Novas Perspectivas sobre a Genética do Câncer de Mama
Pesquisas recentes mostram como fatores genéticos e o splicing estão relacionados ao câncer de mama.
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Índice
- Fatores Genéticos no Câncer de Mama
- Estudos de Associação do Genoma Inteiro (GWAS)
- O Papel da Expressão Gênica
- Splicing e Seu Impacto
- Combinando Informações de Tecidos
- Design do Estudo
- Descobertas do Estudo
- Importância de Genes Únicos
- Comparação com Pesquisas Anteriores
- Investigando os Papéis Funcionais dos Genes
- Explorando Funções Gênicas
- O Caminho à Frente
- Limitações na Pesquisa Atual
- Conclusão
- Fonte original
O Câncer de mama é uma doença que pode ser influenciada por genética, fatores ambientais e escolhas de estilo de vida. É importante entender como esses fatores se juntam para aumentar o risco de desenvolver essa doença. Estudos recentes mostraram que existem muitos Genes específicos que podem ter um papel no câncer de mama.
Genéticos no Câncer de Mama
FatoresPesquisas indicam que o câncer de mama pode estar ligado a certos traços genéticos. Alguns desses traços vêm de genes que têm um efeito forte, enquanto outros vêm de variantes mais comuns encontradas na população. Essas influências genéticas estão associadas apenas a uma pequena parte do risco total de câncer de mama. Embora muitos genes tenham sido estudados, identificar quais desses genes realmente causam câncer de mama ainda é um esforço contínuo.
Estudos de Associação do Genoma Inteiro (GWAS)
Estudos de associação do genoma inteiro (GWAS) foram usados para encontrar mais de 200 locais no nosso DNA que estão relacionados ao aumento do risco de câncer de mama. Esses estudos tornaram possível identificar certas áreas no nosso código genético, mas também mostraram que as variantes comuns encontradas por esses estudos explicam apenas uma pequena parte do risco.
O Papel da Expressão Gênica
Além de identificar locais no genoma, os pesquisadores também estão investigando como os genes são expressos. Isso significa olhar como os genes são ativados ou desativados e como isso afeta o câncer de mama. Novos métodos estão sendo desenvolvidos para examinar a expressão gênica em diferentes Tecidos. Isso pode revelar quais genes podem estar mais ativos no câncer de mama em comparação com tecidos saudáveis.
Splicing e Seu Impacto
Uma área importante de pesquisa é o splicing alternativo. O splicing é um processo que ajuda a determinar como os genes são expressos. Isso pode afetar a forma como as proteínas são produzidas no corpo. Estudos recentes descobriram que diferentes maneiras de splicing do RNA, que é uma molécula que ajuda a transmitir informações dos genes, podem influenciar significativamente o risco de câncer de mama. Os pesquisadores estão agora investigando como diferentes eventos de splicing se relacionam com essa doença.
Combinando Informações de Tecidos
Para melhorar a compreensão do risco de câncer de mama, os pesquisadores estão combinando informações de diferentes tecidos. Ao examinar como os genes se comportam em vários tecidos, eles podem ter uma imagem mais clara de como esses fatores contribuem para o câncer de mama. Por exemplo, analisar eventos de splicing não apenas no tecido mamário, mas também em outros tecidos relevantes pode ajudar a descobrir novas informações genéticas.
Design do Estudo
Em um estudo recente, os pesquisadores realizaram uma análise combinada para observar o splicing em múltiplos tecidos. Eles criaram modelos de previsão para como o splicing acontece em 11 tecidos que podem ser importantes para o câncer de mama. Ao fazer isso, conseguiram comparar os resultados da nova análise com estudos anteriores focados apenas no tecido mamário.
Descobertas do Estudo
Dessa análise em múltiplos tecidos, os pesquisadores identificaram um número significativo de genes relacionados ao câncer de mama. Alguns desses genes não haviam sido descobertos em estudos anteriores. Entre os muitos genes identificados, um subconjunto foi encontrado longe de variantes genéticas conhecidas associadas ao risco de câncer de mama. Isso indica que podem haver fatores genéticos adicionais em jogo que ainda não foram totalmente explorados.
Importância de Genes Únicos
O estudo destacou vários genes que não haviam sido relatados em pesquisas passadas. Essas descobertas sugerem que focar no splicing pode revelar novas contribuições genéticas ao câncer de mama. Também enfatiza a importância de investigar como os genes interagem e afetam uns aos outros em diferentes tecidos.
Comparação com Pesquisas Anteriores
Quando comparado a estudos de expressão anteriores, a nova análise de splicing descobriu vários genes únicos. Embora alguns genes tenham sido encontrados em ambos os métodos de análise, um número substancial foi único para o estudo de splicing. Isso indica que diferentes métodos e abordagens podem gerar diferentes insights sobre a genética do câncer de mama.
Investigando os Papéis Funcionais dos Genes
Como parte do estudo, certos genes foram examinados para entender melhor seus papéis na biologia do câncer. Esses genes incluem aqueles conhecidos por estarem envolvidos na progressão do câncer. Por exemplo, um gene foi encontrado com expressão reduzida em células de câncer de mama resistentes ao tamoxifeno, indicando que pode ter um papel nas respostas ao tratamento.
Explorando Funções Gênicas
Outro grupo de genes foi associado a eventos de fusão específicos, o que significa que segmentos de DNA de diferentes genes se combinaram em células cancerosas. Essa fusão pode criar proteínas que podem contribuir para o desenvolvimento do câncer. Ao investigar esses genes mais a fundo, os pesquisadores esperam entender suas potenciais funções no câncer de mama melhor.
O Caminho à Frente
As descobertas do estudo sugerem que há muito mais a aprender sobre o câncer de mama e sua base genética. À medida que a pesquisa avança, os cientistas pretendem confirmar os papéis dos novos genes identificados e seus eventos de splicing no câncer de mama. Esse conhecimento pode abrir caminho para novos tratamentos e medidas preventivas no futuro.
Limitações na Pesquisa Atual
Embora o estudo ofereça insights valiosos, também tem limitações. Análises de múltiplos tecidos podem identificar muitos genes, mas também podem introduzir falsos positivos. Os pesquisadores precisam ser cautelosos e confirmar suas descobertas por meio de experimentos adicionais. Além disso, focar em uma população específica limita a aplicabilidade das descobertas a outros grupos. Estudos futuros devem incluir um conjunto mais diversificado de populações para uma compreensão mais abrangente.
Conclusão
Entender o câncer de mama é complexo, com muitos fatores em jogo. Os aspectos genéticos, especialmente o papel do splicing gênico, são cruciais para obter insights sobre essa doença. A pesquisa contínua ajudará a revelar mais sobre como esses genes interagem e influenciam o risco de câncer de mama, levando a melhores estratégias de prevenção e tratamentos para aqueles afetados pela doença. À medida que os cientistas continuam a explorar essas relações em uma variedade de tecidos, eles trabalharão para uma compreensão mais profunda dessa doença desafiadora.
Título: A splicing-based multi-tissue joint transcriptome-wide association study identifies susceptibility genes for breast cancer
Resumo: Splicing-based transcriptome-wide association studies (splicing-TWASs) of breast cancer have the potential to identify new susceptibility genes. However, existing splicing-TWASs test association of individual excised introns in breast tissue only and have thus limited power to detect susceptibility genes. In this study, we performed a multi-tissue joint splicing-TWAS that integrated splicing-TWAS signals of multiple excised introns in each gene across 11 tissues that are potentially relevant to breast cancer risk. We utilized summary statistics from a meta-analysis that combined genome-wide association study (GWAS) results of 424,650 European ancestry women. Splicing level prediction models were trained in GTEx (v8) data. We identified 240 genes by the multi-tissue joint splicing-TWAS at the Bonferroni corrected significance level; in the tissue-specific splicing-TWAS that combined TWAS signals of excised introns in genes in breast tissue only, we identified 9 additional significant genes. Of these 249 genes, 88 genes in 62 loci have not been reported by previous TWASs and 17 genes in 7 loci are at least 1 Mb away from published GWAS index variants. By comparing the results of our spicing-TWASs with previous gene expression-based TWASs that used the same summary statistics and expression prediction models trained in the same reference panel, we found that 110 genes in 70 loci identified by our splicing-TWASs were not reported in the expression-based TWASs. Our results showed that for many genes, expression quantitative trait loci (eQTL) did not show significant impact on breast cancer risk, while splicing quantitative trait loci (sQTL) showed strong impact through intron excision events.
Autores: Guimin Gao, J. McClellan, A. N. Barbeira, P. N. Fiorica, J. L. Li, Z. Mu, O. I. Olopade, D. Huo, H. K. Im
Última atualização: 2023-10-15 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.15.23297045
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.15.23297045.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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