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Aproveitando Grafos de Conhecimento para Previsões de Saúde Melhores

Combinar dados de EHR com grafos de conhecimento personalizados melhora as previsões de resultados na saúde.

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O sistema de saúde depende muito dos dados dos prontuários eletrônicos de saúde (EHRs), que incluem detalhes importantes sobre os pacientes e seus históricos médicos. Mas usar esses dados sozinhos para prever resultados de saúde pode ser complicado. Para fazer previsões melhores, os pesquisadores estão buscando formas de combinar os dados dos EHRs com fontes externas de conhecimento médico. Uma abordagem inovadora envolve a criação de gráficos de conhecimento Personalizados (KGs) que representam os conceitos médicos relevantes para cada paciente.

O Desafio das Previsões

Modelos preditivos clínicos são ferramentas que ajudam a prever vários resultados de saúde, como chances de mortalidade, readmissão no hospital e a duração das internações. Esses modelos costumam trabalhar com conjuntos de dados gigantescos de EHR, mas enfrentam desafios ao tentar incorporar conhecimento de diferentes domínios médicos. É aí que os gráficos de conhecimento personalizados entram em cena.

O Que São Gráficos de Conhecimento?

Gráficos de conhecimento são coleções estruturadas de informações que mostram como diferentes conceitos médicos estão relacionados. Eles ajudam a representar relações complexas entre várias entidades médicas, como doenças, procedimentos e medicamentos. No entanto, criar gráficos de conhecimento personalizados a partir dos dados dos EHRs tem se mostrado uma tarefa complicada.

Combinando Conhecimento Externo com Dados de EHR

Para melhorar as previsões, os pesquisadores propõem uma estrutura que utiliza conhecimento de grandes modelos de linguagem (LLMs) e gráficos de conhecimento biomédico estabelecidos. Esse método extrai conhecimento médico relevante e gera gráficos de conhecimento específicos para cada paciente. Esses gráficos personalizados podem ser usados com modelos avançados para fazer previsões precisas na saúde.

Como a Estrutura Funciona

A estrutura proposta opera em três etapas principais:

  1. Gerando Gráficos de Conhecimento Específicos para Conceitos: Para cada código médico no conjunto de dados, o conhecimento é extraído de LLMs ou amostrado de gráficos de conhecimento biomédico existentes. Isso forma um gráfico de conhecimento específico para o conceito que captura relações importantes sobre os códigos médicos.

  2. Criando Gráficos de Conhecimento Personalizados: Para cada paciente, os gráficos de conhecimento específicos para o conceito são combinados com base em seus códigos médicos individuais. Isso resulta em um gráfico de conhecimento personalizado que reflete a história médica e as características únicas do paciente.

  3. Utilizando uma Rede Neural de Gráficos para Previsões: Os gráficos de conhecimento personalizados são alimentados em um modelo especializado conhecido como Rede Neural de Gráficos Aumentada por Bi-atenção (GNN). Esse modelo é projetado para capturar informações importantes sobre as jornadas de saúde dos pacientes e fazer previsões precisas.

Testando a Estrutura

Para avaliar a eficácia dessa abordagem, os pesquisadores realizaram experimentos usando dois conjuntos de dados de EHR amplamente utilizados: MIMIC-III e MIMIC-IV. Os resultados mostraram que a estrutura proposta superou significativamente vários modelos de referência em diversas tarefas de Previsão na saúde, incluindo mortalidade, readmissão, duração da estadia e recomendação de medicamentos.

O Papel do Conhecimento Externo

Usar conhecimento de fontes externas, como grandes modelos de linguagem, permite uma compreensão mais ampla dos conceitos médicos. Ao enriquecer os dados dos EHR com esse conhecimento externo, a estrutura demonstrou uma performance preditiva melhorada, mesmo quando a quantidade de dados de treinamento era limitada.

Aplicações Práticas

Essa estrutura tem potencial para várias aplicações no campo médico. Ela pode melhorar a medicina personalizada ao ajudar os clínicos a tomarem decisões mais informadas com base nos dados individualizados dos pacientes. Ao aproveitar o poder do aprendizado de máquina e da inteligência artificial, os provedores de saúde podem melhorar o atendimento ao paciente e a alocação de recursos.

Importância da Interpretabilidade

Entender como as previsões são feitas é essencial tanto para os clínicos quanto para os pacientes. A estrutura fornece insights valiosos ao visualizar os gráficos de conhecimento personalizados, destacando relações e entidades-chave que contribuem para as previsões. Isso melhora a interpretabilidade do modelo e permite que os provedores de saúde expliquem suas decisões aos pacientes.

Abordando Preocupações Éticas

Embora essa estrutura ofereça soluções inovadoras, também é essencial considerar as implicações éticas. Grandes modelos de linguagem podem, às vezes, herdar preconceitos presentes nos dados em que foram treinados. Para mitigar esses riscos, a estrutura garante que apenas conhecimento médico seja recuperado, minimizando as chances de introduzir preconceitos relacionados à raça, gênero ou outros fatores.

Direções Futuras

À medida que a tecnologia continua a evoluir, há um potencial significativo para refinar e expandir essa estrutura. Pesquisas futuras poderiam se concentrar em melhorar os algoritmos para gerar gráficos de conhecimento personalizados ou integrar fontes de conhecimento médico ainda mais compreensivas. Também há a oportunidade de explorar como essa estrutura pode se adaptar a novos desafios na saúde conforme eles surgem.

Conclusão

O desenvolvimento de gráficos de conhecimento personalizados combinados com modelos avançados de aprendizado de máquina apresenta um método poderoso para melhorar previsões na saúde. Ao aproveitar o conhecimento de fontes externas e adaptar previsões para pacientes individuais, os provedores de saúde podem melhorar a qualidade do atendimento e tomar decisões mais informadas. Essa abordagem inovadora para modelagem preditiva tem grande potencial para o futuro da medicina personalizada.

Fonte original

Título: GraphCare: Enhancing Healthcare Predictions with Personalized Knowledge Graphs

Resumo: Clinical predictive models often rely on patients' electronic health records (EHR), but integrating medical knowledge to enhance predictions and decision-making is challenging. This is because personalized predictions require personalized knowledge graphs (KGs), which are difficult to generate from patient EHR data. To address this, we propose \textsc{GraphCare}, an open-world framework that uses external KGs to improve EHR-based predictions. Our method extracts knowledge from large language models (LLMs) and external biomedical KGs to build patient-specific KGs, which are then used to train our proposed Bi-attention AugmenTed (BAT) graph neural network (GNN) for healthcare predictions. On two public datasets, MIMIC-III and MIMIC-IV, \textsc{GraphCare} surpasses baselines in four vital healthcare prediction tasks: mortality, readmission, length of stay (LOS), and drug recommendation. On MIMIC-III, it boosts AUROC by 17.6\% and 6.6\% for mortality and readmission, and F1-score by 7.9\% and 10.8\% for LOS and drug recommendation, respectively. Notably, \textsc{GraphCare} demonstrates a substantial edge in scenarios with limited data availability. Our findings highlight the potential of using external KGs in healthcare prediction tasks and demonstrate the promise of \textsc{GraphCare} in generating personalized KGs for promoting personalized medicine.

Autores: Pengcheng Jiang, Cao Xiao, Adam Cross, Jimeng Sun

Última atualização: 2024-01-17 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2305.12788

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2305.12788

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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