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神経変性疾患に関する遺伝的洞察

研究によると、神経変性疾患の遺伝的な関連が明らかになって、タンパク質の凝集の役割が強調されてる。

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神経変性における遺伝的関連神経変性における遺伝的関連その影響を探る。神経変性疾患の遺伝的要因を明らかにして、
目次

タンパク質病は、加齢に関連していて、脳内に特定のタンパク質が蓄積することで起こる病気なんだ。このタンパク質たちが集まって、いろんな細胞で有害な構造を作るんだよ。特定の神経変性疾患は、これらの群れを形成する同じタンパク質に関連付けられることがあるんだ。例えば、α-シヌクレイン(ɑS)っていうタンパク質があって、これがレビー小体(LBs)や他の凝集物の形成につながることがある。この症状はパーキンソン病(PD)、レビー小体型認知症(DLB)、多系統萎縮症(MSA)などで見られるよ。多くの患者は、これらの病気のいくつかの症状を同時に示すことが多くて、さらに複雑な状況になってるんだ。

例えば、アルツハイマー病(AD)の患者のかなりの割合がレビー小体の兆候を見せるんだ。実際、ADのケースの半分以上がこういう構造を持っていて、ADの通常の兆候であるアミロイドプラークやタウタングルも、DLBやかなりの数のPD症例でも見られるんだ。これは複雑な状況を作って、重要な質問を浮かび上がらせる:「これらの病気は共通の生物学的原因を持ってるのか?」「これらのタンパク質関連の病気には共通のリスク要因があるのか?」

シヌクレイノパチーの遺伝的知見

ɑSに関連する遺伝子、SNCAの稀な変異は、このタンパク質に関連した病気の共通点を示唆しているよ。SNCAの変異や重複によって引き起こされる遺伝的なシヌクレイノパチーの家系では、1つの家族内でPDやPDD、DLBなど、いろんな病気の結果が生じることがあるんだ。

SNCAの遺伝子における点変異や重複に関連した2つの特定の遺伝性のシヌクレイノパチーは、PDやMSAで見られるタンパク質の凝集物と関係があることを示してるよ。最近の研究もこの考えを支持してる。例えば、別の遺伝的経路に関連するGBA1遺伝子に変異を持つ人は、PDやDLBのリスクが高いことがわかってきたし、最近の発見ではMSAとも関連してるかもしれないんだ。脳細胞のレベルでは、さまざまなシヌクレイノパチーは、ɑS関連の損傷により脳の異なる領域がより影響を受けやすくなって生じるかもしれない。

いろんなタンパク質の形が存在することを示す研究もあって、同じ変異を持つ患者でも環境や遺伝的背景などの他の要因によってユニークな病気の症状を示すことがあるんだ。これは、複数の要因がこれらの病気の特異な特徴に寄与することがあることを強調してるんだ。

混在疾患の複雑さ

神経変性疾患の患者の脳にさまざまなタイプのタンパク質が存在することは、重複する病気のプロセスや、さまざまなタンパク質関連の状態の間に共通の基盤があることを示唆してるかもしれない。ただし、その関連性は、タンパク質の群れが明確に存在することに依存するかもしれない。

これらの病気を調べたさまざまな研究は、混合した結果を生み出したけど、神経変性疾患、特にシヌクレイノパチーの間に遺伝的な重複がある傾向が出てきてる。例えば、タウ関連の病気に関連するMAPT遺伝子の変異は、PDやDLBにも関連していて、APOEやTMEM175のような他の遺伝子は、ADとDLBの間に共通のリスクを示してる。

興味深いことに、異常なタンパク質の存在が毒性や凝集を引き起こす可能性があって、これはɑS、Aβ、タウタンパク質の相互作用が全体の病気プロセスに寄与してるかもしれないことを示唆している。これらのタンパク質の関連性を調べる研究が進行中で、実験室の研究は有望な手がかりを提供しているけど、これらの発見が実際の人間の文脈にどう適用されるかはまだ疑問が残る。

神経変性疾患を理解するための2つのアプローチ

研究者たちは、神経変性疾患の複雑なメカニズムを解明するために人間の遺伝子分析とモデル生物を使った研究の2つの主要な遺伝的手法を使用しているよ。これまでのところ、遺伝的修飾因子についての最も徹底的な研究は酵母を使って行われているんだ。そこで、研究者たちはɑSやAβタンパク質の存在が細胞の健康にどう影響するかを評価したんだ。ほぼ完全な酵母のゲノムとそれに対応するタンパク質を分析することで、特定の遺伝子がこれらのタンパク質によって引き起こされる毒性にどう影響するかを特定できたんだ。

この酵母モデルは、人間の病気にも関連があると考えられていて、特定された遺伝子もADやPDの既知の要因に関連してる。これらの知見にもかかわらず、酵母モデルで見られる効果と人間の研究でのɑSやAβの効果の間にはほとんど関連がないんだ。

人間の遺伝学では、全ゲノム関連研究(GWAS)が病気に関連する一般的な変異を見つけるための標準的な方法として使用されてきたよ。これらの研究は通常、集団内で一般的な変異に焦点を当てるけど、そういった変異は通常わずかな効果しか持たないから、その役割を特定するのが難しいんだ。稀な変異を効果的に除外するためには、大規模なコホートが必要だね。最近の研究では、特定の種類の遺伝的変化や特定の機能に焦点を当てて、これらの稀な変異の検索を狭めようとしたんだ。

私たちの研究では、ADやPDのリスクに関連したɑSやAβの修飾因子の間に共通の関連が見出せるかを探ろうとしたよ。これらのタンパク質に関連する遺伝子と、さまざまなシヌクレイノパチーと診断された496人の患者の間で既知のリスク遺伝子におけるターゲットエクソームスクリーニングを行ったんだ。

遺伝子スクリーニングからの発見

私たちのターゲット遺伝子スクリーニングは、PDの既知のリスクに関連した遺伝子、例えばGBA1やLRRK2での稀な非同義変異の有意な濃縮を示したよ。特に、3つの既知のAD関連遺伝子も出現し、これらの病気の間にある共有リスクの理解を深めたんだ。独立したデータセットでの検証の結果、特にɑSの修飾因子と比べて、Aβの修飾因子との強い関連が明らかになった。

この遺伝子群は、PSEN2と共に、アクチン細胞骨格の調節に関連するつながりを示したよ。ニューロン内のこのフレームワークの破壊が、どちらの病気においても重要な要因であることが分かったんだ。

PSEN2はニューロンの生存に不可欠であることが特定され、これは私たちの発見と一致していて、PSEN2のダウンレギュレーションがSNCAのレベルを増加させることを示してる。これは、PSEN2の変異や欠失が、ɑSの発現に影響を及ぼし、シヌクレイノパチーの発症に関わる可能性のあるメカニズムを示唆しているんだ。

アクチン細胞骨格の役割

細胞に構造を提供し、その機能に重要な役割を果たすアクチン細胞骨格は、PDやADに関連する多くの遺伝子の中で注目されているんだ。ニューロンにおけるこの構造の混乱は、細胞機能の障害やタンパク質の凝集に関連する神経毒性の増加など、負の影響の連鎖を引き起こすことがあるんだ。

私たちの発見は、PSEN2とアクチン調節遺伝子がPDやADの病理に観察されたものとよく一致していることを強調しているよ。PSEN2がダウンレギュレーションされたニューロンでは、シヌクレイノパチーに関連する重要なマーカーも増加していて、これらの経路が相互に関連していることを示しているんだ。

ニューロンモデルと観察

これらの関係をよりよく理解するために、シヌクレイノパチーを模倣する新しい幹細胞モデルを開発したよ。このモデルを使って、ɑSの発現の変化が時間をかけて細胞にどのような影響を与えるかを調べることができたんだ。初期の観察では、ɑSのレベルが増加すると細胞に損傷や死を引き起こすことがわかって、これはこのタンパク質と神経変性疾患の進行との関連を再確認するものだったんだ。

興味深いことに、これらのモデルでRhoAシグナル伝達経路が減少したとき、アクチンの安定性が下がり、ɑSでの病理学的変化が増加したんだ。これは、アクチンシグナル伝達の混乱が神経変性の条件の発展に重要な役割を果たすかもしれないという考えを支持しているね。

疾患メカニズムを理解するための意味

研究によると、多くの神経変性疾患は従来のカテゴリーに当てはまらないことがわかっていて、さまざまな病理の混在した兆候を示すことが多いんだ。この複雑さは、臨床症状に単に焦点を当てるのではなく、基礎となる生物学に基づいてこれらの病気を分類する、より細やかなアプローチが有益かもしれないことを示唆しているよ。

私たちの発見は、特定のタンパク質病に関連する遺伝的変異のニュアンスを理解することで、複数の病気に共通する新たな経路を明らかにできる可能性があることを示しているね。このアプローチを用いることで、共通のリスク要因の特定がより良くできて、結果的に治療戦略の改善につながるかもしれない。

結論

アミロイドとタウタンパク質との複雑な関係、遺伝的要因の役割、そしてそれらがアクチン細胞骨格のような細胞構造にどのように影響を与えるかは、神経変性疾患の複雑さを強調してるよ。研究が進むにつれて、神経変性障害のより統合的な視野が、治療のターゲットをより良く特定するのに役立つことが明らかになってきているんだ。

これらの病気の遺伝的基盤に焦点を当てたり、これらの仮説をテストするためにモデルシステムを利用することで、異なるタンパク質病の相互作用を理解するための進展が期待されるよ。この研究の目的は、これらの厄介な状態を管理または予防するためのより効果的な介入の道を開くことなんだ。

オリジナルソース

タイトル: Deep sequencing of proteotoxicity modifier genes uncovers a Presenilin-2/beta-amyloid-actin genetic risk module shared among alpha-synucleinopathies

概要: Whether neurodegenerative diseases linked to misfolding of the same protein share genetic risk drivers or whether different protein-aggregation pathologies in neurodegeneration are mechanistically related remains uncertain. Conventional genetic analyses are underpowered to address these questions. Through careful selection of patients based on protein aggregation phenotype (rather than clinical diagnosis) we can increase statistical power to detect associated variants in a targeted set of genes that modify proteotoxicities. Genetic modifiers of alpha-synuclein ([a]S) and beta-amyloid (A{beta}) cytotoxicity in yeast are enriched in risk factors for Parkinsons disease (PD) and Alzheimers disease (AD), respectively. Here, along with known AD/PD risk genes, we deeply sequenced exomes of 430 [a]S/A{beta} modifier genes in patients across alpha-synucleinopathies (PD, Lewy body dementia and multiple system atrophy). Beyond known PD genes GBA1 and LRRK2, rare variants AD genes (CD33, CR1 and PSEN2) and A{beta} toxicity modifiers involved in RhoA/actin cytoskeleton regulation (ARGHEF1, ARHGEF28, MICAL3, PASK, PKN2, PSEN2) were shared risk factors across synucleinopathies. Actin pathology occurred in iPSC synucleinopathy models and RhoA downregulation exacerbated [a]S pathology. Even in sporadic PD, the expression of these genes was altered across CNS cell types. Genome-wide CRISPR screens revealed the essentiality of PSEN2 in both human cortical and dopaminergic neurons, and PSEN2 mutation carriers exhibited diffuse brainstem and cortical synucleinopathy independent of AD pathology. PSEN2 contributes to a common-risk signal in PD GWAS and regulates [a]S expression in neurons. Our results identify convergent mechanisms across synucleinopathies, some shared with AD.

著者: Vikram Khurana, S. Nazeen, X. Wang, D. Zielinski, I. Lam, E. Hallacli, P. Xu, E. Ethier, R. Strom, C. A. Zanella, V. Nithianandam, D. Ritter, A. Henderson, N. Saurat, J. Afroz, A. Nutter-Upham, H. Benyamini, J. Copty, S. Ravishankar, A. Morrow, J. Mitchel, D. Neavin, R. Gupta, N. Farbehi, J. Grundman, R. H. Myers, C. R. Scherzer, J. Q. Trojanowski, V. M. Van Deerlin, A. A. Cooper, E. B. Lee, Y. Erlich, S. Lindquist, J. Peng, D. H. Geschwind, J. Powell, L. Studer, M. B. Feany, S. R. Sunyaev

最終更新: 2024-03-07 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.03.583145

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.03.583145.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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