神経芽腫治療のためのPRMT5を標的にする
研究によると、PRMT5は高リスク神経芽腫の治療において重要な役割を果たしている。
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神経芽腫は主に子供に影響を与える癌の一種だよ。体の神経細胞が制御を失って、腫瘍を形成することが起こる。これは子供の固形腫瘍の中で最も一般的なもので、残念ながら、神経芽腫と診断される子供の約半数は非常に重篤な形態で、予後が悪いんだ。これらの子供たちの長期生存率は40%未満なんだよ。
この悪い予後の主な理由の一つは、MYCNという遺伝子の変化だ。これが増幅されると、攻撃的な腫瘍が成長するんだ。この遺伝子の変化がある神経芽腫はMYCN増幅神経芽腫(MNA神経芽腫)と呼ばれていて、治療が難しいケースの約半分を占めてる。他の患者は、TERTやMYCと呼ばれる遺伝子の調整に問題を抱えていて、癌の成長を助ける重要なタンパク質が過剰に生産されることがあるんだ。
より良い治療法の必要性
残念ながら、これらの遺伝子の欠陥は、現在の治療にとって簡単なターゲットではないんだ。MNA神経芽腫を治療する新しい方法を見つける必要がある。研究者たちは、合成致死性という領域に焦点を当てていて、癌細胞の弱点を見つけて薬で狙うんだ。以前の研究では、MNA神経芽腫細胞がPRMT5というタンパク質に依存して生存していることが示されたんだ。PRMT5がブロックされると、これらの癌細胞は死に始めるんだよ。
PRMT5はアルギニンメチルトランスフェラーゼと呼ばれるタンパク質群の一部で、他のタンパク質を修飾して機能を助ける役割を果たしてる。これらのタンパク質にはいくつかの種類があって、PRMT5は特に対称的ジメチル化という重要なプロセスを行うんだ。これは、遺伝子の発現や細胞の損傷への反応など、多くの細胞プロセスに必要なんだよ。
PRMT5と神経芽腫に関する発見
私たちの研究では、PRMT5をブロックすることが神経芽腫細胞に与える影響を詳しく見たんだ。PRMT5を特に抑制する特別な薬、GSK3203591を使って、MYCN変化のある神経芽腫細胞ラインとそうでないものの両方でテストしたんだ。
MYCN増幅を持つ神経芽腫細胞にこの薬を適用したところ、これらの細胞が治療に対して非常に敏感であることが分かった。一方、MYCN増幅のない細胞はほとんど反応しなかった。このことは、PRMT5がMNA神経芽腫細胞の生存に重要な役割を果たしていることを示しているんだ。
さらに、GSK3203591でこれらの細胞を治療したとき、分子レベルでいくつかの変化が起こった。例えば、細胞死の指標である切断されたカスパーゼ-3やPARPがMNA細胞株で有意に増加し、これらの特定の細胞においてPRMT5を狙う効果を強調している。
MYCNの役割
MYCNとPRMT5の関連をさらに理解するために、MYCN遺伝子をオンオフできる特定の細胞ラインモデルを使用した。これらの細胞でMYCNを活性化すると、GSK3203591に対して非常に敏感になり、効果を見るのに必要な薬の濃度が大幅に低下した。MYCNをオフにすると、細胞は薬に対して抵抗性を持つようになった。
これは、MYCNの存在がPRMT5抑制の効果に不可欠であることをさらに確認するものだ。また、治療によって引き起こされる遺伝子発現の変化を調べた結果、PRMT5が抑制されたときに、MYCNによって調整される多くの遺伝子が有意にダウンレギュレートされることが分かった。これは、PRMT5をブロックすることで、MYCNがさまざまな細胞プロセスを調整する方法に干渉していることを意味している。
PRMT5が遺伝子発現に与える影響
MNA神経芽腫細胞ラインをGSK3203591で治療した後、RNAを分析して、数百の影響を受けた遺伝子を特定した。いくつかの遺伝子は発現が増加したが、他の多くは減少し、特に癌の生存や成長に関連するものが多かった。
PRMT5が抑制されると、MYCNによって活性化される遺伝子が強く抑制されることが分かった。これには、細胞の成長と生存に必要な重要な癌シグナリング経路が含まれている。私たちの分析では、GSK3203591治療がこれらの癌細胞の代謝および成長促進経路の広範なシャットダウンを引き起こすことが示された。
代替スプライシングの変化
PRMT5は、シングル遺伝子が異なるタンパク質バリアントを生成することを可能にする代替スプライシングの調整でも知られている。GSK3203591が神経芽腫細胞の代替スプライシングに与える影響を調べたところ、重要な変化が見られた。
スプライシングイベントを受ける多くの遺伝子は、DNA修復や代謝などの癌関連プロセスにリンクされていた。たとえば、いくつかのDNA修復遺伝子のスプライシングパターンに変化が見られた。これは、スプライシングにおけるPRMT5の役割が癌細胞の遺伝物質の完全性を保持する上で重要な意味を持つことを示唆している。
代謝の変化
私たちの研究では、PRMT5をブロックすることが神経芽腫細胞がグルコースやグルタミンのような必須栄養素をどう使うかに影響を与えることが明らかになった。これらは癌細胞の代謝とエネルギー生産に重要なんだ。同位体を使ってこれらの栄養素がどのように処理されるかを追跡したところ、MNA神経芽腫細胞がPRMT5阻害剤で治療された際に、グルタミンの使用量が減少していることが分かった。
グルタミントランスポートおよび代謝に関与するいくつかの遺伝子がダウンレギュレートされていることを確認した。この発見は、MNA神経芽腫細胞が成長と生存のためにグルタミンに依存しているという考えと一致していて、PRMT5を抑制することでこの依存関係が乱れることを示唆している。
エピトランスクリプトームへの影響
従来の遺伝子発現の変化に加えて、PRMT5の抑制はm6Aメチル化などの転写後修飾にも影響を与えた。この修飾は、mRNAがタンパク質にどれだけよく翻訳されるかに関与している。GSK3203591がMYCN mRNAのm6Aレベルを減少させ、この減少がMYCNタンパク質レベルの低下と相関していることが分かった。
さらに、mRNAの他の修飾因子について調べたところ、PRMT5抑制後にこれらも多く減少していることが分かった。これは、PRMT5がスプライシングだけでなく、mRNAがタンパク質に翻訳される効率にも広範な影響を与えることを示している。
マウスでのin vivo研究
PRMT5の抑制が生きた生物でどれほど効果的かを評価するために、神経芽腫のマウスモデルを使用した。これらのマウスはMYCNを発現するように遺伝子操作されていて、私たちの発見をテストするのに適しているモデルだった。GSK3203591のバージョンであるGSK3326593で治療したところ、治療を受けたマウスがプラセボを受けたマウスと比べて生存率が上昇したんだ。
すべてのケースで劇的な腫瘍縮小が見られたわけではないが、マウスの全体的な健康状態と寿命は大幅に改善された。これは、PRMT5を標的にすることが高リスクの神経芽腫治療に有用な戦略になり得ることを示唆している。
将来の治療法への影響
私たちの研究結果は、MNA神経芽腫におけるPRMT5の重要な役割を強調している。このタンパク質の抑制は、これらの癌細胞が繁栄するための重要なプロセスの核心を直撃するようだ。遺伝子発現、代替スプライシング、代謝プロセスを乱すことで、GSK3203591やGSK3326593のようなPRMT5阻害剤が標的療法の有望な選択肢として浮かび上がる。
この研究は、これらの新しい洞察を活用した併用療法の可能性も示唆している。PRMT5はさまざまな細胞経路に関与しているため、他の治療法と併せて標的にすることで、全体的な効果を高めたり、多くの癌に見られる抵抗を克服するのに役立つかもしれないね。
結論
全体的に、私たちの研究は高リスクの神経芽腫細胞がPRMT5抑制に対して脆弱であることを強調している。遺伝子調整、スプライシング、代謝適応におけるその役割の組み合わせが、PRMT5を新しい治療戦略の主要なターゲットとして位置づけている。今後の研究では、高リスクの神経芽腫に苦しむ子供たちの治療結果を改善するために、既存の治療法と併用してPRMT5阻害剤をどのように最適に活用するかを引き続き探求するべきだね。
タイトル: Glutamine addiction is targetable via altering splicing of nutrient sensors and epitranscriptome regulators
概要: About 50% of poor prognosis neuroblastoma arises due to MYCN over-expression. We previously demonstrated that MYCN and PRMT5 proteins interact and PRMT5 knockdown led to apoptosis of MYCN amplified (MNA) neuroblastoma. Here we evaluate PRMT5 inhibitors GSK3203591/GSK3326593 as targeted therapeutics for MNA neuroblastoma and show MYCN-dependent growth inhibition and apoptosis. RNAseq revealed dysregulated MYCN transcriptional programmes and altered mRNA splicing, converging on key regulatory pathways such as DNA damage response, epitranscriptomics and cellular metabolism. Metabolic tracing showed glutamine metabolism was impeded following GSK3203591 treatment, which disrupted the MLX/Mondo nutrient sensors via intron retention of MLX mRNA. Glutaminase (GLS) protein was decreased by GSK3203591 despite unchanged transcript levels, suggesting post-transcriptional regulation. We demonstrate the RNA methyltransferase METTL3 and cognate reader YTHDF3 proteins are lowered following splicing alterations; accordingly, we observed hypomethylation of GLS mRNA and decreased GLS following YTHDF3 knockdown. In vivo efficacy of GSK3326593 was confirmed by increased survival of Th-MYCN mice together with splicing events and protein decreases consistent with in vitro data. Our study supports the spliceosome as a key vulnerability of MNA neuroblastoma and rationalises PRMT5 inhibition as a targeted therapy. GRAPHICAL ABSTRACT O_FIG O_LINKSMALLFIG WIDTH=200 HEIGHT=133 SRC="FIGDIR/small/582087v2_ufig1.gif" ALT="Figure 1"> View larger version (54K): [email protected]@1eb9520org.highwire.dtl.DTLVardef@18b980corg.highwire.dtl.DTLVardef@1ab46e0_HPS_FORMAT_FIGEXP M_FIG C_FIG
著者: Karim Malik, J. Bojko, M. Kollareddy, M. Szemes, J. Bellamy, E. Poon, A. Moukachar, D. Legge, E. E. Vincent, N. Jones, A. Greenhough, A. Paterson, J. H. Park, K. Gallacher, L. Chesler
最終更新: 2024-03-11 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.582087
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.582087.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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