生きてるシステムのエネルギーフローを測る
生物学的な文脈での分散和則を使ったエントロピー生成の研究。
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自然界では、天候や生物などすべてが常に動いている。これらの動きを研究する上で重要な概念がエントロピー生成で、これはシステムが変化する際に環境に失われるエネルギーを指す。この損失は、エネルギーは創造も破壊もできず、ただ変換されるだけという熱力学第二法則によって決まる。
エントロピーがどれだけ生成されるかを測るのは難しいことがある、特に細胞のような小さなシステムを見ているとき。これらのシステムはしばしばランダムな力に影響され、振る舞いを制御する特定の要因へのアクセスが限られている。エントロピー生成率をよりよく測るために、研究者たちは分散和則(VSR)という方法を開発した。この方法を使うことで、小さな粒子から大きな生細胞まで、動くシステムでエネルギーがどのように散逸するかを直接測定できる。
分散和則(VSR)
VSRは、システム内のさまざまな変動の関係に焦点を当てている。変動の度合いを測定することで、研究者たちはエントロピー生成に至る根本的なプロセスについての洞察を得ることができる。変動は、物体の位置とその上に作用する力の両方について計算される。
例えば、小さな粒子がレーザービームに捕らえられ、流体の中を移動させられると、その動きはエントロピー生成について多くのことを明らかにする。位置と力の変動を観察することで、科学者たちはVSRを適用して局所的なエントロピー生成率を推定できる。
このルールは、単純なモデルや複雑な生細胞を含むさまざまなシナリオでテストされてきた。重要な発見の一つは、これらの測定が異なる条件で異なることがあり、エントロピー生成は均一ではなく、空間分布や環境相互作用のような要因で変わる可能性があるということだ。
アクティブブラウン運動粒子
VSRを示すために使われるシステムの一つがアクティブブラウン運動粒子。これは自分で流体の中を動ける小さな粒子で、他の分子とのランダムな衝突に影響される。実験では、アクティブブラウン運動粒子をレーザー光で作られたトラップに置き、流体の中を押したり引いたりする。
粒子の動きとその上に作用する力を観察することで、研究者はVSRを適用できる。例えば、粒子を水の中で引っ張ると、研究者はその動きによって失われるエネルギーを計算し、粒子の振る舞いにどう関係しているかを探ることができる。
結果は、粒子の動きとその上に作用する力に関連したエントロピー生成の明確なパターンを示している。この洞察は、単純なシステムでのエネルギー使用の効率を理解するのに役立ち、より複雑な生物にも応用できる。
ヒト赤血球
単純な粒子を越えて、VSRはヒトの赤血球(RBC)にも適用されている。これらの細胞は体内で酸素を運ぶために重要で、その動きはかなり複雑だ。研究者たちは光学ツイーザーを使ってRBCに力を加え、その反応を測定してきた。
これらの実験では、RBCが空間的に変動するエネルギー生成のパターンを示すことがわかった。つまり、細胞の異なる部分が異なる速度でエネルギーを生成できる。VSRを使うことで、研究者はこれらのプロセスがどのように機能し、RBCの機能に関連しているかを定量化できた。
RBCの研究で明らかになったのは、細胞の活発な代謝がその行動に影響を与えており、これはグルコースを分解してエネルギーを生成する。この代謝活動が細胞膜の変動を引き起こし、エントロピー生成に寄与している。VSRを適用することで、科学者たちはRBCが生成しているエネルギーの量とそれが全体のパフォーマンスにどう関係しているかを推定できた。
確率的スイッチングトラップ
もう一つの実験は、確率的スイッチングトラップ(SST)という方法を使った。ここでは、光学トラップの位置がランダムに二つのポイントの間で切り替わる。このため、粒子は常に変化に適応しなければならず、複雑な力の作用を受けることになる。
これらの実験中に得られた測定値は、スイッチングが粒子の運動と散逸するエネルギーにどのように影響するかを明らかにする。収集されたデータにVSRを適用することで、研究者はこれらの急激な変化の間にエネルギーがどのように生成されるかについての洞察を得て、粒子が動的に環境とどのように相互作用するかを説明する助けとなる。
エントロピー生成の測定
エントロピー生成を計算するために、VSRは実験で観察された変動をエネルギー出力に直接結びつける方法を提供する。変動が時間の経過とともにどのように変化するかを体系的に分析することで、研究者はエネルギーがどのように転送され、失われるかを示す重要なパラメータを導き出すことができる。
要するに、粒子の力と位置がどれだけ変動するかを測定することで、科学者たちはさまざまなプロセスで生成または失われるエネルギーを推定できる。この関係は、微小なシステムから大きな生物的および化学的プロセスまで理解するために重要だ。
生物システムへの影響
エントロピー生成とエネルギー散逸を理解することは、さまざまな生物システムにとって重要だ。例えば、細胞では適切なエネルギー管理が機能を維持するために不可欠だ。これらのプロセスの混乱は非効率につながり、病気や機能不全を引き起こす可能性がある。
VSRは、研究者がこれらの概念をより深く探求する手助けをし、力と動きがエネルギー消費にどのように関連しているかを理解する枠組みを提供する。この知識は、細胞がどのように機能し、外部からの刺激にどのように反応し、必要な機能を維持するかについてのさらに良い洞察をもたらす可能性がある。
今後の方向性
VSRを利用した研究は、達成できることの表面をなぞり始めたばかりだ。研究者たちが方法を洗練し、新しいシステムを探求し続ける中で、将来的な研究は熱力学の基本原理、特に生物学的な文脈においてさらに深い洞察を提供するかもしれない。
より高度な測定技術の出現により、科学者たちは生細胞内のエネルギー生成プロセスをより正確に直接観察し、定量化できるようになるかもしれない。これにより、代謝やエネルギー効率の理解において革命的な進展があり、代謝病やエネルギー管理に関連する他の障害に関する革新的な治療法への道が開かれるだろう。
結論
分散和則を通じたエントロピー生成の探求は、研究者にとって強力なツールを提供する。位置と力の変動に焦点を当てることで、科学者たちはさまざまなシステムにおけるエネルギーの動態についての重要な情報を解き明かすことができる。この理解は、生物学や生物物理学の分野において研究の新たな道を切り開き、エネルギーの流れを管理することが生命にとって不可欠であることを示している。
この分野での研究が進むにつれて、健康、病気管理、そして生物システム全体の理解への影響は深遠なものになる可能性があり、エネルギー、動き、そして生命そのものとの複雑な関係を浮き彫りにするだろう。
タイトル: Variance Sum Rule for Entropy Production
概要: Entropy production is the hallmark of nonequilibrium physics, quantifying irreversibility, dissipation, and the efficiency of energy transduction processes. Despite many efforts, its measurement at the nanoscale remains challenging. We introduce a variance sum rule for displacement and force variances that permits us to measure the entropy production rate $\sigma$ in nonequilibrium steady states. We first illustrate it for directly measurable forces, such as an active Brownian particle in an optical trap. We then apply the variance sum rule to flickering experiments in human red blood cells. We find that $\sigma$ is spatially heterogeneous with a finite correlation length and its average value agrees with calorimetry measurements. The VSR paves the way to derive $\sigma$ using force spectroscopy and time-resolved imaging in living and active matter.
著者: I. Di Terlizzi, M. Gironella, D. Herraez-Aguilar, T. Betz, F. Monroy, M. Baiesi, F. Ritort
最終更新: 2024-03-06 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://arxiv.org/abs/2302.08565
ソースPDF: https://arxiv.org/pdf/2302.08565
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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