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# Biologia# Comportamento e Cognição Animal

Avanços no Monitoramento dos Ritmos Circadianos com MIROSLAV

MIROSLAV oferece uma abordagem inovadora para estudar a atividade animal e os ritmos circadianos.

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Os Ritmos Circadianos são processos naturais que seguem um ciclo de cerca de 24 horas. Eles podem ser encontrados em várias criaturas vivas, desde bactérias até humanos. Esses ritmos biológicos ajudam a regular funções importantes como padrões de sono e atividade. Quando esses ritmos são interrompidos, podem surgir vários problemas de saúde, incluindo doenças como Alzheimer. Por isso, os pesquisadores estão interessados em estudar os ritmos circadianos, especialmente em modelos de animais que podem imitar doenças.

Medindo a Atividade Animal

Para estudar os ritmos circadianos, os cientistas geralmente analisam o quão ativos os animais são. Tradicionalmente, os pesquisadores usavam testes comportamentais padrão para observar essa atividade. Mas medir a atividade em roedores de laboratório precisa de uma abordagem diferente. Dispositivos especiais chamados sistemas de monitoramento de gaiola (HCM) são usados para esse fim. Esses dispositivos rastreiam o movimento dos animais em suas gaiolas sem perturbá-los, permitindo que os cientistas coletem mais dados ao longo do tempo.

Recentemente, o interesse pelos sistemas HCM cresceu, e muitos novos dispositivos foram criados. Muitos deles são de Código aberto, ou seja, qualquer um pode usar e modificar os designs. Isso contrasta com os dispositivos comerciais, que costumam ser sistemas fechados e dificultam a adaptação para as necessidades específicas dos pesquisadores.

Desafios com os Sistemas HCM Atuais

Dispositivos HCM comerciais costumam ter várias limitações. Um problema grande é que são proprietários, ou seja, pertencem a uma empresa que controla como funcionam. Isso dificulta para os pesquisadores adaptarem os dispositivos a novos experimentos. Quando os dados são coletados, geralmente são processados por softwares que não são transparentes, dificultando a reprodução dos resultados.

Para superar esses desafios, alguns pesquisadores começaram a trabalhar em sistemas modulares de código aberto que podem ser facilmente personalizados. Isso permite ajustar os sistemas com base nas necessidades de seus experimentos e fazer melhorias ao longo do tempo.

Apresentando o MIROSLAV

MIROSLAV, que significa Multicage InfraRed Open Source Locomotor Activity eValuator, é um novo sistema HCM projetado com três objetivos principais:

  • Monitorar muitas gaiolas de uma vez por períodos prolongados.
  • Garantir que dados não sejam perdidos.
  • Seguir princípios de código aberto e ciência aberta.

O MIROSLAV é baseado em tecnologia Arduino, que é amplamente utilizada porque é fácil de usar e adaptável. O sistema inclui arrays de sensores que rastreiam a atividade dos roedores em suas gaiolas. As leituras são enviadas para uma unidade principal, que registra e transmite os dados sem fio para um computador.

Como Funciona o MIROSLAV

Componentes de Hardware

O sistema MIROSLAV é composto por várias partes principais:

  1. Arrays de Sensores de Gaiola: Esses sensores estão presos às partes superiores das gaiolas e registram o movimento dos animais dentro. Eles usam tecnologia infravermelha para detectar qualquer atividade.

  2. Unidade Principal: Esta unidade coleta dados dos arrays de sensores. Ela marca o tempo da atividade e transmite para um computador via Wi-Fi.

  3. Pilhas de Serialização de Entrada: Essa parte conecta várias placas de entrada, permitindo que o MIROSLAV monitore até 64 gaiolas ao mesmo tempo.

  4. Transferência de Dados Sem Fio: O MIROSLAV usa uma rede Wi-Fi para enviar dados de forma rápida e eficiente. Também existe a opção de conectá-lo diretamente via USB para configurações mais simples.

Componentes de Software

O MIROSLAV vem com um conjunto de ferramentas de software que ajudam os pesquisadores a gerenciar e analisar os dados. Esse software é fácil de usar e segue diretrizes claras, permitindo que os usuários compreendam cada passo do processamento de seus dados.

  1. Aquisição de Dados: O software captura dados em tempo real dos sensores e os salva para análises futuras.

  2. Limpeza de Dados: Os dados brutos são limpos e organizados em um formato fácil de trabalhar. Esse processo garante que qualquer leitura falha seja removida.

  3. Análise de Dados: Uma vez que os dados são limpos, os pesquisadores podem realizar análises estatísticas para examinar padrões de atividade ao longo do tempo.

A Importância das Soluções de Código Aberto

Sistemas de código aberto como o MIROSLAV são importantes por várias razões. Primeiro, eles permitem que os pesquisadores adaptem as ferramentas para atender às suas necessidades específicas, o que é especialmente importante no campo ágil da pesquisa biomédica. Ter acesso ao design significa que os cientistas podem modificar o hardware e o software para se adequar aos seus experimentos.

Em segundo lugar, o uso de sistemas de código aberto incentiva a colaboração entre os pesquisadores. Quando as ferramentas estão disponíveis para todos usarem, isso cria uma comunidade onde os cientistas podem compartilhar ideias, melhorias e descobertas.

Um Estudo de Caso: Ritmos Circadianos e Doença de Alzheimer

Para demonstrar como o MIROSLAV funciona, os pesquisadores realizaram um estudo analisando os ritmos circadianos em um modelo de rato da doença de Alzheimer. Neste estudo, eles usaram o MIROSLAV para monitorar os padrões de atividade dos ratos ao longo de um período específico após induzir a doença.

Configuração do Estudo

  1. Modelo de Rato: Os pesquisadores usaram um grupo de ratos Wistar e os dividiram em dois grupos: um que receberia uma substância para induzir Alzheimer e um grupo controle que não receberia.

  2. Gaiola e Monitoramento: Arrays de sensores MIROSLAV foram instalados nas gaiolas quatro dias antes do início do tratamento. Isso permitiu que os pesquisadores registrassem os níveis de atividade de base antes de qualquer mudança acontecer.

  3. Coleta de Dados: A atividade dos ratos foi monitorada por 25 dias, coletando dados sobre como seu movimento mudava ao longo do tempo.

Descobertas

Os resultados do estudo mostraram vários padrões interessantes na atividade dos ratos. Inicialmente, não havia diferenças entre os dois grupos. No entanto, logo após o início do tratamento, o grupo com Alzheimer mostrou uma diminuição na atividade noturna.

À medida que os dias passavam, os níveis de atividade oscilaram, indicando uma interrupção em seus ritmos circadianos naturais. Descobertas assim podem proporcionar insights valiosos sobre como doenças como Alzheimer impactam a vida diária e o comportamento.

Benefícios do MIROSLAV na Pesquisa

O sistema MIROSLAV oferece várias vantagens para os pesquisadores:

  • Alta Capacidade: Pode monitorar muitas gaiolas de uma vez, permitindo estudos em larga escala que não eram viáveis com sistemas mais antigos.

  • Qualidade dos Dados: O sistema é projetado para minimizar a perda de dados, garantindo que os pesquisadores tenham dados confiáveis para trabalhar.

  • Custo-efetivo: Construir um sistema MIROSLAV é relativamente barato em comparação com sistemas de monitoramento comerciais, tornando-o acessível para mais pesquisadores.

Limitações e Desenvolvimento Futuro

Embora o MIROSLAV seja uma ferramenta poderosa, ele tem algumas limitações. Os sensores infravermelhos usados no sistema não conseguem diferenciar entre animais individuais em ambientes de grupo. Isso significa que os pesquisadores precisam ter cautela ao interpretar dados de vários animais juntos.

Além disso, o MIROSLAV não foi projetado para suportar processos de limpeza agressivos. Desenvolvimentos futuros podem focar em tornar o sistema mais robusto e integrar recursos adicionais, como sensores avançados para monitoramento ambiental.

No geral, o MIROSLAV representa um grande avanço na capacidade de monitorar a atividade animal para pesquisa de ritmos circadianos. Com sua estrutura de código aberto e design modular, ele incentiva a colaboração e a inovação na comunidade científica. Os pesquisadores estão esperançosos de que ferramentas como o MIROSLAV ajudem a esclarecer as complexidades dos ritmos circadianos e seu impacto na saúde e nas doenças.

Fonte original

Título: My friend MIROSLAV: A Hackable Open-Source Hardware and Software Platform for High-Throughput Rodent Activity Monitoring in the Home Cage

Resumo: While conventional behavioural tests offer valuable insight into rodent behaviour in specific paradigms, rodents spend most of their time in a safe, undisturbed environment - their home cage. However, home cage monitoring (HCM) is often impractical at scale over prolonged periods of time without significant loss of data. To achieve this, we developed MIROSLAV, the Multicage InfraRed Open Source Locomotor Activity eValuator, a home cage activity and environmental monitoring device designed to be open, adaptable, and robust. Its transparent and modular design allows the device to be tailored to varying experimental requirements and environmental conditions, while its wireless operation and multiple redundancies minimise loss of data and animal disturbance. Data quality is maintained by a modular software workflow for data preparation (Prepare-a-SLAV) and cleaning (TidySLAV), followed by exploratory (MIROSine - MIRO The Explorer) and statistical (MIROSine - StatistiSLAV) analysis of circadian periodicity. Here, using MIROSLAV, we demonstrate circadian dysrhythmia and a disrupted response to regular stimuli (e.g. behavioural testing, bedding change) in a rat model of sporadic Alzheimers disease, showcasing MIROSLAVs utility in a typical animal study of disease. In accordance with the 3Rs, every rodent study and laboratory performing them can benefit from HCM, provided the existence of transparent and customisable tools which allow robust deployment to tens or hundreds of cages in various conditions. MIROSLAV provides this opportunity to researchers in a cost-effective manner.

Autores: Davor Virag, J. Homolak, I. Kodvanj, A.-M. Vargantolic, A. Babic Perhoc, P. Meglic, P. Sostaric Muzic, A. Knezovic, J. Osmanovic Barilar, M. Cifrek, V. Trkulja, M. Salkovic-Petrisic

Última atualização: Oct 29, 2024

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.25.600592

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.25.600592.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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