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# Ciências da saúde# Patologia

Novo Modelo Melhora Avaliação TIL em Câncer de Mama

MuTILs melhora a análise de linfócitos infiltrantes de tumores em tecidos de câncer de mama.

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Melhorias recentes em scanners de lâminas e tecnologia de computador despertaram interesse em usar a histologia para pesquisa sobre câncer. A histologia é o estudo de tecidos e fornece informações importantes sobre o câncer, ajudando os médicos a entenderem o que tá rolando no corpo. Este artigo vai falar sobre como os cientistas estão usando novos métodos para encontrar marcadores úteis em tecidos de câncer de mama que podem ajudar a prever os resultados para os pacientes.

O que é Histopatologia?

Histopatologia é uma área médica onde especialistas, chamados patólogos, analisam amostras de tecido sob um microscópio. Eles examinam essas amostras, geralmente tiradas de biópsias tumorais, para tomar decisões sobre diagnóstico e tratamento do câncer. Essa área foca em padrões visuais, meio que como os radiologistas analisam imagens do corpo.

O que são Biomarcadores?

Um biomarcador é uma característica biológica que indica o estado de uma doença. No câncer, os biomarcadores podem mostrar se um paciente provavelmente vai se sair bem ou mal com o tratamento. Alguns biomarcadores preveem a eficácia de um tratamento com base em testes anteriores. Por exemplo, linfócitos infiltrantes de tumor (TILs) são células imunes que invadem tumores e podem dar pistas sobre como o sistema imunológico do corpo tá reagindo ao câncer.

Câncer de Mama e Suas Variantes

A maioria dos cânceres de mama é um tipo chamado carcinoma, que tem diferentes formas dependendo de como os tecidos aparecem sob o microscópio. Os tipos mais comuns incluem carcinoma ductal infiltrante, que começa nos ductos da mama, e carcinoma lobular infiltrante, que começa nos lobos. Estudos recentes categorizaram o câncer de mama em vários subtipos com base em análises genéticas, e esses subtipos estão ligados a diferentes taxas de sobrevivência dos pacientes. Os TILs são especialmente relevantes para prever resultados em subtipos específicos de câncer de mama.

Avaliando os TILs

Para entender melhor os TILs, os pesquisadores desenvolveram um conjunto de dados chamado PanopTILs para facilitar a contagem dessas células imunes. Esse conjunto mescla informações de outros conjuntos de dados de segmentação de tecidos e células, permitindo uma melhor avaliação dos TILs em tecidos de câncer de mama. Os patólogos avaliam visualmente os TILs inspecionando lâminas coradas de amostras tumorais. No entanto, pode haver diferenças significativas em como diferentes patólogos pontuam os TILs, o que traz desafios para a pesquisa e uso clínico consistentes.

A Necessidade de Computação na Avaliação dos TILs

Por causa da variabilidade na pontuação dos TILs entre especialistas, há uma pressão para desenvolver ferramentas computacionais que possam ajudar a avaliar os TILs de forma mais confiável. Vários algoritmos foram criados para pontuar os TILs, mas muitos não se alinham com as recomendações clínicas. Isso destaca a necessidade de um novo modelo que possa avaliar os TILs de maneira precisa e fácil de entender.

Apresentando o MuTILs

MuTILs é um novo modelo computacional projetado para analisar lâminas de tecido de câncer de mama. Ele pode identificar diferentes áreas do tecido e tipos de células dentro das lâminas. Esse modelo ajuda a avaliar a presença de TILs de forma mais eficaz, usando dois sistemas paralelos que trabalham juntos. Ao segmentar tecidos e células, o MuTILs pode fornecer uma imagem mais clara de quantos TILs estão presentes em uma amostra.

Como o MuTILs Funciona

O MuTILs opera usando um sistema que combina informações de diferentes partes da imagem do tecido. Ele usa dois modelos que olham para diferentes níveis de detalhe. O primeiro modelo examina áreas de tecido maiores, enquanto o segundo se concentra em partes menores das células. Os dois modelos se comunicam entre si para melhorar a precisão. Esse método ajuda o modelo a fazer melhores previsões sobre quantos TILs há na amostra.

Construindo o Conjunto de Dados

O conjunto de dados PanopTILs foi formado ao combinar informações de vários conjuntos de dados existentes. Os pesquisadores coletaram imagens de pacientes com câncer de mama para criar um conjunto de treinamento robusto para o modelo MuTILs. Esse conjunto incluiu exemplos de vários tipos de tumores de mama, permitindo que o modelo aprendesse a reconhecer TILs e outras características importantes do tecido de forma eficaz.

Validação do Modelo

Para garantir que o MuTILs funcione bem, ele foi testado em dados de muitos pacientes com câncer de mama. As pontuações visuais dos patólogos foram usadas como referência para comparar o quão bem o MuTILs poderia avaliar os TILs nas lâminas. O fluxo de trabalho envolveu várias etapas, desde identificar áreas do tecido até excluir materiais não orgânicos, tornando tudo sistemático e eficiente.

Correlação com Pontuações Visuais

Os resultados mostraram que as pontuações computacionais produzidas pelo MuTILs estavam intimamente relacionadas às pontuações visuais dos patólogos. Isso significa que o modelo pode fornecer avaliações confiáveis que se alinham bem com as avaliações de especialistas. As pontuações foram categorizadas de diferentes maneiras, incluindo quantos TILs estavam presentes em comparação com outras células no tecido.

Valor Prognóstico do MuTILs

Os pesquisadores investigaram se o MuTILs poderia ajudar a prever os resultados do câncer. Em um grupo de pacientes com carcinoma ductal infiltrante e tumores Her2+, as pontuações do MuTILs mostraram ter um valor prognóstico significativo. Isso significa que elas poderiam ajudar a identificar quais pacientes poderiam ter melhores ou piores resultados.

A Importância da Explicabilidade

Um grande desafio na tecnologia médica moderna é garantir que modelos computacionais sejam fáceis de entender para médicos e pacientes. Há uma necessidade forte de transparência, especialmente quando esses modelos são usados em ambientes clínicos. O MuTILs foi projetado para ser explicável, dividindo suas previsões em partes compreensíveis. Ele identifica regiões-chave do tecido e tipos celulares que contribuem para a pontuação geral de TIL, permitindo que os patólogos vejam por que certas previsões foram feitas.

Enfrentando Desafios

Mesmo com seu bom desempenho, o MuTILs enfrenta desafios. O modelo tem dificuldade em diferenciar entre tecido mamário normal e canceroso em resoluções baixas, o que pode impactar sua precisão em certos casos. Mais dados de treinamento e melhorias futuras podem ajudar a resolver essas questões.

Conclusão

O MuTILs representa um avanço significativo na avaliação dos TILs em câncer de mama. Ao combinar técnicas visuais e computacionais, oferece uma maneira confiável de analisar tecidos cancerígenos, o que pode, em última análise, apoiar melhores decisões de tratamento para os pacientes. A capacidade do modelo de fornecer resultados claros e compreensíveis promete seu uso na prática clínica e na pesquisa, abrindo caminho para mais desenvolvimentos em diagnósticos e planejamento de tratamento do câncer.

Fonte original

Título: A panoptic segmentation approach for tumor-infiltrating lymphocyte assessment: development of the MuTILs model and PanopTILs dataset

Resumo: Tumor-Infiltrating Lymphocytes (TILs) have strong prognostic and predictive value in breast cancer, but their visual assessment is subjective. To improve reproducibility, the International Immuno-oncology Working Group recently released recommendations for the computational assessment of TILs that build on visual scoring guidelines. However, existing resources do not adequately address these recommendations due to the lack of annotation datasets that enable joint, panoptic segmentation of tissue regions and cells. Moreover, existing deep-learning methods focus entirely on either tissue segmentation or cell nuclei detection, which complicates the process of TILs assessment by necessitating the use of multiple models and reconciling inconsistent predictions. We introduce PanopTILs, a region and cell-level annotation dataset containing 814,886 nuclei from 151 patients, openly accessible at: sites.google.com/view/panoptils. Using PanopTILs we developed MuTILs, a neural network optimized for assessing TILs in accordance with clinical recommendations. MuTILs is a concept bottleneck model designed to be interpretable and to encourage sensible predictions at multiple resolutions. Using a rigorous internal-external cross-validation procedure, MuTILs achieves an AUROC of 0.93 for lymphocyte detection and a DICE coefficient of 0.81 for tumor-associated stroma segmentation. Our computational score closely matched visual scores from 2 pathologists (Spearman R=0.58-0.61, p

Autores: Lee A.D. Cooper, S. Liu, M. Amgad, M. A. Rathore, R. Salgado

Última atualização: 2023-11-20 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.01.08.22268814

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.01.08.22268814.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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