentally identified m.3243A>G at high heteroplasmy levels.

Autores: Kashyap A Patel, S. Cannon, T. Hall, G. Hawkes, K. Colclough, R. M. Boggan, C. F. Wright, S. J. Pickett, A. T. Hattersley, M. N. Weedon

Última atualização: 2023-06-13 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.12.23291273

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.12.23291273.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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