β1アドレナリン受容体のダイナミクスについてのインサイト
研究が異なるリガンドがβ1アドレナリン受容体の機能にどのように影響するかを明らかにしているよ。
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目次
Gタンパク質共役受容体(GPCR)は、哺乳類に見られる大きなタンパク質群で、800種類以上あるんだ。ホルモンや神経伝達物質など、細胞外からのさまざまなシグナルに反応して、体のいろんな機能に重要な役割を果たしてる。これらの受容体は、細胞膜を通過する7つのセグメントからなる特定の構造を持ってて、それが機能にとって重要なんだ。
シグナルやリガンドがGPCRにくっつくと、受容体の形が変わるんだ。その変化によって、受容体が細胞内のGタンパク質と相互作用できるようになり、体内でさまざまな反応を引き起こす一連のイベントにつながる。心拍数の変化から気分の調整まで、反応の幅は広い。さらに、同じ受容体でも、リガンドの相互作用の仕方によって異なる反応を引き起こすこともある。このユニークな挙動は新しい薬の開発にとって重要なんだ。
β1-アドレナリン受容体
よく研究されているGPCRの一つがβ1-アドレナリン受容体(β1AR)で、主に心臓に見られ、心拍数の制御に欠かせない存在なんだ。この受容体をブロックする薬、いわゆるβブロッカーは、高血圧やその他の状態を管理するためによく使われる。これらの薬は、ノルエピネフリンのような自然な物質がβ1ARに結合するのを防いで、心拍数を下げるんだ。
β1ARの構造は他のGPCRと似てるけど、いくつかの部分が異なってて、さまざまなリガンドが効果的に結合できるようになってる。詳細な研究が進んでるけど、受容体がどうやって活性化されてGタンパク質と相互作用するのか、科学者たちはまだ完全には理解してないんだ。
水素重水素交換(HDX)
水素重水素交換(HDX)という新しい技術が、これらの受容体を研究するのに使われてるんだ。HDXでは、特別な溶液に置くことで、タンパク質中の水素原子が重い原子、すなわち重水素に置き換わる様子を追跡できるんだ。この交換の速度が、タンパク質の構造や柔軟性に関する洞察を提供してくれる。
質量分析を使って、科学者たちは、この重水でさまざまな時間にさらした後のタンパク質を分析できる。この方法は、GPCRのような膜タンパク質を研究するのに特に便利で、なかなか分析が難しいんだ。
β1ARのHDX最適化
β1ARを特に研究するために、研究者たちはHDXの方法を洗練させる必要があった。高い配列カバレッジを達成するために条件を調整して、できるだけ多くの部分を研究するようにしたんだ。特定のバッファーや酵素処理が、分析できるタンパク質の量を大幅に改善することが分かった。
HDXプロセスを最適化した後、研究者たちはβ1ARが異なるタイプのリガンド、たとえばアンタゴニストやアゴニストと結合したときの挙動を調べ始めた。彼らは、これらのリガンドが受容体の構造全体で異なる保護パターンやダイナミクスを引き起こすことを発見した。
アンタゴニスト結合の理解
β1ARが3つの異なるアンタゴニストと結合している実験では、結合によって受容体の特定の部分がより安定し、水素交換から保護されることが観察された。この保護は、アンタゴニストが受容体にうまく結合して、そのダイナミクスを変えていることを示しているんだ。
面白いことに、1つのアンタゴニストであるカルベジロールは、他のものとは異なる方法でダイナミクスを変えることが分かった。これは、異なるアンタゴニストが受容体に対してさまざまな影響を与えられる可能性があることを示しているんだ。
アゴニストの相互作用を探る
次に、研究者たちはアゴニスト、つまり受容体を活性化する化合物がβ1ARに与える影響を調べた。アゴニスト結合によって、特にICL1のようなループ領域で受容体の特定の部分のダイナミクスが増加したことが分かった。この発見は、受容体を安定させるアンタゴニストの効果とは対照的だ。
アゴニストとアンタゴニストが受容体のダイナミクスにどのように異なる影響を与えるかの違いは、薬の開発における彼らのそれぞれの役割を理解するのに重要なんだ。アゴニストは特定のヘリックスの外向きの動きを大きく誘発することが観察されて、受容体を活性化する様子が確認された。
部分アゴニストの調査
研究者たちは、全アゴニストほど強くはないけど受容体を活性化する部分アゴニストにも注目した。部分アゴニストは全アゴニストと同様に受容体に影響を与えるけど、保護やダイナミクスの度合いに明確な違いがあったことが分かった。
この観察から、部分アゴニストを含むさまざまな種類のリガンドがGPCRに与える影響の複雑さが強調されてる。これらの相互作用を研究する必要性があることを示していて、より選択的で効果的な薬の開発に繋がるんだ。
ICL1の役割
この研究の重要な発見は、細胞内ループ1(ICL1)が受容体の活性化において重要であることだった。研究では、ICL1のダイナミクスの変化がβ1ARに結合したリガンドのタイプに密接に関連していることが明らかになった。アゴニストが存在する時、ICL1は柔軟性が増して、活性化シグナルを伝達する上で重要な役割を果たしていることを示している。
ICL1の機能をさらに調べるために、研究者たちはこのループ内の特定の残基に変異を行った。これらの変異は、ICL1と受容体の他のコンポーネントであるH8との物理的な相互作用に関する洞察を提供した。
L72変異
特定の変異であるL72Aは、細胞内で受容体のシグナル伝達能力に大きな障害を引き起こしたことが分かり、L72がICL1の機能に重要な役割を果たしていることを示唆しているんだ。この変異した受容体は正常に発現していたけど、リガンド結合時の保護やダイナミクスが変異してない受容体とは異なってた。
この発見は、残基L72が適切なGPCR機能にとって重要であることを強く示唆している。ダイナミクスの破壊は、この変異によって受容体が細胞内のシグナル伝達パートナーとどのように相互作用するかに影響を及ぼす可能性があるんだ。
Gタンパク質結合への影響
変異した受容体に関するさらなる研究では、Gタンパク質に結合できることが示されたが、正常な受容体と比較して安定化のレベルが同じではなかった。これは、変異が受容体が効果的に機能するために必要な重要な相互作用に影響を与えていることを示唆しているんだ。
変異した受容体における保護的なダイナミクスの喪失は、受容体の適切なシグナル伝達と活性化を促進するための相互作用がいかに重要であるかを示している。
結論
HDXを用いたβ1ARの研究は、GPCRシグナル伝達に関与する複雑なダイナミクスに光を当てたんだ。異なるリガンドが受容体の構造と機能にどのように影響を与えるかを観察することで、科学者たちはこれらのタンパク質がどのように動作し、薬と相互作用するかをより良く理解できるようになる。
これらの洞察は、特にGPCRを効果的にターゲットにし、副作用を最小限に抑えた薬の開発に重要な意味を持ってるんだ。研究者たちがGPCRの複雑さを解明し続ける中で、より良い治療戦略を開発する可能性が広がり、さまざまな病気に対するより効果的な治療法の希望が生まれているんだ。
タイトル: Ligand-induced conformational changes in the β1-Adrenergic Receptor Revealed by Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry
概要: G-Protein Coupled Receptors (GPCRs) constitute the largest family of signalling proteins responsible for translating extracellular stimuli into intracellular functions. When dysregulated, GPCRs drive numerous diseases and are the most targeted proteins in drug discovery. GPCR structural dynamics and activity can be modulated by a wide range of drugs, including full/partial agonists and antagonists. While crucial for developing novel therapeutics targeting GPCRs, the structural dynamics of the receptors associated with their activity upon drug interactions are not yet fully understood. Here, we employ Hydrogen Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS), to characterise the structural dynamics of turkey {beta}1-adrenergic receptor (t{beta}1AR) in complex with nine ligands, including agonists, partial agonists and antagonists. We show that dynamic signatures across the GPCR structure can be grouped by compound modality. Surprisingly, we discovered repeated destabilisation of the intracellular loop 1 (ICL1) upon full agonist binding and stabilisation upon antagonist binding, suggesting that increased dynamics in this region are an essential component for G-protein recruitment. Multiple sequence alignments and molecular dynamics simulations indicate that L72 in ICL1 plays important structural role. Differential HDX-MS experiment of t{beta}1AR and t{beta}1AR L72A construct in complex with miniGs, in response to various ligands, suggests involvement of ICL1 in stabilising the GDP bound state by influencing the stability of HG helix of miniGs. Overall, our results provide a platform for determining drug modality and highlight how HDX-MS can be used to dissect receptor ligand interaction properties and GPCR mechanism. Significance statementRecent advances in hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry have allowed probing conformational signatures of challenging membrane protein assemblies. We studied the structural dynamics of a class A GPCR, namely t{beta}1AR, in response to diverse ligands including agonists, antagonists and partial agonists. We demonstrate that the functional effect of compounds can be discerned by simply profiling the dynamics induced across the receptor, without the need for downstream interaction partners. We showed that ICL1 undergoes a significant change in dynamics between activated and inhibited states consistent with a role in downstream signaling pathways in class A GPCRs.
著者: Argyris Politis, J. Toporowska, P. Kapoor, M. Musgaard, K. Gherbi, K. Sengmany, F. Qu, M. Soave, H.-Y. Yen, K. Hansen, A. Jazayeri, J. T. S. Hopper
最終更新: 2024-02-09 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.07.579309
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.07.579309.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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