リボソームDNAの維持:細胞の健康のカギ
細胞が最適な機能のためにリボソームDNAのコピー数をどう調節するか。
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リボソームDNA(RDNA)はゲノムの重要な部分だよ。これはリボソームRNA(RRNA)を作る多くの繰り返し遺伝子を含んでいて、すべての生物がタンパク質を作るのに必要不可欠なんだ。これらのrDNAエリアはしばしば何度も繰り返されていて、変化に対して脆弱になりやすい。大きな問題の一つは、これらの繰り返しが時間とともに減少することがあって、特に遺伝子材料を次の世代に渡す生殖細胞系で、細胞の機能に影響を与えることがあるんだ。
例えば、ショウジョウバエみたいな動物では、高いrDNA繰り返し数を維持することが細胞の健康にとって重要なんだ。rDNAのコピーが減ると、成長や発達に問題が出てくるから、こういった生物は長期間rDNAの数を安定させる方法を見つけることが大事なんだ。
rDNAコピー数維持のプロセス
研究によると、rDNAコピー数(CN)が低いときに、一部の細胞は適応できることがわかってる。特に生殖細胞幹細胞(Gsc)は、rDNAのCNを正常なレベルに戻すことができるんだ。これが起こる一つの方法が、rDNAの拡大と呼ばれるプロセスで、これは数十年にわたってショウジョウバエで研究されてきたんだ。
rDNAのCNが減少すると、特定の遺伝子が活性化されてrDNAコピーの数を増やすのを助けるんだ。エンドヌクレアーゼR2は、このプロセスに寄与する遺伝子の一つなんだ。R2はrDNAの場所でDNAにブレークを作って、細胞がそのブレークを修復するときにrDNAの数を増やせるようにする。このメカニズムはGSCにとって重要で、GSCが分裂する際に、2つの娘細胞のうちの1つ(rDNAコピーが多い方)を残して、もう1つを捨てるようにしてるんだ。
遺伝子調節に関する研究結果
GSCがどのようにrDNAのCNを増やすかをよりよく理解するために、科学者たちは単一細胞RNAシーケンシングと呼ばれる技術を使ったんだ。この方法は研究者が個々の細胞で多くの遺伝子の活動を観察できるから、rDNAのレベルが下がったときに細胞がどのように反応するかの洞察を提供してくれる。
この分析を通じて、インスリン様受容体(INR)がR2を調節する役割を持っていることがわかったんだ。これはrDNAの拡大にとって必須なものなんだ。rDNAのレベルが低いとき、InRの発現が下がって、R2が活性化されてrDNAの数を増やすことができる。このプロセスはGSC内で正常なrDNAのレベルを回復するのに役立つんだ。
食事因子の役割
面白いことに、環境、特に栄養が細胞がrDNAのレベルを管理する方法に影響を与えることがあるんだ。インスリン様シグナル経路は栄養によって影響を受けて、それがrDNAの維持にも影響を与えるんだ。研究者たちは、ショウジョウバエの食事を変えたとき、R2の発現、つまりrDNAの拡大活動が変わることを発見したんだ。例えば、栄養が少ない食事ではGSCがもっとR2を発現し、栄養が豊富な食事ではその逆が起こったんだ。
進化と生物多様性への影響
GSCがInRのような内部の信号や食事のような外部の要因に応じてrDNAのCNを調整できる能力は、洗練された制御システムを示唆してるんだ。このシステムは生物が変化する条件に基づいて遺伝的な構成を適応させることを可能にしていて、これは生存と繁殖にとって重要なんだ。
rDNAがどのように維持されるかを理解することは、ストレスに対する生物の反応、進化の仕組み、生物多様性の維持など、より広範な生物学的プロセスへの洞察を提供するかもしれない。この知識は、rDNAの安定性が損なわれている特定の病気や状態の理解に役立つかもしれないんだ。
結論
rDNAコピー数の維持を研究することで、遺伝学、細胞の機械、環境要因の間の複雑な相互作用が明らかになるんだ。これらの関係を理解することが重要で、それが遺伝研究や農業、医学、保全への応用に進展をもたらすかもしれないね。
タイトル: Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
概要: Preserving a large number of essential yet highly unstable ribosomal DNA (rDNA) repeats is critical for the germline to perpetuate the genome through generations. Spontaneous rDNA loss must be countered by rDNA copy number (CN) expansion. Germline rDNA CN expansion is best understood in Drosophila melanogaster, which relies on unequal sister chromatid exchange (USCE) initiated by DNA breaks at rDNA. The rDNA-specific retrotransposon R2 responsible for USCE-inducing DNA breaks is typically expressed only when rDNA CN is low to minimize the danger of DNA breaks; however, the underlying mechanism of R2 regulation remains unclear. Here we identify the insulin receptor (InR) as a major repressor of R2 expression, limiting unnecessary R2 activity. Through single-cell RNA sequencing we find that male germline stem cells (GSCs), the major cell type that undergoes rDNA CN expansion, have reduced InR expression when rDNA CN is low. Reduced InR activity in turn leads to R2 expression and CN expansion. We further find that dietary manipulation alters R2 expression and rDNA CN expansion activity. This work reveals that the insulin pathway integrates rDNA CN surveying with environmental sensing, revealing a potential mechanism by which diet exerts heritable changes to genomic content.
著者: Jonathan O Nelson, A. Slicko, A. A. Raz, Y. M. Yamashita
最終更新: 2024-02-29 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.582629
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.582629.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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