遺伝子組み換えバイ菌:プラスチックごみの解決策
エンジニアリングされたバイ菌の研究がプラスチック汚染を減らす希望を与えてるよ。
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プラスチックは軽くて強く、化学に耐えられるから、日常生活に欠かせない材料になってるよ。20世紀に発明されて以来、パッケージングや建設、いろんな場面で広く使われてきた。でも、プラスチックの使いすぎは深刻な環境問題も引き起こしてる。多くのプラスチックは一度使ったら捨てられちゃって、膨大なゴミが出てるんだ。1950年から2015年の間に、約4900メガトンのプラスチックゴミが埋立地や環境に行っちゃったんだ。
生産されるプラスチックの大部分は長持ちするように設計されてるから、簡単には分解されないで、環境に何百年も残るんだ。この長持ちする性質は生態系にリスクを与えたり、人間の健康にも影響を及ぼす可能性があるって予測されてる。今の使い方が続くと、2060年までに毎年のプラスチックゴミの量がほぼ3倍になるって言われてる。ゴミの管理や環境回復の努力があっても、相当な量のプラスチックゴミが私たちの土地や水に入り続けることになるよ。
多くのプラスチックは生分解性じゃないと考えられてるけど、研究によると、いくつかの微生物はこれらの材料をエネルギーのために使える簡単な物質に分解できるみたい。でも、この自然のプロセスは遅くて、プラスチックが分解されるのに数週間から数ヶ月かかるんだ。科学者たちは、特定のプラスチックの分解を早くするために、プラスチックを分解する酵素を改善する研究を続けてる。一例がPETaseっていう酵素で、ポリエチレンテレフタレート(PET)っていう一般的なプラスチックを分解できるんだ。
プラスチックゴミの流れ
プラスチックゴミは主に wastewater treatment plants(下水処理施設)を通じて環境に入ってくる。そこで、排水やスラッジがマイクロプラスチックを運ぶことがある。これらの施設には、プラスチックを分解する酵素を生成するエンジニアリングされた細菌を導入することで、マイクロプラスチックを取り除くプロセスがある。この方法は、浄化酵素を処理プロセスに追加し続けるよりも、コストがかからないかもしれない。
でも、この方法の課題は、導入した細菌が新しい環境で長く生き残れないかもしれないことなんだ。だから、科学者たちは地域の細菌を遺伝子組換えして、プラスチックゴミを分解するための酵素を表現させる方法を模索してる。この遺伝子組換えは遺伝子バイオ増強として知られていて、非プラスチック汚染物質の清掃には実験室での成功が示されてる。
プラスチック分解研究の最近の進展
最近の研究では、研究者たちはPETase遺伝子を持つプラスミドを下水中の細菌に導入することに注力してる。この研究では、これらの改変された細菌がPETプラスチックを効果的に分解できることが示された。研究で使用されたPETaseのバリエーション、FAST-PETaseは、以前のバージョンよりも効率的で安定してる。
研究者たちは、FAST-PETase遺伝子を地域の細菌に転送するための特別なプラスミドを開発した。このプラスミドは、細菌が成長し、PETase遺伝子を維持できるように設計された。研究者たちはこの方法の効果をテストし、変換された細菌が機能的なPETaseを表現し、PETプラスチックを直接分解できることを確認した。
PETaseを細菌に導入する方法
汚水中の細菌にPETase遺伝子を持たせるために、研究者たちはpFAST-PETase-cisという共役プラスミドを構築した。このプラスミドには、遺伝子転送プロセスを助ける重要な機能がいくつか含まれている。具体的なプロモーターがPETase遺伝子の発現を促進し、成功した変換を特定するための蛍光マーカーも含まれてる。
研究者たちは、共役プロセスのドナーとして特定のE. coli株を使用した。この株を市の下水と混ぜて培養し、遺伝子材料が地域の細菌に転送されるようにした。数日後、細菌のコロニーを調べて、蛍光マーカーを表現しているかを確認し、成功した遺伝子転送を示した。
遺伝子修飾の安定性
導入したプラスミドがどれだけ維持できるかをテストするために、研究者たちは14日間にわたっていくつかの細菌種を監視した。選択圧がない状態ではプラスミドの存在が大幅に減少することがわかった。つまり、プラスミドからの継続的な利点がない細菌は、時間が経つにつれてプラスミドを失いやすいってことだ。
この損失は、修正された細菌が現実の環境で長期間機能することを確保する重要性を浮き彫りにしてる。将来の応用では、プラスチック分解の持続的なソリューションを達成するために、これらの遺伝子修飾の安定性を維持する戦略を考える必要がある。
PETaseの効果のテスト
研究者たちは、エンジニアリングされた細菌がどれだけPETプラスチックを分解できるかをテストした。彼らは、PETase酵素の効果を測定するために、細胞内および培養上清の両方の方法を使用した。いろんなテストで、曝露されたPETサンプルは目に見える重量減少を示し、成功した分解を示した。
ある実験では、研究者たちはある種のPETフィルムを純粋なFAST-PETase酵素で培養した。時間が経つにつれて大きなマスロスが確認され、酵素がPETプラスチックに対して活動していることが示された。走査型電子顕微鏡でもPETサンプルの表面の変化が観察され、分解プロセスがさらに確認された。
上清を使った分解
研究者たちは、FAST-PETaseを含む培養上清が酵素を事前に精製しなくてもPETを分解できるかを探った。彼らは異なる条件から得られたサンプルをテストし、特定の波長での吸光度を測定して分解生成物を検出した。
初期結果では、酵素発現が刺激されたときに顕著な分解が起こった。処理されたサンプルは分解の明らかな兆候を示し、さらなる観察で上清が全体的な分解プロセスに寄与していることが確認された。
しかし、研究者たちが未希釈の培養上清を使用したとき、最小限の活性しか見られなかった。特定の条件、特に希釈が効果的な分解には必要だと結論づけられた。これは、環境条件や濃度を最適化することで、エンジニアリングされた細菌の性能を向上できる理解につながる。
分解プロセスのスケーリング
研究者たちは、コーヒーカップのフタなどの大きなPETの断片を使用して、分解プロセスをスケールアップすることを目指した。彼らは、エンジニアリングされた細菌の上清に浸したフタでかなりの分解が行われることを観察し、廃棄物管理における実用的な応用の可能性を確認した。
これらの研究の結果は、プラスチック分解のために地域の細菌を遺伝子工学するアプローチがプラスチックゴミの問題に対処する上で重要な役割を果たす可能性があることを示している。エンジニアリングされた細菌の効果を最大化し、環境における安定性を確保することで、このソリューションはリサイクル努力に大きく貢献し、生態系に害を与えるプラスチックゴミの量を減らすことができるかもしれない。
課題と今後の方向性
遺伝子組換え細菌の導入は期待が持たれてるけど、いくつかの課題が残っている。さまざまな環境でのプラスミドの安定性を注意深く監視し、長期的な効果を確保する必要がある。科学者たちは、環境で遺伝子組換え生物を使用することの影響や、潜在的な倫理的懸念を軽減する方法も考えてる。
これからの研究は、エンジニアリングされた細菌の性能向上、より広範な遺伝子ツールの探求、さまざまなプラスチックを分解するための多様な微生物群を作ることに焦点を当てる予定。今回の研究で確立されたフレームワークは、特定のプラスチックゴミのタイプをターゲットにしたモジュラーシステムにつながるかもしれない、もっと持続可能な廃棄物管理へのアプローチを提供することができる。
結論
PETプラスチックを分解できる遺伝子組換え細菌の創造は、プラスチックゴミに取り組む革新的なアプローチを示している。研究が続く中で、この分野の進展は環境中のプラスチック汚染を減らすための効果的でスケーラブルなソリューションにつながるかもしれない。自然の能力と最先端の技術を活用することで、プラスチックが私たちの地球に与える影響を最小限に抑えた持続可能な未来に向かって進んでいけるんだ。
タイトル: Degradation of PET Plastics by Wastewater Bacteria Engineered via Conjugation
概要: Microplastics are contaminants of global concern that pose risks to ecosystems and human health. Focusing on PET plastics, we present a proof-of-concept for reduction of microplastic pollution: in situ engineering of bacteria in wastewater to degrade PET. Using a broad-host-range conjugative plasmid, we enabled various bacterial species from a municipal wastewater sample to express FAST-PETase, which was released into the extracellular environment. We found that FAST-PETase purified from some isolates could degrade about 40% of a 0.25 mm thick PET film within four days at 50 {degrees}C. We then demonstrate partial degradation of post-consumer PET over 5-7 days by exposure to conditioned media from isolates. These results have broad implications for addressing the global plastic pollution problem by enabling environmental bacteria to degrade PET plastics in situ.
著者: Brian P. Ingalls, A. Yip, O. D. McArthur, K. C. Ho, M. G. Aucoin
最終更新: 2024-02-08 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.07.579132
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.07.579132.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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