「RMSD」とはどういう意味ですか？

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RMSDは、平方平均偏差のことだよ。これは、2つのデータセットがどれくらい違うかを測る方法。タンパク質のことを考えると、RMSDは予測されたタンパク質の構造が既知の構造とどれだけ近いかを見るのに使われることが多いんだ。

科学者たちがタンパク質のモデルを作るとき、そのモデルが正確かどうかを知りたいんだ。RMSDは、予測モデルの原子の位置と実際のモデルの原子の位置の平均距離を示す1つの数字を提供してくれるから助かる。RMSDの値が低いと2つの構造は似てるってことだし、高いと大きな違いがあるってこと。これは、治療用抗体を含むタンパク質の設計を改善するために重要な指標なんだよ。