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# 生物学# 微生物学

植物の成長とIAA管理におけるバクテリアの役割

細菌は植物ホルモンIAAを分解するのに重要な役割を果たしていて、成長に影響を与えてるんだ。

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バイ菌が植物のIAAレベルバイ菌が植物のIAAレベルに与える影響よ。Aを調整するのに大事な役割を果たしているバクテリアは健康な植物の成長のためにIA
目次

インドール-3-酢酸、通称IAAは、植物が成長するのを助ける自然な物質だよ。これは植物ホルモンの一種で、特にオーキシンで、細胞の分裂や成長に重要な役割を果たしてる。IAAは主に植物の成長している部分、特に根の先端に多く見られる。この周辺にはIAAを作る細胞がたくさんあって、IAAの濃度に差があることで根の成長を導いてるんだ。

IAAは主に根に存在するけど、植物が土壌に放出する液体、つまり根からの排出物(ルートエクスデート)にも含まれてることがある。この排出物にはIAAや他の物質が含まれることがあるよ。

植物の成長における微生物の役割

植物にはたくさんの微生物が住んでいて、みんなで植物関連のマイクロバイオームというコミュニティを作ってる。このマイクロバイオームには、植物の上や中に住んでるさまざまなバクテリアや真菌が含まれてる。特に根のゾーンは重要で、これらの微生物の働き方に影響を与える。

研究によると、IAAみたいな植物ホルモンを含んだ根からの排出物が、根の近くに住む微生物のコミュニティを大きく変えることができるんだって。時間が経つにつれて、これらの微生物は植物と共存する方法を身につけて、IAAみたいな植物特有の物質を生産したり分解したりする能力を持ってるって推測されてる。根の周りにはIAAを作れるバクテリアがたくさんいるんだ。

でも、土壌でIAAを分解できるバクテリアや、彼らが自然の中でどんな役割を果たしてるのかはあまりわかってないよ。

バクテリアがIAAを分解する方法

バクテリアがIAAを分解する方法は2つある。1つ目は、iac-likeオペロンという遺伝子のグループを使って、特定のバクテリアがIAAをカテコールという別の物質に変えることができる。たとえば、PseudomonasやAcinetobacterみたいなバクテリアがこの能力を持っているよ。

2つ目は、iad-likeオペロンと呼ばれる別の遺伝子のグループを使って、IAAをアンソラニレートという異なる最終産物に分解することができるバクテリアもいる。これができるバクテリアの例には、VariovoraxやAchromobacterがある。

最近の研究で、IAAを分解する遺伝子が多くのバクテリア株に存在することがわかったけど、土壌にいるどれだけのバクテリアがIAAを分解できるのか、そしてそれが土壌の健康にどんな意味を持つのかはまだわからないんだ。

IAAを分解するバクテリアの発見

バクテリアがIAAを分解できるかもっと知るために、科学者たちはアラビドプシス(小さな花を咲かせる植物)や米の根から集めた多くのバクテリアを調べた。IAA分解に関わる遺伝子を探して、どのバクテリアが実際にIAAを分解できるか実験を行ったよ。

科学者たちは、IAAを効果的に分解できることが示された7つの異なるグループからの21の特定のバクテリアを見つけたんだって。面白いことに、そのうちの2つのグループはこれまで報告されてなかった。IAAを分解できるバクテリアは、必ずiac-likeまたはiad-likeオペロンを持ってた。これらのバクテリアがIAAにさらされると、遺伝子の活動が増加して、このホルモンに反応できることが示されたよ。

さらに、これらのバクテリアはIAAを分解するだけでなく、エネルギーと成長のために食料源として利用できるバクテリアもいた。これらのバクテリアを植物で試したところ、余分なIAAが根の成長に与える悪影響を軽減する驚くべき能力を示して、植物の成長を支える可能性があることがわかった。

さらなるIAA分解バクテリアの探索

この研究では、IAAを分解できるバクテリアをもっと特定して、さまざまな環境でどれくらい広がっているかを理解しようとした。科学者たちは、さまざまな生息地から集めた何千ものバクテリアのゲノムを調べたよ。水域、土壌、さらには哺乳類の腸内からも。

結果として、IAAを分解できる能力は主に植物関連の土壌で見つかった。具体的には、植物の根や芽からのバクテリアがIAAを分解できる数が相当多かったけど、水生環境や哺乳類環境ではほとんど見つからなかったんだ。

バクテリアがIAAを利用する方法

科学者たちは、これらのバクテリアがIAAを唯一の食料源として使えるかどうかも知りたかった。多くの株が与えられたすべてのIAAを消費できることがわかって、これを食料源として繁栄できることが示された。中には特に成長が早い株もあって、他の株よりもかなり早くIAAを消費してしまったよ。

植物成長におけるIAA分解バクテリアの重要性

IAAの分解は植物の成長にとって重要で、根の中や周りのIAAのレベルを調整するのに役立つ。適切なバランスを維持することは健康な根の発達に必要なんだ。この研究では、IAAの過剰な影響を軽減できるバクテリアがいることが確認されたけど、これは根の成長を妨げる可能性がある。

特定のIAA分解バクテリアを植物に加えると、正常な根の成長を回復させるのを助けて、そのIAAレベルを管理するのに重要な役割を果たしてることを示唆している。これらの相互作用は、植物とその環境との複雑な関係においてバクテリアがどれだけ重要かを示してるよ。

結論

この研究は、バクテリアが植物のIAAレベルを管理する上での重要な役割を明らかにしてる。さまざまな植物からIAAを分解するバクテリアを発見することで、植物マイクロバイオームの複雑なつながりをよりよく理解できるようになった。

これらのバクテリアがどのように機能しているかを特定することで、植物が成長して発展するのを助ける方法について洞察を得られる。この知識は、将来的にはより良い農業の実践につながり、より健康な植物や生態系を支えるかもしれない。

IAAを生成する植物とIAAを分解するバクテリアの相互作用は、植物ホルモンの健康なバランスを維持するのに重要なんだ。研究が続く中で、これらの関係をさらに探求することは、科学を通じて植物成長を理解し向上させるために大切になるだろう。

オリジナルソース

タイトル: Degradation of indole-3-acetic acid by plant-associated microbes

概要: Plant-associated microbiota affect pant growth and development by regulating plant hormones homeostasis. Indole-3-acetic acid (IAA), a well-known plant hormone, can be produced by various plant-associated bacteria. However, the prevalence of microbes with the capacity to degrade IAA in the rhizosphere has not been systematically studied. In this study, we analyzed the IAA degradation capabilities of bacterial isolates from the roots of Arabidopsis and rice. Using genomics analysis and in vitro assays, we found that 21 out of 189 taxonomically diverse bacterial isolates possess the ability to degrade IAA. Through comparative genomics and transcriptomic assays, we identified iac-like or iad-like operon in the genomes of these IAA degraders. Additionally, the regulator of the operon was found to be highly conserved among these strains through protein structure similarity analysis. Some of the IAA degraders could utilize IAA as their sole carbon and energy source. In planta, most of the IAA degrading strains mitigated Arabidopsis seedling root growth inhibition (RGI) triggered by exogenous IAA. Importantly, we observed increased colonization preference of IAA degraders from soil to root according to the frequency of the biomarker genes in metagenome-assembled genomes (MAGs) collected from different habitats, suggesting that there is a close association between IAA degraders and IAA-producers. In summary, our findings further the understanding of the functional diversity and roles of plant-associated microbes.

著者: Lei Dai, L. WANG, Y. Liu, H. Ni, W. Zuo, H. Shi, W. Liao, H. Liu, Y. Bai, H. Yue, A. Huang, J. Friedman, T. Si, M. Chen

最終更新: 2024-02-08 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.08.579438

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.08.579438.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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