Rastreando as Mudanças na População Humana Através da Genética
Estudar dados genéticos mostra coisas sobre o tamanho da população humana e a evolução.
Richard Durbin, T. Cousins, R. Schweiger
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Índice
Estudar como o tamanho da população humana mudou ao longo do tempo ajuda a responder perguntas importantes sobre o nosso passado. Olhando para o nosso DNA hoje, conseguimos encontrar pistas sobre quantas pessoas viveram em diferentes períodos da história. Cientistas usam técnicas especiais para analisar padrões nas nossas informações genéticas, que oferecem insights de como nossa população evoluiu.
Um método comum usado para estudar o tamanho da população é chamado de coalescente sequencial de Markov por pares (PSMC). Esse método permite que os pesquisadores vejam mudanças no tamanho da população ao longo de milhares de anos. Ajudou os cientistas a aprender sobre eventos significativos na evolução humana, incluindo um aumento rápido na população nos últimos 20.000 anos e os desafios que surgiram quando os humanos se espalharam da África há cerca de 50.000 a 60.000 anos. Com essa pesquisa, também conseguimos estimar quando diferentes grupos humanos, como os neandertais e os denisovanos, se separaram uns dos outros.
A maioria dos estudos sobre o tamanho da população humana focou nos últimos 1 a 2 milhões de anos. Isso acontece em parte porque o tempo médio para duas pessoas traçarem sua ancestralidade até um ancestral comum nos humanos é de cerca de 1 milhão de anos. Porém, existem perguntas interessantes sobre nossos ancestrais mais antigos que podem voltar de 3 a 6 milhões de anos.
Alguns métodos de pesquisa nos permitem olhar mais para trás no tempo comparando o DNA dos humanos com nossos parentes mais próximos, como os chimpanzés e os gorilas. Os pesquisadores usam essas comparações para analisar como essas espécies se divergiram umas das outras. Ao acompanhar essas mudanças genéticas, os cientistas tentam determinar quando diferentes espécies se separaram e como os tamanhos de suas populações mudaram ao longo do tempo.
Em um estudo, os cientistas analisaram mudanças no tamanho da população usando um grande banco de dados de Genomas humanos. Eles encontraram evidências de picos antigos na população, especialmente em torno de 5 a 7 milhões de anos atrás. Essa descoberta foi intrigante porque coincide com a época em que humanos e chimpanzés estavam se tornando espécies distintas. Os pesquisadores foram cuidadosos ao analisar os dados corretamente e evitar suposições que poderiam levar a conclusões erradas.
O estudo da história do tamanho da população também procurou padrões semelhantes em chimpanzés e outros grandes primatas. As descobertas sugeriram que chimpanzés e bonobos passaram por um pico de tamanho populacional na mesma época que os humanos, o que pode indicar uma história compartilhada. Em contraste, gorilas e orangotangos não mostraram esse pico antigo, o que faz sentido porque eles se separaram dos ancestrais humanos e chimpanzés mais cedo.
Outro aspecto da pesquisa envolveu examinar quanto do genoma ainda não se fundiu. Em termos mais simples, isso significa olhar quanto de informação genética permanece não resolvida, o que pode fornecer pistas sobre os cronogramas que estamos estudando. Os pesquisadores estimaram que uma pequena porcentagem do genoma ainda contém informações antigas que datam de 5 milhões de anos, o que é essencial para analisar as mudanças no tamanho da população.
No entanto, os cientistas também devem considerar como certas suposições sobre seus métodos podem nem sempre ser precisas. Por exemplo, a suposição de que não há variações nas taxas de mutação em diferentes partes do genoma pode não ser verdadeira. Se essas suposições estiverem erradas, isso pode afetar as estimativas que os cientistas fazem sobre o tamanho da população.
Para resolver essas questões potenciais, os pesquisadores conduziram simulações para ver como vários fatores poderiam influenciar seus resultados. As conclusões deles sugeriram que muitos dos fatores que consideraram eram improváveis de criar um pico falso em tamanhos populacionais antigos.
Usando métodos baseados em coalescência, os cientistas conseguiram explorar a história humana antiga muito mais para trás no tempo do que se pensava anteriormente. As descobertas deles sugerem que houve uma expansão e declínio populacional significativos entre os primeiros humanos e seus ancestrais, especialmente durante as eras Mioceno e Plioceno.
Essas tendências populacionais antigas podem refletir mudanças ambientais que afetaram diferentes espécies de maneiras semelhantes. No entanto, também há outras explicações a considerar. O movimento de populações locais pode impactar o fluxo gênico e, assim, influenciar as estimativas de tamanhos populacionais. Em populações que não estão se misturando livremente, é possível ver estimativas inflacionadas do tamanho da população.
Um cenário proposto é que, depois que humanos e chimpanzés se divergiram inicialmente, pode ter havido períodos em que as duas populações trocaram genes. Vários estudos debateram se a separação entre essas duas espécies foi limpa ou se houve fluxo gênico após a separação inicial. Diferentes análises chegaram a conclusões diferentes, mas a ideia de fluxo gênico contínuo ganhou algum suporte.
Se os picos de tamanho populacional que observamos em chimpanzés e bonobos são de fato confiáveis, eles poderiam se alinhar com os picos vistos em humanos, sugerindo uma experiência compartilhada entre essas espécies. Essa história compartilhada pode explicar por que os cientistas às vezes têm dificuldades para classificar certos fósseis.
No geral, os pesquisadores enfatizaram a importância de entender os modelos biológicos que usam. Métodos mais precisos poderiam ajudar os cientistas a esclarecer como essas populações antigas eram estruturadas, levando a melhores insights sobre sua evolução. Estudos futuros podem refinar esses modelos considerando diferenças nas taxas de mutação, hotspots de recombinação e outros fatores que poderiam afetar os dados.
Conclusão
O estudo do tamanho da população humana ao longo do tempo é um campo complexo, mas recompensador. Ao examinar dados genéticos e usar métodos avançados, os pesquisadores podem revelar tendências significativas em nossa história evolutiva. As descobertas de estudos recentes sugerem que picos antigos no tamanho da população podem revelar muito sobre como os primeiros humanos viveram, interagiram e evoluíram ao lado de seus parentes mais próximos.
Essa pesquisa não só enriquece nossa compreensão da evolução humana, mas também abre portas para novas perguntas sobre como as espécies se adaptam a ambientes em mudança e as intricadas relações que moldaram nossa ancestralidade. À medida que os métodos melhoram e os dados se tornam mais abrangentes, a história da evolução humana, sem dúvida, ficará mais clara, nos proporcionando uma apreciação mais profunda do nosso lugar no mundo natural.
Título: Deep coalescent history of the hominin lineage
Resumo: 1Coalescent-based methods are widely used to infer population size histories, but existing analyses have limited resolution for deep time scales (> 2 million years ago). Here we extend the scope of such inference by re-analysing an ancient peak seen in human and chimpanzee effective population size around 5-7 million years ago, showing that coalescent-based inference can be extended much further into the past than previously thought. This peak is consistently observed across human and chimpanzee populations, but not in gorillas or orangutans. We show that it is unlikely to be an artefact of model violations, and discuss its potential implications for understanding hominin evolutionary history, in particular the human-chimpanzee speciation.
Autores: Richard Durbin, T. Cousins, R. Schweiger
Última atualização: 2024-10-19 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.17.618932
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.17.618932.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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