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# Biologia # Microbiologia

Surto de Salmonella: Uma Ameaça Oculta na Nigéria

As infecções por Salmonella estão aumentando na Nigéria, trazendo sérios riscos à saúde.

Gabriel Temitope Sunmonu, Veronica O Ogunleye, Odion O. Ikhimiukor, Oluwafemi Popoola, Precious E. Osadebamwen, Aderemi Kehinde, Iruka N Okeke

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Crise de Salmonella na Crise de Salmonella na Nigéria saúde urgente. Infecções em alta geram preocupações de
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Infecções por Salmonella são uma grande preocupação de saúde mundial, especialmente na África. Essas infecções podem levar a doenças graves e até morte. Na Nigéria, a situação é particularmente alarmante, com muita gente ficando doente devido a certos tipos de Salmonella. Um dos tipos mais comuns nessa região é chamado Salmonella enterica, que inclui a famosa cepa que causa febre tifóide.

O que é Salmonella?

Salmonella é um tipo de bactéria que pode causar intoxicação alimentar e outras doenças sérias. Existem muitos tipos de Salmonella, mas os que mais causam problemas em humanos incluem Salmonella Typhi, que é responsável pela febre tifóide, e os tipos não tifóides, que podem vir de várias fontes como aves mal cozidas ou água contaminada.

A Situação na Nigéria

A Nigéria enfrenta um desafio único com as infecções por Salmonella. A falta de saneamento, a escassez de água limpa e as medidas de segurança alimentar inadequadas contribuem para o problema contínuo. Esses fatores permitem que as bactérias se espalhem facilmente, levando a surtos de doenças. Entre os tipos de Salmonella encontrados, alguns são mais comuns, enquanto outros são raramente vistos. Por exemplo, as cepas não tifóides geralmente estão ligadas a aves, que são uma fonte alimentar comum.

O Papel dos Hospitais

Na Nigéria, os hospitais têm um papel importante na identificação e teste de infecções por Salmonella. Por exemplo, o Hospital Universitário em Ibadan tem participado de um projeto para identificar essas bactérias desde 2016. Eles usam testes específicos para diferenciar os tipos de Salmonella, incluindo métodos bioquímicos em tiras comerciais e métodos sorológicos. Uma tendência preocupante é que eles identificaram Salmonella Typhi como prevalente na área, enquanto casos de outro tipo chamado S. Gallinarum eram extremamente raros.

Um Surto Inusitado

Em 2021, uma situação inesperada surgiu. Três amostras foram encontradas que inicialmente pensavam ser S. Gallinarum, mas acabaram sendo outra coisa. Essas amostras foram coletadas de pacientes que moravam em um bairro onde algumas pessoas tinham galinhas. Isso gerou uma investigação para entender se as bactérias poderiam ter se originado dessas aves.

Considerações Éticas na Pesquisa

A pesquisa sobre essas infecções bacterianas é feita de maneira ética. Nesse caso, foi obtida a aprovação de um comitê de ética antes de prosseguir com os estudos e investigações. Isso garante que toda pesquisa seja conduzida de forma responsável e com respeito pelos indivíduos envolvidos.

Identificando as Bactérias

Para identificar o tipo de Salmonella presente nos pacientes, uma série de testes é realizada. Os testes iniciais podem mostrar um determinado tipo, mas normalmente uma análise mais aprofundada é necessária para verificar os resultados. O Hospital Universitário utiliza diversos métodos, incluindo kits de teste específicos e análise do crescimento das bactérias em diferentes meios.

Crescimento e Comportamento da Salmonella

A maneira como a Salmonella cresce pode contar muito sobre suas características. Ao estudar as taxas e padrões de crescimento, os cientistas podem determinar se uma cepa é saudável ou se possui características incomuns. Nesse caso, algumas cepas identificadas tinham taxas de crescimento mais lentas em comparação com cepas típicas. É como comparar um corredor que sai rápido com um que leva seu tempo — ambos podem acabar terminando, mas suas velocidades são bem diferentes.

A Descoberta de Cepas Mal Identificadas

O surpreendente na história foi a identificação inicial errada de algumas cepas de Salmonella. O que se pensava ser S. Gallinarum acabou sendo um tipo de S. Typhi. Essa confusão destaca como é importante realizar testes e análises minuciosos. Se não fossem mais investigações, essas cepas de crescimento lento poderiam ter causado pânico desnecessário sobre um possível surto proveniente de aves de quintal.

Métodos de Teste

Os testes para Salmonella envolvem diferentes abordagens. Vários kits e sistemas são usados para ajudar a identificar corretamente as bactérias. Entre os métodos utilizados, o sistema API 20E ajuda a medir perfis bioquímicos baseado em como as bactérias reagem a diferentes substâncias.

A Importância do Teste de Motilidade

Outro aspecto crítico na identificação da Salmonella é o teste de motilidade. Isso diz aos cientistas se as bactérias podem se mover de uma maneira específica, que pode ajudar ainda mais na classificação. As cepas de crescimento lento tiveram dificuldades em se mover como esperado, o que aumentou a confusão durante a identificação. É como estar em uma festa dançando, mas não conseguindo acompanhar o ritmo — algo simplesmente não se encaixa.

Compreendendo as Curvas de Crescimento

Quando os cientistas testam quão rápido essas bactérias crescem, eles frequentemente criam curvas de crescimento. Esses gráficos indicam como as populações bacterianas mudam ao longo do tempo sob diferentes condições. Algumas cepas crescem rapidamente, enquanto outras levam seu tempo. Nesta pesquisa, as cepas de crescimento lento foram comparadas com as mais rápidas, revelando diferenças marcantes.

Análise de DNA na Pesquisa de Salmonella

Os cientistas dão um passo adiante analisando o DNA das bactérias. Isso ajuda a entender sua composição genética e a determinar como elas se relacionam com outras cepas. É como traçar árvores genealógicas, onde os pesquisadores podem ligar diferentes cepas aos seus ancestrais comuns, revelando a história por trás de cada uma.

O Papel do Sequenciamento de Genoma Completo

A tecnologia de sequenciamento de genoma completo (WGS) permite que os pesquisadores analisem o DNA completo das bactérias. Essa técnica clarifica as especificidades das cepas e fornece clareza sobre suas relações. Também revela quaisquer mudanças no DNA que possam estar afetando as taxas de crescimento ou outras características.

Má Identificação e Suas Consequências

A confusão na identificação dos tipos de Salmonella trouxe vários desafios. Ser mal identificado pode levar a respostas e alocação de recursos incorretas. Nesse caso, as respostas de saúde pública poderiam ter sido direcionadas para controlar uma ameaça que não existia, potencialmente levando a ações desnecessárias, como abater rebanhos de quintal.

A Necessidade de Identificação Precisa

Em áreas onde certas cepas são raras, torna-se ainda mais importante verificar cuidadosamente os achados. Um erro pode levar ao pânico ou à má alocação de recursos, especialmente quando se trata de saúde pública. O estudo enfatiza que cepas suspeitas de Gallinarum devem passar por testes adicionais, especialmente em regiões onde não são comumente relatadas.

Crescimento Lento e Rearranjos Cromossômicos

Os pesquisadores investigaram por que essas cepas de crescimento lento se comportavam de forma diferente. Acontece que certas alterações genéticas poderiam afetar as taxas de crescimento, levando à confusão observada. Compreender essas variações ajuda os cientistas a entender como as bactérias evoluem e se adaptam.

Conclusão: Lições Aprendidas

Em resumo, o incidente destaca a importância de testes minuciosos, identificação precisa e compreensão das complexidades do comportamento bacteriano. Ao investigar casos como esse, os pesquisadores podem melhorar os métodos de diagnóstico e tratamento de infecções, minimizando os riscos à saúde pública. Através desses esforços, protegemos melhor as comunidades e abrimos caminho para um futuro mais saudável.

Considerações Finais

O mundo da microbiologia pode parecer complicado, mas é vital para nossa saúde. Cada descoberta nos aproxima de entender esses pequenos organismos que podem ter um grande impacto. Então, quando você pensar em Salmonella, lembre-se de que até mesmo as bactérias menores podem ter uma história infinita escondida atrás delas, e cabe aos pesquisadores desvendarem essa narrativa — um teste de cada vez!

Fonte original

Título: Slow-growing Salmonella enterica Typhi mis-identified as Salmonella Gallinarum in Ibadan, Nigeria

Resumo: Salmonella enterica serovar Typhi is endemic in Nigeria where S. Gallinarum is rarely reported. Probable S. Gallinarum was blood-cultured from three Ibadan patients within 10-days leading to suspicion of an outbreak. All three isolates were re-identified using VITEK-2, whole genome sequenced on Illumina and Oxford Nanopore platforms and confirmed as S. Typhi genotype 3.1.1. Two isolates from the same household had no single nucleotide polymorphisms, suggesting a point-source, but the third was an independent infection event. The isolates formed small colonies, were negative for motility by hanging drop method, and in Sulphide-Indole-Motility medium at 24h, but positive after 48h incubation. Hybrid genome assemblies revealed chromosomal fragment arrangements with imbalances on either side of ori and ter, which has been shown to slow S. Typhi growth. Suspected S. Gallinarum isolates in typhoid endemic areas should be evaluated biochemically and for motility after extended incubation, and verified by serological or molecular methods. Main contributions of the researchO_LIThis study demonstrates that slow-growing Salmonella Typhi can be mis-identified as S. Gallinarum in resource-limited endemic countries. C_LIO_LIExtended motility testing and confirmatory testing can avoid S. Gallinarum miss-calls. C_LIO_LIThe genetic basis for slow-growth may be chromosomal rearrangements at rrn operons, which are known to occur in S. Typhi C_LI

Autores: Gabriel Temitope Sunmonu, Veronica O Ogunleye, Odion O. Ikhimiukor, Oluwafemi Popoola, Precious E. Osadebamwen, Aderemi Kehinde, Iruka N Okeke

Última atualização: 2024-12-25 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.24.630237

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.24.630237.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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